ScieGuide Münster

Lehrstuhlbrosch端re 2013/14 MSc Biowissenschaften MSc Biotechnologie MSc Molekulare Biomedizin

aktualisierte Auflage von: Beate Brandhoff und Ina Schlathรถlter

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Inhaltsverzeichnis Vorwort

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btS e.V.

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Dekanat des Fachbereichs Biologie

10

Fachbereich Biologie Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP) Prof. Dr. Francisco Goycoolea Prof. Dr. Michael Hippler Prof. Dr. Jörg Kudla Prof. Dr. Bruno Moerschbacher Prof. Dr. Dirk Prüfer Prof. Dr. Paul und Bettina Tudzynski Prof. Dr. Antje von Schaewen Dr. Maik Böhmer Dr. Christian Fufezan

Institut für Evolution und Biodiversität (IEB) Prof. Dr. Erich Bornberg-Bauer Prof. Dr. Juliette de Meaux Prof. Dr. Joachim Kurtz Prof. Dr. Elisabeth Meyer Prof. Dr. Kai Müller Prof. Dr. Arndt Telschow Dr. Francesco Catania Dr. Claudia Fricke

Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie (IMMB) Prof. Dr. Susanne Fetzner Prof. Dr. Friedhelm Meinhardt Prof. Dr. Bodo Philipp Prof. Dr. Alexander Steinbüchel

13 14 16 18 20 22 24 26 28 30

33 34 36 38 40 42 44 46 48

51 52 54 56 58

4

Institut für Molekulare Zellbiologie (IMZ) Prof. Dr. Martin Bähler Prof. Dr. Andreas Püschel

61 62 64

Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie (INVB)

67

Prof. Dr. Angelika Barnekow Prof. Dr. Christian Klämbt Prof. Dr. Norbert Sachser/ Prof. Dr. Sylvia Kaiser PD Dr. Sven Bogdan

68 70 72 74

Institut für Zoophysiologie (IZP)

77

Prof. Dr. Eva Liebau Prof. Dr. Rüdiger Paul Prof. Dr. Wolf-Michael Weber

78 80 82

Weitere Arbeisgruppen am Fachbereich Biologie

84

Fachbereich Chemie und Pharmazie

87

Institut für Biochemie (IBC) Prof. Dr. Hans-Joachim Galla Prof. Dr. Karl-Heinz Klempnauer Prof. Dr. Henning Mootz

88 90 92

Institut für Pharmazeutische Biologie und Phytochemie (IPBP) Prof. Dr. Andreas Hensel

94

Institut für Pharmazeutische und Medizinische Chemie (IPMC) Prof. Dr. Joachim Jose

Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

96

99

Abteilung Prof. Dr. Ralf Adams Prof. Dr. Ralf Adams

100

5

Abteilung Prof. Dr. Hans Schöler Prof. Dr. Hans Schöler Dr. Michele Boiani Dr. Luca Gentile

102 104 106

Abteilung Prof. Dr. Dietmar Vestweber Prof. Dr. Dietmar Vestweber Prof. Dr. Martin Wild

108 110

Abteilungs-unabhängige Forschungsgruppen Prof. Dr. Wiebke Herzog Prof. Dr. Friedemann Kiefer Dr. Kerstin Bartscherer Dr. Boris Greber Dr. Sebastian Leidel Dr. Arndt Siekmann Dr. Erik Storkebaum

Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

112 114 116 118 120 122 124

127

Institut für Infektiologie Prof. Dr. M. Alexander Schmidt

128

Institut für Medizinische Biochemie Prof. Dr. Volker Gerke Prof. Dr. Klaus Ebnet PD Dr. Ursula Rescher

130 132 134

Institut für Molekulare Virologie Dr. Mario Schelhaas

136

Institut für Zellbiologie Prof. Dr. Erez Raz

Weitere Arbeisgruppen am ZMBE

138 140

6

Universitätsklinikum Münster (UKM)

141

Institut für Hygiene, Biomedizinische Massenspektrometrie Dr. Michael Mormann

142

Institut für Medizinische Mikrobiologie Prof. Dr. Karsten Becker Prof. Dr. Barbara Kahl Prof. Dr. Joachim Kühn PD Dr. Christine Heilmann Dr. Bettina Löffler

144 146 148 150 152

Institut für Medizinische Physik und Biophysik (IMPB) Prof. Dr. Jürgen Klingauf

154

Institut für Molekulare Tumorbiologie Prof. Dr. Michael Meisterernst Prof. Dr. Frank Rosenbauer

156 158

Institut für Experimentelle Muskuloskelettale Medizin (IEMM) Prof. Dr. Thomas Pap Prof. Dr. Christine Hartmann

160 162

Institut für Neuropathologie Prof. Dr. Werner Paulus

164

Institut für Pharmakologie und Toxikologie Prof. Dr. Frank Ulrich Müller

166

Klinik für Hautkrankheiten Prof. Dr. Karin Loser

168

Klinik für Kinder- und Jugendmedizin - Allgemeine Pädiatrie Prof. Dr. Heymut Omran

170

Klinik für Psychiatrie und Psychotherapie Prof. Dr. Weiqi Zhang

172

7

Klinik und Poliklinik für Kardiologie Prof. Dr. Johannes Waltenberger

174

Experimentelle Nephrologie Prof. Dr. Eberhard Schlatter/Prof. Dr. Giuliano Ciarimboli

176

Molekulare Nephrologie Prof. Dr. Hermann Pavenstädt

178

Interdisziplinäres Zentrum für Klinische Forschung (IZKF) Dr. Sabine Blaß-Kampmann

180

Zentrum für Krebsmedizin Dr. med. Jörg Haier

182

Zentrum für Reproduktionsmedizin Prof. Dr. Jörg Gromoll

184

Lageplan der Institute

186

Welches Institut ist intern/extern?

187

Notizen

188

Impressum

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Vorwort

Vorwort Liebe Studentinnen und Studenten!

In euren Händen haltet ihr die dritte Auflage der Lehrstuhlbroschüre des Fachbereichs Biologie der Westfälischen Wilhelms-Universität Münster!

Diese, in Kooperation mit der biotechnologischen Studenteninitiative (btS e.V.) Münster erstellte Broschüre, soll euch einen Einblick in die zahl-reichen naturwissenschaftlichen Arbeitsgruppen und Lehrstühle der Universität geben. Im Vordergrund stehen hierbei die Forschungsschwerpunkte der Arbeitsgruppen sowie ihre Lehrangebote für Master-Studierende des Fach-bereichs Biologie. Vielleicht findet ihr interessante Anregungen, die euren Forschergeist wecken! Dann nutzt die angegebenen Informationen und gestaltet euer Studium ganz individuell! Übrigens können viele Fortgeschrittenenmodule auch im Studiengang Master of Education belegt werden, sodass sich auch für Lehramtsstudierende ein Blick in die Broschüre lohnt!

Wir wünschen euch viel Spaß mit der neuen Lehrstuhlbroschüre und viel Erfolg im Studium!

Beate Brandhoff & Ina Schlathölter

Allgemeine Informationen zu den Master-Studiengängen findet ihr auf folgender Homepage: http://www.uni-muenster.de/Biologie/Studieren/Studiengaenge/ master_studiengaenge.html

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btS e.V.

Die btS... ist eine gemeinnützige, unabhängige und politisch neutrale Studenteninitiative, die sich als Schnittstelle zwischen Studierenden und Promovierenden, Hochschulen und Forschungsinstituten sowie Unternehmen der Life Sciences versteht.

Dabei bietet sie ein breites Spektrum an bundesweiten und lokalen Veranstaltungen und Projekten - von Studierenden für Studierende.

Dazu gehören unter anderem Firmenkontaktmessen, Exkursionen, Networking Events sowie Vorträge, Workshops und wissenschaftliche Symposien.

Mit Spaß am ehrenamtlichen Engagement sind die weit mehr als 800 Mitglieder der btS mittlerweile an über 25 Hochschulstandorten aktiv. Über das Netzwerk der studierenden Mitglieder hinaus wird die btS von engagierten Alumni sowie außerordentlichen Mitgliedern aus Professorenschaft, Industrie und weiteren Fördergesellschaften getragen. Zusätzlich ist die btS mit anderen Studenteninitiativen national sowie international vernetzt.

Für alle Interessierten bietet die btS die Chance aus kreativen Ideen durch gemeinsamen proaktiven Einsatz zukunftsorientierte Projekte zu realisieren, grundlegende Erfahrungen zu sammeln und sich persönlich weiterzuentwickeln!

Schaut einfach vorbei! Wir freuen uns auf euch!

Eure btS Münster

Hier findet ihr uns: Schlossplatz 2b (Gebäude der Fachschaftsvertretung Biologie) Homepage: https://gs.bts-ev.de/muenster/ Facebook:

https://www.facebook.com/btSMuenster

E-mail:

Vorstand.Muenster@btS-eV.de

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Dekanat des Fachbereichs Biologie

Dekanat des Fachbereichs Biologie Schlossgarten 3 48143 Münster  

0251 83 23012 dekanat.bio@uni-muenster.de

Studienkoordination Science Studiengänge  Dr. Robert Klapper

 

Zentrum für Didaktik der Biologie /Dekanat des Fachbereichs Biologie Schlossgarten 3  0251 83 24638  klapper@uni-muenster.de  Mi 830 – 12 Uhr

Schlüsselkompetenz-, Projekt- und Projektleitungsmodul  Dr. Miriam Pott (auch Beratung für ausländische Studierende und Studierende im Ausland) Zentrum für Didaktik der Biologie/Dekanat des Fachbereichs Biologie Schlossgarten 3  

 0251 83 21743  pottm@uni-muenster.de  Mi 830 – 12 Uhr

 Dr. Thomas D‘Souza Zentrum für Didaktik der Biologie/Dekanat des Fachbereichs Biologie Schlossgarten 3  

 0251 83 23832  thomas.dsouza@uni-muenster.de  Mi 830 – 12.00 Uhr

Dekanat des Fachbereichs Biologie

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Studienberatung für Master-Studiengänge des Fachbereichs Biologie  MSc Biowissenschaften Dr. Bernd Oppermann Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie Corrensstraße 3  0251 83 39823  opperma@uni-muenster.de  Do 16 - 17 Uhr und nach Vereinbarung

 MSc Biotechnologie Prof. Dr. Paul Tudzynski Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen Schlossplatz 8  

 0251 83 24998  tudzyns@uni-muenster.de  Di 12 - 14 Uhr und Do 12 - 13 Uhr

 MSc Biomedizin Prof. Dr. Andreas Püschel Institut für Molekulare Zellbiologie Schlossplatz 5   

 0251 83 23841  apueschel@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

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Institut f端r Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Prof. Dr. Francisco M. Goycoolea AG Nanobiotechnology Schlossgarten 3 48149 Münster  0251 83 24864  goycoole@uni-muenster.de  Wed 14.30 - 15.00 h

Forschungsschwerpunkte At the center of our research are self-assembled soft nanoglycomaterials that comprise polysaccharides, proteins, and proteoglycans either in isolation or combined with other functional and bioactive/therapeutic components. These materials are harnessed under “bottom-up” approaches by exploiting their inherent physico-chemical properties so that at least one dimension is in the sub -micron scale (<1000 nm). In this way, nanoparticles, nanocomplexes, nanocapsules, or nanogels can be produced. Understanding in depth the relationship between the physico-chemical characteristics of these systems and their biological activities lies at the center of our interests. The ultimate goal is to contribute to problems related to the following:

 advanced drug and gene delivery (target delivery and strategies to overcome specific epithelial barriers and increase the target and bioavailability of poorly permeable or delicate bioactive molecules (e.g. biotechnological drugs) and

 development of antibiotic-free therapeutic approaches. On the other hand, our research is driven by more fundamental questions related to the understanding of mechanisms that govern the effect and the fate of different nanoglycomaterials upon interacting with cell models of mammalian epithelia or bacteria and on approaches to describe and simulate these phenomena with physical models.

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Biopolymer Nanotechnology

WS/SS

Forschungsmodule  Nanobiotechnology

WS/SS

Masterarbeit Topic to be discussed.

Methoden  nanoparticles characterization: size distribution and zeta potential  polysacchairdes purification and characterization  nanoparticles drug association efficiency and in vitro release  nanomaterials cytotoxicity assays in mammalian cell lines  biosensor for bacterial quorum sensing controlled by acyl homoserin lactones (AHLs)

 fluorescence spectroscopic techniques to probe biopolymer interactions Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.IBBP/aggoycoolea/index.html

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Prof. Dr. Michael Hippler AG Plant Biochemistry and Biotechnology Schlossplatz 8 48143 Münster  0251 83 24790  mhippler@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Die Anpassung von photosynthetischen Organismen an Umweltstress und die Regulation der Photosynthese unter Stress - Dies sind zwei grundlegende Fragen, mit denen wir uns in der Forschung beschäftigen. Als biologisches und experimentelles Modellsystem verwenden wir für viele Fragestellungen die einzellige Grünalge Chlamydomonas reinhardtii. Molekulare und zelluläre Antworten auf Sauerstoffmangel und auf eine unterschiedliche Verfügbarkeit von Eisen und Kalzium stehen hierbei besonders im Blickpunkt. Auch sind Elektronentransferprozesse in der Photosynthese im Fokus. Neben solchen grundlegenden Fragen arbeiten wir auch an eher angewandten Fragestellungen, wie der Optimierung der Wasserstoffproduktion in C. reinhardtii und der Produktion von langkettigen Kohlenwasserstoffverbindungen in der Grünalge Botryococcus braunii. Für unsere experimentellen Ansätze ist Massenspektrometrie ein zentrales Werkzeug, so dass massenspektrometrische Methodenentwicklung ein weiteres wichtiges Forschungsfeld darstellt.

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Computational Proteomics

SS

 Methoden der funktionellen Proteomik

WS

Forschungsmodule  Molekulare Physiologie, Biochemie und Biotechnologie der Mikroalgen Masterarbeit Themen im Rahmen der Forschungsschwerpunkte.

Methoden  Molekularbiologie  Proteinbiochemie  Massenspektrometrie  optische Spektroskopie Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.IBBP/aghippler/index.html

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Prof. Dr. Jörg Kudla AG Molecular Genetics and Cell Biology of Plants Schlossplatz 4 48149 Münster  0251 83 24813  jkudla@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Analyse Calcium-abhängiger Signalprozesse in Pflanzen Funktionelle Untersuchung von Calcium-bindenden Proteinen und deren Funktion im Modellsystem Arabidopsis thaliana.

Biotechnologische Optimierung von Nutzpflanzen Generierung stresstoleranter Nutzpflanzen (verschiedene Getreidearten und Reis) mit Hilfe biotechnologischer Methoden.

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulargenetik und molekulare Zellbiologie I

WS

 Molekulargenetik und molekulare Zellbiologie II

SS

Forschungsmodule  Bearbeitung ausgewählter Themen der einzelnen Forschungsrichtungen in einem 6 - 8 wöchigen Praktikum

Masterarbeit Voraussetzung: BSc Biowissenschaften (bevorzugt Biologie Schwerpunkt Botanik oder Biotechnologie) und Module mit Schwerpunkt molekulare Biologie und Biotechnologie. Die Themen orientieren sich an aktuellen Forschungsarbeiten.

Methoden  alle modernen molekularbiologischen Methoden  Expressionsanalysen mittels real-time PCR  Hefe-Zwei-Hybrid System  in vivo BiFC Interaktions-Analysen / Laserscanning Mikroskopie  Proteinanalytik  Charakterisierung transgener Pflanzen  rekombinante Herstellung von Proteinen Homepage http://www.wwu.de/Biologie.IBBP/agkudla

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Prof. Dr. Bruno Moerschbacher AG Molecular Phytopathology and Renewable Resources Schlossplatz 8 48149 Münster  0251 83 24794  moersch@uni-muenster.de  Di 16 -17 Uhr und immer, wenn ich da bin

Forschungsschwerpunkte Wir interessieren uns für „funktionale Biopolymere“, insbesondere biologisch aktive Polysaccharide wie z.B. Chitosan, das aus einem der häufigsten nachwachsenden Rohstoffe, Chitin, hergestellt wird und das Pflanzen vor Krankheiten schützen und Wunden ohne Narben heilen lassen kann. Wir verfolgen unsere Projekte in internationalen Kooperationen mit Partnern überwiegend aus Europa, Indien, Südafrika und Brasilien.

Europ. Projekt PolyModE (www.polymode.eu): Suche nach neuartigen Chitosan-modifizierenden Enzymen und deren Optimierung, um mit ihrer Hilfe Designer-Chitosane herstellen zu können.

Europ. Projekt ChitoBioEngineeering (www.uni-muenster.de/CBE-Project): Biotechnologische Herstellung definierter Chitosan-Oligomere mit optimierten Enzymen in bakteriellen Produktionsstämmen.

Deutsch-Indisches Projekt CuChi-BCA (www.uni-muenster.de/CuChi-BCA): Kombination von Kupfer-beladenen Chitosan-Nanopartikeln mit chitosanolytischen, kupfertoleranten und pflanzenstärkenden Bodenorganismen, um eine synergistische Wirkung zu erzielen, die es erlaubt, den Einsatz kupferhaltiger und anderer chemischer Pflanzenschutzmittel zu reduzieren.

Deutsch-Indisches Graduiertenkolleg Molecular and Cellular Glyco-Sciences (www.uni-muenster.de/MCGS)

Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molecular Bio-Engineering I

WS

 Molecular Bio-Engineering II

SS

 Molecular Phytopathology

SS

(gemeinsam mit der AG Tudzynski und AG Prüfer)

Forschungsmodule  Biochemistry and Biotechnology (WS oder SS): Mitarbeit an einem aktuellen Forschungsprojekt der AG

 Molecular and Cellular Biochemistry (SS): Mitarbeit an einem aktuellen Forschungsprojekt in einer MCGS-AG (der Universität Hyderabad in Indien (www.uni-muenster.de/mcgs)

Masterarbeit In der Regel Forschungsmodul in der AG Moerschbacher.

Methoden  moderne Methoden der Biochemie, z.B. Elektrophorese (SDS-PAGE, IEF, 2D-PAGE, native PAGE, Zymographie), Chromatographie (HPLC, HPAEC, HPSEC, HPTLC, GLC), Bioanalytik (Bioaktivitätstests, Massenspektrometrie), Enzymatik (Photometrie, Kinetik), Bioinformatik (3D Proteinstrukturmodellierung, Liganddocking)

 moderne Methoden der Molekulargenetik, z.B. Genidentifizierung (Genomik, Metagenomik), Klonierung und Expression (Bakterien, Hefen, Pflanzen), protein engineering (site-directed mutagenesis, domain swapping), metabolic engineering (neue Stoffwechselwege)

Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.IBBP/agmoerschbacher/

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Prof. Dr. Dirk Prüfer AG Plant Biotechnology Schlossplatz 8 48149 Münster  0251 83 22302  dpruefer@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Funktionelle und angewandte Genomforschung zur molekularen Charakterisierung und gezielten Veränderung der pflanzlichen Biopolymere Stärke, Kautschuk, Inulin, und P-Proteine/Forisome. Ein weiterer Schwerpunkt bildet die Analyse regulativer Prozesse während der Blütenentwicklung mit dem Ziel der Biomassesteigerung.

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Biotechnologie der Pflanzen

WS/SS

 Biosicherheit transgener Organismen

SS

 Molekulare Phytopathologie

SS

(gemeinsam mit der AG Tudzynski und AG Moerschbacher)

Forschungsmodule  themenbezogene Forschungsmodule im Arbeitskreis (WS/SS)  externe Forschungsmodule (Inland/Ausland; auf Anfrage) Masterarbeit FoM in unserer AG. Studierende aller drei MSc-Studiengänge sind willkommen.

