Nuevas expediciones y sublevaciones

En los siguientes años continuaron suscitándose sublevaciones indígenas, pero todas fueron reprimidas fuertemente por el poderío español. El arte de la guerra y las armas españoles ofrecieron una ventaja a los conquistadores. En1555 los indígenas mayas de las tierras bajas asesinaron al fraile dominico español Domingo de Vico, y en 1560 se produjo la reducción de Topiltepeque y del pueblo chol en Lacandón. En 1684 tuvo lugar la reducción de los pueblos indígenas de San Mateo Ixtatán y Santa Eulalia.

Sin embargo, el 13 de febrero de1597,después de dosaños detenazresistenciadelosnativos los indígenas que habitaban el territorio de Petén, se rindieron a los españoles.