HOGENT - Voedings- en dieetkunde - Algemene microbiologie Theorie

INHOUDSOPGAVE

1

INLEIDING.................................................................................................................................11

1.1

DEFINIËRING MICROBIOLOGIE .....................................................................................11

1.2

INDELING VAN DE ORGANISMEN .................................................................................12

1.2.1

DE MEERCELLIGE ORGANISMEN ....................................................................................12

1.2.2

DE ÉÉNCELLIGE ORGANISMEN .......................................................................................13

1.2.2.1 De bacteriën ..............................................................................................................13 1.2.2.2 De gisten ....................................................................................................................13 1.2.2.3 De protozoa ...............................................................................................................13 1.2.3 1.3

DE VIRUSSEN ..................................................................................................................13

HET BELANG VAN MICRO-ORGANISMEN ..................................................................14

1.3.1

NEGATIEVE ROL ..............................................................................................................14

1.3.2

POSITIEVE ROL ...............................................................................................................14

2

DE BACTERIE ..........................................................................................................................16

2.1

DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................16

2.2

VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................16

2.3

DE STRUCTUUR VAN DE BACTERIE............................................................................16

2.3.1

DE BACTERIËLE WAND OF PEPTIDOGLYCAAN OF CELWAND .........................................17

2.3.1.1 Bouw van de bacteriêle wand of peptidoglycaan of celwand ............................17 2.3.1.2 Belang van de bacteriële celwand .........................................................................18 2.3.2

DE CELMEMBRAAN..........................................................................................................19

2.3.3

HET CYTOPLASMA ..........................................................................................................20

2.3.4

PLASMIDEN .....................................................................................................................20

2.3.5

HET KERNMATERIAAL OF DNA ......................................................................................21

2.4

DE INDELING VAN DE BACTERIËN ..............................................................................21

2.4.1

INDELING NAAR VORM ....................................................................................................21

2.4.2

INDELING NAAR BEWEEGLIJKHEID..................................................................................21

2.4.3

INDELDING IN FUNCTIE VAN DE GRAM-KLEURING .........................................................21

2.4.4

INDELING NAAR ZUURSTOFGEBRUIK ..............................................................................21

2.4.4.1 OBLIGAAT AEROBEN ............................................................................................21 2.4.4.2 FACULTATIEF AEROBEN-ANAEROBEN ...........................................................21 2.4.4.3 OBLIGAAT ANAEROBEN .......................................................................................22 2.5

DE RELATIE GASTHEER-BACTERIE ............................................................................22

2.5.1

COMMENSALISME ...........................................................................................................22

2.5.2

PARASITISME ..................................................................................................................22

2.5.3 3

SAPROFITISME ................................................................................................................22

BESMETTINGSLEER .............................................................................................................23

3.1

DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................23

3.2

VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................23

3.3

EVOLUTIE VAN DE INFECTIEHAARD ...........................................................................23

3.3.1

DE VIRULENTIE................................................................................................................24

3.3.1.1 Het kapsel ..................................................................................................................24 3.3.1.2 Toxines .......................................................................................................................24 3.3.1.3 Vermenigvuldigingskracht .......................................................................................25 3.3.1.4 Endosporenvorming .................................................................................................26 3.3.1.5 Fimbriae .....................................................................................................................26 3.3.1.6 Flagel ..........................................................................................................................26 3.3.2

HET AANTAL BACTERIËN IN DE INFECTIEHAARD ............................................................27

3.3.3

DE BESMETTINGSWEG....................................................................................................27

3.3.4

DE IMMUNITEIT VAN DE PATIËNT ....................................................................................27

3.3.5

DE WEERSTAND VAN DE PATIËNT ..................................................................................28

3.4

VERDEDIGINGSMECHANISMEN VAN DE GASTHEER.............................................28

3.4.1

BARRIÈRES .....................................................................................................................28

3.4.1.1 De huid .......................................................................................................................28 3.4.1.2 Neus en farynx ..........................................................................................................29 3.4.1.3 De mond.....................................................................................................................29 3.4.1.4 De luchtwegen ..........................................................................................................29 3.4.1.5 Het maag-darmstelsel ..............................................................................................29 3.4.1.6 Het urinair stelsel ......................................................................................................30 3.4.1.7 De vrouwelijke genitale tractus...............................................................................30 3.4.2

