Scieguide Jena 2016

Page 1

Let Life Sciences meet you Biochemie | Biologie | Biotechnologie | Molecular Medicine | Molecular Life Sciences

ScieGuide Jena 2016/2017 Institute und Forschungseinrichtungen in Jena


„Die TK ist meine Nr. 1: Denn sie achtet darauf, dass ihr auch später noch fit durchs Leben kommt." Fit und gesund mit der TK, zum Beispiel durch:

> TK-Gesundheitskurse Besser bewegen, ernähren, entspannen

> „TK-Fit-Check" Persönliche Bestandsaufnahme durch Selbsttests > TK-Gesundheitscoach Der interaktive Personaltrainer auf www.tk.de Nur drei von mehr als 10.000 Leistungen. Ich berate Sie gern ausführlich.


Vorwort Liebe Studierende der Naturwissenschaften, Egal ob Forschung im Grundlagenbereich oder anwendungsorientiert, in Jena gibt es dafür viele Möglichkeiten an der Universität, externen Forschungsinstituten und der Universitätsklinik. Die große Bandbreite an Forschungsmöglichkeiten macht es den meisten Studierenden allerdings auch schwer, sich umfassend über das vorhandene Angebot zu informieren. Daraus ergibt sich auch das Problem für Studierende, die passende Arbeitsgruppe für ihre Abschlussarbeiten aus dem breiten Angebot zu finden. Auch die Forschungsgruppen sind stets auf der Suche nach motivierten Studierenden. Mit dieser Broschüre möchte die btS Jena den Studierenden der Naturwissenschaften einen Überblick über die vielen Forschungseinrichtungen geben und die Suche nach Praktika, Abschlussarbeiten oder einfach Informationen erleichtern. Dabei erhebt der ScieGuide in seiner ersten Auflage keinerlei Anspruch auf Vollständigkeit. Wir möchten ebenfalls hier die Chance nutzen um uns nochmals bei den teilnehmenden Instituten und Arbeitsgruppen zu bedanken, dass sie uns so bereitwillig bei diesem Projekt unterstützt und die Informationen zur Verfügung gestellt haben. Zum Schluss wünschen wir allen Leserinnen viel Spaß beim Durchblättern des ScieGuides, und viel Erfolg bei der Suche nach der passenden Forschungsgruppe.

Die btS-Geschäftsstelle Jena

3


I NHALTSANGABE Friedrich-Loeffler-Institut - Institut für molekulare Pathogenese.. 1 2 AG Chlamydien und Mykoplasmen...................................................... 1 3 AG Genomik der Wirtsanpassung und Virulenz................................... 1 4 AG Infektionsimmunologie................................................................... 1 5 AG Infektionsimmunologie................................................................... 1 6

Friedrich-Schiller Universität Jena................................................... 1 8

Entomology Group............................................................................... 1 9 Angewandte und ökologische Mikrobiologie........................................ 20 Vertebrate Morphology Group.............................................................. 21 AG Heinzel (Biochemie)....................................................................... 22 Professur für Zellbiologie der FSU Jena.............................................. 23 AG Kosan............................................................................................. 24 AG Evolutionäre Entwicklungsbiologie.................................................25 Molekulare Onkologie.......................................................................... 26

Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute........................28

AG Cellerino......................................................................................... 29 AG Englert............................................................................................30 AG Ermolaeva...................................................................................... 31 AG Große............................................................................................. 32 AG Haenold..........................................................................................33 AG Hemmerich.....................................................................................34 AG Kaether.......................................................................................... 35 AG Maltzahn........................................................................................ 37 AG Morrison ........................................................................................ 38 AG Platzer............................................................................................ 39 AG Ploubidou....................................................................................... 40 AG Rudolph..........................................................................................41 4


INHALlSANGABE

AGWang ..............................................................................................42

Hans Knöll lnstltute•• „ ..... „ ................ „ ..... „ ................„ ..... „ .............. 44 Applied Systems Biology......................................................................45 Biobricks of Microbial Natural Product Synthesis.................................46 Biomolecular Chemistry....................................................................... 47 Bio Pilot Plant. ...................................................................................... 48 Cell and Molecular Biology...................................................................49 Chemical Biology of Microbe-Host lnteractions................................... 50 Chemistry of Microbial Communication ................................................51 Fungal Septomics................................................................................ 52 lnfection Biology...................................................................................53 Jena Microbial Resource Collection (JMRC) ....................................... 54 Microbial lmmunology.......................................................................... 55 Microbial Pathogenicity Mechanisms................................................... 56 Molecular and Applied Microbiology.....................................................57 Secondary Metabolism of Predatory Bacteria...................................... 58 Systems Biology I Bioinformatics ......................................................... 59

Max-Planck-Institut für Biogeochemie .•• „ ..... „ ..... „ ......... „ ..... „ ........ 60 Max-Planck-Institut für Biogeochemie ..................................................61

Max Planck Institute for chemical ecology .•••... „ ..... „ ..... „ ......... „ .... 62 Biosynthesis I NMR.............................................................................. 63 Department of Biochemistry................................................................. 64 Department of Bioorganic Chemistry................................................... 65 Department of Entomology ................................................................. 66 Department of Evolutionary Neuroethology......................................... 67 Department of Molecular Ecology........................................................ 68 Experimental Ecology and Evolution ....................................................69

5


I NHALTSANGABE Mass Spectrometry/Proteomics........................................................... 70 Olfactory Coding.................................................................................. 71 Sequestration and Detoxification in Insects......................................... 72

Max-Planck-Institut für Menschheitsgeschichte............................. 74 Archäogenetik...................................................................................... 75

Universitätsklinikum Jena................................................................. 76 Sepsisforschung...................................................................................77 Lehrstuhl für Biophysik......................................................................... 78 Institut für Virologie und Antivirale Therapie......................................... 79 Host Septomics.................................................................................... 80 Institut für Molekulare Zellbiologie........................................................81 Single-Molecule Microscopy Group..................................................... 82 Gynäkologische Molekularbiologie.......................................................83 Laboratory for in-vitro research and routine diagnostic........................ 84 Functional genetics.............................................................................. 85 Institute of Immunology........................................................................ 86 Placenta-Labor..................................................................................... 87 Group of Experimental Nephrology...................................................... 88 RG Petersen/Chen............................................................................... 89 Medical Physics Group Jena................................................................90 Paediatric Oncology............................................................................. 91 Laboratory for Biomaterials.................................................................. 92 Cell Biology of the Cytoskeleton.......................................................... 93 Institute of Biochemistry I..................................................................... 94 AG Signaltransduktion......................................................................... 95 AG Huber............................................................................................. 96 AG Mosig............................................................................................. 97 6


INHALlSANGABE

Extracellular matrix (ECM) I Myocardial Remodelling .......................... 98 Prenatal Monitoring of Autonomie Maturation.. „„ ... „„ .... „„ ... „„ ... „„ ... 99 AlertsNet. ........................................................................................... 101 Prof. Dr. rer. nat. / med. habil. Michael Hartmann.. „„ ... „„ ... „„ ... „„... 102 Experimental Transplantation Surgery„ .. „„ .... „„ ... „„ ... „„ ... „„... „„... 103 Prof. Dr. rer. nat. / med. habil. Michael Hartmann.. „„ ... „„ ... „„ ... „„... 104 AG Biolmaging ................................................................................... 105 Biomagnetic Center............................................................................106 QUIPS/PAIN OUT Projekte................................................................ 107 Spektroskopische Diagnostik............................................................. 108 Center for lnfectious Diseases and lnfection Control .. „„ .... „„ ... „„ .... 109 Fetal Programming of Diseases in Later Life .. „„ ... „„ ... „„ ... „„... „„... 11 O Research Group Hippocampal Plasticity„ ... „„ ... „„ ... „„ .... „„ ... „„ ... „.111 AG Wartenberg: Molekulare Kardiologie und Stammzellforschung„.112 Nephrology and Rheumatology Research Group .... „„ ... „„ ... „„ ... „„. 113

7


WIR ÜBER UNS Was macht die btS?

Für Studierende. Von Studierenden. Unser Ziel ist es, Euch den Einstieg in das Berufsleben zu erleichtern und Euch einen Einblick in die reale Welt der Life Sciences zu geben. Daher organisieren wir für Euch aufschlussreiche Workshops, Exkursionen und Vortragsreihen. Der Kreativität der Mitglieder sind dabei keine Grenzen gesetzt. Jedes btS-Mitglied kann selbst entscheiden, in welchem Bereich und mit wie viel Verantwortung er/sie sich mit einbringen möchte. Durch die Mitwirkung in der lokalen Geschäftsstelle werden vor allem die Soft Skills wie Kommunikationsfähigkeit, Organisationsgeschick und Teamfähigkeit trainiert. Neben der bundesweiten Vernetzung mit anderen Mitgliedern und bereits im Beruf stehenden Alumnis, bietet Dir die Mitarbeit in der btS noch weitere Vorteile. Ihr erhaltet ein Abo der Zeitschrift |transkript und die einmalige Chance, durch unsere Partner direkt über Jobangebote informiert zu werden.

Die btS in Jena

Engagier dich und werde selbst kreativ! Unsere Geschäftsstelle in Jena gibt es seit Ende 201 0. In lockerer Atmosphäre kannst Du direkt in Kontakt mit Studierenden und Promovenden aus anderen Semestern und den verschiedensten Studienrichtungen der Naturwissenschaften treten. Auch potentielle Arbeitgeber kannst Du bei uns schon während des Studiums kennenlernen. Als aktives btS-Mitglied hast Du die Möglichkeit gleich doppelt von unseren vielfältigen Veranstaltungen zu profitieren. Du lernst selbstbewusst auf Unternehmen zuzugehen, kannst viele Erfahrungen im Bereich des Projektmanagements sammeln und hast dabei auch noch Spaß. Du hast eine Idee für ein Projekt oder wünschst Dir eine bestimmte Veranstaltung? Komm vorbei und bestimme mit was läuft!

8


WIR ÜBER UNS

Scie Dabeil Wir treffen uns regelmäßig alle zwei Wochen. Für den genauen Termin kontaktiere uns einfach via E-mail (Vorstand.Jena@bts-ev.de) oder sprich uns einfach persönlich an. Wenn Du über unsere Events auf dem laufenden gehalten werden willst, dann besuch doch einfach unsere Homepage (www.jena.bts-ev.de) oder unsere Facebook-Seite (facebook.com/btS.Jena).

9



Kategorien

!Biochemie

1

Neurologie

~Onkologie 1

Pflanzenbiochemie Pharmazie

lvirologie

11


FRIEDRICH-LOEFFLER-INSTITUT INSTITUT FÜR MOLEKULARE PATHOGENESE

lnstltutaleltung

Prof. Dr. Christian Menge

Anschrift

Naurnburger Str. 96a

07743Jena

Lage

Das Institut für molekulare Pathogenese (IMP) repräsentiert zusammen mit dem Institut für bakterielle Infektionen und Zoonosen, ebenfalls am Standort Jena, die Kompetenz des Friedrich-Loeffler-lnstituts in der Erforschung bakterieller Infektionserreger. Das IMP hat die Aufgabe, die Interaktion zwischen bakteriellen Erregern von Tierseuchen und Zoonosen und ihren Wirten auf molekularer Ebene zu charakterisieren, die gewonnenen Erkenntnisse bezüglich ihrer Relevanz im Gesamtorganismus zu evaluieren und daraus Verfahren zur Prophylaxe und Bekämpfung von Infektionen bei landwirtschaftlichen Nutztieren zu entwickeln. Herausragende wissenschaftliche besitzt das Institut

Friedrich-Loeffltr- lnS1itut Bundesforschungsinstitut

für Tiergesundheit

02015 GeoBasls-OEIBKG (C2009).Google

Webseite

://www.fll.de/de/lnstltute linstitut-fuer-molekulareogenese-imp/ FRIEORICH-LOEFflER-INSTITUT

1

E„~.t..„.„„•• '"' ,„„„..••„.

f

12

1

Expertise

- In der Aufklärung der Systematik der Chlamydien und der Entwicklung von Strategien zur Bekämpfung von Chlamydiosen bei Tier und Mensch, sowie - der molekularen Epidemiologie und der Diagnostik von Mykobakterien-Infektionen bei landwirtschaftlichen Nutztieren (Rindertuberkulose und Paratuberkulose).


FRIEDRlett-LOEFFLEF IN[ TUi 1

1

:=:':::::~"::::~~:7~':.:;:::~::

Institut für molekulare Pathogenese

AG Chlamydien und Mykoplasmen Dr. Christiane Schnee Friedrich-Loeffler-lnstitut, Institut für molekulare Pathogenese AG 210, Naumburger Str. 96a 07743Jena christiane.schnee@fli.bund.de www.fli.de/de/institute/institut-fuer-molekulare-pathogenese-imp/arbeitsgruppenforschungsbereiche/ag-chlamydien-und-mykoplasmen/ 1 J '.33~1)~ o JJ'J :ilil~ ~~Tl~~fJ~sm!;.tJHTl J'JJH3 t f!.1'3Ü®I?

3 ""@xr.sr uull~IJil®!000iu1'1:9(,0-!..ln~ri-~a Die Arbeitsgruppe Chlamydien und Mykoplasmen am Institut für molekulare Pathogenese, die auch das Nationale Referenzlabor für Chlamydiose beherbergt, unterstützt die Untersuchungseinrichtungen der Länder bei der Chlamydien- und Mykoplasmendiagnostik durch Abklärung unsicherer Befunde, Bearbeitung von Psittakose- und Lungenseuche-Verdachtsfällen, Optimierung labordiagnostischer Methoden, Abgabe von Referenzmaterial und Durchführung von Ringversuchen. Die Forschungsschwerpunkte liegen zum einen bei der Entwicklung neuer diagnostischer Verfahren wie z.B. DNA-Mikroarrays zur Speziesdifferenzierung oder Genotypisierung sowie Real-Time-PCR-Assays und serologischen Peptidarrays. Zum anderen werden Fragestellungen zu Pathogenitätsmechanismen Chlamydien- und Mykoplasmen-assoziierter Erkrankungen des Rindes, des Schafes und der Vögel bearbeitet. Dabei werden in vitro und Tiermodelle {Kükenembryo, Kalb, Ziege) etabliert und mit molekulargenetischen und zellbiologischen Methoden untersucht.

' '.(@@llQJ,_;,'.f'~ l~@:Jil-Elfi.l • Bernhard Kaltenboeck, College of Veterinary Medicine, Aubum University, USA

• Nicole Borel, Institut für Veterinärpathologie, Universität Zürich, Schweiz • Simone Magnino, lstituto Zooprofilattico Sperimentale, Pavia, Italien

13


D

FRIEORICH-LOEffF IN[ TI

Institut für molekulare Pathogenese

1

1

: :.:.:·: :.:,':'~ : :~ :~:.rz.:;~:~~

AG Genomik der Wirtsanpassung und Virulenz Dr. Christian Berens Friedrich-Loeffler-lnstitut, Institut für molekulare Pathogenese Naumburger Str. 96a 07743Jena christian.berens@fli.bund.de www.fli.de/de/home/

· r 3'3~u~

o JJr ;:r~~~®[fü~ btru~ii~~u©if ~TtJ t'i'JJu03riü!J:Bu~®(f'

4 ~@Xr8 r uull~[fü®~0©~ ~ä-Er[,Q)[J!][fü 'tilla

Entwicklung genetischer Systeme zur Analyse der Auswirkung bakterieller Effektorproteine aus Chlamydia spp. und Coxiella bumetii auf die Infektiosität und Virulenz Struktur-/Funktionsanalysen bakterieller Virulenzfaktoren zur Aufklärung ihrer molekularen Wirkmechanismen Das Reservoir im Reservoir: Geno- und phänotypische Eigenschaften mit Persistenzvermögen in Shigatoxin-bildender Escherichia coli Rinderherden Escherichia coli als biologischer lndikatororganismus zum Nachweis von Kontakten zwischen Haus- und Wildschweinen

' '.(@@lJQl~'.r'~ l~@:Jil-Elfi.l • Prof. Dr. Andreas Klos, Medizinische Hochschule Hannover, Hannover • PD Dr. Anja Lührmann, Universitätsklinikum Erlangen, Erlangen • Prof. Dr. Lothar H. Wieler, RKI Berlin; lnga Eichhorn, Institut für Mikrobiologie und Tierseuchen, Fachbereich Veterinärmedizin der Freien Universität Berlin • Hans-Knöll-lnstitut, Jena

14


FRIEDRlett-LOEFFLEF IN[ TUi 1

1

:=:':::::~"::::~~:7~':.:;:::~::

Institut für molekulare Pathogenese

AG lnfektionsimmunologie Prof. Dr. Christian Menge Friedrich-Loeffler-lnstitut, Institut für molekulare Pathogenese Naumburger Str. 96a 07743Jena christian.menge@fli.bund.de www.fli.de/de/institute/institut-fuer-molekulare-pathogeneseimp/arbeitsgruppen-forschungsbereiche/ag-infektionsimmunologie/ · r '.33~u~ o JJr :iliJ~~~n0dJ~sm!;.t1Hn hJH3 t !!.1'3ü®I?

2 ~@xr.s r uull~IJil®!0001u 1'1:9 t ]Dll n~'(i~a Die Arbeitsgruppe beschäftigt sich mit der Wirt-Pathogen-Interaktion bei Infektionen des Geflügels und der Wiederkäuer mit Salmonellen, Chlamydien, Coxiellen, Mykobakterien und STEC/EHEC.

Methoden - funktionelle und phänotypische Charakterisierung etablierter Zellinien - funktionelle und phänotypische Charakterisierung von Primärzellkulturen von Geflügel und Wiederkäuern - Quantifizierung und funktionelle Analyse Antigen-spezifischer T-Zellen und yi5T-Zellen von Hühnern, Rindern, Ziegen und Schafen mittels Durchflusszytometrie - Quantitative real-time RT-PCR zum Nachweis der Zytokinantwort im Wirt - Proteomanalysen (2D-PAGE) - Immunhistologie - Konfokale Laser-scanning Mikroskopie (KLSM) ' '.(@@lJQJ,_;,'.f'~ l~@:Jil-Elfi.l • Hans-Knöll-lnstitut, Jena • Max-Planck-Institut für Infektionsbiologie (MPllB), Berlin • Universitätsmedizin Greifswald, Institut für Immunologie und Transfusionsmedizin

15


FRIEORICH-LOEffF IN[ TI

Institut für molekulare Pathogenese

1

l '"""'''"""'""'""'""'ra''""'w""h'''

f'1!tra1~ilrch lnstotut'fo'A.mm;i1Hrallh

AG Mykobakterien Dr. Heike Köhler Friedrich-Loeffler-lnstitut, Institut für molekulare Pathogenese Naumburger Str. 96a 07743Jena heike. koehler@fli. bund .de www.fli.de/de/institute/institut-fuer-molekulare-pathogeneseimp/arbeitsgruppen-forschungsbereiche/ag-mykobakterien/ · r 3'3~u~ o JJr ;:r~~~®[fü~ btru~ii~~u©if ~TtJ t'i'JJu03riü!J:Bu~®(f'

3 ~@Xr8 r uull~[fü®~0©~ ~ä-Er[,Q)[J!][fü 'tilla

- Etablierung und Evaluierung bakteriologischer, molekularbiologischer, serologischer und T-Zell-basierter diagnostischer Methoden für Mykobakterieninfektionen von Nutz- und Wildtieren - Flüchtige organische Substanzen (VOC} von Erreger und Wirt als Biomarker bakterieller Infektionen - Testung innovativer Impfstoffe gegen Erreger des Mycobacterium tuberculosis - Komplexes (MTC} im Tiermodell - Vergleichende Untersuchungen von Vertretern des Mycobacterium avium (M.a.}-Komplexes (MAC} auf Genom- und Transkriptomebene zur Identifikation von Virulenzfaktoren. - Molekulare Genotypisierung von Mykobakterien des MTC und MAC zur Aufklärung von lnfektketten und phylogenetischen Zusammenhängen

' '.(@@lJQl~'.r'~ l~@:Jil-Elfi.l • Max-Planck-Institut für Infektionsbiologie (MPllB), Berlin • Universitätsmedizin Greifswald, Institut für Immunologie und Transfusionsmedizin • Universität Rostock, Medizinische Fakultät, Klinik und Poliklinik für Anästhesiologie und lntensivtherapie, Rostock • Thüringer Tierseuchenkasse, Tiergesundheitsdienste, Jena

16


10,811

m

5

r 162 ....o

66

f• 19reic


F RIEDRICH -S CHILLER U NIVERSITÄT Binnen weniger Jahre seit der politischen Wende in Ostdeutschland hat sich die kleine thüringische Universitätsstadt Jena wieder zu Prof. Dr. Walter Rosenthal einem Wissenschaftszentrum von internationalem Rang gemausert. Es herrscht Anschrift Aufbruchstimmung und ein "Denken ohne Grenzen". Doch bei allem Neuanfang blickt Fürstengraben 1 man gern zurück auf die großartigen 07743 Jena Traditionen: Goethe, Schiller, Hegel und Fichte prägten das Geistesleben, Abbe, Zeiß und Schott legten den Grundstein für wirtschaftliche Prosperität. Lage

Universitätspräsident

Die fast 25.000 Universitäts- und Fachhochschul-Studierenden verleihen der 1 00.000 Einwohner-Stadt, die sich traumhaft, von Muschelkalkfelsen umgeben, ins Flusstal der Saale schmiegt, ein immerwährend jugendliches Flair.

