Microbiota Gastrintestinal | Evidências da Sua Influência na Saúde e na Doença
Os três domínios da vida A partir da análise comparativa de sequências de DNAr, foi reconstruída a árvore filogenética da vida, na qual todos organismos vivos são di vididos em três domínios: Archaea, Bacteria e Eukarya (Figura 1.2),10 sendo domínio o táxon biológico mais elevado. A árvore filogenética universal corresponde à genealogia de toda a vida na Terra e retrata a história evolutiva das células de todos os organismos, revelando cla ramente os três domínios. Dois desses domí nios, Bacteria e Archaea, são exclusivamente microbianos e constituídos somente por células desprovidas de um núcleo envolto por membra na, ou seja, células procarióticas.1,10 O conceito de três domínios é também sus tentado pela análise de genes específicos com partilhados por todos os organismos. A análise de mais de 30 genes presentes em mais de 190 espécies de Bacteria, Archaea e Eukarya, cujos genomas foram totalmente sequenciados, con firma a separação distinta e inequívoca dessas três linhas de descendência.1 A divisão das formas de vida em três domí nios é hoje aceita, mas a posição do domínio Archaea na árvore universal da vida ainda é discutida, existindo três hipóteses principais. A
Extração de DNA PCR Amplificação da sequência de DNA que codifica RNAr (DNAr) Sequenciamento de DNA Alinhamento das sequências Reconstrução da árvore filogenética
Figura 1.1 Etapas de reconstrução de uma árvore filogenética baseada no DNAr PCR: reação em cadeia da polimerase. Fonte: adaptada de Madigan et al., 2010.1
meio de um algoritmo computacional. Por fim, é realizada a reconstrução da história evolutiva desses organismos. Quanto maior a variação da sequência do gene DNAr entre os organismos, maior sua divergência evolutiva.
Bacteria
Espiroquetas Proteobactérias
Archaea
Eukarya
Bactérias verdes filamentosas Grampositivas
Cianobactérias Planctommyces Bacteroides Cytophaga
Entamoeba Methanosarcina
Methanobacterium Methanococcus Thermococcus celer Thermoproteus Pyrodicticum
Halofílicos
Animais Fungos Plantas Ciliados Flagelados
Microsporídios
Thermotoga Aquifex
Ancestral comum
Figura 1.2 Árvore filogenética da vida. Essa árvore, construída por Sarl Woese, ilustra o relacionamento evolutivo de organismos dos três domínios da vida. Foi construída a partir da comparação das sequências do gene da RNA ribossômico (RNAr), o qual será presente em todos os seres vivos Fonte: adaptada de Woese et al., 1990.10
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C o p y r i g h t ©2 0 1 5E d i t o r aR u b i oL t d a . Ma c h a d oe t . a l . Mi c r o b i o t aGa s t r i n t e s t i n a l –E v i d ê n c i a sd as u aI n f l u ê n c i an aS a ú d een aDo e n ç a . Al g u ma sp á g i n a s , n ã os e q u e n c i a i s , ee mb a i x ar e s o l u ç ã o .
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