VERDEDIGINGSMECHANISMEN TEGEN BINNENGEDRONGEN MICRO-ORGANISMEN.....31

3.4.2.1 ASPECIFIEKE FACTOREN....................................................................................31 3.4.2.2 SPECIFIEKE FACTOREN ......................................................................................31 3.4.3

ANDERE VERDEDIGINGSMECHANISMEN ........................................................................32

3.4.3.1 Filtersystemen ...........................................................................................................32 3.4.3.2 Interferon....................................................................................................................32 4

DIAGNOSTIEK EN BEHANDELING ....................................................................................33

4.1

DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................33

4.2

VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................33

4.3

MICROBIOLOGISCHE TECHNIEKEN ............................................................................34

4.3.1

HET MICROBIOLOGISCH ONDERZOEK ............................................................................34

4.3.1.1 De Gram-kleuring .....................................................................................................34 4.3.1.2 De Ziehl-Neelsen-kleuring.......................................................................................35 4.3.2

DE CULTUUR ...................................................................................................................35

4.3.2.1 Algemeen principe ....................................................................................................35 4.3.2.2 De hemocultuur.........................................................................................................36 4.3.2.3 De urinecultuur ..........................................................................................................36 4.3.2.4 De sputumcultuur .....................................................................................................37 4.3.2.5 De cultuur van cerebrospinaal vocht .....................................................................38 4.4

ANTIBIOTICA .......................................................................................................................38

4.4.1

SPECIFIEKE EIGENSCHAPPEN VAN ANTIBIOTICA ...........................................................38

4.4.1.1 Selectiviteit.................................................................................................................38 4.4.1.2 Het spectrum .............................................................................................................38 4.4.1.3 De bacteriële gevoeligheid ......................................................................................39 4.4.2

WERKINGSMECHANISMEN VAN ANTIBIOTICA .................................................................41

4.4.3

DE KEUZE VAN HET ANTIBIOTICUM.................................................................................42

4.4.4

MISBRUIK VAN ANTIBIOTICA ...........................................................................................42

4.4.4.1 Misbruiken .................................................................................................................42 4.4.4.2 Gevolgen....................................................................................................................42 4.4.5

RESISTENTIE ...................................................................................................................43

4.4.5.1 Natuurlijke resistentie...............................................................................................43 4.4.5.2 Verworven resistentie ..............................................................................................43 5

SYSTEMATIEK VAN BACTERIËN ......................................................................................46

5.1

DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................46

5.2

VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................46

5.3

GRAM-POSITIEVE KOKKEN ............................................................................................47

5.3.1

STAFYLOKOKKEN ............................................................................................................47

5.3.1.1 Staphylococcus aureus ...........................................................................................48 5.3.1.2 Staphylococcus epidermidis ...................................................................................49 5.3.1.3 Staphylococcus saprophyticus ...............................................................................49 5.3.2

STREPTOKOKKEN ...........................................................................................................49

5.3.2.1 Streptococcus pyogenes .........................................................................................50 5.3.2.2 Streptococcus agalactiae ........................................................................................50 5.3.2.3 Streptococcus pneumoniae of pneumokok ..........................................................51 5.3.2.4 Viridans mondstreptokokken ..................................................................................51 5.3.2.5 Enterokokken ............................................................................................................51 5.4

GRAM-POSITIEVE BACILLEN .........................................................................................52

5.4.1

BACILLUS ........................................................................................................................52

5.4.1.1 Bacillus anthracis ......................................................................................................52 5.4.1.2 Bacillus cereus ..........................................................................................................53 5.4.2

CLOSTRIDIUM SPP. .........................................................................................................53

5.4.2.1 Clostridium botulinum ..............................................................................................53 5.4.2.2 Clostridium difficile ...................................................................................................54

5.4.2.3 Clostridium perfringens ............................................................................................54 5.4.2.4 Clostridium tetani ......................................................................................................55 5.4.3

MYCOBACTERIA ..............................................................................................................56