Methoden  alle Teilbereiche der rekombinanten DNA Technik  Proteinanalytik  Funktionelle Genanalyse in transgenen Organismen Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.IBBP/agpruefer/index.html

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Prof. Dr. Paul Tudzynski Prof. Dr. Bettina Tudzynski AG Molecular Biology and Biotechnology of Fungi Schlossplatz 8 48149 Münster  

0251 83 24998 (P. Tudzynski) 24801 (B. Tudzynski) tudzyns@uni-muenster.de Bettina.Tudzynski@uni-muenster.de  Di 12 - 14 Uhr und Do 12 - 13 Uhr (P. Tudzynski) Di 11 - 13 Uhr (B. Tudzynski)

Forschungsschwerpunkte Molekularbiologie der Pilze:

 Molekulare Biotechnologie (Sekundärmetabolismus; vergleichende Genomanalysen zur Identifikation neuer Metabolite (“genome mining“); Regulation der Genexpression durch globale und Stoffwechsel-spezifische Regulatoren bzw. Histonmodifikationen; Metabolic Design

 Molekulare Phytopathologie (Signalkaskaden; Rolle von aktiven Sauerstoffspezies, Stress und Pathogenität)

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Genetik und Molekularbiologie der Pilze

WS

 Molekulare Biotechnologie der Pilze

SS

 Molekulare Phytopathologie

SS

(gemeinsam mit der AG Tudzynski und AG Moerschbacher)

Forschungsmodule  Molekularbiologie der Pilze: Signaling und Entwicklung in biotechnologisch und phytopathologisch relevanten Prozessen (ganzjährig, nach Vereinbarung)

Masterarbeit Voraussetzungen: Forschungsmodul (oder BSc Arbeit) in der AG; MSc Biowissenschaften/ MSc Biotechnologie.

Methoden  Klonierung im Hefesystem  Genexpression (Northern, Q-RT PCR)  Transformation von Pilzen (knock-out, Überexpression, Reportergene)  Live-Imaging (Fluoreszenz-/konfokale Lasermikroskopie)  Fermentation (Sekundärmetabolite)  Genomics-Ansätze  Proteininteraktionen Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.IBBP/agtudzynski/index.html

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Prof. Dr. Antje von Schaewen AG Molecular Physiology of Plants Schlossgarten 3 48149 Münster  0251 83 23817  schaewen@uni-muenster.de  täglich 13 - 14 Uhr

Forschungsschwerpunkte Molekulare Physiologie, Zellbiologie & Biotechnologie höherer Pflanzen

 Pflanzlicher Primärstoffwechsel, speziell Kompartimentierung von Isoformen des oxidativen Pentose-Phosphatweges (OPPP) im Cytosol, in Plastiden, und/oder Peroxisomen, sowie ihr Einfluss auf die pflanzliche Entwicklung bzw. Stress-Toleranz.

 Rolle der N-Glykosylierung bei sekretierten Proteinen für die jeweilige Funktion, während der Pflanzen-Entwicklung und bei Stress (abiotisch/biotisch). .

Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Pflanzenphysiologie I (6 Plätze)

WS

 Molekulare Pflanzenphysiologie II (6 Plätze, momentan ausgesetzt) Forschungsmodule  aktuelle Themen unserer Forschung (je 2 Plätze im WS oder SS) Masterarbeit Interesse an Pflanzenwissenschaften (ZPG-Modul, Vertiefungsmodule, Fortgeschrittenenmodule und/oder Forschungsmodule in einer AG des IBBP oder in einem Institut einer anderen Universität).

Methoden  molekularbiologische Standard-Techniken: RT-PCR, FragmentKlonieren in Vektoren für E. coli, Hefen und Pflanzen (binär), cDNABank-Analysen, site-directed mutagenesis, Mutantenanalysen, etc.

 biochemisch/physiologische Methoden: Zell-Fraktionierung, EnzymMessungen, Proteinbestimmung und -Anreicherung mittels Affinitätschromatografie, Antkörper-Produktion, Western-Blot, in situ Lokalisierung, N-Glykosylierungstests, Chlorophyll-Bestimmung, Wachstumsparameter, hormonale Antworten.

 Biotechnologie: Herstellung und Analyse transgener Pflanzen zur Überexpression (transient/stabil) bzw. RNAi-Suppression von Zielgenen in Höheren Pflanzen (Arabidopsis, Tabak, Tomate, Kartoffel)

 Zellbiologie: Konfokale Lichtmikroskopie (CLSM-Analysen fluoreszierender Reporter) in diversen Kompartimenten, Zeitreihen nach Photokonversion bzw. Inhibitor-Gaben/Erholung

Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.IBBP/agpruefer/index.html

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Dr. Maik Böhmer AG Signaling mechanisms in Plants Schlossplatz 4 48143 Münster  0251 83 24841  m.boehmer@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  Interaktion von Schädlingsbefall und Trockenstress in der Signaltransduktion im Modellorganismus Arabidopsis thaliana

 Einfluss von WRKY Transkriptionsfaktoren auf die Inhibition der Samenkeimung durch das Trockenhormon Abscisinsäure (ABA)

 Analyse von frühen Signalprozessen in Arabidopsis thaliana unter dem Einfluss von Schwerelosigkeit (Mikrogravitation) [in Kollaboration mit dem Deutschen Zentrum für Luft-und Raumfahrt]

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulargenetik und molekulare Zellbiologie I

WS

 Molekulargenetik und molekulare Zellbiologie II

SS

Forschungsmodule  Bearbeitung ausgewählter Themen nach Vereinbarung Masterarbeit BSc Biowissenschaften und Module mit Schwerpunkt molekulare Biologie und Biotechnologie. Ein Teil der Experimente von Masterarbeiten im Bereich der Schwerelosigkeit werden in Köln am DLR stattfinden, Vergütung als HiWi möglich.

Methoden  Pflanzenbiochemie (Kinaseassays, Proteinaufreinigung)  Molekularbiologie (Klonierungen, Microarrays)  Pflanzenbiotechnologie  Massenspektrometrie  Interaktion und subzelluläre Lokalisationsstudien von Proteinen (Fluoreszenzmikroskopie, Hefe-Eins-Hybrid, Hefe-Zwei-Hybrid, BiFC)

 Untersuchung von Pflanzen unter Mikrogravitation mittels Klinostat (am Deutschen Zentrum für Luft- und Raumfahrt)

Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.IBBP/agboehmer/index.html

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Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

Dr. Christian Fufezan AG Singlet oxygen damage to Proteins Schlossplatz 8 48143 Münster  0251 83 24861  fufezan@uni-muenster.de  Mo 11 - 12 Uhr

Forschungsschwerpunkte  reactive oxygen species (ROS) network  method development of mass spectrometrical bioinformatics  high through-put „data mining“

Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen (IBBP)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  mass spectrometry data analysis  insights into advanced computational proteomics  distributed computing Forschungsmodule  ROS network analysis  advanced computational proteomics – label free quantification  advanced computational proteomics – quantification and identification in metabolomics

 mongoDB and mass spectrometry data analysis Masterarbeit not specified

Methoden  computational proteomics  mass spectrometry/ quantitative proteomics  fluorescence spectroscopy Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.IBBP.AGFufezan/

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Institut f체r Evolution und Biodiversit채t (IEB)

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Prof. Dr. Erich Bornberg-Bauer AG Evolutionary Bioinformatics Hüfferstraße 1 48149 Münster  0251 83 21630, 0160 4487493  ebb@wwu.de  Di 1030 – 1130 Uhr tel. Anfrage empfohlen

Forschungsschwerpunkte The Molecular Basis of Phenotypic Innovations: Broadly speaking, we use simulations, transcriptomics (aka RNAseq), genomic data and wet-lab experiments to investigate the phenotypic effects of genotypic changes. We are primarily concerned with the question of how molecular changes cause new phenotypes to emerge. For example, we ask how multicellularity has arisen and how complex new organs such as the placenta were created in first place. Furthermore, we want to understand which of the zillions of possible evolutionary paths at the molecular level are facilitated or hindered by biophysical constraints which govern structure and function of proteins and RNAs. For example, we aim to understand how evolution has created complex multi-functional enzymes and how we can exploit such evolutionary principle for new methods in biotechnological design of proteins. Finally, we ask how novel genes emerge, in particular in animal genomes, and what their possible effects are.

Research areas

 evolutionary molecular design: using high throughput screening for next generation biotechnology

 modular evolution of proteins: dynamics and adaptive benefits of domain rearrangements

 genome evolution: emergence of novel genes  regulatory network evolution: molecular causes and phenotypic consequences in development

Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Computational Biology: Python  Molecular Evolution and Phylogenesis (together with Prof. Kai Müller)  Computational molecular biology (coordinated by Dr. Sarah Behrens) Forschungsmodule  projects in computational, experimental and statistical evolutionary genome analysis (can be arranged any time upon mutual agreement)  computational and experimental aspects of evolutionary protein design (can be arranged any time upon mutual agreement, WS/SS)

Masterarbeit You will need to be willing to communicate in English. If you wish to work experimentally, you should have basic skills in cloning, protein purification and functional characterisation of proteins. If you wish to work with computers, you should be familiar with basics of scripting languages, preferably python or perl but generally these can be easily learned along the lines if you have some background e.g. in C or JAVA. With regard to bioinformatic skills you should have attended some basic courses in bioinformatics and understand the principles behind sequence comparison and the structure of the most widely used databases. Generally, you should also be willing to work a couple of weeks or months abroad with some of our collaboration partners.

Methoden  experimentally: Protein design and purification, evolutionary biotechnology using in vivo selection in assays, lab-on a chip.  computationally: Ancestral sequence reconstruction, structural analysis of proteins and RNA, epigenetic control analysis using transcriptome and genome data, phylogenetic methods, testing for signs of adaptation, analysis of cellular complex networks.

Homepage bornberglab.org

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Prof. Dr. Juliette de Meaux AG Plant Molecular Evolution Hüfferstraße 1 48149 Münster  0251 83 21095  juliette.de.meaux@uni-muenster.de  Mo 12 - 13 Uhr

Forschungsschwerpunkte Our research seeks to reconstruct the recent history of adaptive molecular variation in the weedy annual and model plant species Arabidopsis thaliana. We are especially interested in the accurate characterization of adaptively relevant variation. This is the necessary path to illuminate our understanding of the molecular basis of adaptation in plants. Therefore we focus on:

 phenotypic evolution in A. thaliana: seed dormancy, immunity, flowering time

 cis-regulatory evolution  the role of miRNA in adaptation

Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Evolutionary Genetics:

SS

Inititation to population-, quantitative and/or ecological genetics and genomics.

Forschungsmodule The genetic (and epigenetic) basis of plant adaptation: module taylored on the individual needs of the student.

Masterarbeit Successful completion of modules in botany, biochemistry, bioinformatics or evolutionary biology.

Methoden  molecular methods of evolutionary genetics: PCR, sequencing, qRTPCR, transcriptomics, genotyping, sequencing, chromatin immunoprecipitation

 population genetics: DNAsp and other population genetics programms

 statistics: QTL mapping, quantitative genetics, ANOVA and co.  ecology: genetics in the field, measurements of fitness  bioinformatics: NGS sequencing Homepage http://ieb.uni-muenster.de/plantmolevol

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Prof. Dr. Joachim Kurtz AG Animal Evolutionary Ecology Hüfferstraße 1 48149 Münster  0251 83 24661  joachim.kurtz@uni-muenster.de  nach Vereinbarung per E-mail

Forschungsschwerpunkte Wir beschäftigen uns mit der Parasit-Wirt-Coevolution und der Evolution von Immunsystemen. Als Modellorganismen dienen Mehlkäfer, Fruchtfliegen und der Dreistachlige Stichling.

Die wechselseitige Anpassung von Wirten und Parasiten kann zu extrem rascher, evolutiver Veränderung führen, und stellt damit ein gutes Modell dar, um Evolutionsprozesse zu untersuchen. Wir untersuchen den evolutiven Wettlauf von Wirten und Parasiten durch experimentelle Coevolution von Mehlkäfern mit einem Mikroparasiten, dem Bakterium Bacillus thuringiensis.

Zur Analyse der genetischen Grundlagen der Anpassung nutzen wir Techniken des sog. Next Generation Sequencing (NGS). Weitere Forschungsarbeiten der AG zeigen, dass Insekten, entgegen bisheriger Annahmen, über spezifische adaptive Immunität verfügen. Wir untersuchen, ob Varianten des Down syndrome cell adhesion molecule (DSCAM) bei Insekten spezi‥sche Immunität vermitteln können.

Die Forschungsarbeiten mit Stichlingen fokussieren auf Parasit-Wirt-Interaktionen und nutzen eine Bandwurminfektion der Stichlinge als Infektionsmodell. Der Bandwurm ist in der Lage, das Immunsystem seines Wirtes zu manipulieren, um seine Entwicklung im Wirt zu ermöglichen. Wenn der Parasit geschlechtsreif wird, manipuliert er das Verhalten infizierter Stichlinge in einer Weise, dass die Prädation der Fische durch den Endwirt erleichtert wird.

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Wirt-Parasit Coevolution (Host-Parasite Coevolution)

WS

 Evolutionäre Medizin (Evolutionary Medicine)

SS

 Integrative Studien: Heimische Lebensräume (für MEd)

SS

Forschungsmodule  Ökologische Immunologie und Wirt-Parasit Coevolution (WS und SS) Masterarbeit Kenntnisse der Evolutionsbiologie; Kenntnisse aus einigen der oben angegebenen Module sind eine sinnvolle, aber nicht zwingend notwendige Voraussetzung; alle Studiengänge möglich, insbesondere Biowissenschaftler.

Methoden  Methoden der Evolutionsbiologie (div. experimentelle Methoden, phylogenetische Analysen, (Infektionsassays)

DNA-Sequenzvergleiche)

und

Parasitologie

 Immunbiologie (FACS, Phagozytose, Spektrophotometrie, Lumineszenz, Fluoreszenzmikroskopie)

 Molekularbiologie (PCR, qRT-PCR, Klonierung, Sequenzierung)  Proteinbiochemie, Mikrobiologie und Genomik (NGS, Transkriptomik, Resequenzierung)

Homepage http://ieb.uni-muenster.de/evolseco

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Prof. Dr. Elisabeth Meyer AG Limnology Hüfferstraße 1 48149 Münster  0251 83 23881  meyere@uni-muenster.de  Mo 11 - 12:30 Uhr

Forschungsschwerpunkte  Biodiversität temperierter und tropischer Fließgewässerökosysteme  limnische Biogeographie; Vorkommen und Ausbreitung invasiver Gewässerorganismen

 Life performance, Stressökologie und Konkurrenzverhalten heimischer und invasiver Bachflohkrebse

 Populationsökologie, Populationsgenetik  Ökologie der Chironomidae  Grundwasserorganismen  Restaurierung urbaner Gewässer  Ökosystemare Prozesse

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Wirbellose Süßwassertiere (Freshwater Invertebrates)

WS

 Ecology and Evolution of Freshwater Organisms

SS

 Applied biostatistics using R - the practice of experimental design and inference

Forschungsmodule  Limnologische Arbeitsmethoden/Experimentelle aquatische Ökologie (WS/SS) Teil 1: Grundlagenmethoden Limnologie (Freiland- und Labormethoden), taxonomische Grundlagen, Grundlagen der Gewässerbewertung Teil 2: Begleitend zu aktuellen Forschungsprojekten Konzeption und Durchführung von Experimenten

Masterarbeit BSc Biowissenschaften oder BSc in einem umweltwisschenschaftlichen Bereich und Motivation.

Methoden  Freiland: qualitative und quantitative Probennahmen, hydromorphologische und physiko-chemische Messungen, Freilandexperimente

 Institut/Labor: Hälterungsmethoden, experimentelle Studien (Autökologie, Verhalten, Physiologie), Mikroskopie, Videobeobachtung und -mikroskopie, Bildanalyse, Präparation, Morphologie, Taxonomie, molekularbiologische und biochemische Analysemethoden, statistische Auswertungen

Homepage http://www.uni-muenster.de/Limnology/

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Prof. Dr. Kai Müller AG Evolution and Biodiversity of Plants Hüfferstraße 1 48149 Münster  0251 83 21645  kaimueller@uni-muenster.de  E-mailen oder einfach vorbeischauen (irgendwer ist immer da und kann helfen)

Forschungsschwerpunkte Die AG erforscht die Evolution pflanzlicher Biodiversität sowie deren molekulare Grundlagen. Hierbei werden vordergründig Hypothesen zur zeitlichräumlichen Diversifikation und zur Evolution von Schlüsselinnovationen verschiedener Blütenpflanzengruppen getestet unter Verwendung versch. phylogenetischer, wie auch molekularbiol. und experimenteller Ansätze, welche auch die Arbeit mit modernen molekularbiol. Hochdurchsatzmethoden (z.B. massive parallel sequencing) umfassen. Ein aktueller Schwerpunkt unserer Arbeit ist die Erforschung der Evolution parasitisch lebender Blütenpflanzen sowie die Untersuchung der molekularen Evolution pflanzlicher Parasiten, ihrer Ökologie und Interaktion mit Wirten sowie abiotischen Faktoren. Darüber hinaus arbeiten wir an grundlegenden Fragen zur Genomevolution, insbesondere bei Gruppen mit ungewöhnlichen Ernährungsformen, zu denen neben parasitischen auch karnivore Pflanzen zählen. Als Modellgruppe für fleischfressende Pflanzen untersuchen wir die extrem spezialisierten Vertreter der Ordnung Lamiales. Die Untersuchung von Mutationsdynamiken, aber auch von Ökologie, Systematik und Taxonomie stellen auch bei anderen Pflanzengruppen weitere Themen dar. Im Zusammenhang mit diesen Fragestellungen ist die AG auch in der Entwicklung bioinformatischer Methoden und Software aktiv.

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molecular Phylogenetics  Molecular and Evolutionary Biology of

WS SS

Plant-Environment Interactions

 botanische Alpenexkursion (begrenzte Teilnehmerzahl)

SS

Forschungsmodule  Forschungsmodule sind zu jedem der oben genannten und frei wählbaren Themenbereiche ganzjährig möglich

 Für die Mitarbeit in Projekten zu molekular-phylogenetischen bzw. bioinformatischen Methoden und Softwareentwicklung sind Grundkenntnisse einer Programmiersprache vorteilhaft, z.B. Java, Perl, Python…

Masterarbeit Für eine Masterarbeit sind gute Grundlagenkenntnisse moderner evolutionsund molekularbiol. Methoden und Kenntnisse bzgl. der Systematik und Evolution von Pflanzen vorteilhaft, aber nicht zwingend notwendig; Eine Masterarbeit mit Schwerpunkt Bioinformatik/Softwareentwicklung erfordert Grundkenntnisse einer Programmiersprache.

Methoden  alle gängigen molekularbiologischen Methoden zur DNA/RNA Analyse, Fluoreszenz in situ Hybridisierung (FISH, GISH)

 evolutionsbiologische Methoden inkl. Sequenzdatenanalyse und phylogenetisch-statistische Rekonstruktionsverfahren

 Bioinformatik inkl. Prozessierung, Assemblierung und Analyse von mittels Hochdurchsatzmethoden generierten Daten

 morphometrische Analysen, Infektionsassays Homepage http://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/de/

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Jun. Prof. Dr. Arndt Telschow AG Genome Evolution Hüfferstraße 1 48149 Münster  0251 83 21637  telschow@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  Artbildung, Biodiversität, Emerging diseases, Evolution von Virulenz und Resistenz, Genetische Konflikte, Parlament der Gene, PflanzenBestäuber Netzwerke, Symbiose

 intrazelluläre Bakterien (Wolbachia), parasitsche Wespen (Nasonia), Tierkrankheiten (Koi herpes Virus), humane Pathogene (Dengue Virus), territoriale Korallenfische (Damsel fish)

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Mathematische Modelle in der Biologie I

WS

 Mathematische Modelle in der Biologie II

SS

Forschungsmodule  Theoretische Biologie, Genomevolution und Systembiologie

WS/SS

Masterarbeit Voraussetzung: Forschungsmodul in der AG.