Webseite www.uni-jena.de

18

Kurze Wege und ein eng geknüpftes Forschungsnetzwerk sind das Geheimnis für die Renaissance der Saalestadt als Wissenschaftsmetropole. "Man kennt sich", viele der Direktoren und Abteilungsleiter außeruniversitärer Institute in Jena haben zugleich eine Professur an der Alma Mater inne. Darüber hinaus pflegt die Jenaer Uni einen Hochschulverbund mit Halle und Leipzig und gehört zur "Coimbra Group". Gemeinsame, vielfach interdisziplinäre Projekte, z. B. in den fünf DFGSonderforschungsbereichen und den über 20 Graduiertenkollegs und -schulen, sind die natürliche Folge. Das fruchtbare Aufbruchsklima stiftet auch eine ganze Reihe ungewöhnlicher und perspektivenreicher Ansätze in der Forschung, die häufig interdisziplinär und in Verbundnetzwerken verfolgt werden, und in der sich inzwischen fünf Schwerpunktbereiche entwickelt haben. Quelle: www.uni-jena.de


Friedrich-Schiller Universität

Entomology Group Prof. Dr. Rolf Georg Beutel Institut für Spezielle Zoologie und Entwicklungsbiologie Erbertstraße 1 07743 Jena reif. beutel@uni-jena. http://www.uni-jena.de/szeb.html

:f"'· ~L~N5 JIJ

~

The Entomology Group investigates the morphology, high level phylogeny and evolution of the megadiverse Hexapoda (insects). One focus is on the development and optimization of innovative morphological techniques (e.g. µ-computed tomography, 3d reconstruction). Groups of special interest are Zoraptera, other groups of Polyneoptera, Strepsiptera, Coleoptera, and Diptera. Special topics are for instance the head morphology, embryology, the flight apparatus (especially wing reductions, BIG4 project}, attachment structures and effects of miniaturization. The phylogenetic studies are mainly based on morphological data but closely linked to molecular projects, especially 1KITE. Fossils are also investigated with innovative techniques and in a phylogenetic framework.

c 0 0 Q):;,~~ ~l@ Ji 0 • Sugadaira Montane Research Center, Sugadaira, University of Tsukuba, Japan • 1KITE (http://www.1kite.org/); Bonn, Shenzhen, Davis, Jena etc. • Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing • BIG4 (http://big4-project.eu/), Copenhagen

19


D

Friedrich-Schiller Universität

Angewandte und ökologische Mikrobiologie Prof. Dr. Gabriele Diekert Institut für Mikrobiologie Philosophenweg 12 07743 Jena gabriele.diekert@uni-jena.de http://www.mikrobiologie.uni-jena.de/cms/index.php/de/angewandte-undkologische-mikrobiologie-laoem-5

/J0.J 778111~

~~

11~~ ~rru~

.hJ[!f! 1@rLrru QJ ll1~112J.& l~® r

10 "" r• hJ JIJ o ~@ Jll ~1'1l'.r'i}Dl!.ilf

r,

l!ZJ

Die Arbeitsgruppe beschäftigt sich hauptsächlich mit dem Energiestoffwechsel strikt anaerober Bakterien. Dabei stehen folgende Themenbereiche im Mittelpunkt: Reduktive Dechlorierung als Atmungsprozess (Organohalid-Respiration: siehe DFG Forschergruppe FOR1530), anaerobe Etherspaltung (B12abhängige Methyltransferasen), Rolle von Vitamin-B12-Derivaten bei diesen Prozessen, Biosynthese von Norpseudo-B12. Die Physiologie, Biochemie, Energetik, Enzymatik und Molekularbiologie der Organohalid-Respiration und der Etherspaltung wird untersucht. Die Methoden reichen von der Isolierung strikt anaerober Mikroorganismen, deren Charakterisierung bis hin zur Enzymreinigung und -Charakterisierung sowie molekulargenetische Methoden zur Untersuchung der Stoffwechselregulation.

1

0

Q):;,~~ ~l@ .fi ~ J

• Prof. Dr. Holger Dobbek, Humboldt-Universität Berlin, Deutschland • Prof. Dr. Jorge Escalante-Semerena, University of Georgia, Athens, USA •Prof. Dr. Fraser Armstrong, University of Oxford, England • Prof. Dr. Fred Hagen, TU-Delft, Holland

20


Friedrich-Schiller Universität

Vertebrate Morphology Group Prof. Dr. Martin S. Fischer Institut für Spezielle Zoologie und Evolutionsbiologie Erbertstraße 1 07743 Jena Martin.Fischer@uni-jena.de http://www.uni-jena.de/szeb.html

:f"'· ~L~J1r· ll ~ The Vertebrate Morphology Group investigates the functional morphology, life history, phylogeny and evolution of vertebrates from "fish to mammal". We use a variety of different methods such as 30-reconstruction of larval series, high-speed real time movies, high-speed fluoroscopy, biomechanics, and sophisticated histological techniques. The different researchers have highly independent topics but all have the common goal of a better understanding of the major transformations in vertebrate evolution. Please take a lock at the webpage and publications of each researcher.

c 0 0 Q):;,~~ ~l@ Ji 0 •Roger D. Quinn, Roy Ritzmann, Case Western Reserve University • Prof. Dr. Witte, Hartmut, TU Ilmenau, Fakultät für Maschinenbau • Dr. Andreas Karguth, TETRA Gesellschaft für Sensorik, Robotik und Automation mbH, Gewerbepark "Am Wald" 4- 98693 Ilmenau • Dr. Pearson, Martin, Bristol Robotics Laboratory, Univers. of the West of England,

21


D

Friedrich-Schiller Universität

AG Heinzel (Biochemie) Prof. Dr. Thorsten Heinzel Zentrum für Molekulare Biomedizin Hans-Knöll-Str. 2 07745 Jena

G.Eberhardt@uni-jena.de/T.Heinzel@uni-jena.de/maren.godmann@uni-jena.de

"" r• hJ JIJ o ~© Jll ~1'1l '.r'i}Dl!.ilf

r,

l!ZJ

Ein Forschungsschwerpunkt liegt auf der Untersuchung molekularer Mechanismen der Genregulation, insbesondere der Transkriptionsrepression. Transkriptionsfaktoren interagieren oft mit DNAund/oder Histon-modifizierenden Enzymen, die das Chromatin sowie nichtHiston-Proteine durch posttranslationale Modifikationen verändern und somit die Genexpression steuern können. Diese epigenetischen Modifikationen sind reversible, können aber auch ggf. an Tochterzellen vererbt werden. Mittels epigenetischer Mechanismen kann die Zelle trotz des "statischen" Genoms dynamisch auf wechselnde Umweltbedingungen reagieren. Wir sind daran interessiert, wie dieses komplexe und streng koordinierte Zusammenspiel von genetischen und epigenetischen Mechanismen die zelluläre Identität bei normalen Entwicklungsprozessen (warum differenziert eine multipotente Stammzelle?) beeinflusst und welche Rolle eine fehlerhafte Steuerung dieser Programme bei die Entstehung von Krankheiten (z.B. Krebs) spielt.

:f o QJ:;,~~ ~J@ Ji ~ I • Prof. Dr. Oliver Krämer, Institut für Toxikologie, Universitätsmedizin Mainz, • Prof. Dr. Axel Brakhage, Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie (HKI), Jena • Prof. Dr. Zhao-Qi Wang, Leibniz-Institut für Altersforschung (FLI), Jena • Prof. Dr. Rüdiger Behr, Leibniz-Institut für Primatenforschung (DPZ), Göttingen

22


Friedrich-Schiller Universität

Prof. Dr. 8erit Jungnickel 8ioinstrumentezentrum Winzerlaer Strasse 2 Modul 3/Ebene 4 07745 Jena zellbiologie@uni-jena.de http://www.cellbiology.uni-jena.de/cms/

f

"" r' hJ JIJ 0.0-?.J !.;Jjj'f:::J.r'Jij!..JIJ) i 0~:.,

Schwerpunkte: Immunbiologie, Tumorbiologie, Stammzellbiologie, Neurobiologie. Wir analysieren den Mechanismus der Veränderung von Antikörpergenen in 8Zellen über Somatische Hypermutation, und dabei besonders Mechanismen der DNA-Schädigung und DNA-Reparatur sowie den Einfluss von Checkpoint Signalwegen. Ziel ist, zu verstehen wie eine Zelle genau die Gene sehr stark mutieren kann, die sie gerade am dringendsten braucht, ohne dabei durch Mutation anderer Gene Krebs zu verursachen. Seit einiger Zeit analysieren wir auch den Einfluss eines Reparaturwegs auf die Erhaltung von Stammzellen und das Altern, vor allem im Nervensystem, aber auch in anderen Geweben. Auch wollen wir verstehen wie und ob dieser Weg die Tumorbildung vermeidet. In unserem jüngsten Projekt analysieren wir den Einfluss von 8-Zellen und Antikörpern auf die Interaktion des Menschen mit Candida albicans, einem harmlosen Kommensalen, der bei Immunsuppression des Wirts zu einem tödlichen Pathogen werden kann.

:f o QJ:;,~~Hl@ Ji ~ I • Christian Kosan, Institut für Biochemie und Biophysik, Jena • llse Jacobsen, Hans Knöll Institut, Jena • Hortense Slevogt, Septimics, Universitätsklinikum Jena • Ronny Hänold, Fritz Lipmann Institut Jena

23

c


D

Friedrich-Schiller Universität

AG Kosan Dr. Christian Kosan Center for Molecular Biomedicine Hans-Knöll-Str. 2 07745 Jena

christian.kosan@uni-jena.de http://www.biochemie.uni-jena.de/

/J0.J 778111 ] ~~ 6 f

11~<0 :E.cl[fi)~

.hJ[!f! 1@rLrru

"" r• hJ JIJ o ~@ Jl:b'./'1l'.r'i}Dl!.ilf

r,

~ 1Di~112'J.&fü® r

l!ZJ

Zelluläre Prozesse werden durch die exakte Expression von Transkriptionsfaktoren reguliert. Durch die transkriptionelle Regulation und Interaktion mit spezifischen Co-Faktoren werden diese zu bestimmten Zeitpunkten während der Entwicklung aktiviert. Eine Fehlregulation eines oder mehrerer dieser Faktoren kann zu krankhaften Veränderung der Zelle und so zur Krebsentstehung führen. Das Protoonkogen c-Myc und dessen Co-Faktoren sind an vielen Entwicklungsprozessen beteiligt und eine Fehlregulation dieser Faktoren kann zur Tumorentstehung führen. Wir untersuchen die Funktionen von Miz-1 und des Miz-1/Myc-Komplexes bei unterschiedlichen biologischen Fragestellungen und sind interessiert an ihrer Funktion bei: 1.) der Entwicklung und Differenzierung von Blutzellen sowie der Entstehung von Leukämien und Lymphomen 2.) Alterungsprozessen in hematopoetischen Stammzellen (HSC) 3.) adaptiver Stressantwort - die Auswirkung von genotoxischem Stress (DNA-Schädigung) 4.) lnflammation und Sepsis

•Prof. Bauer UKJ, Jena • Prof. Tarik Möröy, Institut de recherches cliniques de Montreal (IRCM) Montreal Kanada • Prof. Hui Zeng Institute of lnfectious Diseases, Beijing Ditan Hospital, Capital Medical University, Peking, China

24


Friedrich-Schiller Universität

AG Evolutionäre Entwicklungsbiologie Prof. Dr. Lennart Olsson Institut für Spezielle Zoologie und Entwicklungsbiologie Erbertstraße 1 07743 Jena lennart.olsson@uni-jena.de

/J0.J 778.n1~ 4 f

~~

"7l'0 0~.rE>~hJ~JHJl d1@ Ill ~JJfüirm ~l~® r

"" r' hJ .nJ a.0-~ !..:JJ1'f~ißl!.mr,0~:...

Die Arbeitsgruppe evolutionäre Entwicklungsbiologie beschäftigt sich vorwiegend mit der Entwicklung und Evolution des muskuloskeletalen Systems der Wirbeltiere. Dabei sind Hauptschwerpunkte die Entstehung von evolutionären Neuheiten und die Evolution von abgeleiteten Reproduktionsformen. Hauptobjekte unserer Forschung sind Amphibien und Knochenfische.

f o 0 :;, ~ml@ .n ~ J • Peter Konstantinidis, Virginia Institute of Marine Science • Simon Leader, University of Roehampton • Timo Moritz, Deutsches Museum für Meereskunde, Stralsund

25


D

Friedrich-Schiller Universität

Molekulare Onkologie PD Dr. Birgit Spänkuch Center for Molecular Biomedicine Hans-Knöll-Straße 2 07745 Jena

birgit.spaenkuch@uni-jena.de http://www.biochemie.uni-jena.de

/J0.J 778.n1~ 2

~~

"71~~ ~rru~

.hJ[!f! 1©rLrru QJ ll1Il11m.&fü®r

f "" r• hJ .nJ o ~© Jll ~1'1l'.r'i}Dl!.llf r, l'2;i Unsere Arbeitsgruppe beschäftigt sich mit der Hemmung von Zellzykluskinasen im Rahmen der Entwicklung neuer Ansätze in der individualisierten Krebstherapie. Dabei ist unser Haupt-Target die Polo-like Kinase 1 {Plk1 ), die für die Mitose aller Zellen essentiell ist. Inhibitoren von Plk1 {niedermolekulare Inhibitoren, siRNAs) werden mit Inhibitoren anderer Kinasen oder Zellzyklus-relevanter Enzyme in Zellkultur kombiniert, wobei aktuell insbesondere Chk1 und Topoisomerase llalpha bearbeitet werden. Unser Hauptaugenmerk liegt in allen Studien bei der Untersuchung potentieller Unterschiede zwischen Krebs- und Nicht-Krebszellen, um mechanistische Unterschiede aufzuklären und mögliche therapeutische Fenster zu identifizieren. Diese Unterschiede liegen z.B. in der unterschiedlichen Funktionalität von Zellzykluskontrollpunkten, wobei hier Unterschiede häufig auf den unterschiedlichen p53-Status zurückzuführen sind oder aber eine unterschiedliche p21-Lokalisation beobachtet werden kann.

• PD Dr. Peter Hemmerich (Jena) • Prof. Dr. Gisbert Schneider (Zürich, Schweiz)

26



LEIBNIZ INSTITUlE ON ÄGING - FRITZ LIPMANN INSTITUlE Directors

Prof. Dr. K. Lenhard Rudolph Dr. Daniele Barthel Address

Beutenbergstraße 11 07745Jena

Location f

l

©2015 GeoBasis-DE/BKG (©2009).Google

Website

http://www.leibniz-fli.de/

... ..·:·:··f 1·

•••• 1

28

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Institute

The Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI} is the first national research institute in Germany focusing on biomedical research on human aging, a multifactorial process controlled by environmental and genetic factors. The research focus on these two program areas is unique at national and international level. The main aim of the research at FLI is to delineate mechanisms that are relevant for human aging and the development of aging induced dysfunction and diseases. To this end, functional genomic platforms and a pipeline of model organisms spanning from invertebrates over genetic mause and fish models towards models were developed. humanized Translational knowledge transfer in cooperation international, national with and local cooperation partners aims at the development of new therapies to preserve tissue maintenance and to reduce the risk of aginginduced diseases thus facilitating healthy and better aging.


