2. Na sústavu 11. aplikujeme zovšeobecnený estimátor 12. čím dostaneme odhady štrukturálnych parametrov všetkých rovníc modelu. V prvej fáze odhadu teda vlastne vykonáme prvý a druhý stupeň MNŠ pomocou DMNŠ na každú rovnicu modelu, vypočítame reziduály pre každú rovnicu a z nich odhadneme variačno-kovariačnú maticu reziduálných porúch celého modelu. Potom aplikujeme zovšeobecnenú metódu najmenších štvorcov na model v tvare 11. , čo je tretí stupeň metódy.
14