Methoden  mathematische Modellierung (Differential- und Differenzengleichungen)  biologische Netzwerke  evolutionäre Spieltheorie  (nichtlineare) Zeitreihenanalyse  Bioinformatik  Programmierung (Mathematika, C, R, Perl) Homepage http://ieb.uni-muenster.de/genevol

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Dr. Francesco Catania AG Evolutionary Cell Biology Hüfferstraße 1 48149 Münster  0251 83 21222  francesco.catania@uni-muenster.de  Mo 10 - 12 Uhr

Forschungsschwerpunkte What I am primarily interested in my research work is to understand the processes that govern the evolution of genomes and gene architecture in eukaryotes, including both single-celled and multicellular organisms. We employ both comparative genomics analyses and experimental tools to gain insight into how genomes evolve, how novel gene structures and functions arise and what and how (epi)genetic novelties cause key biological events such as speciation or diseases.

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  The growth of the evolutionary thought

WS

 Evolutionary medicine

SS

Forschungsmodule  The evolution of gene expression and architecture  RNA splicing  DNA splicing Masterarbeit not specified

Methoden  programming languages (e.g. PERL, PYTHON)  sequence database search  routine laboratory techniques (e.g. DNA and RNA extraction, sequencing and real time quantitative PCR)

Homepage http://ieb.uni-muenster.de/evolcell

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Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

Dr. Claudia Fricke AG Evolution & Sexual Conflict Hüfferstraße 1 48149 Münster  0251 83 21042  claudia.fricke@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Wir erforschen verschiedene Aspekte der männlichen und der weiblichen Fortpflanzung, um besser verstehen zu lernen, welche evolutionären Prozesse die untersuchten reproduktiven Merkmale geformt haben. Wir studieren sexuelle Interaktionen zwischen Männchen und Weibchen und benutzen für unsere Untersuchungen hauptsächlich die Fruchtfliege Drosophila melanogaster als bewährten Modellorganismus. Wir führen Experimente durch, um verschiedene offene Fragen in den Themengebieten Sexuelle Selektion, Sexuelle Konflikte und Spermienkonkurrenz zu beantworten.

Institut für Evolution und Biodiversität (IEB)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  nach Absprache und im Bereich der laufenden Forschungsarbeiten Masterarbeit Nach Absprache und im Bereich der laufenden Forschungsarbeiten.

Voraussetzung sind erfolgreich abgeschlossene Kurse, die evolutionsbiologische Kenntnisse vermitteln.

Methoden  Verhaltensstudien  Experimentelle Evolutionsstudien  Paarungsstudien Homepage http://ieb.uni-muenster.de/evolseco

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Institut f端r Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie (IMMB)

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Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie (IMMB)

Prof. Dr. Susanne Fetzner Corrensstraße 3 48149 Münster  0251 83 39824  fetzner@uni-muenster.de  Mo 16 - 18 Uhr oder nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  bakterielle Stoffwechselwege Aufklärung von Stoffwechselwegen des bakteriellen Abbaus sowie der Biosynthese biologisch aktiver Heteroaromaten: Charakterisierung der beteiligten Enzyme und Gene; Untersuchung der molekularen Grundlagen der Regulation.

 Enzymbiochemie Enzyme zur Modifizierung und Spaltung von biologisch aktiven Heteroaromaten, z.B. Chinolonen und Flavonolen: Untersuchung der physiologischen Bedeutung und der Katalysemechanismen.

 Quorum sensing-Interferenz Enzyme zur Inaktivierung von Signalstoffen der bakteriellen Kommunikation.

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Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie (IMMB)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Enzymbiochemie

WS/SS

Forschungsmodule  individuelle Projektarbeiten in den Themenbereichen Enzymbiochemie, Regulation von Stoffwechselwegen, Alkylchinolon-Stoffwechsel, Quorum -sensing-Interferenz

Masterarbeit Voraussetzung: Forschungsmodul im Arbeitskreis.

Methoden  verschiedene Methoden der Proteinbiochemie und Molekularbiologie;  weitere Informationen im online-Modulhandbuch des Fachbereichs Biologie

Homepage http://mibi1.uni-muenster.de/Biologie.IMMB.Fetzner/index.html

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Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie (IMMB)

Prof. Dr. Friedhelm Meinhardt Corrensstraße 3 48149 Münster  0251 83 39825  meinhar@uni-muenster.de  Fr 14 - 15 Uhr oder nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  extrazelluläre Enzyme und Genregulation bei Vertretern der Gattung Bacillus im Hinblick auf Stammverbesserung. Mitglied der vom BMBF im Rahmen der „Innovationsinitiative Industrielle Bio-technologie“ geförderten strategischen Innovationsallianz: Natural Life Excellence Network 2020 (NatLifE 2020).

 Struktur und Funktion von Virus Like Elements (VLEs) in Hefen und der von ihnen kodierten Ribotoxine.

Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie (IMMB)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  mikrobielle Molekularbiologie

WS/SS

Forschungsmodule  mikrobielle Molekularbiologie, Projektstudium, jederzeit nach Vereinbarung

Masterarbeit Voraussetzung: Forschungsmodul im Arbeitskreis.

Methoden  breites Spektrum moderner und klassischer molekularbiologischer und molekulargenetischer Methoden

Homepage http://mibi1.uni-muenster.de/Biologie.IMMB.Meinhardt/Index.html

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Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie (IMMB)

Prof. Dr. Bodo Philipp AG Mikrobielle Biotechnologie Corrensstraße 3 48149 Münster  0251 83 39827  bodo.philipp@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Wir untersuchen ausgesuchte Aspekte der mikrobiellen Ökologie und Physiologie mit dem Ziel, neue biotechnologische Anwendungen zu finden. Im Fokus stehen der bakterielle Stoffwechsel sowie chemische und zelluläre Interaktionen zwischen Mikroorganismen.

Hinsichtlich des Stoffwechsels untersuchen wir aktuell neue Stoffwechselwege, über die Bakterien Steroidverbindungen transformieren oder vollständig abbauen. Diese Untersuchungen sind für die biotechnologische Produktion von Steroid-Wirkstoffen und den Umweltschutz relevant, da biologisch wirksame synthetische Steroide in Abwässern schlecht abgebaut werden und im Verdacht stehen, die Fertilität von Menschen und Tieren zu beeinflussen.

Hinsichtlich mikrobieller Interaktionen untersuchen wir zelluläre Interaktionen (Zellaggregation, Biofilmbildung) und chemische Interaktionen (Antibiose, Kommunikation). Wir nutzen dabei synthetische Mikrobengemeinschaften, um Prinzipien von mikrobiellen Interaktionen aufzuklären und diese biotechnologisch zu nutzen (community engineering). Dabei stehen die Verbesserung von Biotransformationen und die Suche nach neuen Wirkstoffen, um den Stoffwechsel und das Wachstum von Mikroorganismen zu beeinflussen, im Vordergrund. Auch die Verhinderung der Biofilmbildung (Antifouling) gehört zu unseren Forschungsinteressen.

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Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie (IMMB)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Bakterieller Abbau organischer Verbindungen

SS

Stoffwechselwege, Zell-Zell-Interaktionen und biotechnologische Anwendungen (8-10 Plätze)

 ein weiteres spezialisiertes Fortgeschrittenenmodul ist in Planung Forschungsmodule  Mitarbeit in einem aktuellen Forschungsprojekt zu den Themen bakterieller Stoffwechsel oder mikrobielle Interaktionen; ganzjährig nach Vereinbarung, ca. 4 Plätze pro Jahr

Masterarbeit Alle biowissenschaftlichen Studiengänge (Fortgeschrittenen- oder Forschungsmodul in der AG sinnvoll, aber keine Voraussetzung).

Methoden  physiologische Untersuchungen: Wachstums- und Zellsuspensionsexperimente; Anreicherung, Isolierung und Charakterisierung von Mikroorganismen

 biochemische Untersuchungen: Enzymatische Assays, HLPLCAnalytik, UV/VIS-und fluoreszenzspektroskopische Untersuchungen

 molekulargenetische

Untersuchungen: Herstellung definierter Deletionsmutanten, Transposonmutagenese, Herstellung von Reporterstämmen, Transkriptionsstudien

Homepage http://mibi1.uni-muenster.de/ Biologie.IMMB.Philipp/index.html

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Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie (IMMB)

Prof. Dr. Alexander Steinbüchel Corrensstraße 3 48149 Münster  0251 83 39821  steinbu@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte 

mikrobielle Synthesen von Triglyceriden und Wachsestern (auch Biotreibstoffe und Mikrodiesel)



mikrobielle Synthesen und Abbau von Biopolymeren (Cyanophycin, Polyester und Polythioestern, Kautschuk) sowie deren biotechnologische Produktion

Ralstonia eutropha Zelle

PDHB-Flasche

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Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie (IMMB)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Biotechnologie der Mikroorganismen - Polyphasische

WS

Taxonomie

 Biotechnologie der Mikroorganismen - Technisch

WS/SS

relevante Bioprodukte

 Biotechnologie der Mikroorganismen - Isolierung

WS

und Charakterisierung biotechnisch relevanter Enzyme

 Marine Nahrungsketten: Mikrobielle Primärproduktion

SS

und Stoffwechsel

Forschungsmodule  Molekularbiologie biotechnisch relevanter Stoffwechselwege (SS und WS) Bearbeitung eines individuellen eigenständigen Forschungsprojektes, das in eines der laufenden Forschungsvorhaben des Arbeitskreises (s. o.) eingebunden ist.

Masterarbeit Voraussetzungen: Fortgeschrittenenmodule und Forschungsmodul im Arbeitskreis; bevorzugte Studiengänge Biowissenschaften & Biotechnologie

Methoden  Molekularbiologie  Biochemie  Analytik (HPLC, GC, GPC, MS)  Fermentationen bis zum 500L-Maßstab Homepage http://mibi1.uni-muenster.de/Biologie.IMMB.Steinbuechel/Index.html

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Institut f端r Molekulare Zellbiologie (IMZ)

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Institut für Molekulare Zellbiologie (IMZ)

Prof. Dr. Martin Bähler AG Molekulare Zellbiologie Schlossplatz 5 48149 Münster  0251 83 23841  baehler@uni-muenster.de  Mi 11 - 12 Uhr oder nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Wir untersuchen die zellulären und molekularen Funktionen ausgewählter Aktin-abhängiger Motormoleküle. Gegenwärtig konzentrieren wir uns auf drei unterschiedliche Motormoleküle: je eines das wichtig ist für die Hirnentwicklung, die Immunantworten und die Dynamik der Mitochondrien. Das Fehlen dieser Motormoleküle führt zur Ausbildung eines Wasserkopfes, zu mangelhaften angeborenen und erlernten Immunantworten, sowie zu degenerativen Erkrankungen. Wir wollen die zu Grunde liegenden molekularen Mechanismen aufklären und verstehen. Dazu verwenden wir ein breites Spektrum moderner Methoden und arbeiten zusätzlich mit anderen Arbeitsgruppen zusammen.

Weitere Inforwww.sfb629.uniwww.imprs-mbm-

mationen: muenster.de; cedad.mpg.de/

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Institut für Molekulare Zellbiologie (IMZ)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Expression, Reinigung und Charakterisierung

WS/SS

rekombinanter Proteine

 Angeborene Immunabwehr

WS

 Molekulare Zellbiologie II

SS

Forschungsmodule  Molekulare Zellbiologie (nach Vereinbarung)  Mausmodelle menschlicher Krankheiten (nach Vereinbarung)  Motormoleküle und Signaltransduktion (nach Vereinbarung) Masterarbeit Voraussetzung: Ein Forschungsmodul in der Arbeitsgruppe, vorteilhaft wäre auch der Besuch eines FGMs der AG.

Methoden  verschiedene Formen der Fluoreszenz- und Elektronenmikroskopie  Biochemie, Molekularbiologie & Zellbiologie  Entwicklungsbiologie  Zellkultur  Chemotaxis  Histochemie  Mausgenetik  experimentelle Autoimmun Encephalomyelitis Homepage www.uni-muenster.de/Biologie.AllgmZoo/

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Institut für Molekulare Zellbiologie (IMZ)

Prof. Dr. Andreas Püschel AG Molekularbiologie Schlossplatz 5 48149 Münster  0251 83 23841  apueschel@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Eine Reihe von neurologischen Erkrankungen beruhen auf Störungen der Wanderung und Differenzierung von Neuronen während der Embryonalentwicklung. Unsere Arbeitsgruppe untersucht Signalwege, die für die normale Entwicklung des Nervensystems essentiell sind und die Differenzierung von Neuronen aus neuronalen Vorläuferzellen steuern. Dabei interessieren wir uns insbesondere für die Rolle verschiedener GTPasen und Kinasen, die die Organisation und Dynamik des Cytoskeletts, den polarisierten Transport in das Axon und die neuronale Polarität steuern. Die Funktion der untersuchen Faktoren wird mittels RNAi in kultivierten Neuronen oder die Herstellung konditionaler Knockout Mäuse analysiert. Um die Regulation von Transportprozessen in kultivierten Neuronen oder die neuronalen Migration in Schnittpräparaten des Cortex zu untersuchen, verwenden wir verschiedene Live Cell Imaging Systeme.

Weitere Informationen: http://sfb629.uni-muenster.de/ http://cedad.uni-muenster.de/ http://www.uni-muenster.de/CiMIC/

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Institut für Molekulare Zellbiologie (IMZ)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Neurobiologie

WS

 Neuroentwicklungsbiologie I+II

SS

Forschungsmodule  Molekulare Neurogenetik  Molekulare Zellbiologie des Neurons Masterarbeit Voraussetzung: Ein Forschungsmodul in der Arbeitsgruppe.

Methoden  Biochemie (heterologe Expression, Protein-Protein-Interaktion)  Zellbiologie  Molekularbiologie  Life Cell Imaging Techniken (Konfokale Mikroskopie, 2-Photon Mikroskopie)

 neuronale Primärkulturen  Slice-Kulturen  Analyse transgener Mäuse Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.AllgmZoo/Gruppen/Pueschel/index.html

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Institut f端r Neuro- und Verhaltensbiologie (INVB)

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Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie (INVB)

Prof. Dr. Angelika Barnekow AG Experimentelle Tumorbiologie Badestraße 9 48149 Münster  0251 83 23894  holkerh@uni-muenster.de  im Semester Do 12 - 13 Uhr

Forschungsschwerpunkte  Tumorbiologie, Mikrobiologie, zellulärer Transport, kleine GTPasen und Kinasen, Tumorviren und Onkogene

 molekularbiologische Grundlagen der Alzheimer Erkrankung  DNA computing

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Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie (INVB)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Einführung in die Methodik der Gewebekultur:

SS

Neben Grundtechniken der Zellkultivierung, heterologe Expression, virale Transformation, in vitro Differenzierung.

Forschungsmodule  Molekularbiologische Methoden: Mitarbeit an einem unserer aktuellen Forschungsprojekte (WS/SS).

Masterarbeit Voraussetzung: Ein Forschungsmodul in der Arbeitsgruppe, vorteilhaft wäre auch der Besuch eines FGMs der AG.

Methoden  Zellkultur  Mikroskopie  molekular- und mikrobiologische Methoden, sowie proteinchemische, immunologische und in silico Analysen

Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.NeuroVer/Tumorbiologie/ welcomed.html

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Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie (INVB)

Prof. Dr. Christian Klämbt AG Neurobiologie Badestraße 9 48149 Münster  0251 83 21122  klaembt@uni-muenster.de  einfach vorbei kommen

Forschungsschwerpunkte Wir untersuchen die Entwicklung, Differenzierung und Funktion von Gliazellen im Nervensystem von Dro sophila. Zur Zeit bearbeiten wir die folgenden Themen:

 molekulare Mechanismen der glialen Spezifizierung und Differenzierung  Zuckertransport über die Blut-Hirn-Schranke  Analyse der Neuron-Glia-Interaktion mit ihren Konsequenzen für das Verhalten. Hierbei bestehen Zusammenarbeiten mit dem Institut für Informatik der WWU.

Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie (INVB)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Drosophila Genetik (gemeinsam mit der AG Bogdan)

WS/SS

Forschungsmodule  Elektronenmikroskopie (WS/SS)  Drosophila Neurobiologie  Drosophila Verhaltensbiologie  Molekulargenetik Masterarbeit Es besteht keine Präferenz für einen Studiengang. Voraussetzung: sehr gute Kenntnisse in der molekularen Genetik, Interesse und Engagement.

Methoden  Drosophila Genetik (zelltyp-spezifische RNAi; MARCM, ffip outTechnik)

 hochauflösende Mikroskopie (konfokale Mikroskopie, Elektronenmikroskopie, strukturierte Beleuchtung)

 Zellkultur + biochemische Methoden  rekombinante DNA / RNA Methoden, u.a. TALEN, CRISPR, Gateway  Herstellung transgener Organismen Homepage http://neurobio.uni-muenster.de/Homepage.html

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Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie (INVB)

Prof. Dr. Norbert Sachser Prof. Dr. Sylvia Kaiser AG Verhaltensbiologie Badestraße 9 48149 Münster  

0251 83 21013 sachser@uni-muenster.de (Prof. Sachser) kaisesy@uni-muenster.de (Prof. Kaiser)  Di 12 - 14 Uhr (mit Anmeldung per E-Mail) (Prof. Sachser) nach Absprache (per E-Mail) (Prof. Kaiser)

Forschungsschwerpunkte  hormonelle und molekulare Grundlagen von Kognition, Emotion und sozialem Verhalten

 Verhaltensentwicklung unter besonderer Berücksichtigung der pränatalen Phase und der Adoleszenz

 Stress und Wohlergehen  Evolution von Paarungs- und Sozialsystemen der Säugetiere.

Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie (INVB)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Gene, Hormone und Verhalten

SS

 Sozial- und Paarungssysteme der Säugetiere

SS

 Tierschutz

WS

Forschungsmodule  Diverse aus dem Bereich der Verhaltensbiologie (nach Absprache) Masterarbeit Sehr gute verhaltensbiologische Kenntnisse; Studiengänge: Biologie, Biomedizin.

Methoden  quantitative Erfassung und Analyse des sozialen, kognitiven und emotionalen Verhaltens (einschließlich RFID basierten Trackings und Monitorings)

 Hormonanalysen (RIA, ELISA)  statistische Methoden Homepage www.ethologie.de

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Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie (INVB)

PD Dr. Sven Bogdan AG Aktindynamik Badestraße 9 48149 Münster  0251 83 21123  sbogdan@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Wie steuert das Aktin-Zytoskelett Zellformveränderungen und Zellbewegungen während der Entwicklung eines multizellulären Organismus? Wir nutzen Drosophila als Modellorganismus und kombinieren genetische und biochemische Analysen, um die molekularen Netzwerke zu identifizieren, die Aktin-Dynamik in vivo kontrollieren. Live-imaging Analysen in Drosophila ermöglichen es zudem Aktin-abhängige Entwicklungsprozesse in vivo darzustellen, genetisch zu manipulieren und so die physiologischen Funktionen zentraler Aktin-Regulatoren zu verstehen. Von diesen Analysen erhoffen wir uns, ein besseres Verständnis zu bekommen, wie Zellen im Gewebeverband auf extrazelluläre Signale mit Veränderungen des Aktin-Systems und der Membran-Dynamik reagieren.

Übersichtsartikel zur Forschung: Fricke R., Gohl C. and Bogdan, S. (2010). The F-BAR protein family: Actin’ on the membrane. Communicative & Integrative Biology 3:2, 1-6; March/April 2010.

