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Rapport d’activité 2026 – Extrait

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Rapport d’activité 2026 – Extrait

La science des données biologiques, moteur de l’innovation suisse

En tant qu’infrastructure d’importance nationale subventionnée par la Confédération au titre de l’art. 15 LERI, le SIB soutient la recherche et l’innovation en Suisse et promeut le pays au niveau international dans le domaine des sciences de la vie.

Editorial

L’

ordre mondial est soumis à des tensions croissantes, dues en particulier à la fragmentation géopolitique, à la rivalité technologique et au désengagement croissant des États-Unis du multilatéralisme. Parallèlement, l'importance stratégique de l'IA et des données ne cesse de croître. Les nations se livrent à une course effrénée pour s'assurer le contrôle de ces atouts –non seulement pour l'innovation et la puissance économique, mais aussi pour la sécurité et la souveraineté. La manière dont ces leviers stratégiques sont gérés, et par quels acteurs, est désormais une question déterminante pour la paix et la stabilité.

D ans ce contexte, une IA digne de confiance, fondée sur des données de haute qualité et au service du bien commun, est plus essentielle que jamais. La Suisse est bien positionnée pour mener cette ambition à l’échelle mondiale. Son excellence scientifique, ses infrastructures de données robustes et les liens étroits entre le monde académique et l’industrie sont complétés par des institutions disposant d’une solide expérience dans l’élaboration de normes internationales, ainsi que par une réputation de longue date en matière de neutralité et de collaboration. Le SIB en est une illustration dans le domaine des sciences de la vie. Il fournit des ressources de données de référence ainsi qu'une expertise et des standards qui sous-tendent une IA fiable, favorisent l'innovation suisse et produisent des bénéfices concrets pour la société.

La concentration unique à Genève d'acteurs de la diplomatie et de la science ainsi que d'organisations internationales offre une plateforme puissante. Elle permet non seulement d'accueillir, mais aussi d'orienter les discussions sur la gouvernance de l'IA, la cybersécurité et les infrastructures numériques partagées. Ce rôle – ainsi que la position de Genève comme pôle mondial des données de haute qualité – est renforcé par

d’importantes conférences à venir, notamment le premier Dialogue mondial de l’ONU sur la gouvernance de l’IA, la Conférence européenne sur la biologie computationnelle – organisée par le SIB –et le Sommet sur l’IA de 2027.

S’ appuyant sur sa réputation de fiabilité et de stabilité, la Suisse peut jouer un rôle de premier plan en matière de données de confiance, de l’IA responsable et de diplomatie scientifique. Maintenir cette position constitue une opportunité stratégique : investir durablement dans les écosystèmes de données afin de préserver la compétitivité, la stabilité et l’influence de la Suisse à long terme. •

« Le SIB incarne une IA digne de confiance au service de l'intérêt général. »

Simone de Montmollin Conseillère nationale Présidente du Conseil de Fondation du SIB

L e SIB en bref

L'organisation suisse de référence en matière de science des données biologiques et biomédicales.

Notre mission

Nous faisons progresser la science des données grâce à des collaborations interdisciplinaires et à une maîtrise approfondie des données biologiques et des technologies de pointe : nous fournissons aux chercheur·euses et aux clinicien·nes des bases de données et des outils informatiques, ainsi que des services et des formations, afin d'accélérer l'innovation dans des domaines variés : médecine, santé, agriculture, préservation de la biodiversité et protection de l'environnement.

nous représentons et fédérons la bioinformatique suisse. En encourageant l'excellence scientifique et la collaboration, nous contribuons à faire de la Suisse un des pays les plus innovants au monde.

Le SIB est une organisation à but non lucratif qui regroupe des employé·es et des membres affilié·es de 28 institutions partenaires.

911

membres, dont

193

employé·es

92

groupes

28

partenaires institutionnels dans toute la Suisse

169 bases de données et outils informatiques développés par nos membres et employé·es, accessibles via le portail Expasy.org

Au 1 er janvier 2026

La marque SIB est reconnue au-delà de nos frontières comme gage de fiabilité et d’excellence. Plusieurs de nos ressources sont notamment reconnues au niveau mondial comme essentielles à la recherche et démontrent la pertinence des scientifiques suisses dans le domaine de la bioinformatique.

