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Prof. Dr. Hartmut Juhl, Indivumed

Multi-omics für individuelle Krebsforschung

Inwieweit unterscheidet sich Indivumeds Krebsbiobank in puncto Proben- und Datenstandardisierung von Biobanken, die an Krankenhäusern aufgebaut wurden?

Das ganze Unternehmen Indivumed beruht auf der Überzeugung, dass nur hochqualitative Proben für zielführende Forschung geeignet sind. Viele Kliniken haben herausragende Biobanken aufgebaut, doch es gibt zwei Aspekte, die unsere eigene Krebsbiobank einzigartig machen. Der erste sind unsere ISOzertifizierten SOPs, durch die wir die Gewebeproben mit einer Ischämiezeit von nur zehn Minuten direkt im OP sammeln und einfrieren. Die molekulare Struktur der Krebszellen bleibt so vollständig erhalten. Neben dem Tumor sammeln wir auch Normalgewebe und erheben umfassende klinische Daten der Patienten, um ein Gesamtbild der individuellen Erkrankung zu erhalten. Dieser Detailgrad hilft uns, den Krebs nicht nur im Genom, sondern multi-omisch zu betrachten. Zweitens arbeiten wir mit Partnerkliniken rund um die Welt zusammen. Unser Clinical Network macht es uns möglich, Standardisierung von Proben und Daten auf einem globalen Level zu betreiben und darin alle geografischen, kulturellen, ethnischen und sonstigen Besonderheiten abzubilden. Wie helfen Digitalisierung und künstliche Intelligenz Indivumed, um basierend auf Multi-omics-Datensätzen zu neuen Erkenntnissen zu gelangen?

Die Basis ist die Kombination aus klinischen Daten mit Genom-, Transkriptom-, Proteom- und PhosphoProteom-Daten – rund 250 GB pro Patient. Durch die zunehmend wachsenden Daten gewinnen wir Erkenntnisse über den Krebs, die bisher undenkbar waren. Wir vergleichen zum Beispiel unterschiedliche Tumorentitäten mit gleichen Prof. Dr. med. Qualitäten und sehen so Hartmut Juhl „Pan-cancer“-Muster, die Gründer und CEO niemand sonst sehen kann, Indivumed Group weil kein anderer das Ausgangsmaterial in dieser Menge und Qualität zur Verfügung hat. Der Weg dahin liegt in der Bioinformatik, die diese Arbeit mit Algorithmen beschleunigt. Über unsere Analytik-Plattform nRavel® wenden wir KI-gestützte Analysemethoden und spezialisierte Tools an, die uns helfen, auch ganz konkrete Fragestellungen viel schneller und besser zu beantworten. Eine Cloudlösung hilft uns, diese gigantischen Datenmengen zu verarbeiten. Was macht Indivumeds Expertise zur Benchmark in der Tumoranalyse? Alles oben gesagte, aber vor allem auch unsere Zusammenarbeit mit wertvollen Partnern aus der Forschung und Pharmaindustrie. Unsere teils schon lange bestehenden Kooperationen beruhen darauf, dass wir wesentlich dazu beitragen können, beim Drugscreening die richtigen Kandidaten zu identifizieren. Somit kommen wir durch die Analyse viel schneller zum eigentlichen Ziel: zielgerichtete Medikamentenentwicklung für den individuellen Krebs zu ermöglichen. ›

Abb.: Deutscher Ethikrat Abb.: Dominik Obertreis www.obertreis.de – Advertorial