Laboratórna diagnostika
É OVAN Z I L A AKTU
Genetika Diagnostika ochorení v odbore lekárskej genetiky je vykonávaná v rámci vzájomnej spolupráce troch odborných pracovísk: ambulancie lekárskej genetiky, cytogenetického laboratória a laboratórií molekulárnej genetiky. Pri podozrení na ochorenie, pri ktorom by mohol pacient profitovať z genetickej laboratórnej diagnostiky, sú dve možnosti postupu. Len pri relatívne úzkej skupine molekulárno-genetických vyšetrení nazývaných aj rutinná diagnostika (potravinové intolerancie, trombofílie, celiakia a niektoré iné) je možná indikácia vyšetrenia viacerými špecialistami a odobratý materiál sa odošle priamo do genetického laboratória. Pri podstatne väčšej skupine ochorení definovaných ako zriedkavé ochorenia je nutný manažment pacienta prostredníctvom ambulancie lekárskej genetiky.
Cytogenetické laboratórium je vybavené modernými mikroskopmi Olympus, Nikon a Leica. Na urýchlenie kultivácie využívame CO2 inkubátor Memmert a N-BIOTEK. Na hodnotenie karyotypov používame hodnotiaci softvér LUCIA. Analýzu karyotypov realizujeme z leukocytov periférnej krvi a z amniocytov plodovej vody. Karyotypy sú hodnotené podľa medzinárodného štandardu ISCN 2013, podľa slovenských a medzinárodných štandardov sa hodnotí konvenčné farbenie, G- a C-prúžkovanie chromozómov.
V rámci molekulárnej genetiky využívame štandardné techniky PCR, real-time PCR, MLPA, MS-MLPA, fragmentačnú analýzu, ďalej metódu priameho sekvenovania (metóda sekvenovania podľa Sangera, ktorá je v súčasnosti považovaná za zlatý štandard v molekulárnej genetike), ako aj najmodernejšie diagnostické prístupy, akými sú napríklad sekvenovanie novej geneOkruh pacientov v oblasti lekárskej genetiky je roz- rácie, SNP microarray a onkogenetická FISH analýza. siahly, rôznorodý a neustále rastie. K najbežnejším in- Pracoviská molekulárnej genetiky disponujú týmto prístrojovým vybavením: real-time PCR cykléry (Light[1] dikáciám patria nasledovné: Cycler 1.5, LightCycler 2.0, LightCycler 480, Cobas – dieťa s vrodenou vývojovou chybou, z 480 od firmy Roche, Rotor-Gene 3000 od Corbett – zaostávanie dieťaťa v psychomotorickom vývine, a Bio-Rad CFX96), genetické analyzátory (3130xl od závažné poruchy reči, správania, učenia, – partnerský pár trpiaci primárnou neplodnosťou, firmy Applied Biosystems) a najmodernejší plne automatizovaný systém myCrobe od firmy GeneProof. opakovanými potratmi, narodením mŕtveho dieťaťa, – plánovanie gravidity v rodinách s genetickým V rámci rutinnej genetickej diagnostiky vyšetrujeme napríklad trombofilné mutácie, potravinové intoleochorením, rancie, dyslipidémie a iné. Z hľadiska komplexnosti – onkologické ochorenie u pacienta v mladom veku, – opakovaný výskyt onkologických ochorení v rodine, prístupu poskytujeme v molekulárno-genetickej diagnostike širokú škálu moderných postupov s využi– tehotenstvo so zvýšeným genetickým rizikom tím najmodernejšej techniky, akou je sekvenovanie (patologické výsledky skríningu, USG, vysoký vek novej generácie – NGS (NextSeq550 a iSeq100 od rodičov), firmy Illumina, IonPGM™ System od firmy ThermoFis– neurodegeneratívne ochorenia, her) alebo tiež SNPmicroarray. V neposlednom rade – patologicky nízky vzrast, obezita, poruchy sluchu, ponúkame diagnostiku širokého spektra zriedkavých zraku, ochorení, pričom naše portfólio obsahuje viac ako 650 – pacienti s výskytom atypického tromboembolizmu chorobných jednotiek (patrí sem napr. Duchennova (mladý vek, neobvyklá lokalizácia, rekurencia), – pacienti s poruchami trávenia, suspektnými potravi- muskulárna dystrofia, neurofibromatóza, Marfanov syndróm a iné). V oblasti onkogenetiky a predispozícií k novými intoleranciami, vrodenou hepatopatiou, onkologickým ochoreniam vieme stanoviť prítomnosť – prognóza terapie niektorými cytostatikami, warfarípatogénnych variantov pri viac ako 50 onkogeneticnom a inými liečivami. kých chorobných jednotkách (ako napríklad analýza V prípade pochybností o najvhodnejšom postupe je génov BRCA1 a BRCA2 zodpovedajúcich za vrodenú optimálne konzultovať prípad so špecialistom v ambu- predispozíciu k dedičnej forme rakoviny prsníka a ovárií a mnohých iných), v oblasti molekulárnej patológie lancii lekárskej genetiky.
40