••• •

.·:·:··t1• . ... 1

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Insti tute

Fritz Lipmann Institute

AG Cellerino (Biology of Aging) Dr. Alessandro Cellerino Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena alessandro.cellerino@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/associated-research-groups/cellerino/ ~ ~ Q!l[füi)@) :;,r o ((

3 :f"'· ~L'.Z1N5 JIJ

~

The main topic of my resarch is investigating the biological aspects of aging using the short-lived fish Nothobranchius furzeri that was developed at the FLI over the last ten years. My specific fields of interest are: - Aging of brain and neuronal stem cells - Role of microRNAs in aging - Molecular evolutionary studies in the context of aging - Pharmacological interventions into aging We a strong background in Neurobiology and use a variety of techniques ranging from neuroanatomy to transgenesis and analysis of "omics" data. The group is based on a research agreement with Scuola Normale Superiore, Pisa, ltaly.

co

o 0:;..~ml@ J1 0

• Alessandro Cellerino, Scuola Normale Superiore, Pisa, ltaly • Martin Reichard, Institute of Vertebrate Biology, Brno, Checz Republic • Dario Valenzano, Max Planck for Biology of Aging, Cologne, Germany • Antonino Cattaneo, European Brain Research Institute, Rome, ltaly

29

c


D

••• •

Fritz Lipmann Institute

.·:·:··t1• . ... 1

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Institute

AG Englert (Molecular Genetics) Prof. Dr. Christoph Englert Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena christoph.englert@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/research-groups/englert/ ®~~[\ ~hJ [J~~©&liD öJj~

:f"'· ~L8J1'' ll

~ 1b8~

- signaling pathways regulating aging and lifespan in a short-lived vertebrate - molecular basis and age-dependency of regenerative processes - molecular basis of kidney development and homeostasis - animal models: mause, zebratish, Nothobranchius furzeri {short lived killifish}

D c 0 0 Q):;,~~ ~l@ Ji 0 • Carmen Birchmeier, topic: Wt1 in the CNS; MDC Berlin, Germany • Klas Kullander, topic: Wt1 in the CNS; Uppsala University, Sweden • Britta Qualmann/Michael Kessels, topic: characterization of cytoskeletal components in zebrafish, FSU Jena, Germany • Diethelm Wallwiener, topic: Wt1 in female fertility; University Warnen Hospital Tübingen, Germany

30


••• •

.::::.:·fl•I

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Insti tute

Fr"1tz L"1pmann lnst"1tute

~

AG Ermolaeva (Stress tolerance and homeostasis in aging and disease)

L_

PAVING WAYS TO HEALTHY AGING

Dr. Maria A. Ermolaeva Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena maria.ermolaeva@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/research-groups/ermolaeva/ ~ ~ Q!l[(i]i)@)

;.r o J

5 :f"'· ~L~N5 JIJ ~ Our group is interested in finding ways of improving tissue homeostasis during age-related diseases and during normal aging. We combine data obtained in three different model systems (nematode C. elegans, human and mause cells and murine disease models) in order to fulfill this task. Our main areas of interest are (i) stem cell maintenance and (ii) tolerance of tissues to physiological stresses. In the past we already identified treatments which enhance systemic proteostasis and protect nematodes from protein folding stress [Ermolaeva et al, Nature, 2013]. We currently continue by implementing these nematode findings in mause models of colitis and diabetes. In addition our current projects are: (a) studying mechanisms of stem cell quiescence; (b) studying effects of diets and other environmental factors on longevity and organ function; (c) high throughput screens for chemical and natural compounds which promote stress tolerance; (d) molecular basis of trans-generational stress effects.

c 0 0 Q);.~~ ~l@ Ji 0 • Cologne Cluster of Excellence in Cellular Stress Responses in Aging-associated Diseases, Cologne, Germany •Research Training Group 1715 on adaptive responses to stress, Jena, Germany • Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und lnfektionsbiologie/Hans-Knöll-lnstitut (HKI), Jena, Germany • INNOVENT - Technologieentwicklung Jena, Germany 31


D

••• • Fritz Lipmann Institute

c::==========================================-

.:::::·

f li

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Institute

AGGroße Prof. Dr. Frank Große Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena frank.grosse@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/research-groups/grosse/

/J0.J 778.n1~ 7 f

"" r• hJ

~~

"71~~ ~rru~

.hJ[!f! 1©rLrru QJ ll1Il11m.& l~® r

.nJ o ~© Jll ~1'1l'.r'i}Dl!.llf r,

l'2;i

Die Verdopplung der genetischen Information ist ein zentraler Bestandteil aller Lebewesen. Auftretende Fehler während der DNA-Replikation können Krebs verursachen oder zur vorzeitigen Alterung führen. Unsere Forschungsgruppe interessiert sich für die grundlegenden Aspekte der DNAReplikation, deren Regulation und ihren Umgang mit Fehlern, die dabei auftreten können. Wir sehen unsere Forschung als Beitrag zum besseren Verständnis, wie Zellen Replikationsfehlern vorbeugen und dabei vorzeitiger Alterung und letztlich auch dem Zelltod entgehen. Wir behandeln vor allem folgende Fragestellungen: - Wie wird die Replikation initiiert und wie wird sie gestoppt, wenn etwas schief läuft? - Was geschieht mit Replikationsgabeln, die vor einer geschädigten Stelle blockiert werden? - Wie werden blockierte Replikationsgabeln wieder aktiviert und gestartet? - Welcher Art sind die Signale, die den Zelltod veranlassen, wenn geschädigte Stellen sich als irreparabel erweisen?

f o 0:;,~ml@ .n ~ r • Laboratory of Radiobiology and Experimental Radiation Oncology, University Medical Center Hamburg-Eppendorf, D-20246 Hamburg, Germany. • Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine, University of Oulu, Finland. • Institute of Biomedicine, University of Eastern Finland, Kuopio, Finland. • Department of Biochemistry, McGill University, Montreal, Canada.

32


••• •

.::::.:·fl•I

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Insti tute

Fr"1tz L"1pmann lnst"1tute

AG Haenold (Neuroimmunology) Dr. Ronny Hänold Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena ronny.haenold@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/associated-research-groups/weihhaenold/ ~ ~ Q!l[füi)@) :;,r o ((

5 :f"'· ~L'.Z1N5 JIJ

~

Projects: 1. Transcriptional control of neuroplasticity and neurosenescence by NF-KB 2. Microglia-specific activation of NF-KB pathways during neuroinflammation 3. In vivo MRI on small animal scanners for studies of neurodegeneration and regeneration Tools and Methods: 1. Histological, cellular and molecular studies: lmmunohistochemistry, fluorescence microscopy, cell imaging; primary neuronal and glial cell cultures; FACS; proteomics and transcriptomics 2. Neurogenesis and neuritogenesis analysis: Axonal de- and regeneration assays; hippocampal culture 3. Mouse models: Characterization of conditional NF-KB knockout and reporter mice; mause models for acute and chronic neurodegeneration and neuroinflammation; behavioral assays; aging cohorts 4. ln-vivo MR imaging {MRI} of mice: Contrast-enhanced MRI; anatomical T1- and T2 weighted MRI; longitudinal MRI {young postnatal to aged mice}

co

o 0:;..~ml@ J1 0

• Institute of Biochemistry and Biophysics, FSU Jena, Germany • Institute of General Zoology and Animal Physiology, FSU Jena, Germany • Institute of Diagnostic and lnterventional Radiology, University Hospital Jena, Germany • Hans-Berger Department of Neurology, University Hospital Jena, Germany

33

c


D

••• • Fritz Lipmann Institute

.:::::·

f li

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Institute

AG Hemmerich (Core Facility lmaging) PD Dr. Peter Hemmerich Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena peter.hemmerich@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/core-facilities/

/J0.J 778.n1~ 2 f

"" r• hJ

~~

"71~~ ~rru~

.hJ[!f! 1©rLrru QJ ll1Il11m.& l~® r

.nJ o ~© Jll ~1'1l'.r'i}Dl!.llf r,

l'2;i

-Advanced Live Cell lmaging (ALCI) Etablierung und Anwednung von Fluoreszenz-Fluktuationsmikroskopischen Methoden zur Erforschung der Arbeitsweise von ProteinKomplexen in lebenden Zellen (FRAP, FCS, FRET, RICS, etc.). - STED Höchstauflösungs-Mikroskopie Etablierung und Anwendung der Stimulated Emission Depletion (STED)Mikroskopie zur Ultrastuktur-Analyse bis zu einer Auflösung von 30 nm. - Funktion von Kernkörpern Analyse der Assemblierung von subnukleären Strukturen in Zellkernen lebender menschlicher Zellen mittels ALCI und STED. - Telomer-Biologie Analyse der Assemblierungs-Mechanismen von Telomeren in lebenden Zellen mittels ALCI und STED.

f o 0:;,~ml@ .n ~ r • Institut für umweltmedizinische Forschung, Düsseldorf, Deutschland • Heinrich-Pette-lnstitut, Hamburg, Deutschland •Friedrich-Schiller-Universität, Jena (versch. AGs), Deutschland • Adcvanced lmaging Microscopy, Carl Zeiss, Jena, Deutschland

34


••• •

.::::.:·fl•I

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Insti tute

Fr"1tz L"1pmann lnst"1tute

AG Kaether (Membrantransport) Dr. Christoph Kaether Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena christoph.kaether@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/research-groups/kaether

/J0.J 778111] ~~ 10 "" r' hJ JIJ 0.0-?.J !.;Jjj'f:::J.r'Jij!..JIJ) i 0~:.,

Wir untersuchen den Transport sowie die Lokalisation von Proteinen im Innern von Zellen, hauptsächlich von Membranproteinen, die an Alterungsvorgängen beteiligt sind. Dazu nutzen wir eine Vielfalt von Methoden, darunter Video-, Konfokal-, Apotome-Mikroskopie sowie biochemische Methoden (biet, IP, Deglykosylierung, etc.), die Arbeit mit Mausmodellen sowie HochdurchsatzScreenings mit automatischer Mikroskopie. Projekte: -Die Funktion des anti-aging Hormons Klotho -Regulation der Notchsignaltransduktion -Proteinexport an ER-exit sites -Die Funktion des Sortierrezeptors Rer1

1 0 Q) :;,~~ ~l@ .fi ~ J • Koret Hirschberg, Universität Tel Aviv, Israel • Christian Hübner, Humangenetik Universität Jena, Deutschland • Hans-Dieter Arndt, Organische Chemie Universität Jena, Deutschland

35

C


„Die TK ist meine Nr. 1: Denn sie kümmert sich ganz persönlich um uns Studenten. Gleich hier an der Uni ." Die TK für Studierende:

> Betreuung vor Ort Wir sind persönlich für Sie da

> Bei Anruf Hilfe TK-Mitarbeiter und Ärzte sind 24 Stunden erre ichbar

> Reiseimpfungen Kostenübernahme bei empfohlenen Impfungen Nur drei von mehr als 10.000 Leistungen . Ich berate Sie gern ausführlich.


••• •

.::::.:·fl•I

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Insti tute

Fr"1tz L"1pmann lnst"1tute

AG Maltzahn (Stern cells in regeneration of skeletal muscle) Dr. Julia von Maltzahn Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena julia. vonmaltzahn@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/research-groups/von-maltzahn/ ~ ~ Q!l[füi)@) :;,r o ((

8 :f"'· ~L'.Z1N5 JIJ

~

Skeletal muscle serves a multitude of functions in the organism including voluntary locomotion and exhibits a remarkable ability to adapt to physiological demands. Satellite cells are the stem cells of skeletal muscle and are associated with its growth, maintenance and regeneration. Aged skeletal muscle shows a significantly impaired regenerative potential. Our lab investigates the intrinsic differences between adult and aged satellite cells, especially the satellite stem cell subpopulation. This work will provide insights into pathways that are perturbed in aged satellite cells and allow for modification of these pathways thereby rejuvenating aged muscle. To assess the functionality of satellite cells in the aged organism we injure skeletal muscles from adult and aged mice and harvest the muscles at different time points after injury and investigate the muscles regarding regeneration.

co

o 0:;..~ml@ J1 0

• Florian Bentzinger, Nestle, Lausanne, Switzerland • Said Hashemolhosseini, Erlangen, Germany • K.Lenhard Rudolph, FLI, Jena, Germany • Christoph Kaether, FLI, Jena, Germany

37


D

••• • Fritz Lipmann Institute

c::========================================-

.:::::·

f li

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Institute

AG Morrison Dr. Helen Morrison

Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena helen.morrison@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/research_groups/morrison ~ ~ Q!][füi)@) :;,f o(( 8~~[1 ~hJ [J~~©&J~ ö~~

9 :f"'· ~L'.ZlM Jlj

~ \.Si'.Zl~

My lab is interested in the nature of cell communication, and the miswiring of signaling pathways in disease and in the aging process. We focus on age dependent signaling impairments underlying nervous system maintenance and regeneration, and in disease mechanisms for disorders of myelinating cells and nervous system tumors. These disease areas represent a great medical need and our work aims to perform translational work in each area. We use a multidisciplinary approach that includes structural, cellular and mause models. PROJECTS: PERIPHERAL NERVE REGENERATION AND AGING - plasticity of the Schwann cell differentiation - Schwann cell and axonal interactions - role of the microenvironment, during cell repair and cancer development BRAIN PLASTICITY AND THE REGENERATING BRAIN - Ras and Ras-like protein activity control in synaptic and structural neuroplasticity - the cellular basis for memory formation. The regulation of synapse efficacy is important for the healthy aging brain. Co o QJ:;,~:.Hl© Ji 0

• http://www.ctf.org/Research/Synodos.html

38


••• •

.·:·:··t1• . ... 1

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Insti tute

Fritz Lipmann Institute

AG Platzer (Genome Analysis) PD Dr. Matthias Platzer Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena matthias.platzer@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/research-groups/platzer/ ~ ~ Q!l[füi)@) :;,r o ((

8 :f"'· ~L'.Z1N5 JIJ

~

Using next-generation sequencing (NGS) technologies, the group is working on the functional and comparative analysis of genomes and transcriptomes of short- and long-lived model organisms for aging research. - We aim to identify genetic determinants of lifespan and aging-relevant traits in the short-lived turquoise killifish (Nothobranchius furzeri). As a prerequisite, we provide key resources such as a reference sequence of the N. furzeri genome and a comprehensive catalog of transcripts and genes. - We search for molecular networks underlying the exceptionally long-lasting health (healthspan) and longevity of mole-rats. - In close collaboration with clinical partners, we perform functional genomic analyses aimed at the (epi)genetic dissection of multifactorial and agingrelated human diseases like sepsis as well as the influence of prenatal stress on brain aging. - New bioinformatics tools are being developed to facilitate sequence analysis and annotation.

co

o 0:;..~ml@ J1 0

•Prof. Christoph Englert, Dr. Alessandro Cellerino, FLI, Germany • Prof. Michael Bauer, Prof. Andre Scherag, CSCC, Jena University Hospital, Germany • Prof. Matthias Schwab, Neurology, Jena University Hospital, Germany • Prof. Thomas Hildebrand, Leibniz Institute for Zoo and Wildlife Research, Berlin, Germany

39


D

D

••• • Fritz Lipmann Institute

c::==========================================-

.:::::·

f li

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Institute

AG Ploubidou

Dr. Aspasia Plaubidau Leibniz Institute an Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena aspasia.plaubidau@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/assaciated-research-graups/plaubidau/ ®~~[\ ~hJ [J~~©&liD öJj~

i"' , ~L8M JIJ

~ \b8~

Our research tapic is cancer, a majar age-related pathalagy. lt is well established, in different systems, that cytaskeletan deregulatian is assaciated with ancagenic cell grawth. The cytaskeletan fulfills its diverse functians by converting intra- and extra-cellular signals inta structures and structure remadeling. Our primary aim is ta understand haw cytaskeletal signaling, in particular centrasame activity, cantributes ta cell renewal ar cammitment ta differentiatian and haw is this signaling subverted in cancer. We use cultured cells and arganatypic systems, which are analyzed via genamic and RNAi-based functianal genamic technalagies ta define malecular mechanisms af cytaskeletal regulatian. In additian, we emplay mause madels that recapitulate distinct malecular aspects af cancer develapment and argan/tissue hameastasis.

c0

0

Q):;,~~ ~l@ Ji 0

• Bode MH Lange, Berlin, Germany • Marie-Helene Verlhac, Paris, France •Michael Way, London, UK • Kurt Zatloukal, Graz, Austria

40


••• •

.·:·:··t1• . ... 1

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Insti tute

------:::==

Fritz Lipmann Institute

AG Rudolph Prof. Dr. Karl-Lenhard Rudolph Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena lenhard.rudolph@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/research-groups/rudolph/

f

"" r' hJ JIJ 0.0-?.J !.;Jjj'f:::J.r'Jij!..JIJ) i 0~:.,

Die Forschungsgruppe beschäftigt sich mit den Ursachen, Prozessen und Folgen der Stammzellalterung. Die Stammzellen des erwachsenen (adulten) Organismus sind für den lebenslangen Erhalt und die Regeneration der Gewebe und Organe des Körpers unerlässlich. Experimentelle und klinische Daten deuten darauf hin, dass die funktionelle Reserve adulter Stammzellen und damit ihre Regenerationskraft während des Alterns abnehmen. Die molekularen Mechanismen, die dem Funktionsverlust der Stammzellen zugrunde liegen, sind derzeit noch weitgehend unbekannt. Mithilfe genetischer Analysen werden immer mehr Gene und genetische Loci identifiziert, die die Lebensdauer sowie die Geschwindigkeit des Alterns verschiedener Organismen bis hin zum Menschen beeinflussen. Die exakte Funktion, die diese Gene beim Altern von Säugetieren haben, und die mit ihnen verbundenen molekularen Mechanismen sind jedoch bislang ebenfalls nicht ausreichend verstanden. Immer mehr experimentelle Daten lassen vermuten, dass zumindest einige der mit Altern verbundenen Gene auch die funktionelle Reserve adulter Stammzellen beeinflussen.

41


D

••• • Fritz Lipmann Institute

c::==========================================-

.:::::·

f li

Leibniz Institute on AgingFritz Lipmann Institute

AG Wang

Prof. Dr. Zhao-Qi Wang Leibniz Institute on Aging Fritz Lipmann Institute Beutenbergstraße 11 07745 Jena zhao-qi.wang@leibniz-fli.de www.leibniz-fli.de/research/research-groups/wang/ ~ ~ Q!][füi)@) :;, f o(( 8~~[1 ~hJ [J~~©&J~ ö~~

16 :f"'· ~L'.ZlM Jlj

~ \.Si'.Zl~

Our lab uses cellular and molecular tools as well as animal models to dissect how the dysfunction of DNA damage signaling and repair pathways causes pathological changes and aging in humans. Our current specific interests are: 1. The cellular reponse on DNA damage mediated by the key molecules ATR and Nbs1 and their role on the development of age-related diseases, including neuro(de)generation. 2. The biological processes regulated by Poly(ADP-Ribose) homeostasis and Poly(ADP-Ribosyl)ation, the fastest reaction upon DNA damage. 3. The effects of chromatin remodeling, mediated by the histone acetylation cofactor Trrap, on brain development and neurodegeneration.

co

o 0:;..~ml© J10

• Prof. Dr. Yosef Shiloh, Tel Aviv University, Tel Aviv, Israel • Prof. Dr. Wieland B. Huttner, Max-Planck-Institute of Molecular Gell Biology and Genetics, Dresden, Germany •Dr. Axel Behrens, The Francis Crick Institute, London, UK •Prof. Dr. Michael Hottiger, University of Zurich, Zurich, Switzerland

42



LEIBNIZ I NSTITUTE FOR N ATURAL PRODUCT RESEARCH I NFECTION B IOLOGY - H ANS KNÖLL I NSTITUTE Institutsleitung Prof. Dr. Axel A. Brakhage

Anschrift Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

Lage

©201 5 GeoBasis-DE/BKG (©2009).Google

Webseite http://www.leibniz-hki.de

44

AND

Microbial natural products serving as mediators of biological communication are essential for our lives. They do, however, play an ambivalent role: on the one hand, they contribute to the generation of many infectious diseases; on the other hand, they belong to the most important sources provided in drugs such as antibiotics. We investigate the communication between micro-organisms to be able to make use of the acquired know-how to develop innovative components for the diagnosis and therapy of diseases. By means of implementing those research results and the derived models thereof, we make a contribution to the development of the systems biology of an infection.


l·l<I

Hans Knöll Institute

Applied Systems Biology Prof. Dr. Marc Thilo Figge Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 0775 Jena

thilo.figge@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/applied-systems-biology.html ~~(!I.J[fi]i)§)~ f

0

J r®~® 8 fidJ

8 ~~@ r:> bk@ ~

13 " ) :;, ~ ' /f]

©fll [l

&!~ ~

The research group Applied Systems Biology is concerned with the mathematical modelling and computer simulation of infection processes caused by human-pathogenic fungi. The spatio-temporal data basis for these models is acquired by automatizing the data analysis of microscopy images on infection processes for high-throughput scanning. Our aim is to unravel secrets of the dynamical, functional and morphological aspects of the hostpathogen interaction using approaches of image-based systems biology.

45


l·l<I

Hans Knöll Institute

Biobricks of Microbial Natural Product

~ynthesis

Dr. Vita Valiante Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

vito.valiante@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/biobricks-of-microbial-natural-product-syntheses.html j

~ QI.llfi1U .0~ r o J 1'®$.il®iil "" fil iil$.il.fu@&jif11k®$.il

3 ") :;, ~ ' /f] ©fll [l @:)[1$.il With the beginning of the genomic era, secondary metabolite biosynthetic pathways can be predicted by genome mining. These pathways can be isolated and heterologously expressed in amenable organisms to identify new metabolites. Such an approach is more powerful than stochastically trying to activate chemical biosynthesis in lab conditions.