Gohl C., Zobel T. and Bogdan, S. (2011) Molekulare Kontrolle der AktinDynamik in vivo – Erkenntnisse aus der Fruchtfliege. Biospektrum 01/2011.

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Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie (INVB)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Einführung in die Methodik der Gewebekultur  Drosophila Genetik (gemeinsam mit der AG Klämbt)

SS WS/SS

Forschungsmodule  Molekulargenetik des Drosophila Zytoskeletts: aktuelle Projekte der Arbeitsgruppe

Masterarbeit Voraussetzung: Ein Forschungsmodul in der Arbeitsgruppe, Studiengänge: Biologie und Biomedizin.

Methoden  aktuelle Methoden der Molekulargenetik, Genetik, Biochemie, Zellkultur, Lebendzell– und hochauflösende Mikroskopie (LSM, SIM, SDM)

Homepage http://www.actindynamics.org/cms/index.php?page=sven-bogdan-muenster

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Institut f端r Zoophysiologie (IZP)

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Institut für Zoophysiologie (IZP)

Prof. Dr. Eva Liebau AG Molekulare Physiologie Schlossplatz 8 48143 Münster  0251 83 21710 oder 21715  liebaue@uni-muenster.de  Di 10 -13 Uhr oder einfach vorbeischauen

Forschungsschwerpunkte Tropenmedizinische Fragestellungen: Immunmodulation bei humanpathogenen Parasitosen Sekretomanalysen und Entgiftungsprozesse bei Filarien

 Fettsäure- und Retinol-bindende Proteine  Glutathion-Stoffwechsel (Redox-Regulation)  Ubiquitin-foldmodifier (Ufm1)-Kaskade in C. elegans Koordinatorin Afrikanisch-Deutsches Netzwerk Camero o nian-German Cooperation Project (CGCP) http://cameroon.uni-muenster.de

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Institut für Zoophysiologie (IZP)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Parasitologie

SS

Forschungsmodule  Molekulare Parasitologie: Mitarbeit an aktuellen Fragestellungen aus der Tropenmedizin (siehe Forschungsschwerpunkte)

Masterarbeit Keine Voraussetzungen oder präferierte Studiengänge.

Methoden Das Methodenspektrum umfasst allgemeine Techniken der Molekularbiologie, Biochemie, Physiologie, Genetik und Bioinformatik.

Highlights:

 rekombinante Expression in verschiedenen prokaryotischen/ eukaryotischen Systemen

 Kristallisation  Strukturanalyse  Protein-Interaktionsstudien (u.a. Y2H, pulldowns, Biacore)  Hochleistungsflüssigkeits-Chromatographie  Zellkultivierung  Herstellen transgener Modelorganismen, knock-down, RNAi-Screening Homepage http://molphysiol1.uni-muenster.de/

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Institut für Zoophysiologie (IZP)

Prof. Dr. Rüdiger Paul AG Tierphysiologie Schlossplatz 8 48143 Münster  0251 83 23851  paulr@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Am Beispiel der genetischen Modellorganismen Caenorhabditis elegans und Daphnia pulex werden komplexe Regulationsprozesse der Stressantwort untersucht.

Die Anpassungsreaktionen an veränderte Umweltbedingungen erfordern differentielle Proteinexpression. Die Projekte untersuchen evolutive Adaptation oder individuelle Akklimation und resultierende Verschiebungen von Toleranzgrenzen in einem integrativen Ansatz von der molekularen Ebene über die Physiologie der Tiere (zelluläre und organismische Ebene) bis zur Analyse von ökologischen und evolutionären Aspekten. Weitere Projekte mit marinen Wirbellosen (Arenicola marina, verschiedene Muscheln) befassen sich ebenfalls mit den Anpassungsleistungen der Tiere an die variablen Umweltbedingungen des Lebensraums Wattenmeer.

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Institut für Zoophysiologie (IZP)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Stressphysiologie bei genetischen Modellorganismen WS  Tierschutz

WS

 Ökologie des Wattenmeers

SS

 Marine Nahrungsketten: Primärkonsumenten

SS

Forschungsmodule  Molekulare Stressphysiologie von Caenorhabditis elegans  Ökophysiologie mariner Invertebraten  Integrative Physiologie aquatischer Invertebraten Masterarbeit Interesse an den Forschungsthemen und Methoden, Engagement und Bereitschaft zur Einarbeitung. Teilnahme an Fortgeschrittenen- und Forschungsmodulen der AG erwünscht, aber nicht Voraussetzung.

Methoden  molekularbiologische Methoden (z.B. RNA-Interferenz; Transcriptomics)

 Proteinbiochemie (z.B. Proteomics, Chromatographie, Elektrophorese, photometrische Aktivitätsbestimmung)

 physiologische Methoden (z.B. Mikroskopie) Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.Zoophysiologie/tierphys/index.htm

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Institut für Zoophysiologie (IZP)

Prof. Dr. Wolf-Michael Weber AG Elektrophysiologie und molekulare Medizin Schlossplatz 8 48143 Münster  0251 83 21782  wmw@uni-muenster.de  jederzeit

Forschungsschwerpunkte Unsere Gruppe arbeitet an den Transportsystemen epithelialer menschlicher Zellen. Überwiegend liegt der Fokus dabei auf dem epithelialen Na+ Kanal (ENaC) und auf Cl- Kanälen wie dem cystic Ťhbrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) sowie möglichen Interaktionen zwischen diesen beiden Molekülen. Ein weiterer Aspekt unserer aktuellen Forschung ist die Entwicklung neuer Therapien, um die Symptome, welche durch Störungen der CFTR- und ENaC-Aktivität beim Menschen ausgelöst werden, zu behandeln.

Die aktuelle Forschung kann zurzeit in 3 Hauptbereiche unterteilt werden:

 Antisense-Oligonukleotide (AON) als Therapieform bei Mukoviszidose (spezifische Hemmung des ENaC durch Antisenseoligonucleotide)

 Gentherapie mit CFTR mRNA zur Behandlung der Lungenerkrankung bei Mukoviszidose

 humaner ENaC (Expression und Regulation)

Institut für Zoophysiologie (IZP)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Physiologie menschlicher Transport-proteine und damit verbundene Krankheiten

Forschungsmodule  Physiologie menschlicher Transport-proteine und damit verbundene Krankheiten

Masterarbeit Physiologie menschlicher Transport-proteine und damit verbundene Krankheiten; Präferierte Studiengänge: MSc Biologie und Biomedizin.

Methoden  Molekularbiologie  Elektrophysiologie  Laser-Konfokal-Mikroskopie Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.Zoophysiologie/electrophys/

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weitere Arbeitsgruppen am Fachbereich Biologie

weitere Arbeitsgruppen am Fachbereich Biologie  Prof. Dr. Claudia Acquisti

 

Institut für Evolution und Biodiversität (IEB) AG Evolutionary Functional Genomics Hüfferstr. 1 48149 Münster  0251 83 21089  Claudia.Acquisti@uni-muenster.de  nach Vereinbarung Fortgeschrittenenmodule keine Forschungsmodule „Ecological Genetics“ „theoretical biology, molecular evolution, and systems immunology“ Homepage http://ieb.uni-muenster.de/evolfuncgen

 Prof. Dr. Ralf Seidel

 

Institut für Molekulare Zellbiologie (IMZ) AG DNA motors Schlossplatz 5 48149 Münster  0251 83 23920  ralf.seidel@uni-muenster.de  nach Vereinbarung Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.AllgmZoo/

weitere Arbeitsgruppen am Fachbereich Biologie

 PD Dr. Klaus Tenberge

 

Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen AG Morphology, Anatomy and Cytology of Plants and Fungi Schlossgarten 3 48149 Münster Dienstzimmer: Bromelienhaus im Botanischen Garten  0251 83 31362  tenberg@uni-muenster.de  Di 1015 - 12 Uhr (Anmedlung erwünscht) Fortgeschrittenenmodul „Funktionelle Anatomie und digitale Cytologie der Pflanzen“ Homepage http://www.uni-muenster.de/Biologie.IBBP/agtenberge/index.html

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Fachbereich Chemie und Pharmazie

Quelle: https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Cobalamin.svg

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Fachbereich Chemie und Pharmazie

Institut für Biochemie Prof. Dr. Hans-Joachim Galla AG Zellbiologie/Biophysik Wilhelm-Klemm-Str. 2 48143 Münster  0251 83 33200  gallah@uni-muenster.de  Mi, Do 12 - 13 Uhr oder nach tel. Absprache

Forschungsschwerpunkte  Regulation der Eigenschaften der Blut-Hirn-Schranke (BHS) durch benachbarte Zellen, Metalloproteinasen

   

extrazelluläre

Matrixbestandteile

Tight junction Expression und Regulation Charakterisierung von ABC-Transportern Einfluss von Nanopartikeln auf die BHS Proteinwechselwirkung mit Lipidmembranen

und

Matrix

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Fachbereich Chemie und Pharmazie

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Biochemie:

WS

Zellkultur; Proteinisolierung, SDS-PAGE, Western Blot; TEER Messung; Quarzmikrowaage Messungen. Homepage: http://www.uni-muenster.de/Chemie.bc/teaching/bc-labc-BCMSc.html

Forschungsmodule  Termine nach Absprache frei wählbar im WS und SS; Themen: aktuelle Forschungsprojekte: Biochemie; Nanotechnologie; Biophysik und Zellbiologie

Masterarbeit Ein absolviertes Fortgeschrittenenmodul, Forschungsmodul oder Praktikum in unserer Gruppe ist von Vorteil. Themen: aktuelle Forschungsprojekte.

Methoden  Proteinbiochemie  zellbiologische Methoden (Präparation, Kultivierung, Zellassays)  molekularbiologische Methoden (qrtPCR, Klonierungen)  Überexpression von Proteinen in Hefen  Transendothelial electrical resistance measurements (TEER)  Confocal laser scanning microscopy (CLSM)  Atomic force microscopy (AFM)  Quarzmikrowaage-Analysen Homepage http://www.uni-muenster.de/Chemie.bc/research/HJG/bc-research-HJGintro.html

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Fachbereich Chemie und Pharmazie

Institut für Biochemie Prof. Dr. Karl-Heinz Klempnauer AG Molekularbiologie Wilhelm-Klemm-Str. 2 48143 Münster  0251 83 33203  klempna@uni-muenster.de  jederzeit und nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Das Hauptinteresse der Arbeitsgruppe ist die Regulation der Genexpression, Zellproliferation und Differenzierung tierischer Zellen, und damit verbunden, die Entstehung von Tumoren. Wir beschäftigen uns mit der molekularen Wirkungsweise von verschiedenen nukleären Proteinen, die als Transkriptionsfaktoren aufgrund ihrer onkogenen bzw. tumorsupprimierenden Eigenschaften an der Tumorentstehung beteiligt sind. Neben dem Verständnis der Wirkungsmechanismen dieser Proteine sind wir auch daran interessiert, Testsysteme zu entwickeln, mit deren Hilfe wir Inhibitoren für die betreffenden Proteine identifizieren können.

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Fachbereich Chemie und Pharmazie

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Eukaryontische Genexpression

SS

Forschungsmodule  Forschungsmodule (zu den Forschungsthemen der Arbeitsgruppe) sind nach Absprache jederzeit möglich

Masterarbeit Voraussetzung: Absolvierung eines Forschungsmoduls in unserer Gruppe. Teilnehmer aller biologischen Studiengänge sind willkommen.

Methoden  molekularbiologische Grundtechniken  Mutagenese  Zellkultur tierischer Zellen  Methoden zur Analyse der Genexpression (Reportergen-Assays, RTPCR, Northern blotting)

 RNA-Interferenz  Chromatinstrukturanalysen  rekombinante Proteinexpression  Methoden zum Nachweis von Protein-Protein, Protein-DNA und Protein-RNA-Interaktionen in vitro und in vivo

 Analyse post-translationaler Proteinmodifikationen Homepage http://www.uni-muenster.de/Chemie.bc/research/KHK/bc-research-KHKintro.html

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Fachbereich Chemie und Pharmazie

Institut für Biochemie Prof. Dr. Henning Mootz AG Proteinchemie/Biotechnologie Wilhelm-Klemm-Str. 2 48143 Münster  0251 83 33005  henning.mootz@uni-muenster.de  nach Absprache

Forschungsschwerpunkte  Protein-Spleißen durch Inteine: Mechanismus und biotechnologische Anwendungen für die chemische Modifikation von Proteinen

 posttranslationale Modifikationen des Ubiquitin- bzw. SUMO-Typs: Generierung spezifischer Konjugate, Bindungsstudien etc.

 Nicht-ribosomale Peptidsynthese: Verständnis der Funktionsweise der beteiligten Multidomänenenzyme (für z.B. Peptidantibiotikasynthese) allgemeine Gebiete: Semisynthese

Biochemie,

Proteinchemie,

Enzymologie,

Protein-

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Fachbereich Chemie und Pharmazie

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Proteinchemie und Biotechnologie

SS

Forschungsmodule  aktuelle Forschungsgebiete, nach Vereinbarung Masterarbeit Qualität!

Methoden  Proteinexpression und -reinigung, FPLC  UV-Vis, FRET, Fluoreszenz-Anisotropie, SPR  Klonierung (PCR, Punktmutagenese, Zufallsmutagenese für gerichtete Evolution etc.)

 Einbau unnatürlicher Aminosäuren in Proteine  chemische Peptidsynthese  HPLC, Massenspektrometrie  Zellkultur Homepage http://www.uni-muenster.de/Chemie.bc/research/HM/bc-research-HMintro.html

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Fachbereich Chemie und Pharmazie

Institut für Pharmazeutische Biologie und Phytochemie Prof. Dr. A. Hensel Corrensstraße 48 48149 Münster  0251 83 33381  ahensel@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  Naturproduktchemie  Glykobiologie (Oligo-, Polysaccharide, Glykoproteine): strukturelle Aspekte und pharmakologische Aktivitäten

 Ethnopharmakologie: Neue pharmakologischer Aktivitäten traditioneller Kräuter

 Stabilität pflanzlicher Sekundärprodukte/Naturheilmittel  analytische Entwicklung und Standardisierung von Naturheilmitteln

Fachbereich Chemie und Pharmazie

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  jeweils WS und SS, aber mit mindestens 1 Semester Voranmeldung seitens der Studierenden am IPBP. Praktikum ist blockweise ca. vier Wochen, nachmittags ca. Juni/Juli oder Dezember/Januar zusammen mit Studierenden der Pharmazie (7. Semester). Abschluss: schriftliche Klausur oder ggf. mündliche Prüfung. Voraussetzung: gute Kenntnisse in organischer Chemie und Botanik

Forschungsmodule  Nach Vereinbarung. Voraussetzung: mit guten Ergebnissen abgeschlossenes Fortgeschrittenenmodul

Masterarbeit Bevorzugte Studiengänge: Pharmazie, Lebensmittelchemie, Biotechnologie, Chemie. Voraussetzungen: Fortgeschrittenenmodul und Forschungspraktikum.

Methoden  Chromatographie (HPLC, GC, TLC, GC-MS, Densitometrie)  Spektroskopie (MS, NMR)  Naturstoffisolierung  quant. Bestimmungsmethoden für Naturstoffe aus komplexer Matrix  Anwendung und pharmakologische Eigenschaften von Arzneipflanzen  ausgewählte Aspekte moderner Phytotherapie Homepage http://www.uni-muenster.de/Chemie.pb/studieren/praktika/ Arzneimittelentwicklung.html

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Fachbereich Chemie und Pharmazie

Institut für Pharmazeutische und Medizinische Chemie Prof. Dr. Joachim Jose Corrensstraße 48 48149 Münster  0251 83 32210  joachim.jose@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte     

Drug Discovery Biokatalyse für die Synthese von Feinchemikalien und Medikamenten Biosensor-Entwicklung zielgerichtete Optimierung von Inhibitoren und Enzymen

Fachbereich Chemie und Pharmazie

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  Mitarbeit an Forschungsprojekten in unserer Gruppe Masterarbeit Masterarbeiten können jederzeit vergeben werden (nach Vereinbarung).

Methoden  anwendungsorientierte biotechnologische Themen  vielfältige Methoden der Molekularbiologie, Proteinanalyse und Proteinaufreinigung (z.B. SPL, FPLC)

 modernste Analysetechniken (z.B. FACS, CE und Konfokales Laserscanning-Mikroskop)

Homepage http://www.uni-muenster.de/Chemie.pz/forschen/ag/jose/index.html

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Max Planck Institut f端r Molekulare Biomedizin

Foto: Presseamt M端nster / Angelika Klauser

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Abteilung Prof. Dr. Adams Prof. Dr. Ralf Adams Gewebebiologie und Morphogenese Röntgenstraße 20 48149 Münster  0251 70365 400  i.acres@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Das zentrale Forschungsinteresse ist die wichtige Frage „wie Zellen Organe bilden“, Wir beschäftigen uns mit dem kardiovaskulären System von Wirbeltieren, in denen sich Blutgefäße präzise in verschiedene Gewebsumgebungen einfügen und sich in Organ-spezifischer Weise spezialisieren. Wir kombinieren genetische Ansätze in den Modellorganismen Maus und Zebrafisch mit in vitro Methoden, wie Zellbiologie, Videomikroskopie, Biochemie und der Analyse von Genexpressionsprofilen.

Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Entwicklungsbiologie, Blutgefäßwachstum und –differenzierung Forschungsmodule  Morphogenese von Blutgefäßen Masterarbeit Bevorzugte Studiengänge: MSc Molekulare Biomedizin; MSc Biowissenschaften.

Methoden  Klonierung von Expressionskonstrukten  Transfektion vaskulärer Zellen mit Expressionskonstrukten oder siRNA für funktionale Studien

 biochemische und zellbiologische Methoden  Immunohistochemie  Analyse von Zellen oder Geweben durch konfokale Mikroskopie  PCR, Klonierung, usw.

Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/research/teams/adams/index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Abteilung Prof. Dr. Schöler Prof. Dr. Hans R. Schöler Zell- und Entwicklungsbiologie Röntgenstraße 20 48149 Münster  0251 70365 300  office@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Im zentralen Mittelpunkt unserer Abteilung stehen Untersuchungen zur Pluripotenz von Stammzellen sowie die molekularen Mechanismen der Stammzelldifferenzierung. Die Genregulation des Transkriptionsfaktors Oct-4 und dessen Interaktionspartner spielt eine zentrale, regulative Rolle in der Pluripotenzerhaltung ebenso wie für die Stammzell­differenzierung. Ein weiterer Forschungsschwerpunkt ist die Reprogrammierung und Weiterentwicklung der Reprogrammierungstechnologie somatischer Zellen in induzierte pluripotente Zellen (iPS). Die Generierung von patientenspezifischen iPS Zellen ermöglicht die Modellierung von neuralen und cardialen Krankheiten, sowie denen des blutbildenden Systems.

Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Planarians as model to study pluripotent stem cells  Pluripotenznetzwerk in vivo  Planarians as model to study pluripotent stem cells

SS SS WS

 Cellular reprogramming and iPS cell research  Pluripotenznetzwerk in vivo

WS

 Zelldifferenzierung und Zelladhäsion

WS

WS

Forschungsmodule  Entwicklungsbiologie, Stammzellbiologie, Zelldifferenzierung Masterarbeit Zurzeit können wir leider keine Masterstudenten aufnehmen.

