Toto dílo lze šířit za podmínek CC-BY-NC-SA 3.0 http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/cz/
Inovace textu byla podpořena z projektu: Národní klastr informačního vzdělávání (NAKLIV) - podpora spolupráce, sdílení a transferu znalostí. Registrační číslo projektu: CZ.1.07/2.4.00/12.0060
Medline přehledně: Producent: Národní lékařská knihovna USA (The U.S. National Library of Medicine) Počet záznamů: 21 000 000 Retrospektiva: do roku 1946 Typ databáze: bibliografická s rostoucí kolekcí plných textů Pokrytí: medicína a příbuzné obory Přístup: zdarma URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
Co je MEDLINE? Databáze Medline se řadí k světově nejvýznamnějším a nejprestižnějším databázím pro oblast medicíny a jí příbuzných oborů, včetně veterinářství. Databázi produkuje Národní lékařská knihovna USA a přístup do databáze je realizován přes rozhraní PubMed, které je přístupné zdarma všem uživatelům. První elektronická verze Medline byla spuštěna v lednu 1966. Na sítí Internet začala Medline fungovat přes zmíněné rozhraní PubMed v roce 1996, kdy byla spuštěna experimentální verze. V roce 1997 pak byla tato verze představena veřejnosti. Počet vyhledávání v databázi v této době dosahoval asi 2 milionů dotazů měsíčně. V dnešní době toto číslo převyšuje 3 miliony, jedná se však o počet položených dotazů denně. Od svého vzniku se rozhraní PubMed stále vyvíjí, téměř od začátku například obsahuje heslář MeSH, dále vyhledávácí rozhraní prošlo několika kompletními změnami vzhledu, průběžně jsou přidávány funkce pro usnadnění vyhledávání nebo jsou retrospektivně doplňovány další záznamy. Předchůdcem elektronické verze byl referátový časopis Index Medicus, který začal vycházet již v roce 1871. Řada bibliografických záznamů z tohoto časopisu byla později převedena i do elektronické verze Medline. Stejně tak byly převedeny i záznamy z dalšího zdroje Current List of Medical Literature. Celková retrospektiva záznamů v Medline sahá až do roku 1946.
Referátové časopisy Referátové časopisy jsou považovány za předchůdce dokumentografických systémů (databází). Obsahovaly tištěné soubory bibliografických záznamů dokumentů pro dané obory. K samotné automatizaci a přechodu do elektronické podoby došlo u prvních databází v 60. letech minulého století.
Co MEDLINE obsahuje? Hlavním informačním zdrojem pro Medline jsou odborné časopisy. Indexováno je celkem asi 5600 časopisů z celého světa v 39 jazycích, pokud k tomu přičteme i nejstarší čísla časopisů, tak se celkem jedná asi o 60 světových jazyků. Většina z těchto časopisů byla do Medline zařazena na základně doporučení odborné komise Literature Selection Technical Review Committee. Dalšími zdrojovými dokumenty jsou v menší míře než časopisy například noviny, magazíny nebo i knihy. Z konkrétních oborů mimo obecné medicíny jsou zahrnuty například: behaviorální vědy, bioinženýrství, biofyzika, zubní lékařství, HIV/AIDS, ochrana zdraví, výukové materiály nebo také biochemie a chemie. Pro registraci chemických látek Medline používá CAS Registry Numbers. Další velice zajímavou a podstatnou částí Medline je heslář MeSH (Medical Subject Headings). Jedná se o hierarchický řízený slovník pojmů. MeSH slouží ke standardizaci klíčových slov při popisu obsahu dokumentů, jejichž záznamy se ukládají do databází a při vyhledávání v těchto bázích. Je také možné MeSH procházet nebo v něm přímo vyhledávat. Struktura hesláře je hierarchický. Deskriptory jsou uspořádány do 16 hlavních kategorií, které se pak dále větví. Deskriptory mohou být také doplněny podhesly (např. heslo „rakovina jater“, může být upřesněno podheslem „genetika“). Pro lepší ilustraci struktury hesláře je uveden obrázek níže.
O výjimečnosti Medical Subject Headings svědčí také to, že je překládán do mnoha světových jazyků. Do češtiny ho překládá Národní lékařská knihovna v Praze. Česká verze MeSH je použita například v databázi Bibliographica Medica Czechoslovaka (BMČ).