The isolation and structure elucidation of new chemicals can be theoretically used to assign a function to these molecules and to understand their ecological meaning. This approach is not only suitable to increase knowledge about chemical diversity, but can be exploited to uncover the natural role of concealed secondary metabolites. The Junior Research Group "Biobricks of Microbial Natural Product Syntheses" is part of the Leibniz Research Cluster Bio/Synthetic multifunctional micro-production units - Novel ways in bioactive compound development (LRC).

46


l·l<I

Hans Knöll Institute

Prof. Dr. Christian Hertweck Hans Knöll lnsitute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

christian.hertweck@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/biomolecular-chemistry.html

") :;, ~ ' /f]

©fll [l

&J~ ij

The aim of our research projects is to identify pharmacologically relevant compounds in microorganisms as well as toxins and to understand how they are produced. On the basis of this knowledge we investigate the ongin and types of disease-causing substances and try to produce new therapeutics. To achieve these goals, we combine chemical and biological methods. In addition, we are particularly interested in the communication of microorganisms and their interactions. For the discovery of new biologically active compounds we do not only employ chemical analytics and synthetic methods but also genetics. On one hand we search for genes that are involved in the production of biologically active compounds. For this purpose we employ genome-mining approaches. On the other hand we exchange and recombine biosynthesis genes to obtain improved therapeutics.

•Prof. Elke Dittmann, University of Potsdam, Germany • Prof. Jörn Piel, ETH Zürich, Switzerland • Prof. Thilo Stehle, University of Tübingen, Germany

47


Hans Knöll Institute

l·l<I

Bio Pilot Plant Dr. Uwe Horn Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

uwe.horn@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/biotechnikum.html j

~ QI.llfi1U .0~ r o J 1'®$.il®iil "" fil iil$.il.fu@&jif11k®$.il

28 ") :;, ~ ' /f] ©fll [l @:)[1$.il 1. Development and optimization of fermentation processes, downstream processing and product purification procedures and methods for the analysis of process parameters 2. Development of integrated biotechnological high-performance processes and the transfer to industrial applications including strain development and optimization 3. Fermentation under specific physiological conditions • Anaerobic fermentation • Fermentation in the chemostat • High-cell-density fermentation for the synthesis of proteins and biopolymers 4. Development of innovative technologies • Microfluidic platform for ultrahigh-throughput screening of natural products and enzymes • In vitro test systems for the study of microbial adhesion and biofilm formation

• Prof. Klaus Jandt, University of Jena, Germany • Prof. Gabriele König, University of Bonn, Germany • Prof. Erika Kothe, University of Jena, Germany

48


l·l<I

Hans Knöll Institute

Cell and Molecular Biology ~-~--~

Prof. Dr. Hans Peter Saluz Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

hanspeter.saluz@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/cell-and-molecular-biology.html ~~(!I.J[fi]i)§)~ f

0

J r®~® 8 fidJ

8 ~~@ r:> bk@ ~

20 " ) :;, ~ ' /f]

©fll [l

&!~ ~

Research in the Department of Gell and Molecular Biology is devoted to the flow of molecular information during hast-pathogen interactions. As model hosts, we use human cell lines, mice and chicken embryos in ovo. Our main interest lies in the the pathogens of Chlamydiales and pathogenic fungi. Within this framework, we aim at the elucidation of how infections proceed in living organisms (imaging) and how infected organs react on a molecular level (e.g. comparative genomics, transcriptomics and interactomics). lmaging is performed by means of our latest generation positron emission tomography-computed tomography (PET-CT) instrument that provides coregistered images, i.e. it combines the high spatial resolution and anatomical detail of the CT with the molecular, quantifiable images obtained by the PET. Furthermore, we are focussing on comparative genomics, transcriptomics, interactomics and novel technologies like multicolor hyperspectral imaging of biomolecules.

• Hyperspectral imaging, GMBU, Jena, Germany • Microbiome-host interactions, Research Ministry of Marine Affairs and Fisheries, Jakarta, lndonesia • MS-lmaging, Max Planck Institute for Chemical Ecology, Jena, Germany

49


Hans Knöll Institute

l·l<I

Dr. Christine Beemelmanns Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

christine.beemelmanns@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/chemical-biology-of-microbe-host-interactions.html j

~ QI.llfi1U .0~ r o J 1'®$.il®iil "" fil iil$.il.fu@&jif11k®$.il

4 " ) :;, ~ ' /f] ©fll [l @:)[1$.il We are investigating two model systems to understand and fully characterize specific molecular interaction mechanisms between microbes and the eukaryotic hast. Furthermore, we want to harvest the biosynthetic potential of the microbial symbionts to find novel natural products and chemotypes with selective pharmacological potential. Due to the ever-rising numbers of multidrug resistant pathogens, there is a growing need for antimicrobial compounds suitable for medicinal application.

• Chemical analysis of secondary metabolites from microbial (defensive) symbionts • Functional and structural analysis of microbial signaling molecules • Isolation and characterization of antibacterial and antifungal natural products • Total synthesis of natural products and derivatives

r

0

@ p _:;,[j\-;:

f] r flr ·

• Assistant Prof. Michael Thomas-Poulsen, University of Copenhagen, Denmark • Prof. Jon Clardy, Harvard Medical School, Boston, USA • Prof. Nicole King, University of California, USA • Prof. Michael G. Hadfield, University of Hawai'I, Honululu, USA

50


l·l<I

Hans Knöll Institute

Chemistry of Microbial Communication Dr. Pierre Stallforth Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a Jena 07745

pierre.stallforth@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/chemie-mikrobieller-kommunikation.html

6 " ) :;, ~ ' /f]

©fll [l

&J~ ij

The social amoeba Dictyostelium discoideum represents an ideal model organism to study general eukaryotic cellular mechanisms. Differentiation and multicellularity in this protist, however, have evolved in a setting where D. discoideum is surrounded both by mutualistic and pathogenic bacteria. Additionally, bacteria are the major food source of D. discoideum. Only in consideration of this ecological context, can a deep understanding of the fundamental molecular communication and signalling processes be gained. For communication purposes bacteria and the amoeba have evolved mechanisms to produce signals, as weil as cognate sensors. Coevolution of different species typically results in the fact that interplayers adopt components of each other's language. The common language that is of interest to us consists of secreted small molecules. lsolating these compounds, elucidating their structure and determining their function is our main focus.

r

0

@ p _:;,[j\-;:

f] r flr ·

We cooperate with various groups at: • Washington University, St. Louis, USA •MIT, Cambridge, USA • DSMZ, Braunschweig, Germany

51


Hans Knöll Institute

l·l<I

Fungal Septomics Prof. Dr. Oliver Kurzai Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a Jena 07745

oliver.kurzai@leibniz-hki.de www.septomics.de ~~QI.l[fi1[).0~[f'

@1 J'®$ij@[l

-;-:. fil [l$ij.fu@&j[Jft@$ij

12 ") :;, ~ @@ ©fll [l @:l[l® In our team we characterize virulence traits of fungal pathogens in the context of human immunity. We use many important fungal pathogens (Candida albicans, Aspergillus fumigatus, Cryptococcus neoformans) as model organisms and also work with bacterial pathogens for comparative studies. To analyze hast-pathogen interaction, we focus on human innate immune cells and work with purified human neutrophils, monocytes, dendritic cells NK-cells and also with a complex ex vivo whole blood infection assay. A special focus is put on pathogen and hast variability and its genetic background. In close interaction with the German National Reference Center for lnvasive Fungal lnfections (NRZMyk), which is run by our group, we aim to connect basic science with clinical applications.

• Prof. Jürgen Löffler & team, Würzburg, Germany •Dr. Agostinho Carvalho & team, Minho, Portugal • Several companies (e.g. lnflaRx GmbH Jena, Biotype Diagnostic GmbH, Dresden), Germany

52


l·l<I

Hans Knöll Institute

lnfection Biology Prof. Dr. Peter F. Zipfel Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

peter.zipfel@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/infektionsbiologie.html j

~ QI.llfi1U .0~ r o J r®~® 8 J1d1 8 ~~© r:> bt@ ~

25 " ) :;, ~ ' /f]

©fll [l

&!~ ~

The Department of lnfection Biology studies how the human pathogenic yeast Candida albicans evades hast complement attack and consequently causes infections. • Complement and innate immunity • Immune evasion of Candida albicans • Complement evasion of human pathogenic microbes • Pathology of complement mediated human diseases • New diagnostics and therapies of kidney and retinal diseases In addition we analyse how genetic modifications such as mutations, sequence and copy number variations in complement genes cause human disorders that manifest in different organs. The identification of diseaserelated genetic variants and novel autoantibodies contribute to the better understanding of the pathology of the complement mediated kidney disorders and lead to new diagnostics and new therapeutic approaches.

r

0

@ p _:;,[j\-;:

f] r flr ·

• Prof. Thorsten Wiech, Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf, Hamburg, Germany • Prof. Sven Hammerschmidt, University Greifswald, Germany • Prof. Michael Wiesener, University Erlangen-Nürnberg, Germany • Prof. Giuseppe Remuzzi, Dr. Marina Noris, Bergamo, ltaly

53


Hans Knöll Institute

l·l<I

Jena Microbial Resource Collection Dr. Kerstin Voigt Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

kerstin. voigt@leibniz-hki.de www.jmrc.hki-jena.de ~~ (!I.J[fi]i) §)~ f

0

J 1'®$.il®[l

.,.. fil [l$.ij.fu@&j[l1k@$.il

8 ") :;, ~ ' /f]

©fll [l @:)[1$.il

The Jena Microbial Resource Collection (JMRC) is a joint institution of the HKI and the Friedrich Schiller University Jena. The JMRC provides scientific services comprising the collection, storage, maintenance and the worldwide exchange of microbiological resources (micro-organisms, natural products, test capacities). In addition, we research into the biodiversity of fungi as producers of natural products and pathogens causing infectious diseases. Our main focus is on: • Storage, maintenance and world-wide exchange of micro-organisms, natural products and research data • International network of resource data bases • Bioactive compounds profiling • Virulence of Lichtheimia species • Fungus-immune cell interactions • Functional genomics of fungi • Evolution, biodiversity and polyphasic taxonomy of fungi

• Prof. Cornelia Lass-Flörl, Medical University Innsbruck, Austria •Dr. Tamas Papp, University of Szeged, Hungary • 1 KFG project team members, DOE-Joint Genome Institute, Walnut Creek, CA, USA

54


l·l<I

Hans Knöll Institute

Microbial lmmunology Prof. Dr. llse Denise Jacobsen Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

ilse.jacobsen@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/mikrobielle-immunologie.html ~~(!I.J[fi]i)§)~ f

0

J r®~® 8 fidJ

8 ~~@ r:> bk@ ~

13 " ) :;, ~ ' /f]

©fll [l

&!~ ~

The Research Group Microbial lmmunology investigates the interactions between Candida and the hast, aiming at a better understanding of the interactions that lead to pathophysiological alterations. We furthermore strive to understand which process in pathogenesis lead to the development of clinical symptoms and lethal disease. In this regard, we focus on the following aspects: • The role of fungal morphology in pathogenesis • Molecular mechanisms contributing to Candida sepsis • Gastrointestinal colonisation and translocation To address these questions we use microbiological and immunological methods as well as molecular biology in combination with various infection models. We aim to contribute to a better understanding of the processes during infection. This knowledge is indispensable to develop novel strategies for preventing and treating life-threatening Candida infections.

• Prof. Michael Bauer, Jena University Hospital, Germany • Dr. Andreas Beilhack, University Hospital of Würzburg, Germany • Prof. Berit Jungnickel, Friedrich Schiller University Jena, Germany

55


Hans Knöll Institute

l·l<I

Microbial Pathogenicity Mechanisms Prof. Dr. Bernhard Hube Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

bernhard.hube@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/microbial-pathogenicity-mechanisms.html ~~QI.l[fi1[).0~[f'

@1 J'®$ij@[l

-;-:. fil [l$ij.fu@&j[l{t@$ij

17 ") :;, ~ @@ ©fll [l @:l[l® The department Microbial Pathogenicity Mechanisms (MPM) investigates the pathogenesis of mycoses due to Candida species by using cellular, microbial, molecular and biochemical methods. Candida species belang to the normal human microflora, but can cause severe infections when barriers are damaged or the immune system is weakened.

Our research topics are: • Molecular biology of human pathogenic fungi • Functional genomics • HosUpathogen interactions • Metal acquisition • lntracellular survival • Invasion mechanisms • Microevolution • Morphological transitions • Mode of action of antifungal agents

• Dr. Duncan Wilson, University of Aberdeen, United Kingdom • Prof. Christophe d'Enfert, Institut Pasteur, Paris, France •Prof. Thomas Gutsmann, Research Center Borstel, Germany

56


l·l<I

Hans Knöll Institute

Molecular and Applied Microbiolog,_..__ _ __ Prof. Dr. Axel A. Brakhage Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

axel.brakhage@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/molekulare-und-angewandte-mikrobiologie.html

~~QI.l[fi1[).0~[f' @ff r®~® 3 J'idJ füj ?.J@ r:> bk@ ~

36 " ) :;, ~ @@

©fll [l &JI) ij

The Department carries out research in the following areas: • lnfection biology of human-pathogenic fungi • Molecular/synthetic biotechnology of natural products • Microbial communication and natural products • Eukaryotic transcription factors and signal transduction • Stress- and immunoproteomics Aspergillus fumigatus is the most important airborne fungal pathogen of humans. For elucidation of hast-pathogen interactions and of virulence determinants state-of-the-art functional genomics tools and cell biological methods are applied. Fungi produce numerous secondary metabolites including antibiotics. We uncover regulatory mechanisms of natural product biosyntheses as well as mechanisms of microbial interactions influencing natural product production. This research represents a new avenue of drug discovery.

• Institut Pasteur, Paris, France • Innsbruck Medical University, Innsbruck, Austria • Charite, Berlin

57


Hans Knöll Institute

Secondary Metabolism of Predatory Bacteria Priv.-Doz. Dr. Markus Nett Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

markus.nett@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/sekundaermetabolismus-raeuberischer-bakterien.html j

~ (!I.J[fi]i) §)~ f

0

J 1'®$.il®[l

.,.. fil [1$.ij.fu@&j[J @$.il

6 ") :;, ~ ' /f] ©fll [l ~[1$.ij Our research focuses on antimicrobial natural products. We are particularly interested in

• The identification of novel antibiotics from predatory bacteria • The development of genomics-inspired strategies for drug discovery • Antibiotic biosynthesis • The engineering of bacterial pathways for the generation of customized drugs • Biotechnological methods for the production of natural products

•Prof. Rolf Müller, Helmholtz Institute for Pharmaceutical Research, Germany • Prof. Manuela Tosin, University of Warwick, UK • Prof. Oliver Werz, Friedrich-Schiller-University Jena, Germany

58

l·l<I


l·l<I

Hans Knöll Institute

Systems Biology I Bioinformatics Prof. Dr. Reinhard Guthke Hans Knöll Institute Beutenbergstrasse 11 a 07745 Jena

reinhard.guthke@leibniz-hki.de www.leibniz-hki.de/en/systembiologie-und-bioinformatik.html j

~ QI.llfi1U .0~ r o J r®~® 8 J1d1 8 ~~© r:> bt@ ~

15 " ) :;, ~ ' /f]

©fll [l

&!~ ~

The Research Group Systems Biology/Bioinformatics is dedicated to the integrated computational analysis of genome, transcriptome, proteome and metabolome as weil as microbiological and clinical data. A central task is the gene expression analysis of fungi producing secondary metabolites as weil as of the pathogenic fungi Candida albicans and Aspergillus fumigatus and their interaction with the human immune system by microarray and RNA-Seq data. The data analysis comprises the management of heterogeneous large-scale experimental data, pre-processing, discovery of the main features and patterns by data mining techniques and - finally - prediction of experimentally testable hypotheses. Hypotheses of interest concern molecular interactions between host and pathogen, or between transcription factors and their target genes within the host or the pathogen or the fungus that produces an natural product.

• Würzburg University Hospital, Würzburg, Germany • Gebze Technical University, Gebze-Kocaeli, Turkey • BioControl Jena GmbH, Jena, Germany

59


M AX-P LANCK-I NSTITUT FÜR B IOGEOCHEMIE Institutsleitung Prof. Dr. Martin Heimann Prof. Susan E. Trumbore Prof. Dr. Markus Reichstein

Anschrift Hans-Knöll-Str. 1 0 07745 Jena

Lage

Die Erde im Blickpunkt Wir erforschen, wie lebende Organismen inklusive der Mensch - grundlegende Stoffe wie Wasser, Kohlenstoff, Stickstoff sowie Energie mit ihrer Umwelt austauschen. Wir wollen besser verstehen, wie dieser Austausch und der globale Wandel des Klimas und der Umwelt sich gegenseitig beeinflussen. Dadurch wollen wir zu einem verbesserten Verständnis des Erdsystems und den ökologischen Auswirkungen seiner Veränderungen auf globaler Ebene beitragen. Unsere Forschungsziele beinhalten: - die quantitative Analyse, wie diese Interaktionen das Klima der Erde beeinflußen, in Zeiten zunehmender Einflüsse des Menschen - das Entwickeln eins verbesserten Verständnisses der Regulation von Ökosystem-Prozessen und der daran gekoppelten biogeochemischen Kreisläufe, im Zusammenhang mit dem Klimawandel - die Erforschung von Rückkopplungsmechanismen auf der Erdoberfläche, die die Vegetation, die Zusammensetzung der Atmosphäre und das Klima betreffen

©201 6 GeoBasis-DE/BKG (©2009).Google

Webseite www.bgc-jena.mpg.de

60


Max-Planck-Institut für Biogeochemie

Max Planck Institut

Max-Planck Institute for Biogeochemistry Markus Reichstein (managing director)

1!/ >i "'

i1

1

Hans-Knöll-Str. 10 07745 Jena contact@bgc-jena.mpg.de http://www.bgc-jena.mpg.de/

:f"'· ~L~J1 r· ll ~ Our mission is to understand the role of living organisms in the Earth System. We aim to learn - how organisms exchange fundamental resources like energy, water, carbon and nitrogen with their environment, - how these exchanges act to influence climate across a range of scales, and - how these exchanges regulate the response of vegetation and soils to changes in climate and land use. Current biologiocal research focusses an the carbon cycle (see picture), soil biogeochemistry, biosphere-atmosphere interactions, biosphere modelling, plant carbon allocation, soil organic matter, biodiversity, landscape processes, functional biogeography, ecosystem ecology.

c0

0

Q):;,~~ ~l@ Ji 0

• iDiv (German Centre for Integrative Biodiversity Research), Leipzig, Halle, Jena • AquaDiva (DFG Collaborative Research Centre), FSU Jena

61


M AX P LANCK I NSTITUTE FOR CHEMICAL ECOLOGY Institutsleitung Prof. Dr. David G. Heckel

Anschrift Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena

Lage

©201 5 GeoBasis-DE/BKG (©2009).Google

Webseite http://www.ice.mpg.de

62

The Max Planck Institute for Chemical Ecology was founded by the Max Planck Society in March 1 996. The Thuringian town of Jena was selected because it is home to the FriedrichSchiller-University and many other research centers, making it an attractive scientific location. The establishment of the new institute building on the Beutenberg Campus with immediate proximity to other biological and chemical institutes offers excellent potential for scientific co-operations and the establishment of networks. The institute attracts researchers from all over the world. At the moment it hosts scientists from 34 different countries. Besides the five directors who are heads of their departments, around 1 95 scientists including 1 08 PhD and roughly 25 graduate students do their research work here. Altogether, almost 400 persons are affiliated with the institute (updated: March 201 3). An important task of the institute is training young researchers in modern techniques of chemical ecology. In 2005 a special graduate program, the International Max Planck Research School, was established that offers the possibility for highly qualified young researchers to conduct their research in an international atmosphere.