Methoden  Zellkulturtechniken embryonaler und verschiedener adulter Stammzellen sowie deren Differenzierung (murin und human)

 Reprogrammierungstechniken  iPS Technologie  Gentransfertechnolgie + Genprofiling  Proteomics  Bioinformatik  Elektronenmikroskopie Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/research/teams/schoeler/index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Abteilung Prof. Dr. Schöler Dr. Michele Boiani Mouse Embryology Laboratory Röntgenstraße 20 48149 Münster  0251 70365 330  mboiani@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Die Säugetiereizelle besitzt eine Reihe einmaliger Eigenschaften. Unter anderem besitzt sie die Fähigkeit zur Haploidisierung ihrer eigenen DNA, das Potential nach Parthenogenese oder Befruchtung die Embryonalentwicklung zu durchlaufen und sogar das Vermögen somatische Zellkerne zu Reprogrammieren (Etablierung von totipotenten geklonten Embryonen und pluripotenten Stammzellen). Diese Eigenschaften sind während der gesamten Reproduktionsspanne des Tieres vorhanden, werden aber mit Fortschreiten des Alterungsprozesses beeinträchtigt. Die Forschung in der AG Boiani zielt darauf ab die biomolekularen Prozesse, die den oben genannten Eigenschaften zu Grunde liegen, anhand des Mausmodells zu untersuchen und besser zu verstehen. Dabei kommen wissenschaftliche Methoden aus dem Bereich der Entwicklungsbiologie, der Kernreprogrammierung, der Stammzellforschung sowie der Reproduktionsmedizin zum Einsatz. Zudem, bietet die Arbeit in der Gruppe Boiani auch eine Erfahrung der behördlichen Vorschriften zum Thema ‚Tierforschung’ an. Mehr zu der Forschung der AG Boiani ist beispielhaft in den folgenden Publikationen erläutert: Schwarzer et al. (2012). Human Reproduction 27:2627-2640; Esteves et al. (2011). Aging Cell 10:80-95; Balbach et al. (2010). Developmental Biology 343:71-83.

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Biologie der Reproduktion

WS

 Zelldifferenzierung und Zelladhäsion

WS

 Modellorganismen in der biomedizinischen Forschung

SS

Forschungsmodule  Manipulating reproduction in mice: techniques and relevance to human reproduction (WS+SS) oder Mitarbeit in einem aktuellen Forschungsprojekt der AG Boiani (WS+SS)

Masterarbeit Begeisterung für Entwicklungsbiologie der Säugertiere, Bereitschaft zur Arbeit mit Mäusen als Tiermodelle. Die vorherige Absolvierung eines Forschungsmoduls in meiner Gruppe ist zu empfehlen, stellt jedoch keine Voraussetzung dar. Studiengänge: alle.

Methoden  Mikromanipulation von Oozyten und Embryonen  chirurgischer Embryotransfer  Gewinnung von mausembryonalen Stammzellen  Konfokalmikroskopie für subzelluläre Lokalisationsstudien von Proteinen  Immuncytochemie + biochemische Analyse (Western-Blot)  Zellkultur, Real-time PCR und Microarray  Genotypisierung und Analyse von knock-out und transgenen Mäusen Homepage www.mpi-muenster.mpg.de/en/research/teams/groups/rgboiani/index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Abteilung Prof. Dr. Schöler Dr. Luca Gentile Mouse Embryology Laboratory Von-Esmarch-Straße 54 48149 Münster  0251 83 46870  luca.gentile@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Planarien sind Meister der Regeneration. Nach Verletzung oder Amputation können sich Planarien vollständig regenerieren. Dieser besonderen Fähigkeit liegen adulte pluripotente Planarien-Stammzellen (pASCs) zugrunde, die circa ein Viertel aller Zellen im Körper ausmachen.

Wir sind interessiert in:

 Stammzellbiologie  Pluripotenz  Regeneration

Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Planarien als Modell zur Erforschung pluripotenter Stammzellen I (nach Vereinbarung)

 FGM zu aktuellen Themen der Forschungsgruppe Forschungsmodule  Planarien als Modell zur Erforschung pluripotenter Stammzellen II (nach Vereinbarung)

 FoM zu aktuellen Themen der Forschungsgruppe Masterarbeit Voraussetzung: Absolvierung eines Forschungsmoduls in der Arbeitsgruppe.

Methoden  Zelldissoziation und FACS  Immunfärbung  Whole-mount ISH/ICH und FISH  Konfokalmikroskopie  qPCR  dsRNA-vermittelte RNAi  Zellkultur  RNA-Sequencing  Planarienhaltung Homepage http://www.mpi-uenster.mpg.de/research/teams/groups/rggentile/index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Abteilung Prof. Dr. Vestweber Prof. Dr. Dietmar Vestweber Vaskuläre Zellbiologie Röntgenstraße 20 48149 Münster  0251 70365 200  vestweb@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte In unserer Arbeitsgruppe untersuchen wir die Interaktionen von Leukozyten mit Blutgefäßen, die die Einwanderung von Leukozyten in Gewebe regulieren und damit die Ausbildung von Entzündungen und die Immunüberwachung des Körpers kontrollieren. Darüber hinaus interessieren wir uns für die molekularen Grundlagen der Ausbildung von Blutgefäßen. Die verschiedenen Projekte unserer Arbeitsgruppe konzentrieren sich auf die Regulation der Einwanderung von Leukozyten in das Gewebe, auf die Leukozyten Interaktion mit der Gefäßwand, auf die Diapedese von Leukozyten und auf die Bedeutung endothelialer Zellkontakte für die Angiogenese.

Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  Zelladhäsion von Leukozyten und Endothel Masterarbeit Voraussetzung: Absolvierung eines Forschungsmoduls in der Arbeitsgruppe.

Methoden  Erzeugung von Expressionvektoren  adenovirale Genexpression  Erzeugung genomischer Vektoren zum transgenen Arbeiten in der Maus  Immunhistochemie  transendothelaile Migration von Leukozyten in vitro  Zelladhäsionsassays  Fluoreszenzmikroskopie Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/research/teams/vestweber/index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Abteilung Prof. Dr. Vestweber Prof. Dr. Martin Wild Vascular Glycoimmunology Laboratory Röntgenstraße 20 48149 Münster  0251 83 21760  mwild@mpi-muenster.mpg.de  einfach anrufen, tägl. 830 -12 und 14 - 16 Uhr

Forschungsschwerpunkte Humane Glykosylierungsstörungen Glykostrukturen haben großen Einfluss auf physiologische Vorgänge einschließlich Immunreaktionen. Im Mittelpunkt unserer Forschung steht die Rolle der Glykosylierung bei der Immunität, besonders bei Interaktionen von Leukozyten mit dem vaskulären Endothel. Die Identifizierung und Charakterisierung von angeborenen humanen Glykosylierungsstörungen (CDG) ist hierbei ein besonderer Fokus unserer Forschung.

Leukozyten-Migration und Selektine Immunreaktionen sind entscheidend von der Fähigkeit der beteiligten Leukozyten abhängig, an die „Orte“ von Infektion (entzündete Gewebe) und Fremdantigen-Präsentation (sekundäre lymphatische Gewebe) zu gelangen. Hierzu besitzen die Leukozyten Oberflächen-Rezeptoren, die es ihnen ermöglichen, insbesondere mit den Endothelzellen der Blutgefäße in Kontakt zu kommen.

Erst dieser Kontakt ermöglicht eine örtlich und zeitlich gesteuerte LeukozytenAuswanderung aus dem Blut. Diese Vorgänge werden insbesondere im Mausmodell untersucht.

Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  keine Masterarbeit keine Angabe

Methoden keine Angabe

Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/research/teams/groups/rgwild/index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Angiogenesis Laboratory Prof. Dr. Wiebke Herzog Röntgenstraße 20 48149 Münster  0251 70365 457  wiebke.herzog@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Das Wachstum von Blutgefäßen wird durch viele komplex ineinandergreifende Faktoren reguliert, welche nicht nur während der Entwicklung sondern auch im erwachsenen Körper wichtig sind. Störungen dieser Prozesse spielen bei vielen humanen Erkrankungen, wie Krebs, Ischemie oder Diabetes eine wesentliche Rolle.

Wir untersuchen daher die Rolle von verschieden Genen für die Blutgefäßentwicklung im Zebrafisch Embryo. Anhand einer Vielzahl von transgenen z.B. Fluorophor-exprimierenden Zebrafisch-Linien können wir im konfokalen Mikroskop das Verhalten einzelner Blutgefäßzellen im lebenden Embryo beobachten und dann die Rolle einzelner Gene in pharmakologisch oder genetisch manipulierten Embryonen untersuchen.

Momentan fokussieren wir uns auf zwei Fragestellungen: Zum einen sind wir speziell an Faktoren interessiert, welche die Endothelzellwanderung beeinflussen, zum anderen untersuchen wir die Rolle des Wnt Signalweges für die Entwicklung der Blutgefäße und für die Spezialisierung der BlutHirnschranke.

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Aktuelle Methoden in Gefäßbiologie und Imaging

SS

Forschungsmodule  Zu aktuellen Themen der Forschungsgruppe. Forschungsmodule in meiner AG sind intern!

Masterarbeit Interesse (Belegung eines Moduls in der AG von Vorteil), keine bevorzugten Studiengänge.

Methoden  Konfokale Bildgebung (auch live / time lapse)  Molekularbiologie  Erzeugung transgener Fische (Transgenesis)  embryologische Manipulation (Injektion, Transplantation)

 in situ Hybridisierung / Immunohistochemistry  Expressions-profiling (Microarrays, deep sequencing, qPCR)

Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/ research/teams/groups/rgherzog/ index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Mammalian Cell Signaling Laboratory Prof. Dr. Friedemann Kiefer Röntgenstraße 20 48149 Münster  0251 70365 230  fkiefer@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Alle wesentlichen Prozesse im lebenden Organismus werden durch wechselseitige Regulation verschiedener Gewebs- und Zelltypen gesteuert. Dies trifft auf Entwicklungsprozesse genauso zu, wie auf das Entstehen einer Immunantwort.

Im Zentrum unserer Forschung stehen die Bildung und Erhaltung von Lymphgefäßen, sowie das Entstehen und die Effekte von Immunreaktionen. Dabei untersuchen wir gezielt wie Endothelzellen und Lymphozyten / Leukozyten auf molekularer Ebene aktiviert werden, aber auch wie sich diese Zelltypen gegenseitig in ihrer Funktion beeinflussen. Neben klassischen zellbiologischen Ansätzen setzen wir auch massiv ImagingVerfahren ein um solche Vorgänge im lebenden Organismus beobachten zu können. Langfristig erhoffen wir uns von unseren Untersuchungen ein besseres Verständnis von Pathologien wie dem Lymphödem aber auch Allergien und Autoimmunerkrankungen.

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Zelldifferenzierung und Zelladhäsion

WS

 Aktuelle Methoden in Gefäßbiologie und Imaging

SS

Forschungsmodule  Signaltransduktion in Endothelzellen und Leukozyten, ganzjährig nach Absprache

Masterarbeit Bevorzugt (aber nicht ausschließlich) für Studenten der Studiengänge: MSc Molekulare Biomedizin, MSc Biowissenschaften.

Methoden  Imaging Technologien (konfokale Mikroskopie, Lichtblattmikroskopie, Lebendzell- und „intravitale“ 2-Photonen-Mikroskopie, FRET und FLIM-Messungen)

 grundlegende zellbiologische, biochemische, immunologische und molekularbiologische Arbeitstechniken (Klonierung, Proteinexpression in eukaryontischen Zellen, Immunhistochemie)

 Untersuchung von Zellverhalten und Wanderung  Analyse transgener und von knock-out/knock-in Mausmodellen Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/research/teams/groups/rgkiefer/index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Stem Cells and Regeneration Dr. Kerstin Bartscherer Von-Esmarch-Str. 54 48149 Münster  0251 83 46846  kerstin.bartscherer@mpi-muenster.mpg.de  by appointment via e-mail

Forschungsschwerpunkte Neurodegenerative diseases affect people at all ages, however, regeneration of the human nervous system is limited. We use planarian flatworms, which are gifted with the remarkable talent to regrow lost body parts, as a model for regeneration. Regeneration is due to a large number of neoblasts, adult stem cells that migrate to the site of damage where they differentiate to replace lost cell types, such as neurons. How neoblasts are attracted to the wound and how they are programmed for differentiation is not well understood. We are especially interested in the signals and their transcriptional outputs that give positional information to neoblasts, and use genetic and proteomic approaches along with cell biological techniques to identify regulators of regeneration.

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Modelorganisms in Biomedical Research

SS

Forschungsmodule  Neuroregeneration in Planarian

WS/SS

Masterarbeit by arrangement

Methoden  planarian flatworms as animal model  transcriptomics und proteomics  common molecular- und cellbiological methods  microscopy Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/research/teams/groups/rgbartscherer/ index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Stem Cell Pluripotency Laboratory Dr. Boris Greber Röntgenstraße 20 48149 Münster  0251 83 46906  boris.greber@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung per E-mail

Forschungsschwerpunkte Human pluripotent stem (hPS) cells can either be derived from preimplantation embryos or from somatic cells, through cellular reprogramming. These cells can in principle be differentiated into virtually any cell type of the human body, which makes them an invaluable tool for either studying early human development in vitro or for generating specific tissues of medical interest. hPS cells can also self-renew meaning that they can be indefinitely expanded to serve as an unlimited source for generating the differentiated cells of interest.

However, the factors leading to the various specialized cell types are only partially known. We seek to gain a better understanding of the mechanisms driving differentiation of hPSCs specifically into cardiac muscle cells as well as into defined cardiac subtypes such as ventricular and atrial cells. To this end, we are elucidating the molecular signals and intrinsic factors driving cell fate decisions along the cardiac cell lineage. Using recombinant signaling factors, small molecule inhibitors of pathways, as well as genetic engineering, we want to gain as much control as possible for manipulating cell fate decisions in this context.

The cells will also be utilized for applied purposes such as cardiac disease modeling based on patient-specific iPS cells.

Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Cellular Reprogramming in regenerative Medicine

WS

 Cellular Reprogramming and iPS Cell Research

SS

Forschungsmodule  not available Masterarbeit by arrangement

Methoden  culture and differentiation of human pluripotent stem cells  direct reprogramming of human somatic cells  overexpression / knock-down / knock-out in hPSCs  standard procedures in molecular biology (molecular cloning, real-timePCR, western blotting, immunocytochemistry, etc.)

 genome-wide expression analysis, ChIP-sequencing Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/research/teams/ groups/rggreber/index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

RNA Biologie Dr. Sebastian Leidel Von-Esmarch-Straße 54 48149 Münster  0251 83 46848  sebastian.leidel@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  RNA Modifikation  nicht-kodierende RNA  RNA Biologie  Evolution

Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  Mitarbeit an unterschiedlichen Projekten im Rahmen der Forschungsarbeiten in unserer Gruppe

Masterarbeit … ist möglich.

Methoden  Protein– und RNA-Biochemie  Hefegenetik  Zellbiologie  chemische Genetik  molekularbiologische Techniken Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/research/teams/groups/rgleidel/index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Laboratory for Cardiovascular Patterning Dr. Arndt Siekmann Röntgenstraße 20 48149 Münster  0251 70365 459  arndt.siekmann@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte The goal of our lab is to understand the processes that are important for the proper formation of the cardiovascular system, which is the first organ system to form during development. It consists of an elaborately branched blood vessel tree, providing nutrients and oxygen to all parts of the body. In order to better understand blood vessel formation, we utilize zebrafish as a model organism.

Available transgenic lines, marking endothelial cells with fluorescent proteins allow for the in vivo observation of the developing vascular system. In addition, forward and reverse genetic tools permit a detailed analysis of the genes important for endothelial development. We are particularly interested in the question how individual blood vessels connect to each other and thereby establish a functional circulation. We are furthermore interested in understanding how blood flow influences endohelial gene expression patterns.

Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  not available Forschungsmodule 1 place in the summer and 1 place in the winter semester:

 generating a zebrafish mutant using TALEN technology  analysis of endothelial gene expression patterns using mRNA in situ hybridization

 in vivo analysis of blood vessel formation using confocal microscopy Masterarbeit Prerequisite: research module in the group.

Methoden  molecular biology (cloning, working with plasmids, PCR)  confocal microscopy  mRNA in situ hybridization  cell transplantations  microinjection of zebrafish embryos Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/research/teams/groups/rgsiekmann/ index.html

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Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

Molecular Neurogenetics Laboratory Dr. Erik Storkebaum Von-Esmarch-Str. 54 48149 Münster  0251 83 46895  erik.storkebaum@mpi-muenster.mpg.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte We are an international group and our working language is English. Our team aims at deciphering the molecular mechanisms of motor neurodegenerative disorders, in particular CMT and ALS. The aim of our research is to provide new insights into the molecular pathogenesis, what could eventually lead to the development of effective treatments for these incurable diseases.

For CMT, we focus on dominant mutations in three different tRNA synthetases (YARS, GARS and AARS) that all give rise to CMT neuropathy. Why do mutations in such essential, ubiquitously expressed enzymes give rise to a peripheral neuropathy? We work with drosophila models validating our findings in mouse models.

For ALS, we concentrate on FUS, a protein implicated in several steps of RNA biogenesis. Dominant mutations in FUS give rise to familial ALS raising the possibility that defects in RNA biogenesis could cause or contribute to ALS pathogenesis. Next generation RNA sequencing, in combination with genetic screens in Drosophila and validation in mouse models are used to tackle these questions.

Max Planck Institut für Molekulare Biomedizin

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Enträtselung molekularer Mechanismen von Motorneurodegenerativen Erkrankungen durch die Kombination von Drosophila- und Mausgenetik (availability is not linked to any specific semester)

Forschungsmodule  Drosophila und Maus als Modellsysteme für Motoneurodegenerative Erkrankungen (availability is not linked to any specific semester)

Masterarbeit Prerequisite: completed module in the group.

Methoden  Drosophila and mouse genetics  molecular biology techniques  histology and immunohistochemistry  microscopy  morphometric analysis Homepage http://www.mpi-muenster.mpg.de/ research/teams/groups/rgstorkebaum/ index.html

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Zentrum f端r Molekularbiologie der Entz端ndungen (ZMBE)

Quelle: http://de.academic.ru/dic.nsf/dewiki/1437919

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Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

Institut für Infektiologie Prof. Dr. M. Alexander Schmidt Von-Esmarch-Straße 56 48149 Münster  0251 83 56466  infekt@uni-muenster.de  by appointment

Forschungsschwerpunkte The research projects at the Institute focus on the molecular basis of pathogenicity and the defense strategies of the host. We strive for a better understanding of the molecular mechanisms involved in the interplay between pathogenic microorganisms, their target cells, and the respective host organisms.

Furthermore, we expect to identify new ways to circumvent or exploit the ingenuity of pathogenic microbes for improving diagnosis, generate novel therapeutic options, and potentially also develop new preventive measures to combat infectious diseases. Current research is focused on two main related areas: „molecular biology of bacterial infections“ and „mucosal immunology and vaccine development“. Topics include:

 molecular and cellular consequences of pertussis toxin interactions with the blood-brain-barrier – impact on polymicrobial infections (SFB629)

 intestinal pathogenic E. coli, molecular "cross-talk" and signal transduction with cellular barriers and immune cells (GRK1409)

 autopenetrating bacterial effector proteins and modulation of signaling responses in cellular barriers (SFB 1009, IMF)

 potential application of bacterial effector proteins as novel biologics for therapy  molecular interactions of Gram-negative and Gram-positive probiotic bacteria with cellular barriers (DFG)

 molecular biology and glycobiology of the AIDA-I autotransporter family  regulation and application of the AIDA-system

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Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Analyse der Virulenz enteropathogener Bakterien

WS/SS

 Molecular Analysis of infection and inflammation Processes 1

SS

 Molecular Analysis of Infection and Inflammation Processes 2

WS

 Molecular analysis of bacterial infections

WS/SS

 Molecular infection biology

WS/SS

Forschungsmodule  by appointment during winter and summer terms; participation in current research projects of the institute

Masterarbeit Prerequisite: at least one advanced or rather research module in the institute of infektiology

Methoden    

modern molecular biological and microbiological methods Handling of pathogenetic bacteria and cell cultures Immunofluorescence electron microscopy

Homepage http://zmbe.uni-muenster.de/ institutes/ifi/ifiindex_de.htm

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Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

Institut für Medizinische Biochemie Prof. Dr. Volker Gerke Von-Esmarch-Straße 56 48149 Münster  0251 83 56722  gerke@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  Analyse von Membranorganisation und Membrantransport in eukaryontischen Zellen

 Mechanismen der regulierten Exocytose in Endothelzellen  Regulation des Zellkortex bei Zelladhäsion und –migration  biochemische und biophysikalische Charakterisierung von Ca2+bindenden Proteinen

Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

131

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Analyse der zellulären Membrandynamik

WS/SS

 Molekulare Zellbiologie subzellulärer Kompartimente

WS/SS

 Molecular Analysis of Infection and Inflammation Processes

WS/SS

 Molekulare Zellbiologie II

SS

Forschungsmodule  Analyse der zellulären Membrandynamik

WS/SS

 Molekulare Zellbiologie subzellulärer Kompartimente

WS/SS

Masterarbeit Alle Studiengänge möglich. Voraussetzung: Fortgeschrittenen- bzw.