Další důležitou informací o obsahu Medline je to, že se v posledních letech rychle zvyšuje počet záznamů, které mají k dispozici link na plný text dokumentu. V některých případech je možné dokument otevřít přímo z rozhraní PubMed. Pokud však tato situace nastane, je dokument otevřen z dalšího rozhraní PubMed Central, které v režimu otevřeného přístupu zdarma zpřístupňuje plné texty.
PubMed Central PubMed Central (PMC) je jednou z nejznámějších služeb, která zpřístupňuje vědecké materiály na bázi otevřeného přístupu. Úzká vazba na databázi PubMed garantuje této službě vysokou využívanost. Systém je specifický v tom, že zpřístupňuje bezplatně elektronické časopisy. Své seriály tak k archivaci do PubMed Central přihlašují samotní vydavatelé. Tituly přitom musí splňovat jisté kvalitativní požadavky a musí být tematicky zaměřené na vědy o životě. V současnosti už archív obsahuje více než 1.000 titulů časopisů. U každého titulu je jiná retrospektiva a mnohdy nastává i situace, že články jsou bezplatně k dispozici až po uplynutí určitého časového období. Archiv je spravován Národní lékařskou knihovnou USA a je inspirací pro vznik dalších projektů na podobné bázi, například ve Velké Británii vznikl systém UK PubMed Central, který je tematicky i funkčně shodný, akorát se geograficky orientuje na Velkou Británii.
O významu systému pro lékaře svědčí i to, že některé grantové agentury přispívající na výzkum požadují, aby byly závěry zveřejněny právě v PubMed Central. Například u americké grantové agentury National Institute of Health (NIH) je toto zpřístupňování od roku 2008 ze zákona povinné. Jen pro zajímavost tato agentura operuje s ročním rozpočtem ve výši asi 31 mld. dolarů. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
Další rozhraní, které stojí za zmínku je Medline Plus. Zajímavé je hlavně tím, že nejvíce přibližuje laikovi. Obsahuje aktuální informace o zdraví a stránky jsou přístupné zdarma. Jádrem jsou různá témata o zdraví, aktuality, umístění lékařů, specialistů, zubařů nebo nemocnic. Podstatnou součástí je také lékařská encyklopedie, kde můžeme najít rozsáhlou sbírku lékařských snímků nebo informace o asi 4000 nemocích, jejich symptomech a případných testech. Dále je obsažena databáze léků a přírodních, zejména bylinných produktů. Další možností je shlédnutí řady interaktivních zdravotních návodů. Rozhraní Medline Plus je dostupné z této URL adresy: medlineplus.gov.
Jak v MEDLINE vyhledávat? Databáze Medline nabízí možnost základního a pokročilého vyhledávání. V základním vyhledávání si uživatel může zvolit databázi, ve které chce hledat. Může například zvolit všechny databáze nebo pouze Pubmed Central, heslář MeSH, katalog Národní lékařské knihovny USA, knihy, databáze PubChem, které jsou zaměřené na chemii a řadu dalších. Po výběru databáze se dotaz zadává do jednoho vyhledávacího pole. Další možností je využití pokročilého vyhledávání, kde si uživatel může dotaz sestavit sám. Rozhraní pro sestavení dotazu se jmenuje „PubMed Advanced Search Builder“. V několika polích je možné skládat dotaz. Pro usnadnění zadávání dotazu se zobrazuje našeptávač a také můžeme použít indexy, kde lze vyhledat správné znění pojmu. Dotaz lze skládat různými způsoby, viz. obrázek níže.
Po zobrazení vyhledaných záznamů je možné aktivovat další filtry pro upřesnění požadovaného výsledku.
Použité zdroje: U.S.National Library of Medicine: National Institute of Health. U.S.National Library of Medicine [online]. 2012 [cit. 2012-06-28]. Dostupné z: http://www.nlm.nih.gov/pubs Co je MeSH. 2012. Dostupné z: http://www.nlk.cz/sluzby/pruvodce/soubory/mesh.pdf FABIÁN, Ondřej. Elektronické informační zdroje [online]. 2009 [cit. 2012-06-28]. http://texty.jinonice.cuni.cz/studijnitexty/fabianondrej/fabian_01.pdf/view?searchterm=Fabi%C3%A1n
Dostupné z:
TRLICA, Adam. Problematika Open Access a otevřené repozitáře. Opava, 2011. Bakalářská práce. Slezská univerzita v Opavě. Vedoucí práce PhDr. Ondřej Fabián.