Notre vision

Au SIB, nous savons que l'expertise en matière de données des sciences de la vie est essentielle pour relever les grands défis mondiaux. En exploitant le potentiel des données biologiques et biomédicales, nous générons des connaissances et favorisons l’innovation pour un avenir meilleur.

Renforcer la sécurité alimentaire

Préserver la biodiversité Améliorer la santé

La bioinformatique alimente les découvertes en sciences de la vie

Transformer les données biologiques en connaissances fiables et réutilisables pour la recherche, la clinique, les politiques publiques et l’IA.

La biologie rivalise avec l’astronomie et la physique des particules comme l’un des plus grands producteurs mondiaux de données massives. Le profilage génétique de routine d’une seule tumeur chez un patient, par exemple, génère environ 500 milliards de points de données d’ADN, auxquels s’ajoutent l’imagerie tumorale et les informations cliniques. Aucun être humain ne peut traiter les informations produites à cette vitesse, à cette échelle et avec cette complexité – et encore moins extraire des connaissances à partir de sources de données disparates à travers le monde.

C'est là qu'intervient la bioinformatique. Au cœur des sciences de la vie modernes, ce domaine fournit les outils et l’expertise nécessaires pour stocker, analyser et interpréter ces données – alimentant des avancées scientifiques dans le monde entier. Son impact est concret : suivi en temps réel des épidémies, développement plus rapide de médicaments, nouvelles connaissances pour la conservation des espèces menacées.

Domaine interdisciplinaire combinant la science des données et la biologie, la bioinformatique couvre une grande diversité de données, d’outils et de méthodes.

Exemples de types de données :

IMAGES, telles que des scans médicaux pour la détection précoce des maladies;

SEQUENCES D'ADN, pour identifier les espèces et les mutations responsables de maladies ;

STRUCTURES DE PROTÉINES, pour comprendre les maladies et concevoir de nouveaux médicaments.

Exemples d'infrastructure :

BASES DE DONNÉES, pour stocker et organiser des informations de référence ;

LOGICIELS, pour modéliser, visualiser, interpréter et comparer les données biologiques ;

CAPACITÉS DE CALCUL ET DE STOCKAGE, pour traiter et sécuriser de grandes quantités de données biologiques et cliniques.

Exemples de méthodes :

REPRÉSENTATION DES CONNAISSANCES, pour retrouver et analyser des données au sein et entre institutions, disciplines et pays ;

IA ET ANALYSES STATISTIQUES, pour détecter des motifs invisibles à l’analyse humaine.

L'ACCÈS À TOUTE L’EXPERTISE SUISSE

Grâce à des partenariats institutionnels et à des collaborations étroites avec les groupes académiques affiliés, le SIB constitue une porte d’entrée vers toute l’expertise suisse en bioinformatique.

Chiffres au 1 er janvier 2026

BÂLE

17 GROUPES

229 MEMBRES DONT 25 EMPLOYÉ·ES

membres, dont 193 employé·es

BERNE

3 GROUPES 25 MEMBRES DONT 1 EMPLOYÉ

YVERDON

1 GROUPE 5 MEMBRES

LAUSANNE 22 GROUPES 296 MEMBRES DONT 88 EMPLOYÉ·ES

GENÈVE

14 GROUPES

121 MEMBRES

DONT 70 EMPLOYÉ·ES

ZURICH

18 GROUPES

147 MEMBRES

DONT 9 EMPLOYÉ·ES

VILLIGEN

1 GROUPE

5 MEMBRES

SAINT-GALL

1 GROUPE 3 MEMBRES

WÄDENSWIL

2 GROUPES 16 MEMBRES

Partenaires

Genève HEG HUG UNIGE

Lausanne CHUV EPFL UNIL

LUDWIG CANCER RESEARCH

Yverdon HEIG-VD

FRIBOURG

4 GROUPES 13 MEMBRES

MARTIGNY

1 GROUPE 7 MEMBRES

Fribourg UNIFR

Martigny IDIAP Berne UNIBE Bâle FMI FHNW

SWISS TPH UNIBAS

Zurich

ETH Zürich USZ UZH

Villigen PSI

Wädenswil

AGROSCOPE

ZHAW

DAVOS 3 GROUPES 13 MEMBRES

BELLINZONE

2 GROUPES 17 MEMBRES

LUGANO 3 GROUPES 14 MEMBRES

Lugano USI SUPSI

Bellinzone IOR IRB

Saint-Gall EMPA

Davos

CARDIO-CARE SIAF

Collaboratif par nature

Une des forces du SIB réside dans sa structure unique : en plus de son personnel, 700 membres y sont affilié·es, issu·es de 28 institutions académiques majeures du pays. La plupart de ces institutions siègent au Conseil de fondation, la plus haute instance du SIB. Ce réseau permet à l'institut de coordonner des initiatives nationales et internationales avec indépendance et efficacité. Cela garantit également que la meilleure expertise du pays soit sollicitée pour répondre aux besoins de la recherche.