Max-Planck-1 nstitut für chemische Ökologie

Max Planck Institute

Biosynthesis I NMR Dr. Bernd Schneider Max Planck Institute for Chemical Ecology Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena schneider@ice.mpg.de http://www.ice.mpg.de/exUbiosynthesis.html

: ; ;_ ~.:-. !rS 1l „J!r ~l;.J 1

The research group Biosynthesis/NMR focuses an structure elucidation of ecologically relevant low-molecular secondary metabolites from plants and other organisms, investigations an the tissue- and cell-specific occurrence of natural products, and an stable isotope labeling studies of biosynthetic and metabolic pathways. In particular, we are interested in the detection of biosynthetic intermediates by cryogenic NMR spectroscopy or HPLC-NMR coupling. Major projects encompass the following classes of plant secondary metabolites: Phenylphenalenones, a group of unusual phenylpropanoidderived phytoalexins and plant pigments occurring in the Haemodoraceae, Musacea, and the Pontederiaceae families; salicinoids from Populus species; nudicaulins, a group of indole-phenylpropanoid hybrid alkaloids from Island poppy (Papaver nudicaule ).

~ ~~-:;, rJr • National University of Colombia, Medellin, Colombia

•National Academy of Sciences of Belarus; Institute of Bioorganic Chemistry, Minsk, Belarus • University of Yaounde 1, Yaounde, Cameroon

63


D

D

Max Planck Institute

Max-Planck-1 nstitut für chemische Ökologie

Department of Biochemistry Prof. Dr. Jonathan Gershenzon Max Planck Institute for Chemical Ecology Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena gershenzon@ice.mpg.de http://www.ice.mpg.de/exUbiochemistry.html

::; ;_ ~.:-. !rS

1l „J!r ~F In the Department of Biochemistry, we study the biosynthesis of putative plant defense compounds as a means to explore their ecological roles, especially in trees and other woody plants. By isolating and characterizing the genes and enzymes involved in plant defense biosynthesis, we develop tools to manipulate defensive phenotypes in order to help understand their costs and benefits. At the same time, detailed knowledge of plant defense pathways gives us important insights into the control and evolution of defense. To gain new perspectives on the ecology and evolution of plant defense, we have also begun to study how herbivores and pathogens metabolize plant defense compounds. Knowledge of the metabolic fates of defenses in plant enemies sheds light on their effectiveness and mode of action, and will help understand enemy hast ranges. 1

r ~~ ~ rJr: • Fraunhofer Institute for Molecular Biology and Applied Ecology, Aachen • Fundamental and Applied Research in Chemical Ecology, Universite de Neuchätel, Switzerland • Department of Plant and Environmental Sciences, University of Copenhagen, Denmark • Boyce Thompson Institute for Plant Research, lthaca, New York, USA

64


Max-Planck-1 nstitut für chemische Ökologie

Max Planck Institute

Department of Bioorganic Chemistry Prof. Dr. Wilhelm Boland Max Planck Institute for Chemical Ecology Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena boland@ice.mpg.de http://www.ice.mpg.de/exUbioorganic-chemistry.html

: ; ;_ ~.:-. !rS 1l „J!r ~l;.J 1

In the Department of Bioorganic Chemistry we study defense mechanisms of plants and insects. Modem analytical and molecular methods are employed to identify signals from herbivores and microorganisms related to stress recognition by the plant. Novel methods of Isotope Ratio Mass Spectrometry are used to study the induction of pathways during infection and herbivore damage. The production of defensive secretions of leaf beetles is analyzed to gain information on the biosynthesis, regulation and evolution of these defensive strategies. We focus on the analysis of the molecular basis of the uptake of plant-derived precursors and their transformation into compounds for the insects' communication and defense. The biosynthetic potential of insects is probably strongly enhanced by their commensal gut bacteria or endosymbionts. Therefore we study the biosynthesis of plant-defense elicitors or the detoxification of plant toxins in insects with an emphasis on the participation of gut bacteria.

~ ~~-:;, rJr • Universite Libre de Bruxelles, Brussels. Belgium • Pontifical Catholic University of Peru, Lima, Peru • Department of Biology, University of La Serena, Chile • Computerchemie, Leibniz-Institut für Pflanzenbiochemie, Halle/Saale

65


Max Planck Institute

Max-Planck-1 nstitut für chemische Ökologie

Department of Entomology Prof. Dr. David G. Heckei Max Planck Institute for Chemical Ecology Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena heckel@ice.mpg.de http://www.ice.mpg.de/exUentomology.html

::; ;_ ~.:-. !rS

1l „J!r ~F The overall goal of the Department of Entomology is to study evolutionary adaptations in insects which are mediated by chemical signals. The concept of coevolution forms the theoretical framework, in which insect-plant, insectmicrobe, and insect-insect interactions are examined. Strategies of plants to avoid being chosen for food and to interfere with the process of herbivory are countered by detoxification mechanisms by the insects. Adaptations by microbial pathogens to use insects as a food source are met by a complex insect innate immune response. And chemical signals by which insects communicate with each other are influenced by interspecific and intraspecific selection pressures. Since all evolutionary change has a genetic basis, knowledge of how genes control these phenotypes is fundamental to an understanding of the mechanism of coevolution and the nature of the coevolutionary equilibrium attained at the present time. 1

~~ ~ rJr: • The University of Queensland, Brisbane, Australia • Fraunhofer Institute for Molecular Biology and Applied Ecology (IME), Gießen • Julius Kühn Institute, Federal Research Centre for Cultivated Plants, Darmstadt • Department of Entomology, University of Arizona, Tucson, Arizon, USA

66


Max-Planck-1 nstitut für chemische Ökologie

Max Planck Institute

Department of Evolutionary Neuroethology Prof. Dr. Bill S. Hansson Max Planck Institute for Chemical Ecology Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena hansson@ice.mpg.de http://www.ice.mpg.de/exUevolutionary-neuroethology.html

: ; ;_ ~.:-. !rS 1l „J!r ~l;.J 1

In the Department of Evolutionary Neuroethology we study odor-directed behavior and its underlying neurobiological substrate from a functional and evolutionary perspective. In drosophilid flies our main objective is to understand the evolution of olfactory functions. By studying related species living under different ecological conditions it is possible to understand how habitat and food-choice affect the sense of smell. We look at transduction mechanisms, coding and connectivity at different neural levels, as well as the behavioral outcome of olfactory processing. In sphingid moths we want to understand how hast plant associations have affected olfactory function and behavior. We aim to study the complete neuroethological chain of events, from single molecules and genes, to neurons and whole organism responses, and make use of modern neurobiological and molecular techniques and bioinformatics. Behavioral responses are studied in the field, in wind tunnels, andin laboratory bioassays.

~ ~~-:;, rJr • Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel •International Centre of lnsect Physiology and Ecology, Nairobi, Kenya • Swedish University of Agricultural Sciences, Alnarp, Sweden • Rothamsted Research, Harpenden, Hertfordshire, United Kingdom

67

~

L_


D

D

Max Planck Institute

Max-Planck-1 nstitut für chemische Ökologie

Department of Molecular Ecology Prof. Dr. lan T. Baldwin Max Planck Institute for Chemical Ecology Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena baldwin@ice.mpg.de http://www.ice.mpg.de/exUmolecular-ecology.html

::; ;_ ~.:-. !rS

1l „J!r ~F The overarching research goal of the Department of Molecular Ecology is to manipulate ecological interactions in nature to identify traits that are important for an organism's Darwinian fitness. We focus on plant-mediated interactions and have developed an ecological expression system with a native plant species that has a rich suite of ecological interactions, the wild tobacco Nicotiana attenuata, as well as the herbivores that feed on it, the fungi and bacteria that interact with its roots, and its floral visitors. We have developed molecular (transformation systems, VIGs silencing, cDNA and sequences genomes, UPLC qTOF microarrays, real time RT-PCR, microsatellites, RNA seq), analytical (high throughput HPLC and UPLC-MS, GC-MS (quad,ion trap) and GCxGC-TOF, z-Nose) and ecological (a field station in Utah, insect cultures, and natural history expertise) tools to rigorously manipulate the genetic basis for ecological sophistication in this plant system. 1

r ~~ ~ rJr: • Bean Museum in Lytle Preserve, Utah, USA •Max Planck Partner Group at the Institute of Science Education and Research, Kolkata, lndia • Max Planck Partner Group at the Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences • Global Research Laboratory Program South Korea

68


Max-Planck-1 nstitut für chemische Ökologie

Max Planck Institute

Experimental Ecology and Evolution Dr. Christian Kost Max Planck Institute for Chemical Ecology Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena christiankost@gmail.com http://www.ice.mpg.de/exUexperimental-evolution.html

: ; ;_ ~.:-. !rS 1l „J!r ~l;.J 1

The main goal of the Experimental Ecology and Evolution Research Group is to answer the question: Why do organisms cooperate with each other? For this, we use the cooperative exchange of essential metabolites amongst two or more bacterial strains as an experimentally tractable model. By rigorously and systematically studying the molecular and ecological causes as well as the physiological and evolutionary consequences of a cooperative lifestyle, we aim at contributing to the development of a solid, empirically-based framework that allows to mechanistically predict the evolution of cooperative behaviors within microbial communities. We address this fascinating research question by combining the methodological power of laboratorybased experiments with recent advances in the fields of molecular microbiology and synthetic biology.

~ ~~-:;, rJr • Quantitative Analysis of Molecular and Cellular Biosystems, University of Heidelberg • Institute for Experimental Medicine, Christian-Albrechts-University Kiel • Ecology and Biodiversity, Department of Biology, University of Utrecht, Netherlands •New Zealand Institute for Advanced Study, Auckland, New Zealand

69


D

D

Max Planck Institute

Max-Planck-1 nstitut für chemische Ökologie

Mass Spectrometry/Proteomics Dr. Ales Svatos Max Planck Institute for Chemical Ecology Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena svatos@ice.mpg.de http://www.ice.mpg.de/exUmass-spectrometry.html

::; ;_ ~.:-. !rS

1l „J!r ~F The primary objective of the Mass Spectrometry/Proteomics research group is to measure mass spectra (MS) for structural elucidation and new compound characterization (molecular composition) in cooperation with the scientific departments of the institute. In addition to service, which is aimed especially at structure confirmation of synthetic compounds, projects an structure elucidation of natural products and the elucidation of biosynthetic pathways are carried out. New analytical methods are also developed with a focus an new MALDI matrices and small molecule in situ distribution visualization/imaging. Strang attention is put an teaching and training our users, and we have been organizing summer schools with topics in mass spectrometry an small molecules and proteomics. 1

r ~~ ~ rJr: •Max Planck Institute for Plant Breeding Research, Cologne, Germany • Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Prague, Czech Republic • Rothamsted Research, Harpenden, United Kingdom • Center for Research and Advanced Studies of the National Polytechnic Institute CINVESTAV, lrapuato, Mexico

70


Max-Planck-1 nstitut für chemische Ökologie

Max Planck Institute

Olfactory Coding Dr. Silke Sachse Max Planck Institute for Chemical Ecology Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena ssachse@ice.mpg.de http://www.ice.mpg.de/exUolfactory-coding.html

: ; ;_ ~.:-. !rS 1l „J!r ~l;.J 1

Most organisms rely an their olfactory system to detect and analyze chemical cues in the environment, cues which are subsequently utilized in the context of behavior. The central question of this group is to investigate how odors are coded and processed in the brain to lead to a specific odor perception. The basic layout of the first olfactory processing centers, the olfactory bulb in vertebrates and the antennal lobe in insects, is remarkably similar. Odors are encoded by specific ensembles of activated glomeruli (the structural and functional units of the bulb-lobe) in a combinatorial manner. The vinegar fly Drosophila melanogaster provides an attractive model organism for studying olfaction, as it allows genetic, molecular and physiological analyses. The key method in our group is optical recording of the Drosophila brain, which allows visualizing spatial as weil as temporal components of neuronal activity.

~ ~~-:;, rJr •Göttingen University, Germany • Halle University, Germany • Swedish University of Agricultural Sciences, Alnarp, Sweden • University of Arizona, USA

71

~

L_


D

D

Max Planck Institute

Max-Planck-1 nstitut für chemische Ökologie

Sequestration and Detoxification in lnsects Dr. Franziska Beran Max Planck Institute for Chemical Ecology Hans-Knöll-Str. 8 07745 Jena fberan@ice.mpg.de http://www.ice.mpg.de/exUdetoxification.html

::; ;_ ~.:-. !rS

1l „J!r ~F In the Research Group Sequestration and Detoxification in lnsects we investigate the adaptations of crucifer-feeding leaf beetles to defense compounds present in their hast plants. The crucifer plant family includes many important crops, such as mustard, cabbage, and rapeseed, and is characterized by an activated defense system known as the "mustard-oil bomb"". Tissue damage initiates enzymatic degradation of mustard-oil glucosides yielding highly reactive defense compounds. The herbivores we study are able to avoid mustard-oil glucosides from being activated by the plant enzyme. Many beetle species accumulate the plants' mustard-oil glucosides in their bodies. In fact, some even produce their own activating enzyme, turning the plant defense compounds into insect mustard-oil bombs. Our goal is to elucidate the molecular and biochemical mechanisms deployed by these insects to overcome this plant defense which allows them to become notorious pests of crop plants. 1

r ~~ ~ rJr: • AVRDC - The World Vegetable Center, Tainan, Taiwan • The Smithsonian Tropical Research Institute, Panama City, Panama

72


„Die TK ist meine Nr. 1: Denn sie übernimmt auch Kosten für alternative Heilmethoden." Mit alternativen Heilmethoden bietet die TK mehr als andere Kassen:

> Sanfte Medizin Kostenübernahme für alternative Arzneimittel > Akupunktur Bei chronischen Rücken oder Knieschmerzen > Homöopathie Behandlung bei besonders qualifizierten Ärzten Nur drei von mehr als 10.000 Leistungen. Ich berate Sie gern ausführlich. Jetzt online Mitglied werden!


M AX-P LANCK-I NSTITUT FÜR M ENSCHHEITSGESCHICHTE Institutsleitung Prof. Johannes Krause Prof. (Univ. of Auckland) Russel Gray Dr. Nicole Boivin

Anschrift Kahlaische Strasse 1 0 07745 Jena

Lage

©201 6 GeoBasis-DE/BKG (©2009).Google

Webseite http://www.shh.mpg.de

74

Das Max-Planck-Institut für Menschheitsgeschichte hat sich zum Ziel gesetzt, die Geschichte der Menschheit unter Verwendung modernster analytischer und genetischer Methoden umfassend zu erforschen. Um grundlegende Fragen zur biologischen und kulturellen Entwicklung des Menschen von der Steinzeit bis heute zu beantworten, arbeiten Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler unterschiedlicher Disziplinen, wie Genetik, Linguistik, Archäologie, Anthropologie und Geschichte zusammen, und entwickeln gemeinsam innovative Methoden insbesondere in den Bereichen Gensequenzierung, Sprachdokumentation, Bioinformatik und Phylogeographie. Das Institut wurde im März 201 4 gegründet und besteht derzeit aus der Abteilung Sprach- und Kulturevolution (Direktor Russell Gray) und der Abteilung Archäogenetik (Direktor Johannes Krause). Eine dritte archäologisch ausgerichtete Abteilung (Direktorin Nicole Boivin) ist im Aufbau. Mit der Gründung und dem Aufbau des Max-PlanckInstituts für Menschheitsgeschichte in Jena erhält die Evolutionswissenschaft einen Ort, an dem Fragen zur Entwicklungsgeschichte vielfältiger biologischer und kultureller Phänomene mit modernsten (natur-)wissenschaftlichen Methoden beantwortet werden und kehrt zugleich zu ihren Ursprüngen in Deutschland zurück.


Max-Planck-Institut

Archäogeneti k Prof. Johannes Krause

Kahlaische Str. 10 07745 Jena

arnold@shh.mpg.de www.shh.mpg.de

/J0.J 778.n1~

~~

"7l'0 0~.rE>~hJ~JHJl d1@ Ill ~JJfüirm ~l~® r

35 f

"" r' hJ .nJ a.0-~ !..:JJ1'f~ißl!.mr,0~:...

Die Abteilung Archäogenetik (DAG) nutzt aktuelle Entwicklungen im biomolekularen Bereich, wie etwa zu stabilen Isotopen oder genomweiter DNA-Sequenzierung, um ein völlig neues Spektrum an Informationen beispielsweise aus Quellen anthropologischer bzw. archäologischer Sammlungen zu erschließen. Auf der Basis von winzigen Proben ist es nun möglich, detaillierte Information über genetische Beziehungen, geographische Ursprünge, Selektionsprozesse oder genetische Strukturen von ausgestorbenen humanen, pflanzlichen, tierischen oder gar pathogenen Organismen zu gewinnen. Forschungsschwerpunkte sind a) die Gewinnung genetischer Datensätze der vergangenen 40.000 Jahre eurasischer Geschichte, b) die Analyse von Wirt-Pathogen-Interaktionen über lange Zeiträume, um konkrete Belege über Herkunft, Erreger, Verbreitung und Entwicklung der wichtigsten menschlichen Infektionskrankheiten bereit zu stellen und c) Untersuchungen zu der durch Menschen beeinflussten Transformation biologischer Ressourcen.

f o 0 :;, ~ml@ .n ~ J • Universität Tübingen, Deutschland • Harvard University, USA • University of Adelaide, Adelaide, Australien • Landesamt für Denkmalpflege und Archäologie Sachsen-Anhalt, Deutschland

75


JENA UNIVERSITY HOSPITAL

The only institution of its kind in Thuringia, Jena University hospital can look back on a history of more than 200 years. The Dr. Brunhilde Seidel Kwem University's tradition as a medical school is yet older. Ever since the foundation of the PD Dr. Jens Maschmann University 450 years ago, the School of Medicine has been training and educating Prof. Klaus Benndorf doctors-to-be. Board of Directors

Today, the University hospital with a staff of more than 4,500 is the biggest employer in the region. lts 26 clinical centers and 25 institutes Dr. Tobias Neumann provide care for 53,000 inpatients and for more 270,000 outpatients per year, as weil as than Research Coordinator teaching for 2,300 students of medicine, Tobias.Neuman@med.uni- dentistry and molecular medicine. At Jena University hospital, scientists work both in the jena.de field of fundamental biomedical research and in www.uniklinikum.jena/ patient-related clinical research. Forschung.html One focus is on the field of Sepsis and lnfection Research, driven by major funding projects and research networks such as the lntegrated Research and Treatment Center for Sepsis and Sepsis Sequelae. The research foci Aging and Age-related Diseases, Cellular Signalling as weil as Medical Optics and Photonics are embedded in the profile lines 'Life' and 'Light' of the Friedrich Schiller University. Website The second phase of construction of the www.uniklinikum-jena.de University Hospital in the urban district Lobeda, the largest construction project in the Free State of Thuringia, unites almest all clinical facilities into an ultramodern medical campus. Innovative spatial and directional concepts and llllll' modern equipment provide optimal conditions "U IVE RSITĂ„TS for patient care, medical teaching and for KLlnlKUm experimental and clinical research. Contact

n

Jena

76


unlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Universitätsklinikum Jena - Beutenberg

Campus

Sepsisforschung Prof. Dr. rer. nat. Markus Gräler Zentrum für Molekulare Biomedizin Hans-Knöll-Str. 2 07745 Jena

markus.graeler@med.uni-jena.de www.kai.uniklinikum-jena.de/KAl/English/Research/Sepsis+Research ' J 778111~ ~~

7 f

"" r' hJ JIJ 0.0-?.J !.;Jj j'f :::J.r'Jij!..JIJ) i 0~:.,

Das zentrale Thema der Arbeitsgruppe ist die Signaltransduktion von Lipiden, insbesondere von Sphingosin-1-phosphat {S1 P) und G-Proteingekoppelten S1P-Rezeptoren. S1P spielt eine wesentliche Rolle bei Signalprozessen des Immunsystems wie dem Austritt und der Zirkulation von Lymphozyten, der Differenzierung von T-Zellen und der Antigenpräsentation. Konstitutiv kommt S1 P vor allem im Blut und in der Lymphflüssigkeit vor, und neben Immunzellen exprimieren auch die meisten Gewebezellen einen oder mehrere S1 P-Rezeptoren. Unsere Arbeitshypothese ist, dass eine Deregulierung des S1 P-Systems schnell zu systemischen Problemen führen kann und dass dies vermutlich auch beim Verlauf einer systemischen Infektion wie der Sepsis eine Rolle spielt. Daher untersuchen wir die Grundlagen der S1P-Signaltransduktion in der Sepsis, um daraus zukünftig bessere Diagnoseund Behandlungsstrategien auf Basis der Lipidsignaltransduktion entwickeln zu können.

