يستعمل مرهم توبرادكس ، لمعالجة التهاب الملتحمة ، التهاب القرنية ، التهاب الجزء الامامى من كرة العين ، التهاب العنبية المزمن ، اصابات القرنية الناجمة عن الكيماويات أو الاشعاع أو عن مصادر حرارة ، أو تلك الناجمة عن دخول اجسام غريبة عن العين ، كما يستعمل مرهم توبرادكس ، للمتابعة العلاجية بعد العمليات الجراحية لعدسة العين المعتمة ، الجلوكوما ، الحول .
يستخدم مرهم توبرادكس لعلاج قرحة القرنية و الالتهابات السطحية للعين الناتجة عن سلالات بكتيرية حساسة لمركب التوبرامايسين .
يستعمل مرهم توبرادكس لعلاج الالتهابات فى العين الخارجية ، و ملحقاتها الناتجة عن جراثيم تستجيب لمادة التوبرامايسين ( مثل التهاب الملتحمة ، الالتهاب الحاد لغدد ميبوم و كيس الدمع) .
يستخدم مرهم توبرادكس ، للوقاية من حدوث عدوى فى العين ، بعد الجراحات ،او بعد استخراج الاجسام الغريبة من القرنية أو الملتحمة ، او بعد الرضوض العينية بسبب عوامل فيزيائية أو كميائية ، و قبل و بعد عمليات الجراحة العينية .