RESUMEN PONENCIAS
H3 » GoldenBraid 2.0: A comprehensive DNA assembly framework for Plant Synthetic Biology. Alejandro Sarrion-Perdigones*1, Marta Vazquez-Vilar*1, Jorge Palací1, Bas Castelijns1, Javier Forment1, Peio Ziarsolo2, José Blanca2, Antonio Granell1 and Diego Orzaez1. 1
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Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas (CSIC-UPV), Valencia, Spain. Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana. Universitat Politècnica de València, Valencia, Spain. // * Estos autores han contribuido equitativamente en este trabajo. La Biología Sintética tiene como objetivo aplicar principios ingenieriles a los diseños genéticos, abordajes que vienen realizándose en los últimos años en bacterias y levaduras pero que aún no están muy desarrollados en el campo de las Plantas. Uno de los requerimientos estratégicos, es la adopción de tecnologías estandarizadas que faciliten la construcción de estructuras multigénicas complejas, permitiendo el intercambio de piezas genéticas entre laboratorios. En este contexto es donde en el Laboratorio de Genómica y Biotecnología de Plantas del IBMCP hemos creado GoldenBraid2.0 (GB2.0), un sistema de clonaje con características muy interesantes. GB2.0 está basado en el uso de enzimas de restricción de tipo IIs para el ensamblaje de las piezas de DNA, proponiendo un esquema de clonaje modular con notación posicional que se puede asimilar a la gramática de las lenguas habladas. Así, se simplifican las estructuras y se permite la reusabilidad de los elementos genéticos establecidos. El paquete de herramientas de GB2.0 está compuesto por dos series de vectores de destino y por una amplia colección de piezas genéticas en continuo crecimiento. Desde nuestro laboratorio hemos realizado un gran esfuerzo en caracterizar funcionalmente las piezas genéticas que ponemos a disposición de la comunidad científica. Estas piezas y módulos pre-ensamblados permiten expresión constitutiva e inducible de los genes de interés, realizar silenciamiento endógeno, testar interacción proteía-proteína… El usuario de GB2.0 también tiene a su disposición una serie de recursos web que incluyen una base de datos con todas las piezas disponibles, tutoriales y herramientas de software que permiten realizar los ensamblajes in silico y proveen al usuario de los protocolos detallados a utilizar en el laboratorio para realizar sus construcciones. Estas herramientas pueden visitarse en nuestra página web www.gbcloning.org En conclusión, GB2.0 es una completa infraestructura que permite el intercambio de información y de piezas de DNA entre bioingenieros, ayudando la implementación de proyectos de Biología Sintética de Plantas. 81