Forschungsmodul.

Methoden  Zellkultur; Präparation und Analyse primärer Zellen  Fluoreszenz- und Lebendzellmikroskopie, hochauflösende Mikroskopie  Analyse und Darstellung von Membrantransport (Endo-, Exocytose) und Zellmigration

 molekularbiologische Methoden; Klonierung, Mutagenese, Transfektion  Proteinexpression und –reinigung  biochemische und biophysikalische Methoden; Zellfraktionierung, Proteininteraktion, Lipidbindung, Oberflächenanalysen (Biacore, Mikrowaage)

Homepage http://zmbe.uni-muenster.de/institutes/imb/imbmain.htm

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Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

Institut für Medizinische Biochemie Prof. Dr. Klaus Ebnet Instituts-assoziierte Forschungsgruppe: Zelladhäsion und Zellpolarität Von-Esmarch-Straße 56 48149 Münster  0251 83 52127  ebnetk@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Epithelien bilden Zellverbände, die die Organe gegen die Außenwelt (Hautoder Darmepithel) bzw. gegen die inneren Leibeshöhlen abgrenzen. Endothelzellen sind spezielle Epithelzellen, die die Innenseiten der Blut- und Lymphgefäße auskleiden. Über Zellkontakte sind die einzelnen Epithel- bzw. Endothelzellen in den Zellverband eingebettet. Unsere AG beschäftigt sich mit dem Aufbau solcher Zellkontakte und insbesondere mit Adhäsionsmolekülen.

Diese sind Transmembranproteine, die über ihre extrazellulären Domänen mit den Adhäsionsmolekülen der Nachbarzelle verbunden sind und über ihre intrazellulären Domänen mit zytoplasmatischen Proteinen assoziiert sind. Wir beschäftigen uns mit zwei Klassen von Adhäsionsmolekülen, den Junctional Adhesion Molecules (JAMs) und den Cadherinen. Unser Forschungsansatz besteht darin, zytoplasmatische Interaktionspartner der JAMs bzw. von VEcadherin zu identifizieren, um aus der Funktion der Bindungspartner mehr über die Funktion der Adhäsionsmoleküle zu erfahren. Wenn wir Interaktionspartner identifiziert haben, wenden wir Methoden an, um die Interaktionen zu verifizieren und bezüglich ihrer funktionellen Bedeutung zu analysieren. Über diesen Ansatz ist es uns bisher gelungen, einen Teil der molekularen Mechanismen aufzuklären, durch die die Bildung von Zellkontakten gesteuert wird und die an der Entwicklung funktioneller Epithelzellverbände beteiligt sind.

Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Analyse von Infektions- und Entzündungsprozessen 1 WS/SS  Molekulare Analyse von Infektions- und Entzündungsprozessen 2 WS/SS Forschungsmodule  Molekulare Zellbiologie epithelialer u. endothelialer Zellkontakte WS/SS Masterarbeit Grundkenntnisse in Molekularbiologie und Proteinbiochemie; Interesse an Zellbiologie, Motivation und Einsatzbereitschaft; bei Interesse bietet es sich an, ein Forschungsmodul in der Arbeitsgruppe zu absolvieren (ist jedoch nicht Voraussetzung).

Methoden  Molekularbiologie: Genexpression (RT-PCR), Rekombinante DNA 

  

Techniken (Klonierung, in vitro-Mutagenese) Proteinbiochemie: Proteinaufreinigung aus prokaryontischen und eukaryontischen Zellen; Proteininteraktiosstudien (GST-pulldown, CoImmunpräzipitation); Proteinexpressionsanalysen (Westernblotting); in vitro Phosphorylierung Zellkultur (Primärkulturen, Kultur von Zellinien), transiente Transfektion von Plasmiden und siRNAs, Herstellung von stabilen Zellinien; Zellsynchronisation Mikroskopie: Fluoreszenzmikroskopie/Konfokalmikroskopie; Immunhistochemie, Immunzytochemie funktionelle Methoden: Transepitheliale elektrische Resistenz (TER), parazelluläre Permeabilität für Markerfarbstoffe, Zellproliferation, Mitose, Zellmigration

Homepage http://zmbe.uni-muenster.de/institutes/imb/ebnet/

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Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

Institut für Medizinische Biochemie Dr. Ursula Rescher Instituts-assoziierte Forschungsgruppe Zellbiologie der Signalregulation Von-Esmarch-Straße 56 48149 Münster  0251 83 52121  rescher@uni-muenster.de  Di 11 - 12 Uhr und nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Der Schwerpunkt liegt auf den komplexen molekularen und zellulären Mechanismen, die Entzündung kontrollieren. Weiterführende Informationen auf der Internet-Seite.

Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Zellbiologie subzellulärer Kompartimente

WS/SS

Forschungsmodule  Analyse des zellulären Membrantransports

WS/SS

Masterarbeit Voraussetzung: Modul in der Arbeitsgruppe.

Methoden breites Spektrum molekularbiologischer, biochemischer und zellbiologischer Methoden, u.a.:

 PCR, qRT-PCR, Klonierung, Sequenzierung  biochemische Methoden zur Analyse von Proteinfunktionen in vitro und in vivo

 Zellkulturmodelle  Durchflußzytometrie (FACS)  ELISA  Konfokal/Fluoreszenzmikroskopie  Immunoblotting Homepage http://zmbe.uni-muenster.de/institutes/imb/rescher/reschermain.htm

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Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

Institut für Medizinische Biochemie Institut für Molekulare Virologie Dr. Mario Schelhaas Emmy Noether Gruppe: Virus Endozytose Von-Esmarch-Straße 56 48149 Münster  0251 83 57182  schelhaas@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  Interaktionen zwischen Tumorviren und Zellen während des Zelleintritts  zelluläre Signaltransduktions- und Membrantransportprozesse  Strukturveränderungen viraler Kapside während des Zelleintritts  Systembiologie viraler und zellulärer Endozytose  antivirale Inhibitoren Publikationen: Schelhaas, M., Shah, B., Holzer, M., Blattmann, P., Day, P.M., Schiller, J.T., Helenius, A. (2012). Entry of Human Papillomavirus Type 16 by actin-dependent, clathrin-, caveolin-, and lipid raft independent endocytosis. PLoS pathog. 8, e1002657.

Schelhaas, M. (2010).Come in and take your coat off - how host cells provide endocytosis for virus entry.Cell. Microbiol. 12, 1378-88.

Schelhaas, M., Ewers, H., Rajamäki, M., Day, P., Schiller, J., and A. Helenius (2008).HPV-16 entry: Retrograde cell surface transport along actin-rich protrusions.PLoS pathog. 4, e1000148.

Schelhaas, M., Malmström, J., Pelkmans, L., Haugstetter, J., Ellgaard, L., Grünewald, K., and A. Helenius (2007). Simian Virus 40 depends on ER protein folding and quality control factors for entry into host cells. Cell 131, 516–529.

Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Analyse infektiologischer und entzündlicher Prozesse WS/SS  Zellbiologie der Virusinfektion

WS

Forschungsmodule  Viruseintritt in Wirtszellen Masterarbeit Voraussetzung für eine Masterarbeit ist ein Fortgeschrittenen- oder ein Forschungsmodul. Bevorzugt beides, aber nicht notwendig.

Methoden  Biochemie  Molekularbiologie  Fluoreszenzmikroskopie (epi, cLSM, spinning disk, TIRF)

 Hochdurchsatzverfahren  Lebenzellmikroskopie  Elektronenmikroskopie  Zellkultur  Zellbiologie Homepage http://zmbe.uni-muenster.de/ institutes/imv/schelhaas/ schelhome_de.htm

WS

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Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

Institut für Zellbiologie Prof. Dr. Erez Raz Instituts-assoziierte Forschungsgruppe „Zellbiologie der Signalregulation“ Von-Esmarch-Straße 56 48149 Münster  0251 83 52121  rescher@uni-muenster.de  Di 11 - 12 Uhr und nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Das Institut für Zellbiologie erforscht die grundlegenden Mechanismen der Zellspezifikation und Zellwanderung während der Embryonalentwicklung anhand des Zebrabärblings. Die Arbeit des Instituts konzentriert sich dabei auf die Rolle von RNA-bindenden Proteinen in der Regulation der Zellspezifikation und auf die Kontrolle der Zellwanderung durch Chemokine und ihre Rezeptoren. Eine fehlerhafte Regulation dieser Prozesse ist ein wesentliches Merkmal der Entstehung von Krebs und Entzündungskrankheiten. Die Erforschung der molekularen Grundlagen von Zellidentität und Zellwanderung im Zebrabärbling ermöglicht somit ein besseres Verständnis der Zelltransformation und Invasion von malignen Tumoren, sowie der anormalen Gewebeeinwanderung von Zellen des Immunsystems bei chronischen Entzündungskrankheiten.

Literatur: Goudarzi, M., Banisch, T.U., Mobin, M.B., Maghelli, N., Tarbashevich, K., Strate, I., van den Berg, J., Blaser, H., Bandemer, S., Paluch, E., Bakkers, J., Tolić-Nørrelykke, I.M., Raz, E. (2012) Identification and regulation of a molecular module for bleb-based cell motility. Developmental Cell, 23: 210-218.

Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Analyse infektiologischer und entzündlicher Prozesse WS/SS  Analysis of dynamic developmental Processes in

WS/SS

live Zebrafish Embryos

Forschungsmodule  Molecular Mechanisms controlling Germ Cell Development

WS/SS

in Zebrafish

Masterarbeit Alle Studiengänge möglich

Methoden  Molekularbiologie, Mikroskopie, Analyse der Genexpression während der Embryonalentwicklung

Homepage http://zmbe.uni-muenster.de/institutes/izb/izbmain_de.htm

140

Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE)

weitere Arbeitsgruppen am ZMBE  Prof. Dr. Stephan Ludwig

 

Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen (ZMBE) Institut für Molekulare Virologie Von-Esmarch-Straße 56 48149 Münster  0251 83 57791  ludwigs@uni-muenster.de  nach Vereinbarung Fortgeschrittenenmodule „Molekulare Analyse Influenza Virus induzierter Signalmechanismen“ „Pathogenese viraler Infektionen“ Forschungsmodule „Zelluläre Signalmechanismen infektiöser und entzündlicher Prozesse“ „Charakterisierung verschiedener Virulenzfaktoren von DNA– und RNA -Viren“ „Grundlagen der molekularen Virologie“ Homepage http://zmbe.uni-muenster.de/institutes/imv/imvmain_de.htm

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Universit채tsklinikum M체nster (UKM)

Quelle: Universit채tsklinikum M체nster

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Hygiene, Biomedizinische Massenspektrometrie Dr. Michael Mormann Robert-Koch Straße 41 48149 Münster  0251 83 58440  mmormann@uni-muenster.de  nach Vereinbarung (via Telefon oder E-mail)

Forschungsschwerpunkte Viele Initialschritte von Infektionsprozessen sind durch die Wechselwirkung von Viren, Bakterien bzw. den von Bakterien produzierten Toxinen mit Glykokonjugaten der Zelloberfläche gekennzeichnet. Die strukturelle Charakterisierung der Rezeptorstrukturen ist für das Verständnis einer Vielzahl dieser Prozesse essentiell. Arbeiten zur strukturellen Charakterisierung und Entwicklung von Methoden zur qualitativen und quantitativen Analyse von Glykokonjugaten, d.h. Glykoproteine, Glykolipide und freie Glykane, stellen einen wesentlichen Schwerpunkt unserer dar. Zum Einsatz kommen unter anderen chromatographische Methoden (z. B. HPTLC und HPLC) zur Trennung komplexer Gemische, die mit Massenanalysatoren gekoppelt werden. Die hochauflösende FT-ICR-Massenspektrometrie kommt als alternatives Verfahren zur Charakterisierung von heterogenen Glykokonjugatgemischen zum Einsatz.

143

Universitätsklinikum Münster (UKM)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Biophysikalische Methoden der Molekularbiologie,

SS

Zellbiologie und Physiologie

Forschungsmodule  Methoden zur Charakterisierung von glykosilierten Proteinen

WS/SS

Masterarbeit Nach Belegung eines FoM in unserem Institut sind Studierende aller MScStudiengänge der Biowissenschaften herzlich willkommen, eine Masterarbeit bei uns durchzuführen.

Methoden  massenspektrometrische Verfahren  chromatographische Methoden  enzymatische Methoden zum gezielten Abbau von Glykokonjugaten (Glykoproteine, Glykolipide)

 Surface Accoustic Wave (SAW) zur Untersuchung von nicht-kovalenten Wechselwirkungen

Homepage http://www.campus.uni-muenster.de/hyg_forsch_dreisewerd0.html

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Medizinische Mikrobiologie Prof. Dr. Karsten Becker Domagkstraße 10 48149 Münster  0251 83 55375  kbecker@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  Staphylokokken und ihre natürlichen Habitate  Charakterisierung phänotypischer Varianten von Staphylokokken (sog.

Small-Colony-Variants, SCVs) und ihre Bedeutung für den Infektionsverlauf

 molekulare Epidemiologie und Charakterisierung multiresistenter Stämme von Staphylokokken (Methicillin-resistente Staphylococcus aureus, MRSA)

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  auf Anfrage je nach Verfügbarkeit zu oben angegebenen Themen Masterarbeit Studiengänge: Biologie, Biotechnologie, Biomedizin. Voraussetzung: Interesse an Mikroorganismen; nur in Kooperation und Absprache mit Hochschullehrern des Fachbereichs Biologie.

Methoden  phäno- und genotypische Methoden zum Erregernachweis und zur Erregercharakterisierung (Kultivierungen, Nukleinsäurenachweismethodik, Genotypisierungen, MALDI-TOF MS)

 molekularbiologische Methodik (PCR, qRT-PCR, Klonierung, Sequenzierung)

Homepage http://klinikum.uni-muenster.de/index.php?id=1887

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Medizinische Mikrobiologie Prof. Dr. med. Barbara Kahl Domagkstraße 10 48149 Münster  0251 83 55358  kahl@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  persistierende Staphylococcus aureus Kolonisation und Infektion bei Mukoviszidose

 Adaptation von Staphylococcus aureus während der persistierenden Kolonisation/Infektion bei Mukoviszidose

 Rolle nicht charakterisierter Proteine mit Zellwandanker

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  Untersuchung der Rolle adaptiver Veränderungen von S. aureus während der persistierenden Infektion

Masterarbeit Studiengänge: Biologie, Biotechnologie, Biomedizin (in Kooperation und Absprache mit Hochschullehrern des Fachbereichs Biologie).

Methoden  phäno– und genotypische Methoden zum Erregernachweis und zur Erregercharakterisierung (PCR, Pulsfeld-Gelelektrophorese, multi-locus sequence typing, single-locus sequence-based typing)

 Molekularbiologie (PCR, real-time PCR, Klonierung, Mutagenese,

Proteinexpression in E. coli, SDS-PAGE, Western Blot, ELISA, Fluoreszenzmikroskopie)

 Virulenzanalyse von S. aureus Stämmen (Zellkultur, Durchflusszytometrie, C. elegans Infektionsmodell)

Homepage http://klinikum.uni-muenster.de/index.php?id=3864

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Medizinische Mikrobiologie Prof. Dr. Joachim Kühn Von Stauffenbergstraße 36 48151 Münster  0251 83 54640  kuehnj@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  Assemblierung und Disassemblierung des Herpes simplex-Virus Typ 1

(HSV-1), Funktion viraler Strukturproteine  neuronale Ausbreitung von HSV-1  Wirkung von Naturstoffen gegen Viren

Literatur: W. Hafezi, E.U. Lorentzen., B.R. Eing, M. Müller, N.J.C. King, B. Klupp, T.C. Mettenleiter, J.E. Kühn. (2012). Entry of Herpes Simplex Virus Type 1 (HSV-1) into the Distal Axons of Trigeminal Neurons Favors the Onset of Nonproductive, Silent Infection. PLoS Pathog 8: e 002679.

Liashkovich, I., Hafezi, W., Kühn, JE., Oberleithner, H., Kramr, A., Shahin V. (2008).

Exceptional mechanical and structural stability of HSV-1 unveiled with fluid atomic force microscopy. J Cell Sci 121, 2287-92 Gescher, K., Kühn J., Hafezi, W., Loius, A., Derksen A., Deters, A., Lorentzen E., and Hensel A. (2011). Inhibition of viral adsorption and penetration by an aqueous extract from Rhododendron ferrugineum L. as antiviral principle against herpes simplex virus type-1. Fitoterapia. Apr; 82(3):408-13

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Virologie

WS/SS

Forschungsmodule  Molekulare Virologie Masterarbeit Für Studiengänge der Biologie, Biotechnologie und Biomedizin in Kooperation und Absprache mit Hochschullehrern des Fachbereiches Biologie.

Methoden  Methoden der Viruskultur und der molekularen Virologie (Monolayerund Organkulturen, Immunfluoreszenz und Live Cell Imaging, Elektronenmikroskopie, Immunoblotting, PCR, qRT-PCR, Klonierung, Sequenzierung, in vitro-Mutagenese, Herstellung rekombinanter Viren)

Homepage http://klinikum.uni-muenster.de/ index.php?id=1890

Abbildung: HSV-1-infiziertes Trigeminalexplantat, Virusinfizierte Zellen sind grün dargestellt, sensorische Neuronen rot.

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Medizinische Mikrobiologie PD Dr. Christine Heilmann Domagkstraße 10 48149 Münster  0251 83 55357  heilmac@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Staphylokokken zählen zu den wichtigsten Infektionserregern beim Menschen und verursachen lebensbedrohliche Infektionen, wie die Endokarditis, Osteomyelitis, Pneumonie und Sepsis, die Fremdkörper-assoziiert sein können.

