“Laat ons dit dekreet verwerpen in gewetenszaken heeft de meerderheid geen macht.” Het is de plicht van de staat, de vrijheid van het geweten te beschermen, en daarmede eindigt zijn gezag in godsdienstzaken. Iedere regering, welke godsdienstige verrichtingen poogt te regelen of op te dringen door middel van de burgerlike macht, brengt het beginsel zelf ten offer. Dit Protest stelt zich tegen twee misbruiken: het eerste is het inbrengen van de civiele rechter, en het tweede het eigenmachtig gezag van de kerk. Protestantisme de macht van het geweten boven de rechter, en het gezag van het woord van God boven de zichtbare kerk. In de eerste plaats verwerpt het de civiele macht in Goddelike aangelegenheden, en spreekt met de profeten en apostelen: ‘Wij moeten God meer gehoorzamen dan de mensen.’ Het Protest was een plechtige verklaring tegen godsdienstige onverdraagzaamheid, en een bewering van het recht van alle mensen om God te aanbidden volgens de inspraak van hun eigen geweten.