5.4.3.1 Mycobacterium tuberculosis of de Bacil van Koch (BK) .....................................56 5.4.3.2 Mycobacterium leprae .............................................................................................57 5.4.4

LISTERIA MONOCYTOGENES ..........................................................................................57

5.4.5

CORYNEBACTERIUM DIFTERIAE .....................................................................................58

5.4.6

LACTOBACILLUS ACIDOPHILUS .......................................................................................58

5.4.7

BIFIDOBACTERIUM ..........................................................................................................59

5.5

GRAM-NEGATIEVE KOKKEN ..........................................................................................60

5.5.1

NEISSERIA GONORRHOEAE OF GONOKOK .....................................................................60

5.5.2

NEISSERIA MENINGITIDIS OF MENINGOKOK ...................................................................60

5.5.3

MORAXELLA CATHARRALIS ............................................................................................61

5.6

GRAM-NEGATIEVE COCCOBACILLEN ........................................................................61

5.6.1

BRUCELLA .......................................................................................................................61

5.6.2

BORDETELLA PERTUSSIS ...............................................................................................62

5.7

GRAM-NEGATIEVE BACILLEN .......................................................................................63

5.7.1

ENTEROBACTERIACEAE .................................................................................................63

5.7.1.1 Coliformen .................................................................................................................63 5.7.1.2 NIET – COLIFORMEN.............................................................................................65 5.7.2

NIET-ENTEROBACTERIACEAE ........................................................................................67

5.7.2.1 Haemophilus .............................................................................................................67 5.7.2.2 Pseudomonas aeruginosa ......................................................................................68 5.7.2.3 Bacteroïdes ...............................................................................................................69 5.7.2.4 Legionella...................................................................................................................69 5.8

GRAM-NEGATIEVE KOMMAVORMIGEN ......................................................................69

5.8.1

CAMPYLOBACTER JEJUNI EN COLI .................................................................................69

5.8.2

VIBRIO CHOLERAE ..........................................................................................................69

5.9

GRAM-NEGATIEVE SCHROEFVORMIGEN ..................................................................70

5.9.1

SPIROCHAETALES ...........................................................................................................70

5.9.1.1 Treponema pallidum ................................................................................................70 5.9.1.2 Borrelia burgdorferi...................................................................................................71 5.9.1.3 Leptospira ..................................................................................................................71 5.9.2 5.10

HELICOBACTER PYLORI ..................................................................................................71

ATYPISCHE BACTERIËN .................................................................................................72

5.10.1

MYCOPLASMA PNEUMONIAE ..........................................................................................72

5.10.2

CHLAMYDIA .....................................................................................................................72

5.10.2.1

Chlamydia psittaci ................................................................................................72

5.10.2.2

Chlamydia trachomatis ........................................................................................73

5.10.2.3 6

Chlamydia pneumoniae .......................................................................................73

ALGEMENE VIROLOGIE .......................................................................................................74

6.1

DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................74

6.2

VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................74

6.3

SAMENSTELLING EN MORFOLOGIE VAN HET VIRUS ............................................75

6.4

VERSCHILLEN TUSSEN VIRUSSEN EN BACTERIËN ...............................................77

6.5

VERMENIGVULDIGING VAN VIRUSSEN ......................................................................78

6.5.1

ADSORPTIE, PENETRATIE EN ONTMANTELING...............................................................78

6.5.2

VERMENIGVULDIGING VAN DNA-VIRUSSEN ..................................................................78

6.5.2.1 De vroege periode ....................................................................................................78 6.5.2.2 De late periode ..........................................................................................................79 6.5.3

VERMENIGVULDIGING VAN RNA-VIRUSSEN ..................................................................79

6.5.4

VERMENIGVULDIGING VAN BACTERIOFAGEN ................................................................80

6.6

INVLOED VAN FYSISCHE EN CHEMISCHE FACTOREN .........................................81

6.6.1

TEMPERATUUR ...............................................................................................................81

6.6.2

ZUURTEGRAAD ...............................................................................................................81

6.6.3

STRALINGEN ...................................................................................................................81