Die Pathogenese dieser Infektionen ist gekennzeichnet durch die ausgeprägte Fähigkeit der Staphylokokken, an biotische und abiotische Oberflächen zu adhärieren und diese durch die Bildung eines Biofilmes zu kolonisieren. Unsere Arbeitsgruppe beschäftigt sich mit der molekularen Charakterisierung der Pathogenitätsmechanismen von Staphylokokken, insbesondere der Biofilmbildung von Staphylococcus aureus und Staphylococcus epidermidis. Dabei haben wir in den letzten Jahren verschiedene Gene identifiziert und charakterisiert, die die Adhäsion an künstliche Oberflächen (medizinische Instrumente), an natürliche Oberflächen (Wirtsgewebe) oder die interzelluläre Adhäsion (Akkumulation) vermitteln. Dazu zählen das icaADBC Operon, das die Synthese des interzellulären Polysaccharidadhäsins PIA vermittelt, die Autolysin/ Adhäsine AtlE, AtlA, Aaa und Aae sowie das S. aureus Oberflächenprotein SasC. Außerdem beschäftigen wir uns mit der Internalisierung von Staphylokokken durch humane Wirtszellen und konnten dabei einen neuen Mechanismus identifizieren, der bei S. aureus durch AtlA und bei S. epidermidis durch AtlE

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  Mitarbeit an aktuellen Projekten, die sich mit der molekulargenetischen Charakterisierung der Biofilmbildung bei Staphylokokken oder der molekularen Charakterisierung der Staphylokokken-Internalisierungsmechanismen beschäftigen (WS oder SS)

Masterarbeit  Forschungsmodul mit Schwerpunkt Mikrobiologie / Molekularbiologie, idealerweise im Arbeitskreis

 Begeisterung und Engagement für das Projekt  Studiengänge: Biologie, Biomedizin, Biotechnologie Methoden verschiedene (Standard)-Methoden der

 Mikrobiologie  Molekularbiologie (Klonierung, Genexpression, Mutantenherstellung und -analyse)

 Zellkultur  Proteinbiochemie (Proteinaufreinigung, SDS-PAGE, Western Blots, ELISA, etc.)

 Durchflusszytometrie (FACS) Homepage http://klinikum.uni-muenster.de/ index.php?id=1888

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Medizinische Mikrobiologie Dr. Bettina Löffler Domagkstraße 10 48149 Münster  0251 83 55378  loefflerb@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Unsere Arbeitsgruppe untersucht verschiedene Aspekte der Pathogenese von Staphylococcus aureus Infektionen. S. aureus ist ein fakultatives Humanpathogen, das epitheliale Oberflächen vieler Gesunder besiedelt, aber auch sehr schwere Infektionen, wie Endokarditis, Osteomyelitis und Pneumonie, verursachen kann. In verschiedenen Projekten analysieren wir, wie sich die Bakterien an Wirtsstrukturen anheften, in die Wirtszellen eindringen und über die Freisetzung von Toxinen Entzündung und Gewebeschäden auslösen. Neben Gewebezerstörung besitzt S. aureus auch die Fähigkeit, über lange Zeit unauffällig in Wirtszellen zu persistieren, was die Ursache für chronische Infektionen sein könnte. In weiteren Projekten untersuchen wir deshalb die Interaktion von S. aureus mit der Wirtszelle und versuchen, den Mechanismus aufzuklären, der es den Bakterien ermöglicht, innerhalb der Wirtzelle zu überleben. Ein Ziel dabei ist es, therapeutische Möglichkeiten zu finden, auch die langlebigen und versteckten Bakterien abzutöten.

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  Molekulare Virologie Masterarbeit Teilnehmer aller biologischen Studiengänge sind willkommen. Voraussetzung ist Interesse an Mikroorganismen; die Arbeit wird in Kooperation mit Hochschullehrern des Fachbereichs Biologie durchgeführt.

Methoden  Zellkultur (primäre Zellen und Zelllinien)  molekularbiologische Methoden (PCR, real-time PCR, Klonieren, Sequenzieren)

 FACS-Analysen  Mikroskopie (Fluoreszenz- und Lebendzellmikroskopie)  in vivo Infektionsmodelle an der Maus in Zusammenarbeit mit dem Institut für Klinische Radiologie mittels moderner Bildgebung (Kleintier MRt, PET, Fluoreszenz-Tomographie)

Homepage http://klinikum.uni-muenster.de/index.php?id=3908

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Medizinische Physik und Biophysik Prof. Dr. Jürgen Klingauf Robert-Koch-Straße 31 48149 Münster  0251 83 51001  klingauf@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Schwerpunkt unserer Forschung ist die Untersuchung präsynaptischer molekularer Mechanismen während der synaptischen Signalübertragung zwischen Nervenzellen. An der Synapse, den Kontaktstellen zwischen Nervenzellen, erfolgt nach Einstrom von Ca2+-Ionen eine Verschmelzung von präsynaptischen Vesikeln mit der Plasmamembran, die mit einer Freisetzung von Botenstoffen (Neurotransmittern) verbunden ist (Exozytose). Um die synaptische Funktionsfähigkeit aufrecht zu erhalten, muss der Pool an freisetzungsbereiten Vesikeln in der Präsynapse durch einen umgekehrten Prozess, die Endozytose, wieder aufgefüllt werden.

Weitere Informationen: Sinha R, Ahmed S, Jahn R, Klingauf J (2011) „Two synaptobrevin molecules are sufficient for vesicle fusion in central nervous system synapses“ PNAS 108(34):14318-23.

Hua Y, Sinha R, Thiel CS, Schmidt R, Hüve J, Martens H, Hell SW, Egner A, Klingauf J (2011) „A readily retrievable pool of synaptic vesicles“ Nat. Neurosci. 12;14(7):833-9.

Hua Y, Sinha R, Martineau M, Kahms M, Klingauf J (2010) „A common origin of synaptic vesicles undergoing evoked and spontaneous fusion“ Nat. Neurosci. 13 (12):1451-3.

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Molekulare Physiologie der synaptischen Übertragung I

WS/SS

Forschungsmodule  Molekulare Physiologie der synaptischen Übertragung II

WS/SS

Masterarbeit Studierende aller biologischen Studiengänge sind willkommen. Die vorherige Absolvierung eines Forschungsmoduls in unserer Gruppe ist zu empfehlen, stellt jedoch keine Voraussetzung dar.

Methoden  Kultivierung und Präparation von Zellen (Zelllinien, Primärzellen)

 molekularbiologische Techniken (PCR, Klonierung, Transfektion, Mutagenese)

 zeitaufgelöste Fluoreszenzmikroskopie (live cell imaging)

 hochauflösende Fluoreszenzmikroskopie (4Pi, STORM/PALM/TIRF)

 elektrophysiologische Techniken  Elektronenmikroskopie Homepage http://campus.uni-muenster.de/ klingauf.html

Abb.: Fluoreszenzmikroskopische Aufnahme von primären hippokampalen Neuronen, die mit einem GFPFusions-protein und einem an der Vesikelfusion beteiligten SNARE-Protein transfiziert wurden/ elektronenmikroskopische Aufnahme einer neuronalen Synapse.

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Molekulare Tumorbiologie Prof. Dr. Michael Meisterernst Laboratorium für Zelluläre und Molekulare Biologie Robert-Koch-Straße 43 48149 Münster  0251 83 55311  meistere@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Die Abteilung Meisterernst untersucht die Entstehung menschlicher Tumoren mit Schwerpunkt auf den Mechanismen der Genkontrolle und den Proteinen, die diese steuern. Bevorzugte Modelle sind Krebszellen und embryonale Stammzellen. Eine spannende Frage ist, welche Mechanismen die Transformation von Krebszellen kontrollieren und wie diese sich von Wachstums-signalen in gesunden Stammzellen unterscheiden. Wir arbeiten vorwiegend mit biologischen Modellsystemen (Bsp.: konditionale Transformation, genetische Induktion oder Ablation von Onkogenen), seit einiger Zeit auch mit Maus-modellen. Methodische Schwerpunkte sind Zellbiologie, Proteinbiochemie und moderne Techniken der Genomik. Enge Verbindungen bestehen zur Tumormedizin, aber auch zum Entzündungsschwerpunkt, sowie den methodischen Plattformen des IZKF.

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Genkontrolle durch Transkriptionsnetzwerke 1

WS/SS

 Genkontrolle durch Transkriptionsnetzwerke 2

WS/SS

Forschungsmodule  Systemische Analyse molekularer Tumormodelle

WS/SS

 Genkontrolle durch Transkriptionsnetzwerke

WS/SS

Masterarbeit Voraussetzung: Module in unserer Arbeitsgruppe.

Methoden  Proteininteraktion  humane Assays  Chromatin IP  Standardtechniken zur Proteincharakterisierung  qPCR etc.

Homepage www.imtb.uni-muenster.de

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Molekulare Tumorbiologie Prof. Dr. Frank Rosenbauer Arbeitsbereich Molekulare Stammzellbiologie Robert-Koch-Straße 31 48149 Münster  0251 83 55311  frank.rosenbauer@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte One of the main interests of our laboratory is to understand how transcription factors direct normal stem cell functions, such as self-renewal and differentiation, how they program precursors to adopt a certain lineage choice and how disruption of transcription factor activity leads to cancer (stem) cell transformation. Using both transgenic and knock-out mouse models, we are particularly interested in discovering crucial molecular up- and downstream mechanisms that regulate the expression and function of transcription factors. A current research focus in our laboratory is on PU.1. The Ets-family member PU.1 is essential for both myeloid and lymphoid lineages. PU.1 knock-out mice exhibit early lethality and lack of B-lymphocytes and mature myeloid cells in fetal livers.

In addition, PU.1 is important for HSC self-renewal and differentiation into the earliest myeloid and lymphoid progenitors. Furthermore, PU.1 must be properly downregulated in early thymocytes to allow normal T cell development, since enforced PU.1 expression in thymic organ cultures completely blocked T cell production. We and others could reveal that graded changes in PU.1 concentrations have drastic effects on lineage fate decisions. Therefore, a greater understanding of PU.1 gene regulation is the key to deciphering its role in normal hematopoiesis and malignant transformation.

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Hematopoietic stem cells and leukemia 1

WS/SS

 Hematopoietic stem cells and leukemia 2

WS/SS

Forschungsmodule  not available Masterarbeit Two advanced modules in our group. Topics are based on actual research projekts.

Methoden Investigation of transgenic and knock-out mice with diverse cell biological and molecular biological methods.

Homepage www.imtb.uni-muenster.de

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Experimentelle Muskuloskelettale Medizin Prof. Dr. Thomas Pap Albert-Schweitzer-Campus 1 48149 Münster  0251 83 57798  thomas.pap@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Schwerpunkte in der Abteilung „Molekulare Medizin“ des IEMM sind die Erforschung von Mechanismen, die zur Aktivierung mesenchymaler Zellen bei entzündlichen, degenerativen und malignen Erkrankungen des Bewegungsapparates führen bzw. ihre Regenerationsfähigkeit nach Verletzungen und im Alter bestimmen. Zentrale Schwerpunkte sind dabei die stabile Aktivierung synovialer Fibroblasten bei Rheumatoider Arthritis, die Modulierung von Entzündungs- und Differenzierungssignalen in Chondrozyten, Osteoblasten und Osteoklasten. Zudem untersuchen wir die Matrixzerstörung bei rheumatischen Erkrankungen und Tumoren des Bewegungsapparates bzw. aseptischer Endoprothesenlockerung. Thematisch sind diese Forschungsschwerpunkte auf folgende Arbeitsgruppen verteilt:

      

AG Knorpelbiologie (Dr. Jessica Bertrand) AG Gen- und Proteinregulation (Prof. Dr. Thomas Pap) AG Osteoimmunologie (Dr. Berno Dankbar) AG Zelluläre Wechselwirkung (Dr. Adelheid Korb-Pap) AG Molekulare Entzündungsforschung (Dr. Athanasios Stratis) AG Muskuloskelettale Regeneration (Dr. Richard Stange) AG Tumorbiologie (Dr. Frans van Valen)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Zell-Matrix-Interaktionen in Inflammation und Autoimmunität Forschungsmodule  Zelluläre und molekulare Mechanismen der Gelenkzerstörung: Bearbeitung eines individuellen eigenständigen Forschungsprojektes, das in eines der laufenden Forschungsvorhaben des Arbeitskreises (s. o.) ein gebunden ist.

Masterarbeit Voraussetzung: Ein Forschungsmodul in einer Arbeitsgruppe, vorteilhaft wäre auch der Besuch eines FGMs einer AG.

Methoden  Molekularbiologie  Biochemie  versch. Formen der Mikroskopie  Zellkultur  Histochemie  Zellbiologie  Maustechnologie, etc.

Homepage http://campus.uni-muenster.de/iemm.html Abb.: Massive Gelenkzerstörung im arthritischen Mausmodell (oben μCT, mitte Histologie, unten Anfärbung von knochenzerstörenden Osteoklasten

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Experimentelle Muskuloskelettale Medizin Prof. Dr. Christine Hartmann Domagkstraße 3 48149 Münster  0251 83 55995  christine.hartmann@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Analyse der Funktion des kanonischen Wnt-Signalweges und anderer Signalmoleküle während der embryonalen Skeletettwicklung und in postnatalen Prozessen im Modellsystem Mus musculus (Hill et al. 2005, Dev. Cell; Später et al., 2006, Development; Golovchenko et al., 2013) Funktionale Analysen des dual-funktionellen Proteins beta-catenin in embryonalen Stammzellen der Maus (Lyashenko et al. 2011, Nat. Cell Biol)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Einblicke in die Entwicklung des Vertebratenskeletts

SS

Forschungsmodule  nach Absprache Masterarbeit Absolvierung eines Fortgeschrittenenmoduls in unserer Gruppe. Studierende aller drei Masterstudiengänge sind willkommen.

Methoden  Vermittlung von Grundlagen in der Embryonalentwicklung der Maus  histologische Techniken  Visualisierung von Transkripten in ganzen Embryonen und auf Gewebeschnitten (in situ Hybridisierung)

 molekularbiologische Techniken (z.B. PCR, Gelelektrophorese, Klonierung, Herstellung von RNA-Sonden; Herstellung von transgenen Konstrukten)

 Zellkultur – Kultivierung chondrogener und osteoblastogener Zelllinien und deren Charakterisierung (quantitative Expressionsanalysen mittels PCR, Immunoblots; u.a.)

 Arbeit mit embryonalen Stammzellen (ESC) der Maus: Herstellung von modifizierten ESC-Linien, in vitro Differenzierung von ESCs.

 biochemische Techniken (Immnunopräzipitation; Immunoblots; u.a.)

Homepage http://campus.uni-muenster.de/knochen-skelettforschung.html

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Neuropathologie Prof. Dr. Werner Paulus Pottkamp 2 48149 Münster  0251 83 56967  werner.paulus@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte  zelluläre und molekulare Mechanismen der Gliominvasion (Prof. Paulus, Dr. Senner)

 molekulare Pathogenese pädiatrischer Hirntumoren (Prof. Hasselblatt)  molekulare Mechanismen des oligodendroglialen Zelltodes und Remyelinisierung in demyelinisierenden Erkrankungen (Prof. Kuhlmann)

 Analyse von Krankheitsmechanismen bei neurodegenerativen Erkrankungen mittels induziert pluripotenter Stammzellen (Dr. Hargus)

 Drosophila-Modelle neurologischer Krankheiten (Dr. Jeibmann)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  Bearbeitung ausgewählter Themen der einzelnen Forschungsgruppen in einem 8-wöchigen Praktikum (täglich ganztägig) nach Vereinbarung.

Masterarbeit Themen orientieren sich an aktuellen Forschungsarbeiten zu den oben genannten Forschungsschwerpunkten. Teilnahme an einem Forschungsmodul ist wünschenswert.

Methoden  Zellkulturtechniken (Primärkultur, Tumorzelllinien)  Maus-/Drosophila-Modell  Immunhistologie  Kultur und Differenzierung von humanen pluripotenten Stammzellen  Zelltransplantation in die Maus Homepage http://campus.uni-muenster.de/neuropathologie.html

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Institut für Pharmakologie und Toxikologie Prof. Dr. Frank Ulrich Müller Domagkstraße 12 48149 Münster  0251 83 55502  muellerf@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Seit der Entdeckung von Digitalis 1775 von William Withering als erster herzwirksamer Wirkstoff hat sich in der pharmakologischen Erforschung von HerzKreislauf-Erkrankungen viel getan. Trotz Einführung einer Vielzahl von Kardiaka in der zweiten Hälfte des letzten Jahrhunderts stellen Erkrankungen von Herz und Kreislauf immer noch die häufigste Todesursache in der westlichen Welt dar. Das Aufdecken der molekularen Ursachen dieser Erkrankungen steht im Zentrum der aktuellen und zukünftigen pharmakologischen Forschung.

 kardiovaskuläre Rolle cAMP-abhängiger Transkriptionsfaktoren CREB, CREM, ICER, ATF1 und ATF4

 Rolle von Proteinphosphatasen und ihrer Inhibitoren bei der Entwicklung der Herzinsuffizienz PP1, PP2A, Inhibitor2 und B56a

 Bedeutung von Adenosinrezeptoren für Kontraktion und Relaxation des Herzens

 Mutationen Calcium-regulierender Proteine des sarkoplasmatishcen Retikulums Ursache von Herzrhythmusstörungen

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Kardiovaskuläre Physiologie und Pharmakologie

WS

Forschungsmodule  Molekulare Mechanismen und Herzerkrankungen

WS

Masterarbeit Themen orientieren sich an aktuellen Forschungsarbeiten zu den oben genannten Forschungsschwerpunkten. Teilnahme an einem Forschungsmodul ist wünschenswert.

Methoden  Zellkultur permanenter und primärer Zelllinien  viraler Gentransfer  Molekularbiologie / Biochemie  Einzelzell-Elektrophysiologie / Patch-Clamp  Weitfeld-Fluoreszenzmikroskopie  Konfokalmikroskopie  Untersuchungen der Herzphysiologie Homepage http://campus.uni-muenster.de/ pharmtox.html

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Klinik für Hautkrankheiten Prof. Dr. Karin Loser Exp. Dermatologie und Immunbiologie der Haut Domagkstraße 12 48149 Münster  0251 83 52953  loserk@uni-muenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Die Haut ist ein Organ, das kontinuierlich verschiedensten Umwelteinflüssen ausgesetzt ist, wodurch kutane Immunreaktionen induziert werden. Bei der Vermittlung zwischen Umwelt und Immunsystem spielen kutane dendritische Zellen eine große Rolle, da sie als professionelle Antigen-präsentierende Zellen Antigene aufnehmen, anschließend aus der Haut auswandern und im regionalen Lymphknoten Immunantworten auslösen. Zu den Immunreaktionen, die in der Haut induziert werden, zählen beispielsweise die Abwehr von Infektionen, die Kontrolle von Entzündungsreaktionen, aber auch anti-tumorale Immunantworten. Unser Forschungsschwerpunkt liegt auf der Untersuchung von zellulären und molekularen Mechanismen, die der Regulation kutaner Immunantworten in vivo zugrunde liegen. In diesem Zusammenhang konzentrieren sich unsere Forschungsprojekte auf folgende Bereiche:

 Entstehung und Pathogenität von autoreaktiven T-Zellen bei systemischen Autoimmunerkrankungen wie Lupus erythematodes oder Psoriasis vulgaris

 Moleküle der TNF/TNF-Rezeptor Familie und ihre Rolle für die Aktivität sowie periphere Expansion von regulatorischen T-Zellen bei allergischen bzw. atopischen Erkrankungen  Regulation von anti-viralen bzw. anti-bakteriellen kutanen Immunantworten  Bedeutung von Umweltfaktoren und kostimulatorischen Signalen für die Entstehung, Progression und Metastasierung von Hauttumoren

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Regulation von Immunantworten

WS/SS

Forschungsmodule  Rolle von Immunzellen bei der Entstehung von Allergien

WS/SS

Masterarbeit Forschungsmodul mit Schwerpunkt Immunologie, idealerweise im Arbeitskreis Studiengänge Biologie, Biotechnologie, Biomedizin

Methoden  sämtliche Standardmethoden der Molekularbiologie, Zellbiologie und Proteinbiochemie

 Mehrfarben-Durchflusszytometrie  Histologie  Intravitalmikroskopie  Imaging Homepage http://klinikum.uni-muenster.de/index.php?id=hautklinik_forschung

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Klinik für Kinder- und Jugendmedizin - Allgemeine Pädiatrie Prof. Dr. Heymut Omran Albert-Schweitzer-Campus 1 48149 Münster  0251 83 47732  Angelika.Kulms@ukmuenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Wir befassen uns mit genetisch bedingten Erkrankungen von motilen und immotilen Zilien, den sogenannten Ziliopathien. Hierzu haben wir drei sich ergänzende Forschungsschwerpunkte:

 primäre Ziliäre Dyskinesie (PCD), eine autosomal rezessiv vererbte Krankheit, der eine Fehlfunktion beweglicher Zilien zugrunde liegt. Die Zilien (Flimmerhärchen) des respiratorischen Epithels (Lunge, Bronchien, Nasenschleimhaut) sind bei dieser Erkrankung in ihrer Beweglichkeit gestört. Die Folge ist eine mangelhafte mukoziliäre Reinigung der Atemwege und daraus resultierend chronische Entzündungen der Nasennebenhöhlen, des Mittelohres und der Lunge bis hin zum Lungenversagen. Bei ca. der Hälfte der Betroffenen liegt zusätzlich eine spiegelbildliche Anordnung der inneren Organe vor (Situs inversus).