1 0 Q):;,~~ ~l@ .fi ~ J • Prof. Bodo Levkau, Institut für Pathophysiologie, Universitätsklinikum Essen, Deutschland • Prof. Jan Tuckermann, Institut für Molekulare Endokrinologie, Universität Ulm, Deutschland • LPath lncorporated, San Diego, USA • Noxxon Pharma, Berlin, Deutschland 77

C


D

D

Universitätsklinikum Jena - Beutenberg Campus

un1vERsmns KLlnlKUm Jena

Lehrstuhl für Biophysik Prof. Dr. Stefan H. Heinemann Zentrum für Molekulare Biomedizin Hans-Knöll-Str. 2 07745 Jena

stefan.h.heinemann@uni-jena.de

f

"" r• hJ JIJ o ~© Jll ~1'1l'.r'i}DQ.!JJ

r,

l!ZJ

Ionenkanäle sind in viele zelluläre Prozesse involviert (z. B. Signalverarbeitung) und deshalb für die Physiologie und Pathophysiologie von Zellen und Organen von besonderer Bedeutung. Am Lehrstuhl für Biophysik interessieren wir uns für die Struktur, Funktion und Pharmakologie dieser Membranproteine und erforschen dabei insbesondere: - die molekulare Funktionsweise von Natriumkanälen und deren Rolle in humanen Erkrankungen sowie die Manipulation dieser Kanäle durch Neurotoxine, - die Funktionsweise und Pharmakologie von Kaliumkanälen, - die Regulation von Ionenkanälen durch Redoxprozesse und Häm, - die photonische Manipulation lebender Zellen sowie - die Biophysik des Ionentransports. Zur Umsetzung unserer Forschungsvorhaben stehen moderne Methoden der Elektrophysiologie, Molekularbiologie, Mikroskopie und Zellphysiologie zur Verfügung. Die Mehrzahl unserer Projekte besitzt interdisziplinären Charakter und vereint die Expertise verschiedener Fachrichtungen der Lebenswissenschaften.

:f o QJ:;,~~ ~J@ Ji ~ I • Zahlreiche Kooperationen im Rahmen von Verbundprojekten (FOR 1738 "Häm und Hämabbauprodukte", Kompetenzkluster "nutriCARD", RTG 1715 "Molekulare Signaturen adaptiver Stressreaktionen") • Prof. Dr. Toshinori Hoshi, University of Pennsylvania, Philadelphia, USA • Prof. Dr. Rainer Heintzmann / Prof. Dr. Herbert Stafast, IPHT, Jena • Dr. Marc A. Hollywood, Dundalk Institute of Technology, Dundalk, Irland

78


unlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Universitätsklinikum Jena - Beutenberg

Campus

Institut für Virologie und Antivirale Therapie Prof. Dr. Andreas Sauerbrei Zentrum für Molekulare Biomedizin Hans-Knöll-Str. 2 07745 Jena

virologie@med.uni-jena.de www.virologie.uniklinikum-jena.de

f

"" r' hJ JIJ 0.0-?.J !.;Jjj'f:::J.r'Jij!..JIJ) i 0~:.,

Die Aufgaben des Instituts bestehen in der Erforschung wissenschaftlicher Fragestellungen hinsichtlich ausgewählter Herpes-, Influenza- und Picornaviren, in der studentischen Ausbildung und in der Diagnostik im Rahmen der Tätigkeit als Konsiliarlabor für Alpha-Herpesviren des Robert Koch-lnsitutes (Berlin). Eine Vielzahl aktueller Themen wird molekularbiologisch, strukturbiologisch, zellbiologisch und im Tieversuch bearbeitet. Wissenschaftliche Schwerpunkte sind vor allem die phäno- und genotypische Resistenzbestimmung von Alpha-Herpesviren, die umfangreiche Sequenzanalyse von lnfluenzaviren zur Erstellung von Datenbanken, die Transkriptom-Analyse virusinfizierter Zellen, die Entwicklung und Charakterisierung neuer Virostatika auf der Basis von Neuraminidase-lnhibitoren gegen lnfluenzaviren und Bakterien sowie die Identifizierung von Virus/Wirtszell-lnteraktionen, um neue, zellbasierte Therapiestrategien zu entwickeln.

:f o QJ:;,~~ ~J@ Ji ~ I • Institut für Medizinische Mikrobiologie, Universitätsklinikum Jena •Institut für Infektionsmedizin, Christian-Albrecht-Universität Kiel •Abteilung Pharmakognosie, Universität Wien • IDT Biologika GmbH, Dessau-Rosslau

79


Universitätsklinikum Jena - Beutenberg Campus Host Septomics Prof. Dr. med. Hortense Slevogt ZIK Septomics, FG Host Septomics, Albert-Einstein-Str. 1 0 07745 Jena hortense.slevogt@med.uni-jena.de www.septomics.de

An zah l d er wi s s en s ch aftl i ch en M i tarbei ter 12

F ors ch u n g s s ch werpu n kte

Die Forschungsgruppe untersucht die Wirtsantwort im Verlauf von schwereren Infektionen und einer Sepsis. Zur Analyse sowohl des Wirts(Host) als auch des Erregerprofils nutzt sie dafür Methoden der funktionellen Genomik und Proteomik sowie modernste molekular- und zellbiologische Techniken und analysiert systematisch das Transkriptom- und Proteinmuster aus gesunden und infizierten Zellen und Geweben. Im Fokus der Gruppe liegen folgende Forschungsschwerpunkte: • Proteomanalyse • Next Generation Sequencing (NGS) • Zell- und Mikrobiologie

Kooperati on en

Die Forschungsgruppe "Host Septomics" ist sowohl mit den lokalen als auch mit anderen nationalen (u.a. Greifswald, Magdeburg, Berlin) und internationalen (u.a. USA, Indien, Australien) Universitäten und außeruniversitären Forschungseinrichtungen eng vernetzt.

80


~nlVERSITÄTS fel~~iKum

Universitätsklinikum Jena - Beutenberg Campus

Institut rur Molekulare Zellbiologie

D

Prof. Dr. Reinhard Wetzker Zentrum für Molekulare Biomedizin Hans-Knöll-Str. 2

07745 Jena reinhard .wetzker@uni-jena.de www.zellbiologie.uni-jena.de ff.~~ ~~~u~ ~'.3"i't:JU::J:; ;;1ll.0~JJ~i~Jk.fJ.::JJJ J~JfrJi!JT/Jl§Eilf'

27 (p@J'0@f~rt~lfüiJj::Jl:J,~JJ ~'J-:Jf f.l!JJJ~'1~ Das Institut für Molekulare Zellbiologie gehört zum interfakultären Zentrum für Molekulare Biomedizin. Seine Forschungsaktivitäten konzentrieren sich auf das Verständnis der komplexen Funktionen von Signalproteinen. Die Bedeutung von ausgewählten Untersuchung der pathologischen Signalproteinen und -reaktionen ist dabei ein wichtiger Schwerpunkt. Studien an Zell- und Mausmodellen ermöglichen einen Einblick in die molekulare Pathologie ausgewählter Krankheiten und zielen auf die Entwicklung neuer therapeutischer Konzepte. Eine Auswahl laufender Forschungsprojekte: - Duale Rolle von Pl3Ky in der Pathogenese der septischen Kardiomyopathie - Oxidation von Protein-Tyrosinphosphatasen in der onkogenen Zelltransformation -AMPK als Mediator der Stress-induzierten Autophagie in Endothelzellen - Rolle von mTOR als Sensor für DNA Schäden - Die ambivalente Rolle von Pl3Ky als Mediator von regenerativen und pathologischen Funktionen von Mikrogliazellen J~®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CTU~'.'iil • Emilio Hirsch, Universität Turin •Andreas Hochhaus und Mitarbeiter, Universitätsklinikum Jena •David Car1ing, Imperial College, London

81

D D


Universitätsklinikum Jena - Innenstadt Single-Molecule Microscopy Group Prof. Dr. Michael Börsch Jena University Hospital Nonnenplan 2 - 4 07743 Jena michael.boersch@med.uni-jena.de www.single-molecule-microscopy.uniklinikum-jena.de

N u m ber of res earch as s oci ates 6

Res earch areas

Single-molecule spectroscopy and superresolution fluorescence imaging of membrane proteins are the topics of our biophysics-oriented research group. Our interdisciplinary research focusses on conformational dynamics of single cellular nano-motors, pumps and receptors, for example the enzyme FoF1 ATP synthase. We attach two dye molecules specifically to subunits of these machines and measure their distance changes continuously within the single protein using Förster resonance energy transfer (FRET). Our lab work includes membrane protein purification, enzymatic activity measurements, fluorophore characterization, building microscopes and programming for advanced FRET analysis. In the DFG Collaborative Research Center SFB/TR 1 66 "High-end microscopy elucidates membrane receptor function" we study the dynamics of G-protein coupled Neurotensin receptor 1 .

C ooperati on s

• Prof. Dr. Thomas M. Duncan, SUNY Upstate Medical University, Syracuse, NY, USA • Prof. Dr. W. E. Moerner, Stanford University, Palo Alto, CA, USA • Prof. Dr. Stanley D. Dunn, University of Western Ontario, London, ON, Canada • Dr. Reinhard Grisshammer, NIH NINDS, Rockville, MD, USA

82


unlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

Gynäkologische Molekularbiologie Prof. Dr. rer. nat. Matthias Dürst Frauenklinik Bachstraße 18 07743 Jena

matthias.duerst@med.uni-jena.de www.frauenheilkunde.uniklinikum-jena.de/Molekularbiologie.html

f

"" r' hJ JIJ 0.0-?.J !.;Jjj'f:::J.r'Jij!..JIJ) i 0~:.,

- Erforschung genitaler Erkrankung, v.a. Gebärmutterhalskrebs verursacht durch eine Infektion mit Humanen Papillomviren (HPV) - Früherkennung von Krebsvorstufen durch Biomarker, Früherkennung möglicher Rückfälle - Identifizierung und Etablierung neuer methylierungbasierter Biomarker beim Eierstockkrebs - Erforschung grundlegender Mechanismen der Tumorentstehung

u.a. verwendetet Methoden: lmmunhistochemie, real-time PCR, MicroarrayAnalyse, Zellkultur, adeno- und lentivirale Transduktion, Tumorsphäroidmodelle, Chromosomenanalyse, FISH, DNA- RNA- in situ Hybridisierung

:f o QJ:;,~~Hl@ Ji ~ I • Prof. Elisabeth Schwarz, Prof. Felix Hoppe-Seyler, DKFZ, Heidelberg, Deutschland • Dr. Thomas Henkel, Leibniz-Institut für Photonische Technologien Jena, Deutschland • Dr. Karsten Heidtke, ATLAS Biolabs GmbH, Berlin, Deutschland • Dr. Adam Corner, RainDance Technologies, Billerica USA

83


Universitätsklinikum Jena - Innenstadt Laboratory for in-vitro research and routine diagnostic PD Dr. Uta-Christina Hipler Hautklinik Erfurter Str. 35 07743 Jena christina.hipler@med.uni-jena.de www.derma.uniklinikum-jena.de/in_vitro_labor.html

N u m ber of res earch as s oci ates 5

Res earch areas

The in vitro research laboratory is working in the field of allergology, mycology and cell research. In addition to the routine clinical diagnostic we are working on the testing of biofunctionality and biocompatibility of textiles and textile materials. Biofunctionality is commonly characterized by antibacterial and antifungal activity but also comprises the binding capacity for mediators or the adoption of biological functions. Biocompatibility describes the influence on biological systems as materials should no exert harmful effects, e.g. toxic or inflammatory, on the cells or the tissues. Several methods for in vitro characterization have been developed and several tools are available for evaluation of cytotoxicity, cell proliferation, and inflammatory reactions in different cell types.

C ooperati on s

• Institut für Pharmazie, Lehrstuhl für Pharmazeutische Technologie, FSU Jena, Deutschland • INNOVENT e.V. Technologieentwicklung, Jena, Deutschland • Institut für Photonische Hochtechnologie e.V., Jena, Deutschland • Thüringisches Institut für Textil- und Kunststoff-Forschung e.V. TITK, Rudolstadt, Deutschland

84


~nlVERSITÄTS fel~~iKum

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

Functional genetics

D

Prof. Dr. Christian Hübner Institut für Humangenetik Kollegiengasse 10

07743 Jena christian.huebner@med.uni-jena.de www.humangenetik.uniklinikum-jena.de ~{JQJJJillllrD'9:? 2.Jf Ul9 0S;J/dtJ :<..1000~b~S0

10 ~0:0d:i)flI;_fü E:JIJ\)'.:.:l~

We are mainly interested in the pathophysiology of inherited disorders. On the one hand we try to identify the disease associated genetic defects, on the other hand we study the role of the respective genes with the help of genetically modified mice. A special focus are neurodegenerative disorders as well as ion transport related processes. ldeally, we try to unravel the whole chain of events that result in a specific disease associated phenotype at the genetic, molecular, cellular and organismic level.

D @®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CT1}~

• Dominique Eladari, Paris, France • Ivan Dikic, Frankfurt, Germany •Dennis Brown, Boston, USA • Björn Schröder, Berlin, Germany

85


Universitätsklinikum Jena - Innenstadt Institute of Immunology Prof. Dr. Thomas Kamradt Institute of Immunology Leutragraben 3 07743 Jena immunologie@med.uni-jena.de www.iki.uniklinikum-jena.de

An zah l d er wi s s en s ch aftl i ch en M i tarbei ter 8

Res earch areas

Research at the Institute of Immunology focusses on autoimmunity, immunoregulation, and infection immunology. Our interest is both basic research as well as clinically orientated immunology. In the research focus autoimmunity, we examine the induction, chronification and modulation of pathological immune responses in models of arthritis and autoimmune encephalitis. With regard to immunoregulation we focus on the induction, function and stability of Th1 7 cells and the receptor for IL-33.

C ooperati on s

• Prof. Axel Roers, Institute of Immunology, University of Dresden, Germany • Prof. Karin Hartmann, Department of Dermatology, University of Lübeck, Germany • Prof. Georg Schett, Department of Rheumatology and Immunology, Universitätskinikum Erlangen, Germany • Prof. Andreas Radbruch, Deutsches Rheumaforschungszentrum Berlin, Germany

86


unlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

Placenta-Labor Prof. Dr. Udo Markert Department of Obstetrics Bachstr. 18 07743 Jena

markert@med.uni-jena.de www.placenta-labor.de

:f"'· ~L~N5 JIJ ~ The international team of scientists and students chaired by Prof. Dr. Udo Markert is active in a broad spectrum of topics around human reproduction and pregnancy. We werk on several research projects which include trophoblast research with special regard to non-coding RNA and extracellular microvesicles, breast cancer in pregnancy, ovarian follicles, endometrium, toxicology and alternatives to animal experiments. Additionally, we offer diagnostic analyses of uterine NK cells and plasma cells to clinics working in reproductive medicine. We are open for cooperation with other researchers and companies (e.g. in the fields of ex vive toxicology and placenta perfusion). We offer experimental as weil as theoretical projects to motivated students from different disciplines such as biochemistry, biology, chemistry, medicine, nutrion science and others.

c 0 0 Q):;,~~ ~l@ Ji 0 • Prof. Surendra Sharma, Brown University, Providence, USA • Prof. Angela Cadavid, Universidad de Antioquia, Medellin, Columbia • Prof. Bettina Toth, Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg, Germany • Prof. Udo Jeschke, Ludwigs-Maximilian-Universität München, Germany

87


D

D

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

UnlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Group of Experimental Nephrology Prof Dr. med. Ralf Mrowka

Nonnenplan 2-4

07743 Jena ralf.mrowka@med.uni-jena.de www.kim3.uniklinikum-jena.de/eneph.html ~tlrn.1:rwl0'9~ @11 UII:l~@~II@Jll II.1~9~illEs

2 ~0:0d:i)flI;.fü E:JII0~0

- gene regulation of human Renin-Aldosteron System - transcriptional regulation and post-transcriptional regulation of gene expression for instance by microRNA - assays to investigate nephrotoxicity, iPS technology - immune cell receptor activation assays, Toll-like-Receptors,NFkB-Pathway - modelling of physiological Systems

@®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CT1}~

• Prof. Dr. Stefan Wölfl, Heidelberg University, Heidelberg • Prof. Miguel Andrade, University of Mainz, Mainz • Prof. Edda Klipp, Humboldt University, Ber1in

88


~nlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

RG Petersen/Chen Prof. Dr. med. lver Petersen/ PD Dr. med. Yuan Chen Institut für Pathologie Ziegelmühlenweg 1 07743 Jena iver.petersen@med.uni-jena.de/yuan.chen@med.uni-jena.de www.pathologie.uniklinikum-jena.de ~{JQJJJillllrD'9:? 2.Jf Ul9 0S;J/dtJ :<..1000~b~S0

7 ~0:0d:i)flI;_fü E:JIJ\)'.:.:l~

The research focus of our working group is identification of tumor suppressor genas (TSGs) with epigenetic inactivation in human lung cancer and colorectal cancer. By using Suppression Subtractive Hybridization {SSH) technique, we constructed two cDNA libraries containing genas upregulated in human bronchial epithelial cells (HBEC} or lung cancer cells. We paid our attention to a novel homeobox-containing gene HOPX and desmosomal proteins like desmocollins and desmoplakin. lt turned out that HOPX exerts its tumor suppressive function through Ras-induced senescence, while desmosomal proteins function as TSGs through inhibition of MAPK pathway or Wntlbeta-catenin pathway. Currently we are investigating the regulatory mechanisms as well as the clinical relevance of HOPX end desmosomal genes in cancer cells. For the future study, it would be interesting to find out how overexpression of these tumor suppressors influences the pathways end whether these pathways in vivo are still active.

