Brandon Yadier Solis Solis. Matricula: 170333
¿Qué es un nucleótido? Un nucleótido es una molécula orgánica, que en combinación con otros nucleótidos, produce ADN o ANR. Un nucleótido está compuesto de un azúcar, un fosfato y una de las bases: adenina, timina, guanina, citosina.1
¿Qué es un gen? Se conoce como gen a la cadena de ácido desoxirribonucleico (ADN), una estructura que se constituye como una unidad funcional a cargo del traspaso de rasgos hereditarios. Un gen, según los expertos, es una serie de nucleótidos que almacena la información que se requiere para sintetizar a una macromolécula que posee un rol celular específico.2 ¿Qué es una secuencia génica? La secuenciación de ADN es un conjunto de métodos y técnicas bioquímicas cuya finalidad es la determinación del orden de los nucleótidos (A, C, G y T) en un oligonucleótido de ADN. La secuencia de ADN constituye la información genética heredable del núcleo celular, los plásmidos, la mitocondria y cloroplastos (En plantas) que forman la base de los programas de desarrollo de los seres vivos.3 ¿Qué es la conservación génica? La diversidad genética es el número total de características genéticas dentro de cada especie. A mayor diversidad genética, las especies tienen mayores probabilidades de sobrevivir a cambios en el ambiente. Las especies con poca diversidad genética tienen mayor riesgo frente a esos cambios. En general, cuando el tamaño de las poblaciones se reduce, aumenta la reproducción entre organismos emparentados (consanguinidad) y hay una reducción de la diversidad genética. La diversidad genética se puede medir utilizando la diversidad de genes, la heterocigocidad, o el número de alelos por locus. 4 1
Apologetics Christian, 1995-2017. Nucleótido. Ministerio de Apologética e Investigación Cristiana. http://www.miapic.com/nucleotido-diccionario-de-ciencias 2
Julián Pérez Porto y Ana Gardey, 2012. Definición de Gen. Definición. DE. https://definicion.de/gen/ Ingeniería genética, 2017. Secuencia del ADN. http://ingenieriagen.weebly.com/la-secuenciacioacuten-deladn.html 4 Conabio, 2006. Biodiversidad genética. Biodiversidad Mexicana. http://www.biodiversidad.gob.mx/genes/divgenetica.html 3
NCBI Búsquedas en el NCBI La parte superior de la primera página del NCBI tiene una lista desplegable y una casilla donde entrar los términos de la búsqueda:
Por ejemplo, en la casilla de bases de datos seleccionamos proteínas y en la casilla de texto escribimos: "fungal disease wheat" (sin las comillas) Al hacer click en "Go" y después de unos segundos obtenemos una salida, por ahora, la parte que nos interesa de esta salida es el listado de proteínas.5
Blast. Una nueva aproximación a la comparación rápida de secuencias, la herramienta básica de búsqueda de alineación local (BLAST), se aproxima directamente a las alineaciones que optimizan una medida de similitud local, la puntuación máxima del par de segmentos (MSP). 6 La primera sección, "BLAST assembled genomes", es para buscar secuencias que sean similares a nuestra secuencia consulta en diferentes genomas que ya están secuenciados y anotados.7
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Dr. Marcelo A. Soria, 2017, Curso Introducción a la Bioinformática, Búsqueda de secuencias en NCBI. https://sites.google.com/a/agro.uba.ar/bioinformatica/Home/busqueda-de-secuencias 6
J. Mol. Biol. 5 Octubre de 1995, Herramienta básica de búsqueda de alineación local, PubMed.gov. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2231712 7
Dr. Marcelo A. Soria, 2017, Curso Introducción a la Bioinformática, NCBI – BLAST. https://sites.google.com/a/agro.uba.ar/bioinformatica/Home/clase-2