O assunto batismo esteve na pauta da IECLB desde a décadade 80, e emergiu com maior ênfase na segunda metade de 90, com
a polêmica suscitada pela prática do rebatismo em algumas comunidades
sob influência da expressão carismática. Diferentes documentos da igreja, aprovados ao longo dos anos, condenam a prática
do rebatismo e exortam seus praticantes para a sua interrupção. Em maio de 2004, com o Fórum da Unidade: Contexto e Identidade da IECLB, esse assunto retornou. Com a convicção de que, no atual contexto, a IECLB tem como seu desafio central aprofundar a reflexão e o diálogo acerca da identidade confessional e da unidade da igreja, a Presidência liderou um processo de diálogo com representantes do Movimento de Renovação Carismática (MC), devidamente
respaldado pelo Conselho da Igreja.