@®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CT1}~

• Prof. Dr. Otmar Huber, Institute of Biochemistry II, University Hospital Jena • Prof. Dr. Peter F. Zipfel, Department of lnfection Biology, Leibniz Institute for Natural Product Research and lnfection Biology, Jena • Dr. Hongyu Liu, Division of Hematology & Oncology, University Hospital Chartte Berlin

89

D


un1vERsmns

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

KLlnlKUm

Jena

Medical Physics Group Jena Prof. Dr. rer. nat. med. habil. Jürgen R. Reichenbach MRl-Building Am Steiger Philosophenweg 3 07743 Jena juergen.reichenbach@med.uni-jena.de www.mrt.uni-jena.de ~ ~ Q!][füi)@) :;, f o(( 8~~[1 lf>h1 [J~~©&J~ ö~~

11 i"' · ~L'.Zlflf> Jil ~ l.Si'.ZlIB The Medical Physics Group (Dept. of Radiology, Jena University Hospital) conducts interdisciplinary research in the field of Magnetic Resonance lmaging (MRI). lt applies its methodological expertise to the development of new data acquisition strategies as well as to image post-processing and data analysis. The group is pursuing both methodological and application oriented research projects with a focus on the non-invasive extraction of physical and physiological parameters based on (bio-)medical MRI data. Current research activities include suceptibilitiy sensitive methods (SWI, quantitative suceptibility mapping (QSM)), quantitative MRI, Diffusion Tensor lmaging (DTI), MR-Spectroscopy (MRS), functional MRI (fMRI) and fast imaging approaches for examining dynamic processes. The scientific challenges are often dealt with in cooperation with local, national and international research partners.

90


~nlVERSITÄTS fel~~iKum

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

Paediatric Oncology Dr. rer. nat. Jürgen Sonnemann Children's Hospital Kochstr.2 07745 Jena

juergen.sonnemann@med.uni-jena.de www.kinderklinik.uniklinikum-jena.de ~{JQJJJillllrD'9:? 2.Jf Ul9 0S;J/dtJ :<..1000.d:J~S:J

5 ~0:0d:i)flI;fl1 E:JIJ\)'.:.'.l~

Resistance of cancer cells to chemotherapeutic drugs is a pivotal problem in the treatment of cancer patients. Epigenetic alterations, such as aberrant histone acetylation and methylation, are currently emerging as drivers of acquired drug resistance in cancer. Our research centres on the identification and pharmacological reversion of repressive histone epigenetic marks that may lead to the resensitization of tumours to chemotherapy in experimental models of childhood malignancies.

D @®'.0C'6Ja~1@CT1}~ • Prof. Oliver Krämer, Department of Toxicology, University Medical Center, Mainz, Germany

91


Universit채tsklinikum Jena - Innenstadt Laboratory for Biomaterials Gerlind Schneider MD ENT Department Lessingstrasse 2 07743 Jena gerlind.schneider@med.uni-jena.de www.biomateriallabor.de

N u m ber of res earch as s oci ates 3

Res earch areas

In close cooperation with research partners, biomaterials in particular for applications in the head and neck area are tested and developed by our working group: for example bone replacement materials, drug delivery systems, and soft tissue sealants. In these preclinical evaluations, chemical and physical testing as well as in vitro assays and animal models are employed. Generation, visualisiation, processing, and analysis of two- and three-dimensional image data is very important both in this context and as a basis for design and optimisation of process chains for efficient fabrication of biomaterials using additive manufacturing techniques. The development of training models for surgical simulations is an example for additional fields of activity of the research group.

C ooperati on s

The Laboratory for Biomaterials cooperates with local partners in Jena, among them Ernst-Abbe-Hochschule, INNOVENT e.V. Technologieentwicklung, and 3di GmbH, and with national partners from industry, universities, and non-academic research institutions.

92


unlVERSITÄTS KLlnlKUm

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

Jena

Cell Biology of the Cytoskeleton

C

PD Dr. rer. nat. Michael M. Kessels Institute of Biochemisty 1 Nonnenplan 2-4 07743 Jena Michael. Kessels@med.uni-jena.de www.biochemie.uniklinikumjena.de/en/Biochemistry+l/Research/PD+Dr_+Kessels.html ~ ~ Q!l[(i]i)@)

;.r o J

7 :f"'· ~L~N5 JIJ

~

Development and plasticity of cellular morphology is essential for life of all eukaryots. As cytoskeletal forces are a major source for defining, keeping and changing the morphology and subcellular organization of cells, the group Cell Biology of the Cytoskeleton headed by Michael M. Kessels studies the molecular mechanisms and the cellular functions of components of the actin cytoskeleton. The main focus on the machines that catalyze the critical step of actin filament formation, i.e. the assembly of an actin nucleus. With Cobl, the group has identified a novel, very potent actin nucleator, which brings together three actin molecules, is indispensable for correct morphogenesis of nerve cells. Using a variety of techniques the group characterizes molecular mechanisms, spatial and temporal control as weil as the cell biological and physiological functions of actin filament-promoting and -organizing factors in neuronal morphogenesis, neuronal network formation and synaptic plasticity.

93

~

L_


D

D

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

un1vERsmns KLlnlKUm Jena

Institute of Biochemistry 1 Prof. Dr. rer. nat. Britta Qualmann Institute of Biochemisty 1 Nonnenplan 2-4 07743 Jena britta.qualmann@med.uni-jena.de www.biochemie.uniklinikum-jena.de/Biochemie+l.html

14 :f"'· ~L8J1'' ll ~ 1b8IB Neurons require elaborate cell shapes for neuronal network formation and for the function and plasticity of synapses. The Qualmann lab demonstrated that prominent players in these processes are BAR domain proteins. The group revealed that this superfamily of proteins has membrane-shaping functions and interfaces with cytoskeletal structures. BAR domain proteins thereby act as powerful effectors in bringing about and rearranging the specialized cellular shapes and membrane compartments of neurons. Studies of the institute at the level of molecular interactions and mechanisms, morphometric and functional analyses in primary neuronal cultures and brain tissue as well as physiological and behavioural studies using animal models provide substantial insights into neuronal network formation, synaptic information transmission and synaptic plasticity processes critical for proper brain function and thereby also highlight cellular mechanisms affected in human diseases of the brain.

c 0 0 Q):;,~~ ~l@ Ji 0 • Michael Bauer, Center for Sepsis Control & Care, Jena, Germany • Christian Hübner, Institute of Human Genetics, Jena, Germany • Ivan Dikic, University of Frankfurt, Germany • Detlef Balschun, University of Leuven, Belgium

94


unlVERSITÄTS KLlnlKUm

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

Jena

~

Prof. Karlheinz Friedrich ("AG Signaltransduktion")

L_

Prof. Dr. Karlheinz Friedrich Institut für Biochemie II Nonnenplan 2-4 07743 Jena karlheinz.friedrich@med.uni-jena.de www.biochemie.uniklinikumjena.de/Biochemie+ll/Forschung/AG+Friedrich.html • J

7781111 ~~

1l'0 0~.rEJshJ~JHJls.f1@ Ju ~JJfüirm ~ll'@ r

6 f

"" r' nJ J1J 0.0-?.J !.;IJ1'f~fJZJ!..m i 0~:..

Signaltransduktion ist ein zentraler Aspekt des Lebens. Im Organismus agiert ein extrem komplexes Netzwerk von Zellen, die chemische Signale abgeben, empfangen und verarbeiten. Die AG beschäftigt sich mit molekularen Mechanismen zellulärer Signaltransduktion und mit Fehlfunktionen dieser Prozesse, wie sie bei Krankheiten wie z.B. Krebs und Allergien auftreten. Ein Schwerpunkt ist die Entwicklung von Biomolekülen, die krankhafte Signalprozesse gezielt beeinflussen, wie etwa inhibitorische Antikörper oder rekombinante Wachstumsfaktoren. Ein weites Spektrum von Methoden und Techniken kommt bei dieser Forschung zum Einsatz, das von der Klonierung von DNA über Protein-Biochemie und die Zellkultur bis hin zu in vitro- und in vive-Krankheitsmodellen reicht. Wir wollen besser verstehen lernen, wie Zellen und Moleküle miteinander kommunizieren und haben das Ziel, dadurch zu neuen Entwicklungen auf dem Gebiet der Molekularen Medizin beizutragen.

1

0

Q):;,~~ ~l@ .fi ~ J

• Ludwig Balzmann Institut für Krebsforschung, Wien, Österreich • Regina Elena Nationales Krebsinstitut, Rom, Italien • Sektion Immunologie, Universität Lleida, Lleida, Spanien • Firma INVIGATE GmbH, Jena, Deutschland

95


D

Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

un1vERsmns KLlnlKUm Jena

Institut für Biochemie II (AG Huber) Prof. Dr. Otmar Huber Institut für Biochemie II Nonnenplan 2-4 07743 Jena

otmar.huber@med.uni-jena.de www.biochemie.uniklinikum-jena.de/Biochemie+ll.html ~ ll1n112J~fü® r

f

"" r• hJ JIJ o ~© Jll ~1'1l '.r'i}DQ.!JJ

i

l!ZJ

Epitheliale Zell-Zellkontakte sind essentiell für die Ausbildung und Aufrechterhaltung von Zellpolarität und Gewebestrukturen während Entwicklungs-, Wachstums-, Wundheilungs-, Regenerations und Alterungsprozessen. Eine beeinträchtigte Funktion oder Fehlregulation ist häufig mit Krankheitsprozessen assoziiert, z.B. im Rahmen der Tumorentstehung oder beim Zusammenbruch der Barrierefunktion im Rahmen des Multiorganversagens bei Sepsis. In diesem Zusammenhang untersuchen wir Signalprozesse, die an der Modulation von ZellZellkontakten (Tight und Adherens Junctions, Desmosomen) beteiligt sind. Der kanonische WnUß-Catenin Signalweg und seine Modulatoren sind dabei von besonderem Interesse. Pflanzliche Inhaltsstoffe und deren Derivate wurden als therapeutisch interessante Inhibitoren des Wnt-Signalwegs identifiziert und werden derzeit weiter untersucht. Dabei kommt ein weites Spektrum an biochemischen, molekular- und zellbiologischen Methoden zum Einsatz.

:f o QJ:;,~~ ~l@ Ji ~ I • Prof. Konrad Basler, Institute of Molecular Life Sciences, ETH Zürich, Schweiz • Dr. Dietmar Gradl, Karlsruhe Institute of Technology, Karlsruhe, Deutschland • Prof. Michael Bauer, Center for Sepsis Control and Care (CSCC), Institut für Anästhesiologie und lntensivmedizin, Jena, Deutschland • Dr. Cagatay Günes, Prof. Karl Lenhard Rudolph, Fritz-Lipmann-lnstitut, LeibnizInstitut für Altersforschung, Jena,

96


Universitätsklinikum Jena - Innenstadt

AG M OS ig

artoria hopat<a p•op•;a

Dr. Alexander S. Mosig Institut für Biochemie II Nonnenplan 2-4

stellate cells

monocytcs

vena centralis

IT'llniluer tod<p"'1

07743 Jena alexander.mosig@med.uni-jena.de

.„„„_""' booding!oil

www.biochemie.uniklinikumjena.de/ukjm/Biochemie+ll/Forschung/AG+Mosig.html • J ~fäll~ @J® "1b~as1J0 dJ:~flJ1@.f Jafi.l i'.JJ1~~r2.l:a1~®.:r

3 f o ro@.ful!J flJ@©~:!; .fJ'i 'Ja f7J-!!J1il ~r:t~ Organ-Modelle bieten eine Alternative zu Tierversuchen und können einen wesentlichen Beitrag zur Entwicklung neuer Therapieoptionen leisten. In der medizinischen Grundlagenforschung werden noch immer viele Studien mit Tiermodellen durchgeführt. Die Übertragbarkeit der Studienergebnisse auf den Menschen wird jedoch zunehmend kritisch hinterfragt. Die AG Mosig entwickelt Organ-Modelle der Leber, des Darms und des Gehirns, um die Lücke zwischen Tiermodellen und klinischen Studien bei der Entwicklung neuer Therapieansätze zur Behandlung der Sepsis zu schließen. Hierzu werden speziell entwickelte, mikrofluidisch unterstützte Biochips bei der Abbildung der zellulären Kommunikation innerhalb drei-dimensionaler Organnachbildungen im Verlauf des simulierten Krankheitsgeschehens genutzt. Die Organmodelle werden u.a. zur Untersuchung der zellulären Mechanismen des sepsisassoziierten Multi-Organ-Versagens und der Entwicklung geeigneter neuer Therapieansätzen in der Nanomedizin genutzt.

~'.(@)~ o ..:,~E] t1 J @Jü • Klinik für Anästhesie und lntensivmedizin, Jena, Deutschland • Institut für Organische und Makromolekulare Chemie, Jena, Deutschland •Technische Universität Graz, Österreich • Microfluidic ChipShop GmbH, Jena, Deutschland

97


un1vERsmns

Universitätsklinikum Jena - lnnenstadtl Lobeda

KLlnlKUm

Jena

Extracellular matrix (ECM) I Myocardial Remodelling PD Dr. Marcus Franz Clinic of Interna! Medicine 1 Erlanger Allee 101, 07747 Jena marcus.franz@med.uni-jena.de apl. Prof. Dr. Alexander Berndt Institute of Pathology Ziegelmühlenweg 1, 07743 Jena alexander.berndt@med.uni-jena.de www.kim1.uniklinikum-jena.de/Myokardiales_Remodeling.html ®~~[\ lf> h1 [J~~©&liD öJj~

i"' · ~L8M Jl1

~ 1b8~

• Defining molecular and structural reorganization of extracellular matrix during tissue reorganization processes (cancer invasion, chronic inflammation, cardiovascular disorders, transplant rejection) • Defining the role of activated fibroblasts I myofibroblasts for matrix remodeling, for perpetuation of disease processes, and for development of therapy resistance in cardiology and oncology • Defining oncofetal matrix proteins as new diagnostic, predictive biomarkers and targets for therapy

c 0 0 Q):;,~~ ~l@ Ji 0 • Dr. Raffaella Giavazzi, IRCCS - lstituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri Dep. Oncology • Laboratory of Biology and Treatment of Metastasis, Milan, ltaly • Prof. Dario Neri, ETH Zurich, Institute of Pharmaceutical Sciences, Zurich, Switzerland • Prof. Dr. Hartwig Kosmehl, Institute of Pathology, Helios-Klinikum Erfurt, Germany

98


Universitätsklinikum Jena - lnnenstadt/Lobeda

UnlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Prenatal Monitoring of Autonomie Maturation Prof. Dr. Uwe Schneider Obestetrics Bachstraße 18 uwe.schneider@med.uni-jena.de Prof. Dr.-lng. Dirk Hoyer Biomagnetic Center Salvador-Allende.-Platz 27 dirk.hoyer@med-uni-jena.de www.neuro.uniklinikum-jena.de/Forschung/ Biomagnetisches+Zentrurn/Arbeitsgruppen/AG+Systemanalyse.html www.geburtshilfe.uniklinikum-jena.de/Forschung/Fetaler+Biomagnetismus.html ~{JQJJJillllrD'9:? 2.Jf UIY 0S;J/dtJ :<..1000~b~s0

5 ~0:0d:i)flI;_fü E:JIJ\)'.:.:l~

Our research is focused on the normal maturation of the autonomic function in the human fetus. Using advanced non-invasive technology for fetal monitoring (magnetocardiography, ECG} and applying linear and non-linear methods of haart rate analysis we study physiological confounders of fetal heart rate regulation. We were able to demonstrate that increasing autonomic functioning during intrauterine life is displayed in a 'fetal Autonomie Brain Age Score {fABAS}' that mirrors basic principles of maturation like increasing fluctuation, increasing complexity and pattem formation. Since disturbances of intrauterine maturation or milieu always influence autonomic functioning, we aim to elaborate short- and long-term predictive markers for both neonatal outcome and further development in conditions like intrauterine growth restriction, suspected chorioamnionitis, exposure to synthetic steroids or matemal disease following the concept of Developmental Origins of Health and Disease.

@®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CT1}~

• Kathleen Gustafson, Hoglund Brain lmaging Center, Kansas City, USA • Joao Bemades, Hemani Goncalves, Faculty of Medicine of the University of Porto, Portugal • Jan i:ebrowski, Warsaw University of Technology, Warsaw, Poland • Gari Clifford, Emory University, School of Medicine, Atlanta, USA

99

D



~nlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Universitätsklinikum Jena - Lobeda

AlertsNet Prof. Dr. med. Frank Martin Brunkhorst Center for Clinical Studies Salvador-Allende-Platz. 27 07747 Jena

frank.brunkhorst@med.uni-jena.de www.alertsnet.de ~{JQJJJillllrD'9:?@1J Ul9 ::JS:JtdtJ :<..l::J:J0~b~S:J

5 ~o~:~;:rrre"Iil Ui\I1::.:i~ The working group establishes and operates the Thuringia-wide data collection and alert system for the diagnosis of bloodstream infections (BSI) AlertsNet (www.alertsnet.de/). The aim is to identify risk factors and to improve the treatment and outcomes of hospitalized patients with sepsis I BSI. AlertsNet is based on an electronic database for microbial blood culture pathogens and their resistance profiles, which are complemented by clinical and demographic data of patients with proven BSI. The collected data allows the development of quality indicators and the determination of reference values for blood culture diagnostics and enables feedback to the participating hospitals, so that a short-term intervention to improve the quality of care will be possible.

@®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CT1}~

• Prof. Dr. Petra Gastmeier, National Reference Center for Nosocomial lnfections, Berlin, Germany • Prof. Dr. Kenneth B. Laupland, International Bacteremia Surveillance Collaborative (IBSC), Calgary, Canada • Prof. Dr. Bettina Löffler, Jena University Hospital, Jena, Germany •Prof. Dr. Mathias Pletz, Jena University Hospital, Jena, Germany

101


D

D

Universitätsklinikum Jena - Lobeda

UnlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Molecular Mechanisms of Organ Failure PD Dr. RA. Claus/ Prof. Dr. med. Michael Bauer Forschungszentrum Lobeda Erlanger Allee 101 07747 Jena ralf.claus@med.uni-jena.de www.kai.uniklinikum-jena.de ~tlrn.1:rwl0'9~ @11 UII:l~@~II@Jll II.1~9~illEs

14 ~0:0d:i)fl~.fü E:JII0~0

The investigation of systemic immune reaction, pathogenesis of organ failure and its resolution is ensued by methods of clinical and experimental research. The research areas cover the molecular level of biochemistry of signal transduction to experimental animal and pathophysiological studies in a clinical-translational approach. The research group focusses on alternative functions and signaling mechanisms of harne and harne degradation products in sepsis-associated excretory liver dysfunction and acute kidney dysfunction in hemolytic-uremic syndmme. Besides, we analyse the mle of sphingolipid metabolism in systemic inflammation. Furthermore, we are developing functionalized, theranostic nanoparticles for celltype-specific modulation of signaling pathways in sepsis-associated liver failure using innovative bioimaging techniques.

