Metabolisme • 259
7.4 Navnsetting av enzymer Enzymene får navn etter det substratet de har, og etter den reaksjonen de katalyserer. I tillegg ender alle enzymnavnene på -ase. Noen av de første enzymene som ble oppdaget, følger dessverre ikke disse navnereglene, for eksempel enzymet pepsin. Pepsin bryter ned proteiner og tilhører en stor familie med enzymer som gjør det, nemlig peptidaser. Et annet enzym som derimot følger regelen, er alkoholdehydrogenase. Det er et enzym som fjerner hydrogen fra alkohol (etanol). Vi har seks hovedgrupper av enzymer som er organisert som vist i tabellen. I figurene i denne boka er alle enzymer markert med blå farge. Tabellen viser hovedgrupper av enzymer og hvilke typer reaksjoner de påvirker. Tabellen er ment som en hjelp til bedre å forstå mekanismene i en enzymatisk reaksjon, og hvorfor navnsetting av enzymer kan gi oss informasjon om hvilke typer reaksjoner de katalyserer.
Gruppe
Figur
Reaksjon = Reduksjonsekvivalent
Oksidoreduktaser
+
Oksiderer eller reduserer organiske stoffer. Noen av de viktigste enzymene våre i celleåndingen er i denne klassen. Også katalaser er med i denne gruppen.
+ Boks
Ared
Aoks
Bred
Overfører en gruppe fra ett stoff til et annet. En stor undergruppe her er kinasene, enzymer som flytter en fosfatgruppe fra ett molekyl til et annet. Et eksempel er heksokinase, som vi finner i starten av glykolysen.
0539a_Enzymgrupper1
Transferaser
+
+
A–B
C
A
B–C
0539b_Enzymgrupper2
Hydrolaser
+
Spalter større molekyler til mindre ved bruk av vann. Her er mange av fordøyelsesenzymene våre, for eksempel peptidasene, lipasene og glykosidasene.
+
A–B
H2O
A–H
B–OH
Katalyserer spalting og noen ganger produksjonen av kovalente bindinger. En viktig undergruppe er dekarboksylasene, som spalter av CO2 fra karboksylsyregrupper. Et viktig eksempel her er pyruvatdehydrogenase – se celleånding.
0539c_Enzymgrupper3
Lyaser
+ A
B
A–B
0539d_Enzymgrupper4
Katalyserer endringer i et molekyl som gjør det til en isomer form. Isomere former har samme bruttoformel.
Isomeraser A
Iso-A B X = A,G,U,C
Ligaser
0539e_Enzymgrupper5X
+
XDP
+
P P P
XTP A
0539f_Enzymgrupper6
X
P P P
A–B
Katalyserer produksjonen av kovalente bindinger. Det krever energi i form av ATP. To svært, svært vanlige enzymer er med her, rubisko (se foto syntese) og DNA-ligase.