técnicas de producción
Resultados Perfiles de secuenciación de alto rendimiento
Se emplearon secuencias de alto rendimiento de 16S rRNA para determinar la composición de la comunidad de bacterias durante la fase de cría de las 18 muestras de agua de dos tanques de un mismo laboratorio. En total se obtuvieron 409,455 secuencias efectivas, con 8218 – 40,332 secuencias por muestra (promedio = 22,747.5); 23,641
UTO’s fueron detectados por agregación a un umbral de identidad de 97%. Las secuencias fueron vueltas a muestrear aleatoriamente a una profundidad mínima (8,200 secuencias por muestra) entre muestras. Para estimar la diversidad de bacterias en cada muestra, se calcularon índices de diversidad alfa basados en las Unidades Taxonómicas Operacionales. La diversidad de bacterias, calculada por el índice de Shannon, varió de 3.432 a 9.029
en la fase de cría. No hubo diferencia significativa en el índice de Shannon entre los dos tanques de larvas (p>0.05, test t).
Composición de la comunidad de bacterias y diversidad Beta
Bacteroidetes (17–58%), Proteobacteria (20–54%), Cyanobacteria (0.01–41%), y Firmicutes (1–15%) fueron las phyla de bacterias dominantes (abundancia relativa >5%), contando por más del 80.09% de las Unidades
Figura 1. Dinámica estructural de la comunidad bacteriana a nivel taxonómico de clase durante la fase de criadero de larvas de L. vannamei. Los marcadores de L1 – L9 y de R1 – R9 representan muestras de agua recolectadas sucesivamente durante cada dos días, y no se muestran las clases con menos del 1% de abundancia relativa. Fuente: artículo original, ver citación al final de este artículo.
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