 Lateralisationsdefekte (Lageanomalien von Organen und Organanteilen durch Fehlsteuerung der Körperachsenentwicklung) einschließlich Herz- und Gefäßfehlbildungen, die häufig, aber nicht ausschließlich, im Rahmen der PCD auftreten.

 Nephronophthise, eine seltene, autosomal-rezessiv vererbte Krankheit, die die häufigste genetisch bedingte Ursache für terminales Nierenversagen im Jugendalter ist.

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Analyse von Kandidatengenen, die Ziliopathien verursachen

WS/SS

(molekulargenetisch, histologisch, funktionell)

Forschungsmodule  Mitarbeit an laufenden Projekten zu den Forschungsschwerpunkten Masterarbeit Nach Absprache. Teilnehmer aller biologischen Studiengänge sind willkommen.

Methoden  breites Spektrum molekularbiologischer und genetischer Methoden  Proteinchemie  Histologie  verschiedene Formen der Mikroskopie (u.a. LSM, SEM, TEM)  Maustechnologie Homepage http://pcd.uni-muenster.de

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Klinik für Psychiatrie und Psychotherapie Prof. Dr. Weiqi Zhang Labor für Molekulare Psychiatrie Albert-Schweitzer-Campus 1, Gebäude A9 48149 Münster  0251 83 52580  wzhang@uni-muenster.de  by appointment

Forschungsschwerpunkte Mental illnesses have a multifactorial etiology with a high heritability. Different polymorphisms of candidate genes are believed to susceptibility factors that increase the risk to develop a psychiatric disorder. Nowadays, it is general accepted that the individual risk for mental illness is composed of the interplay of genetic susceptibility and environmental factors. Here, epigenetic mechanisms are believed to be the underlying mediators between genes and environment. Until now, the pathogenetic mechanisms of the psychiatric diseases such as autisms, anxiety disorders as well as schizophrenia are unknown. Identification of the underlying molecular mechanisms is thus crucial for understanding of pathogenesis and for developing novel therapeutic targets for these diseases. We investigate the pathogenetic mechanisms of these diseases on molecular, cellular, network and behavior level in; both human and animal models:

 identification of candidate genes that play a role in the pathogenesis of psychiatric disorders (e.g.anxiety disorders, schizophrenic disorders) in humans.  analyzing epigenetic processes and their functional consequences to uncover the underlying mechanisms which differentially regulate susceptibility genes using different mouse models.  investigating the functional role of different key molecules, such as neuregulin, ErbB4, RGS, neuroligin, neurexin, DHHC7 etc., in brain function.  studying genetic and environmental influences on behavioral endophenotypes using mutant mouse models

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Synaptic plasticity in brain of mouse

WS

Forschungsmodule  Experimental psychiatry  Molecular mechanisms of psychiatric disorders

WS/SS SS

 Current projects in mouse models for neuropsychiatric disorders WS/SS Masterarbeit Prerequisite: completed module in the group. Favorable is a completed research module in the group. All courses of study possible.

Methoden  current methods of molecular genetics & epigenetics  quantitative capture and analysis of social, cognitive and emotinal behaviour (including RFID-based tracking and monitoring)

   

hormone analysis (RIA, ELISA) statistical methods immunohistochemistry electrophysiology on acute brain slices (patch-clamp & field-potential recording)

Homepage http://molpsy.uni-muenster.de

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Klinik und Polklinik für Kardiologie Prof. Dr. Johannes Waltenberger Domagkstraße 3 48149 Münster  0251 83 43201  Melanie.Herzog@ukmuenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Wachstumsfaktoren spielen eine wichtige Rolle für die Entwicklung und für die Funktion unserer Gefäße. Unser übergeordneter Forschungsschwerpunkt ist die Wachstumsfaktor-Modulation im Gefäßsystem. Hieraus ergeben sich mehrere translationale und Grundlagen-bezogene Fragestellungen:

 Rolle von VEGF und anderen Gefäßwachstumsfaktoren für das Homing monozytärer Zellen in der Atherogenese und nach akutem Myokardinfarkt

 molekulare Basis der VEGF-Resistenz, d.h. Nicht-Ansprechen auf Wachstumsfaktor-Stimulation in Anwesenheit pathologischer Prozesse

 gestörte Wachstumsfaktor-Wirkung beim Vorliegen einer Hyperlipidämie

 Signaltransduktions-Defekte  zelluläre Immunaktivierung nach akutem Myokardinfarkt und deren molekulare Basis

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Kardiovaskuläre Risikofaktoren der Monozyten-Funktion - Hyperglykämie and Hyperhomocysteinemie

 Einfluss von BMP-2 auf die Monozytenadhäsion an vaskulären Endothelien

Forschungsmodule  Mononukleare Zelladhäsion an das humane Matrixprotein Fibronektin nach Stimulation mit verschiedenen Liganden

 Einfluss von Wachstumsfaktoren auf mononuklar-endotheliale Zellinteraktionen

 Rolle von Lipoxygenasen bei Diabetes Mellitus und ihre potenzielle Rolle bei disfunktionaler Monozytenmigration

Masterarbeit Einfluss von BMP-9 auf humane Monozyten.

Methoden  molekulare Zellbiologie  Biochemie  Molekularbiologie Homepage http://klinikum.unimuenster.de/index.php? id=medc_kardiologie

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Experimentelle Nephrologie Prof. Dr. Eberhard Schlatter Prof. Dr. Giuliano Ciarimboli Albert-Schweitzer-Campus 1, Gebäude A14 48149 Münster  

0251 83 56991 bzw. 56981 eberhard.schlatter@uni-muenster.de (Prof. Schlatter) gciari@uni-muenster.de (Prof. Ciarimboli)  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Physiologie und Pathophysiologie der Organische Kationentransporter (OCTs).

Die OCTs gehören zur Familie der "Solute Carrier" (SLC22) und zeichnen sich durch eine hohe Polyspezifität aus. Zu diesen Transportern gehören u.a. die elektrogenen OCT-Uniporter. Diese vermitteln die zelluläre Aufnahme und Ausscheidung von kationischen endogenen Metaboliten, sowie vielen exogenen Medikamenten und Toxinen. In diesem Forschungsschwerpunkt werden Struktur-Funktions-beziehungen der OCTs, die Regulation durch Proteinkinasen, die Interaktion mit anderen regulatorischen Proteinen sowie die Rolle der OCTs bei der Entstehung von Medikamentenassozierten Zytotoxizitäten charakterisiert.

Experimentelle Nierentransplantation. Die Nierentransplantation ist das zurzeit beste Verfahren in der Behandlung terminal Niereninsuffizienter. Auch mithilfe der derzeitig verfügbaren Medikamente, können Abstoßungsreaktionen nicht vollständig verhindert werden. So bleibt der chronische Transplantatschaden die Hauptursache eines Transplantatverlusts. Insbesondere vor dem Hintergrund eines knappen Organangebots ist es von immanenter Bedeutung, eine Rejektion mit hoher Sensitivität und Spezifität so früh wie möglich zu entdecken und zu therapieren. In diesem Forschungsschwerpunkt werden funktionelle und immunologische Aspekte der akuten und chronischen Transplantatrejektion am Tiermodell untersucht und nicht invasive bildgebende Methoden zur frühen Detektion von Abstoßungsreaktionen entwickelt und charakterisiert.

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  funktionelle, molekular- und zellbiologische Analyse von epithelialem Transport (8-wöchig, im WS oder SS verfügbar, nach Vereinbarung)

Masterarbeit Voraussetzung: Forschungsmodul in der AG.

Methoden  Wildtyp- und Knockout-Mausmodelle  Zellkulturen  Immunfluoreszenz  Mikrofluorimetrie  Zell-/Molekularbiologie  HPLC Homepage http://campus.uni-muenster.de/expnephr.html

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Molekulare Nephrologie Prof. Dr. Hermann Pavenstädt Albert Schweitzer Campus 1, Gebäude A14 48149 Münster  0251 83 47517  Hermann.Pavenstaedt@ukmuenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Ziel unserer Arbeitsgruppe ist es molekulare Ursachen für renale Erkrankungen zu erforschen. Schwerpunkt unserer Analysen sind dabei Podozyten. Hierbei handelt es sich um hochpolare, lebenslang aktive Zellen der Blut-Urin-Schranke (glomeruläre Filtrationsbarriere), welche mit ihren stark verzweigten Zellfortsätzen und der damit assoziierten Schlitzmembran den trennschärfsten Filter für Proteine in der Niere bilden. Bei fast allen glomerulären Erkrankungen sind Podozyten direkt oder indirekt geschädigt. Diese Schädigung führt zu massivem Proteinverlust (Proteinurie) und einem starken Verlust der Nierenfunktion.

Derzeit werden Fragestellungen zur apiko-basalen Zellpolarität renaler Zellen (Podozyten und tubuläre Zellen), der G-Protein-gekoppelten Signalübertragung (GPCR-Signaling, u. a. zur Biologie des Angiotensin II Rezeptors) sowie zu intrazellulären Transportvorgängen der Podozyten bearbeitet (endolysosomaler Transport, Autophagozytose). Für unsere Analysen setzen wir sowohl in vitro (verschiedenen Ziellinien) und in vivo Systeme (z. B. knockout Mauslinien) ein.

Unser Forschungsmodul richtet sich an die Studierenden der Masterstudiengänge Molekulare Biomedizin, Biowissenschaften und Biotechnologie. Die Betreuung erfolgt durch ein erfahrenes interdisziplinäres Team aus Biologen, Biochemikern und Medizinern.

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  geplant Forschungsmodule Das Forschungsmodul ist 8-wöchig, ganztägig und wird nach Vereinbarung sowohl im WS als auch im SS angeboten. Im Anschluss an das Forschungsmodul sind Masterarbeiten in unserer Gruppe möglich.

Masterarbeit keine Angabe

Methoden  molekularbiologische Methoden: Klonierung und Sequenzierung von DNA, verschiedene PCR-Techniken, Yeast two-hybrid Ansätze, GFP-trap oder Ko-Immunpräzipitationen, Analysen zu Protein-Protein und Protein-Lipid-Interaktionen, transiente Transfektionen von Zelllinien ( z. B. HEK293, HeLa, MDCK).

 zellbiologische Methoden: Generierung von stabilen renalen Zelllinien mit Hilfe retro- und lentiviraler Techniken, induzierbare Überexpression GFP- oder anderweitig getaggter Proteine, shRNA oder miRNA -basierte RNAi Techniken zum gezielten knockdown von Zielgenen.

Einsatz von induzierbaren Expressions- oder RNAi knockdown Systemen (Tet-on-System).

 transgene Tiere: Im Rahmen unserer Untersuchungen werden verschiedenen transgene Mauslinien eingesetzt (wie z. B. konditionale knock Mäuse, Cre- und Reporter-Mauslinien).

Homepage http://campus.uni-muenster.de/mol_neph.html

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Interdisziplinäres Zentrum für Klinische Forschung (IZKF) Dr. Sabine Blaß-Kampmann Albert-Schweitzer-Campus 1, Gebäude D3 48149 Münster  0251 83 58695 oder 58696  Sabine.Blass-Kampmann@ukmuenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Das IZKF Münster fördert innovative Projekte innerhalb der Medizinischen Fakultät in einem breiten Spektrum der Grundlagen- und klinisch-orientierten Forschung. Jährlich werden ungefähr 10 neue Forschungsvorhaben in die Förderung aufgenommen. Die aktuell geförderten Projekte befassen sich mit molekularen Aspekten von Entzündung und Infektion, mit Untersuchungen zu vaskulären Erkrankungen sowie mit Analysen neuro-entzündlicher und neurodegenerativer Erkrankungen. Das aktuelle Angebot ist auf der Internetseite des IZKF Münster einzusehen. Im Rahmen der Förderung bietet das IZKF Münster zahlreiche Doktorandenstellen und Promotionsarbeiten an.

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  keine Forschungsmodule  Workshops und Praktika auf Anfrage möglich im Rahmen der Technologieplattform (http://campus.uni-muenster.de/izkf-coreunits.html)

Masterarbeit Teilnehmer der naturwissenschaftlichen Studiengänge, bevorzugt Biologie, Biochemie, Biotechnologie und Biomedizin sind willkommen (wichtig hierbei ist die erfolgte Absprache mit den Hochschullehrern des Fachbereichs Biologie).

Methoden  breites Spektrum an zellbiologischen, immunologischen und molekularbiologischen Techniken

 Untersuchungen an Wildtyp- und transgenen Mausmodellen  mikroskopische und bildgebende Verfahren Homepage www.izkf.uni-muenster.de Auf der Webseite des IZKF Münster finden Sie außerdem weitere aktuelle Informationen auch zu den Veranstaltungen des IZKF. Reinschauen lohnt sich!

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Zentrum für Krebsmedizin Dr. med. Jörg Haier Comprehensive Cancer Center Münster Albert-Schweitzer-Campus 1 (W1) 48149 Münster  0251 83 57630  joerg.haier@ukmuenster.de  nach Absprache per E-mail

Forschungsschwerpunkte  Mechanismen der Metastasierung, insbesondere Tumorzelladhäsion, -migration und -chemotaxis

 miRNA-Regulation der Tumorprogression und Therapieresistenz  Einflussfaktoren auf Chemotherapie-Resistenz  Einfluss von tumorassoziiierten Fibroblasten auf Progression und Resistenzmechanismen

Universitätsklinikum Münster (UKM)

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Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Mechanismen der Tumorzelladhäsion und –migration (1Platz/Semester) Forschungsmodule  Mechanismen der Chemotherapieresistenz Masterarbeit  mind. ein Modul in der Arbeitsgruppe belegt  sicherer Umgang mit Zellkultur  gute Grundlagenkenntnisse tumorbiologischer Mechanismen und Charakteristika

 Grundkenntnisse der Biostatistik Methoden  Motilitätsassays inkl. Intravital- und Zeitraffermikroskopie  Toxizitäts- und Vitalitätsassays  miRNA-Analytik und –modulation Homepage http://klinikum.uni-muenster.de/index.php?id=cccm

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Zentrum für Reproduktionsmedizin Prof. Dr. Jörg Gromoll Domagkstraße 11 48129 Münster  0251 83 56 447  Joerg.Gromoll@ukmuenster.de  nach Vereinbarung

Forschungsschwerpunkte Das Zentrum für Reproduktionsmedizin und Andrologie (CeRA, Direktor Prof. St. Schlatt) behandelt und untersucht die Ursachen der männlichen Infertilität. In enger Zusammenarbeit von Naturwissenschaftlern mit den behandelnden Ärzten werden genetische, epigenetische sowie endokrinologische Fragestellungen in translationalen Projekten zu den Grundlagen und der Klinik der Fortpflanzung bearbeitet. Dazu führen wir experimentelle in-vitro und invivo Ansätze durch, die von der Verwendung neuester Technologien, wie z.B. Pyrosequenzierung, Raman-Mikroskopie, Imaging- sowie Keimzelltransplantations-Techniken unterstützt werden.

Das Projektspektrum reicht von der Charakterisierung des X-Chromosoms bis hin zur spektralen Charakterisierung von Spermien. Das CeRA ist eine stark forschungsorientierte Einrichtung, die sich vorwiegend über Drittmittel finanziert, so z.B. durch die DFG-Forschergruppe ‚Germ Cell Potential‘ (Sprecher Prof. J. Gromoll) .

Für interessierte Studenten führen wir jährlich eine Sommerakademie zu „Grundlagen und Klinik der Fortpflanzung“ durch, weitere Informationen über unsere Homepage.

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Universitätsklinikum Münster (UKM)

Lehrangebot Fortgeschrittenenmodule  Biologie der Reproduktion:

WS

Umfassende Einführung in die Grundlagen der männlichen und weiblichen Fortpflanzung, Klinik der Infertilität, Einführung in aktuelle Forschungsprojekte und neueste Technologien.

Forschungsmodule  Gonadale Stammzellen (St. Schlatt, Beginn nach Absprache jederzeit möglich)

 Epigenetik der Keimzellen (Beginn nach Absprache jederzeit möglich)  weitere Themen möglich Masterarbeit Nach Absprache.

Methoden        

bildgebende Verfahren Hormonbestimmungen Keimzelltransplantation 3D-Zellkultur Pyro-Sequenzierung Immunhistochemie Raman-Spektralmikroskopie Bio-Imaging

Homepage http://repro.klinikum.uni-muenster.de/

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Lageplan der Institute

Lageplan

Welches Institut ist intern/extern?

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Abkürzungsverzeichnis FS IBBP IBC IEB IMMB IMZ INVB IPBP IPMC IZP MPI UKM ZDB ZMBE

Fachschaft Biologie Institut für Biologie und Biotechnologie der Pflanzen Institut für Biochemie Institut für Evolution und Biodiversität Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie Institut für Molekulare Zellbiologie Institut für Neuro– und Verhaltensbiologie Institut für Pharamzeutische Biologie und Phytochemie Institut für Pharmazeutische und Medizinische Chemie Institut für Zoophysiologie Max Planck Institut für molekulare Biomedizin Universitätsklinikum Münster Zentrum für Didaktik der Biologie Zentrum für Molekularbiologie der Entzündung

Welches Institut ist intern/extern?

Hochschullehrer/innen, die laut Vorlesungsverzeichnis bzw. OnlineModulhandbuch regelmäßig Fortgeschrittenen-Module für mindestens einen der drei Master-Studiengänge (Biowissenschaften, Biotechnologie, Molekulare Biomedizin) anbieten, gelten i.d.R. für alle drei MasterStudiengänge als „interne Prüfer“ und ihr Modul-Angebot als „internes Angebot“. Im Zweifelsfall erhalten Sie über das Prüfungsamt Auskunft.

Online-Modulhandbuch: http://www.uni-muenster.de/Biologie/Studieren/modulhandbuch.html

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Notizen

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Impressum

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Impressum Dekanat des Fachbereichs Biologie Schlossgarten 3 48143 Münster  0251 83 23012  dekanat.bio@uni-muenster.de Ansprechpartner Dr. Miriam Pott Zentrum für Didaktik der Biologie/Dekanat des Fachbereichs Biologie  0251 83 21743   pottm@uni-muenster.de Dr. Thomas D‘Souza Zentrum für Didaktik der Biologie/Dekanat des Fachbereichs Biologie  0251 83 23832   thomas.dsouza@uni-muenster.de Redaktion, Gestaltungskonzept, Satz und Layout (Ausgabe WS 2009/10) Alene Kast, Bernadeta Kukuczka & Kerstin Trompelt Aktualisierung und Erweiterung der Broschüre (Ausgabe WS 2011/12) Benjamin Ricken Aktualisierung und Erweiterung der Broschüre (Ausgabe WS 2013/14) Beate Brandhoff & Ina Schlathölter Druck Druckerei der Techniker Krankenkasse Auflage 500 Exemplare Juli 2013