Κάθε χρόνο, ομάδες των Γιατρών Χωρίς Σύνορα εμβολιάζουν πάνω από 10 εκατομμύρια ανθρώπους, απαντώντας κυρίως στο ξέσπασμα ασθενειών, όπως η ιλαρά, η μηνιγγίτιδα, η διφθερίτιδα, ο κοκίτης, ο κίτρινος πυρετός. Υποστηρίζουν επίσης τη διεξαγωγή τακτικών εμβολιασμών σε κάποια προγράμματα όπου προσφέρουν υγειονομική περίθαλψη σε μητέρες και παιδιά. Στην έκθεσή τους με τίτλο «Ο Σωστός Στόχος: Επεκτείνοντας τη Διάθεση Οικονομικά Προσιτών και Κατάλληλων Εμβολίων/THE RIGHT SHOT Extending the Reach of Affordable and Adapted Vaccines», οι Γιατροί Χωρίς Σύνορα περιγράφουν τα εμπόδια τιμολόγησης