@®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CT1}~

• Mervyn Singer, University College London Hospital, UK •Stefan H. Heinemann, Lehrstuhl Biophysik, CMB. Jena, Gennany • Prof. Dr. M. Trauner, Medizinische Universität Wien, Austria • Ulrich S. Schubert, Institut für Organische und Makromolekulare Chemie, Jena, Gennany

102


~nlVERSITÄTS fel~~iKum

Universitätsklinikum Jena - Lobeda

Experimental Transplantation Surgery Prof. Dr. Uta Dahmen

Drackendorfer Str. 1

D

07747 Jena

uta.dahmen@med.uni-jena.de www.avc.uniklinikum-jena.de/Forschung/Experimentelle+Chirurgie.html ~{JQJJJillllrD'9:? 2.Jf Ul9 0S;J/dtJ :<..1000~b~S0

10 ~0:0d:i)flI;_fü E:JIJ\)'.:.:l~

Our group focuses on projects related to perfusion, regeneration, ischemia and transplantation as well as the inflammatory and immune response of the liver. We further work on projects regarding device development, systems biology and research in medical education. We specialize on developing and establishing: - microsurgical techniques (e.g. ALPPS model) and methods for organ replacement (i.e. liver engineering employing decellularization and repopulation techniques) - methods for contrasting the vascular anatomy of small animals - image analysis algorithms to visualize and quantify diagnostic markers of histological samples {e.g. histological sections, vascular casts) - diagnostic techniques (e.g. orthogonal polarization spectral imaging, nearinfrared spectroscopy) - teaching methods using the innovative tool of image- and video-based selfcontrol and self-reflection in medical education @®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@~/i}~ • Fraunhofer Institute for Medical Image Computing (MEVIS), Bremen, Germany • Leibniz Research Center for Working Environment and Human Factors, TU Dortmund (lfADo), Germany • Experimental Molecular lmaging, RWTH Aachen (ExMI), Germany • Experimental Surgery and Training Center, Semmelweis University, Budapest, Hungary

103


Universitätsklinikum Jena - Lobeda Prof. Dr. rer. nat. / med. habil. Michael Hartmann Prof. Dr. rer. nat. / med. habil. Michael Hartmann Pharmacy Erlanger Allee 1 01 07747 Jena michael.hartmann@med.uni-jena.de www.apotheke.uniklinikum-jena.de/

N u m ber of res earch as s oci ates 15

Res earch areas

Main research of the pharmacy of the University hospital Jena with the departments University center of pharmacotherapy and pharmacoeconomy, clinical pharmacy, clinical technology and oncological care: - pharmacotherapy - pharmacoeconomics - pharmacoepidemiology - drug utilization, health services, drug safety, ecomomic evaluations - pharmaceutical technology, pharmaceutical care in the context of study medication

C ooperati on s

• Clinics and institutes of the University hospital of Jena, Germany • Department of Health Policy and management, Jackson State University, Jackson, MS, U.S.A. • AntiBioticStewardship (ABS) - network, Germany • Other national pharmacies and universities

1 04


~nlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Universitätsklinikum Jena - Lobeda

AG Biolmaging Prof. Dr. Knut Holthoff Forschungszentrum Lobeda Erlanger Allee 101

07747 Jena knut.holthoff@med.uni-jena.de www.bioimaging.uniklinikum-jena.de ~{JQJJJillllrD'9:? 2.Jf Ul9 0S;J/dtJ :<..1000~b~S0

7 ~0:0d:i)flI;_fü E:JIJ\)'.:.:l~

Using state-of-the-art optical and electrophysiological methods like fast confocal calcium imaging, 2-photon microscopy or patch clamp recordings we focus on two main scientific questions: What is the function of GABAergic synaptic transmission during brain development? We are especially interested to understand the impact of depolarizing GABA action during early brain development on the sensory and cognitiv function in later life. What are the characteristics of neuronal network activity under physiological and pathophysiological conditions? We want to understand how neuronal networks in the brain process sensory information and which mechanisms disturb the processing during neurological diseases like epilepsy or stroke.

@®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CT1}~ • Prof. Dirk lsbrandt, Köln

• Prof. Olga Garaschuk, Tübingen • Prof. Christian Hübner, Jena •Prof. Stefan Kiebel, Dresden

105

D


Universit채tsklinikum Jena - Lobeda Biomagnetic Center PD Dr. Carsten Klingner Biomagnetisches Zentrum Erlanger Allee 1 01 07747 Jena carsten.klingner@med.uni-jena.de www.neuro.uniklinikum-jena.de/Forschung/Biomagnetisches+Zentrum.html

N u m ber of res earch as s oci ates 5

Res earch areas

The Biomagnetic Center utilizes various techniques to investigate the structure and function of the central nervous system. In particular,methods of high structural accuracy (MRI) are combined with methods of high temporal resolution (EEG/MEG). The overall objective is not only to increase our understanding of brain processes but also to deliver treatment options for a variety of neurological disorders. Research focus is on the study of neurophysiological, cognitive and neurovegetative processes in addition to pursuing research questions in cardiac science based on the analysis of electromagnetic fields generated by cortical neurons or muscle cells. The Biomagnetic Center is staffed with five scientists and two technicians. It comprises four laboratories, a 306-channel wholehead MEG, a 1 68-channel vector-MCG, a 1 6-channel MicroSQUID and an EEG-Lab.

C ooperati on s

The Biomagnetic Center is tightly connected to other departments of the university Jena. Furthermore, there are intensive cooperations with other national (Ilmenau, Berlin) and international (USA, Australia) universities as well as with non-university research institutes (i.e. Fraunhofer institute).

1 06


~nlVERSITÄTS fel~~iKum

Universitätsklinikum Jena - Lobeda

QUIPS/PAIN OUT:Qualitätsverbesserung in der postoperativen Schmerztherapie Prof. Dr. Winfried Meißner Klinik für Anästhesiologie und lntensivmedizin Erlanger Allee 101 07747 Jena

winfried. meissner@med.uni-jena.de www.quips-projekt.de oderwww.pain-out.eu ff.~~ ~~~u~ ~'.3"i't:JÜ::J:Oj ;;)Jll.::J~1J~i~Jk.fJ.::JJJ J~JfrJi!JT/Jl§Eilf'

3 (p@J'0@f~rt~lfüiJ}:Jl:J,~JJ ~'J-:Jf f.l!JJJ~'1~ QUIPS - Qualitätsverbesserung in der postoperativen Schmerztherapie ist ein multizentrisches, interdisziplinäres Benchmark-Projekt zur Verbesserung der Akutschmerztherapie in operativen Zentren/Krankenhäusern. Ziel ist die Verbesserung der Ergebnisqualität in der postoperativen Schmerztherapie durch eine standardisierte Erhebung weniger Qualitätsindikatoren, ihre Analyse und Rückmeldung an die beteiligten Kliniken. Ein webbasiertes automatisiertes Feedback ermöglicht internes und externes Benchmarking sowie eine kontinuier1iche Ver1aufsbeobachtung. Mit über 400.000 Datensätzen ist QUIPS die größte Akutschmerzdatenbank der Welt. PAIN OUT ist das internationale Pendant zu QUIPS.

QUIPS ist registriert im Deutschen Register für Klinische Studien: DRKS00006153

J~®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CTU~'.'iil

• European Society of Anaesthesiology, Brussels, Belgium • International Association for the Study of Pain (IASP), Washington DC, USA

107


Universitätsklinikum Jena - Lobeda Spektroskopische Diagnostik Dr. Ute Neugebauer CSCC Erlanger Allee 1 01 / 07747 Jena ute.neugebauer@med.uni-jena.de www.cscc.uniklinikum-jena.de/CSCC.html

An zah l d er wi s s en s ch aftl i ch en M i tarbei ter 7

F ors ch u n g s s ch werpu n kte

Entwicklung und Anwendung von spektroskopischen Verfahren (insbesondere Raman- und fluoreszenzbasierter Methoden) zur Charakterisierung von Infektionen. Dabei stehen folgende Fragestellungen im Mittelpunkt: - schnelle, kulturunabhängige, spektroskopische Charakterisierung der Pathogene direkt aus Patientenmaterial (Körperflüssigkeiten und Gewebe) (Biomicrofluidics 201 5, 9, 04411 8.; Anal. Chem., 201 3, 85, 1 071 7) - Entwicklung spektroskopischer Antibiotikaempfindlichkeitsassays (Sci. Rep. 201 5, 5, 8271 , Anal. Bioanal. Chem. 201 5, DOI 1 0.1 007/s0021 6-01 5-891 2-y) - Spektroskopie und Bildgebung von intrazellulären Infektionen (Anal. Chem. 201 5, 87, 21 37) - spektroskopische Charakterisierung der primären Wirtsantwort auf Infektionen mit einem Fokus auf Veränderungen der Leukozyten (Anal Chem. 201 2, 84, 5335) - spektroskopische Methoden zur markerfreien Identifizierung von speziellen Zellen im Gewebe und ihre Bedeutung beim Organversagen (Integr. Biol. 201 4, 6, 946)

Kooperati on en

• Innerhalb Jena zahlreiche Kooperationen zu klinischen, biologischen und technologischen Partnern, • D. Imhof (Peptid-Hemin-Interaktionen), Bonn, Deutschland • J. Ducrée (Mikrofluidik), Dublin, Irland • E. Giamarellos (Sepsis), Athen, Griechenland

1 08


~nlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Universitätsklinikum Jena - Lobeda

Center for lnfectious Diseases and lnfection Control Prof. Dr. Mathias W. Pletz Zentrum für Infektionsmedizin und Krankenhaushygiene Erlanger Allee 101 07747 Jena mathias.pletz@med.uni-jena.de www.infektionsmedizin.uniklinikum-jena.de ~{JQJJJillllrD'9:?@1J Ul9 ::JS:JtdtJ :<..l::J:J0~b~S:J

21 ~o~:~;:rrre"Iil Ui\I1::.:i~ We focus on novel strategies against diflicult to treat bacterial infections. This includes e.g. development of fast diagnostic tests for antimicrobial resistance, PK/PD optimized antibiotic treatment and novel approaches to eradicate biofilms. Our research covers the entire range from bench to bedside. A second research focus comprises pneumonia and pneumococcal vaccines.

@®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CT1}~

• Robert Koch Institute, Wernigerode • CAPNETZ-Foundation e.v., Hannover • Centers for Disease Control and Prevention, Altanta

109


D

Universitätsklinikum Jena - Lobeda

UnlVERSITÄTS KLlnlKUm

Jena

Fetal Programming of Diseases in Later Life Prof. Mattthias Schwab Department of Neurology Erlanger Allee 101 07747,Jena

matthias.schwab@mect.uni-jena.de www.neuro.uniklinikum-jena.de/Forschung/AG+Fetale+Himentw_.html ~tlrn.1:rwl0'9~ @11 UII:l~@~II@Jll II.1~9~illEs

7 ~0:0d:i)fl~.fü E:JII0~0

Environmental influences during pregnancy such as stress or malnutrition have a greater role for the development of diseases in later life than previously thought. They induce epigenetic changes in the fetus allowing it to rapidly adapt to seemingly unfavorable postnatal environmental conditions, known as fetal programming. lf the expected adverse environmental conditions da not arise, this evolutionary biological mechanism gains pathogenetic potential and predisposes to "common diseases". Prenatal stress can lead to increased strass sensitivity in later life and to stressassociated diseases such as raised blood pressure, ADHD and depression. Prenatal malnutrition improves utilisation of food leading to adipositas and diabetes mellitus if postnatal nutrition is normal. We investigate the effect of prenatal stress and matemal malnutrition as wen as the underlying mechanisms.

@®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CT1}~

• Dr. Matthias Platzer, Leibniz Institute for Age Research - Fritz Lipmann Institute, Jena, Germany • Prof. Tessa Roseboom, Academisch Medisch Centrum Amsterdam, The Netherlands • Prof. Bea van den Bergh, lilburg University, The Netherlands • Prof. Peter Nathanielsz, University of Wyoming, WY, USA

110


unlVERSITÄTS KLlnlKUm

Universitätsklinikum Jena - Lobeda

Jena

Research Group Hippocampal Plasticity b Dr. Anja Urbach

•'

Department of Neurology Erlanger Allee 101 07747 Jena

anja.urbach@med.uni-jena.de www.neuro.uniklinikumjena.de/Forschung/AG+Hippocampale+Plastizität.html • J

7781111

~~

1l'0 0~.rEJshJ~JfWs.f1@ Ju ~JJfüirm ~ll'@ r

2 f

"" r' nJ J1J 0.0-?.J !.;IJ1'f~fJZl !.Jm i 0~:..

Our group is focused on adult neurogenesis and spreading depolarizations. We use molecularbiological, microscopic and behavioral methods to study: 1. role of adult-born dentate granule neurons for hippocampus-dependent memory, and their regulation by physiological and pathophysiological processes, 2. role of cell cycle regulators (D-type cyclins) in neuronal stem and progenitor cells of the adult brain, 3. the consequences of human brain pathology-associated spreading depolarizations.

1

0

Q):;,~~ ~l@ .fi ~ J

• Dr. Ronny Hänold (FLI Jena) • Prof. Hübner, Dr. Lutz Liebmann, Dr. Geraldine Zimmer (Humangenetik Jena) •Dr. Robert Filipkowski (Warschau)

111


D

UnlVERSITÄTS KLlnlKUm

Universitätsklinikum Jena - Lobeda

AG Wartenberg: Molekulare Stammzellforscflung

Jena

Kardiologie

und

Prof. Dr. Maria Wartenberg Forschungszentrum Lobeda Erlanger Allee 101 07747 Jena

maria.wartenberg@med.uni-jena.de

~tlrn.1:rwl0'9~ @11 UII:l~@~II@Jll II.1~9~illEs

2 ~0:0d:i)fl~.fü E:JII0~0

1. Redox sensitive signalling pathways leading to cardiovascular differentiation: Reactive oxygen species (ROS) act as second messengers in signalling cascades leading to cardiovascular differentiation. We study the interaction of ROS derived from NADPH oxidases and/or mitochondria with the Pl3- kinase pathway or AMPK pathway which influence vasculogenesis/angiogenesis and cardiomyocyte differentiation from ES-cells.

2. NADPH-oxidases regulate angiogenesis and leukocyte differentiation du ring inflammatory response: We established stem cell lines repressing NOX1, NOX2, or NOX4 expression by shRNA technique. EBs containing immune cells, which were positive for CD45, CD68, CD11b, F4/80, and CD19. Exposure of EBs to E. coli led to a significant time-dependent reduction of CFUs. This was paralleled by an upregulation of inflammatory cytokines and ROS. 3.lsolation and characterisation of adipose derived stromal stem cells (ADSC} effect of age on stemnes and plasticity. @®'.0C'6JJSEJj1@CT1}~

• PD Dr. Jörg Müller, CMB, Jena, Germany • Prof. Dr. Regine Heller, CMB, Jena, Germany • Prof. Dr. Schul1ze-Mosgau, Klinik für Gesichts- und Kieferchirurgie, Jena, Gennany •Prof. Dr. Heinrich Sauer, Universitätsklinikum Gießen, Germany

112


~nlVERSITÄTS fel~~iKum

Universitätsklinikum Jena - Lobeda

Nephrology and Rheumatology Research Group

D

Prof Dr. Gunter Wolf, MHBA Klinik für Innere Medizin III Erlanger Allee 101 07747 Jena

gwolf@med.uni-jena.de www.kim3.uniklinikum-jena.de ~{JQJJJillllrD'9:? 2.Jf Ul9 0S;J/dtJ :<..1000~b~S0

4 ~0:0d:i)flI;_fü E:JIJ\)'.:.:l~

The main topics of our group are molecular aspects of diabetic nephropathy (ON) and diabetes associated complications. ON develops oft in patients suffering type 1 or type 2 diabetes mellitus. lt is characterized with renal injury resulting in massive proteinuria. Prolonged and uncontrolled hyperglycemia contributes to an accumulation of the advanced glycation end-products, elevated angiotensin II levels and hypertension, chronic inflammation and augmented generation of transforming growth factor beta1. The above pathological changes are oft resulting of altered gene and protein expressions of numerous targets or moclulation of the physiological signaling cascades, thus leading to the onset and progression of diabetic nephropathy. In addition we analyze as well the molecular aspects of diabetes associated complications e.g. hypoxia and diabetes induced arthritis. Our analyses are based on cellular studies as well as in number of mouse moclels of DM T1 and DM T2.

@®'.0C'6Ja'.f'E.1j1@CT1}~

D

• Prof. Christian Hübner, lnstutite of Human Genetics, Jena, Germany •Prof. Dr. Michael Klagsbum, Children's Hospital and Harvard Medical School, Boston, USA • Center for Sepsis and Critical Care, Jena, Germany •PD Dr. Christoph Daniel, Universität Ertangen-Nümberg, Ertangen, Germany

113


Bilderverzeichnis - S. 1 9: Entomology Group - S. 20: Angewandte und ökologische Mikrobiologie, Gruppenbild - S. 21 : Vertebrate Morphology Group - S. 22: AG Heinzel, Gruppenbild - S. 23: Professur für Zellbiologie der FSU Jena, Gruppenbild - S. 24: AG Kosan, Gruppenbild - S. 30: AG Englert, kidney whole - S. 21 : AG Ermolaeva - S. 33: AG Haenold - S. 35: AG Kaether, Hela Zellen markiert mit einem Marker für ER-exit sites (rot) und DNA (blau)

- S. 40: AG Ploubidou, Mouse oocyte surrounded by granulosa cells - S. 41 : AG Rudolph - S.45 - 59: HKI/Anna Schroll - S. 61 : MPI für Biogeochemie - S. 63 - 72: MPI für chemische Ökologie/Anna Schroll - S. 75: Archäogenetik, Copyright: Schädel: Ben Krause-Kyora, Mammuthbaby Lyuba:

www.wahlheimat.ruhr, Danny Giessner, Rapunzelsamen: H. Korsch, Herbarium Haussknecht, Institut für Spezielle Botanik der Friedrich-Schiller-Universität Jena, Zelle und DNA-Grafik http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/pmh/PMH_Authoring/media/Images/originals/NHGRI85339.jpg

- S. 77: Sepsisforschung, Gruppenbild - S. 78: Lehrstuhl für Biophysik, Gruppenbild - S. 79: Instiut für Virologie und Antivirale Therapie - S. 80: Host Septomics, Gruppenbild - S. 82: Single-Molecule Microscopy Group - S. 83: Gynäkologische Molekularbiologie, Gruppenbild - S. 87: Plazenta-Labor, Gruppenbild - S. 90: Medical Physics Group Jena - S. 92: Laboratory for Biomaterials - S. 93: Cell Biology of the Cytoskeleton - S. 94: Institute of Biochemistry I - S. 95: AG Signaltransduktion - S. 96: AG Huber - S. 97: AG Mosig - S. 98: Extracellular matrix (ECM)/Myocardial Remodelling (Quelle: UKJ) - S. 1 04: Prof. Michael Hartmann (Quelle: UKJ) - S. 1 08: Spektroskopische Diagnostik, Quelle IPHT/S. Döring - S. 111 : Research Group Hippocampal Plasticity

11 4


Impressum

Auflage

1. Auflage.Februar 2016

Herausgeber

Biotechnologische Studenteninitiative (btS) e.V. c/o Universität zu Köln Zülpicher Str. 47 50674 Köln

E-Mail

Vorstand.Jena@bts-ev.de

Projektleitung

Randy Grimlowski

Projektteam

Anne Brückner, Karolin Heinze, Max Heiduk, Karolin Hess

Grafische Gestaltung

Anne Brückner, Randy Grimlowski, Karolin Heinze

Wie hat Euch der ScieGuide gefallen? Was könnte man in der nächsten Auflage besser machen? Was habt Ihr für Ideen? Eure Anregungen sind wichtig für uns! Schreibt uns gerne an Vorstand.Jena@bts-ev.de

... oder kommt einfach selbst bei uns vorbei!

115



Issuu converts static files into: digital portfolios, online yearbooks, online catalogs, digital photo albums and more. Sign up and create your flipbook.