6.6.4

CHEMISCHE FACTOREN ..................................................................................................82

6.7

MICROBIOLOGISCHE TECHNIEKEN ............................................................................82

6.7.1

MICROSCOPISCH ONDERZOEK .......................................................................................82

6.7.2

DE CULTUUR OF KWEEK .................................................................................................82

6.7.2.1 Proefdieren ................................................................................................................82 6.7.2.2 Bebroede kippeneieren of kippenembryo’s ..........................................................82 6.7.2.3 Cel- en weefselculturen ...........................................................................................82 6.7.3

ANTIGEENDETECTIE .......................................................................................................83

6.7.4

MOLECULAIRE TECHNIEKEN ...........................................................................................83

6.8 7

INDELING VAN VIRUSSEN...............................................................................................83 BESPREKING VAN ENKELE VIRUSSEN ..........................................................................85

7.1

DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................85

7.2

VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................85

7.3

PAPOVAVIRIDAE ................................................................................................................85

7.3.1 7.4

HUMAAN PAPILLOMA VIRUS ............................................................................................85

DE HERPESVIRIDAE .........................................................................................................87

7.4.1

HERPES SIMPLEX VIRUS .................................................................................................87

7.4.1.1 Type 1.........................................................................................................................87 7.4.1.2 Type 2.........................................................................................................................87 7.4.2

HET HERPES ZOSTER-VARICELLA VIRUS .......................................................................87

7.4.3

HET CYTOMEGALIEVIRUS (CMV) ...................................................................................87

7.4.4

HET EPSTEIN-BARR VIRUS (EBV) .................................................................................88

7.5

POXVIRIDAE OF POKKENVIRUSSEN ...........................................................................88

7.5.1

VARIOLA ..........................................................................................................................88

7.5.2

VACCINIA .........................................................................................................................88

7.6

VIRALE HEPATITIS ............................................................................................................88

7.6.1

HEPATITIS A ....................................................................................................................88

7.6.2

HEPATITIS B ....................................................................................................................89

7.6.3

HEPATITIS C....................................................................................................................89

7.6.4

HEPATITIS D....................................................................................................................89

7.6.5

HEPATITIS E ....................................................................................................................89

7.7

PICORNAVIRIDAE ..............................................................................................................90

7.7.1

DE ENTEROVIRIDAE ........................................................................................................90

7.7.1.1 Het poliovirus.............................................................................................................90 7.7.1.2 De coxsackie A- en B-virussen ..............................................................................90 7.7.2 7.8

DE RHINOVIRIDAE ...........................................................................................................90

DE PARAMYXOVIRIDAE ...................................................................................................90

7.8.1

HET MAZELENVIRUS .......................................................................................................90

7.8.2

HET BOFVIRUS ................................................................................................................91

7.9

DE ORTHOMYXOVIRIDAE ................................................................................................91

7.10

RETROVIRIDAE...................................................................................................................92

7.11

CALICIDAEVIRIDAE ...........................................................................................................93

7.11.1 7.12

REOVIRIDAE ........................................................................................................................94

7.12.1 8

NORWALKVIRUS ..............................................................................................................93 ROTAVIRUS .....................................................................................................................94

PRIONEN ..................................................................................................................................95

8.1

DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................95

8.2

VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................95

8.3

NAAMGEVING .....................................................................................................................95

8.4

STRUCTUUR ........................................................................................................................96

8.5

CLASSIFICATIE...................................................................................................................96

8.6

WERKINGSMECHANISME ...............................................................................................96

8.7

OVERDRAAGBAARHEID ..................................................................................................97

8.7.1

FAMILIAAL........................................................................................................................98

8.7.2

INFECTIEUS .....................................................................................................................98

8.7.3

VERTICAAL ......................................................................................................................98

8.7.4

EXPERIMENTEEL .............................................................................................................98

8.8

PATHOGENESE ..................................................................................................................98

8.9

ZIEKTEBEELD .....................................................................................................................99

8.10

BEHANDELING .................................................................................................................100

8.10.1

PREVENTIE ....................................................................................................................100

8.10.2 9

TOEKOMSTPERSPECTIEVEN.........................................................................................100

BRONNEN...............................................................................................................................101