En 1926, durante la Junta de Gobierno provisional, la ley orgánica incrementa las zonas militares a siete; siendo la VI Zona Militar la que integraba las provincias de Guayas, El Oro, Los Ríos y el Archipiélago de Galápagos. En el gobierno de Isidro Ayora, la Ley Orgánica Militar reduce la estructura general del Ejército a cuatro zonas militares, siendo Guayas, la provincia vértice de la IV Zona Militar; organización que fue modificada por la Guerra del 41, fecha en la que se crea la V Zona Militar. Al término de este conflicto, se vuelve a la organización de las cuatro zonas militares, para dar el comando de la II Zona Militar a la ciudad de Guayaquil, considerando a la provincia del Guayas dentro de su jurisdicción. Igualmente la superioridad militar dispone la creación de la Brigada de Infantería No. 2 Guayas con unidades de la Plaza de Guayaquil y de la provincia del Guayas. El 6 de octubre de 1974 se hace entrega, en ceremonia militar, de los estandartes a las unidades de la Brigada Guayas. En 1990, por disposición del Comando General del Ejército se cambia la nominación de: Brigada de Infantería No. 2 Guayas, por la de Brigada de Infantería No. 5 Guayas junto con las unidades que la conforman.
Comandantes de la II de Libertad 1830 Gral. León de Febres Cordero 1833 Gral. Juan Ignacio Pareja 1850 Gral. José María Urbina 1875 Crnl. Teodoro Gómez de la Torre 1922 Gral.Enrique Barriga 1936-1939-1940 Tcrn.L. A. Rodríguez 1937-1938 Crnl. Ricardo Villacrés G. 1941 Crnl. Guillermo Burbano Rueda 1943 Crnl. Horacio A. Cantos 1944 Mayor Julio Sáenz R. 1947-1948 Tcrn. César Alfaro A. 1949-1950 Tcrn. A. Espinoza B. 1951 Crnl. Ernesto Villacís Ch. 1952 Crnl. Carlos Cabrera S. 1953 Tcrn. César Montúfar H. 1953-1954 Tcrn.Ernesto Andrade B. 1954-1956 Tcrn. Jorge Chiriboga Donoso 1956-1957 Crnl.Eliecer Sáenz Segovia 1959-1960 Crnl. Ángel Zurita P. 1961-1963 Crnl.Pedro Vélez Morán 1963 Tcrn. Jesús Reyes Quintanilla
Historia del arma de infanteria.
1830 Gral. Vicente Aguirre 1849 Tcrn. Francisco Robles 1859 Gral. Guillermo Franco 1876-1883 Gral. Ignacio Veintimilla 1936 Crnl. Federico Gortaire 1936-1937 Tcrn. Pedro Icaza. 1938-1939 Crnl. R. H. Rosales. 1943-1950-1951 Crnl. Octavio Ochoa 1944 Tcrn. Miguel Estrella Arévalo 1944-1947 Tcrn. Víctor Balseca H. 1948-1949 Tcrn. Félix Vega Dávila 1950 Tcrn. Marco Bustamante Ch. 1951-1952 Crnl. Julio Montalvo V. 1952-1953 Mayor Jorge Gortaire V. 1953-1959 Tcrn. Luis Piñeiros Pástor 1954 Tcrn. Galo Almeida Urrutia 1955-1956 Crnl. Enrique Calle S. 1957 Crnl. Octavio H. Cevallos 1960-1961 Crnl. Julio García A. 1963 Tcrn. Jaime Veintimilla M. 1963 Crnl. Alfredo Molina Arroyo
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