Un impact positif sur la société

D’une vision ambitieuse à des impacts concrets : découvrez notre chaîne de valeur à travers trois piliers d’activité complémentaires.

PILIER D’ACTIVITÉ I

Accélérer les découvertes grâce à des données, des connaissances et des outils ouverts

POURQUOI Pour générer des découvertes significatives, les scientifiques des sciences de la vie, les clinicien·nes – et l’IA – ont besoin de jeux de données de haute qualité, structurés et harmonisés, ainsi que des outils de pointe pour les analyser, les visualiser et les partager.

QUOI Le SIB est reconnu à l’échelle internationale pour ses bases de données et ses outils en libre accès, principalement soutenus par la Confédération (VOIR P. 8), et soumis à des évaluations régulières par un comité scientifique indépendant.

RÉSULTAT Cette infrastructure fiable, durable et en phase avec les besoins de la recherche, nous permet d'accélérer les découvertes et le développement d’une IA de confiance.

EXEMPLE D’IMPACT Les utilisatrices et utilisateurs (secteurs académiques et privés) d’UniProt, base de données de référence sur les protéines, bénéficient de gains d’efficacité estimés entre 373 et 565 millions d’euros par an.

Gelsomina C, et al. Zenodo 2025

PILIER D’ACTIVITÉ

II

Soutenir la recherche et l’innovation en fournissant des services de pointe

POURQUOI Les milieux académiques et cliniques, les autorités publiques et les entreprises doivent pouvoir s’appuyer sur une science des données solide, mais ne disposent pas toujours de l’expertise ou des capacités en interne.

QUOI Nos équipes de spécialistes en science des données, développement de logiciels, annotation, formation et biologie computationnelle, offrent des services qui associent une expertise approfondie en informatique à une compréhension fine des données biologiques.

RÉSULTAT Nous favorisons l’innovation, la collaboration et la recherche appliquée au sein de projets publics et privés, en Suisse et à l’international.

EXEMPLE D’IMPACT Dans le cadre d’une collaboration soutenue par Innosuisse, nous co-developpons une IA qui suit les patient·es sous anesthésie afin d'accélérer leur récupération post-opératoire.

PILIER D’ACTIVITÉ III

Permettre des collaborations à grande échelle grâce à une coordination efficace

POURQUOI Les avancées majeures en sciences de la vie nécessitent le partage et l’analyse de données – au préalable harmonisées et structurées – par de nombreux acteurs (scientifiques, clinicien·nes, autorités sanitaires), parfois basés dans des pays différents.

QUOI Grâce à notre statut indépendant et à but non lucratif, nous coordonnons les efforts entre communautés, disciplines, institutions et jurisdictions pour surmonter les défis techniques, juridiques ou de protection des données et construire des infrastructures durables.

RÉSULTAT Nous maximisons les investissements dans la recherche, renforçons la réputation et la compétitivité économique de la Suisse, et accélérons les découvertes.

EXEMPLE D’IMPACT Le Swiss Personalized Health Network (SPHN)* permet aux chercheur·ses d’accéder de manière sécurisée aux données cliniques harmonisées de 800 000 patient·es en Suisse, facilitant la recherche à l’échelle nationale tout en garantissant la protection des données.

* Coordonné par l’Académie Suisse des Sciences Médicales et le SIB

Notre position reconnue d'expert en services de R&D (PILIER II), en particulier dans la coordination des données pour de grands projets européens, contribue à notre rôle de premier plan dans la conception et la mise en œuvre d’infrastructures ambitieuses aux niveaux national et international (PILIER III).

La synergie au cœur de nos actions

Notre capacité à coordonner des données de recherche ouvertes et interopérables au sein d'initiatives à grande échelle (PILIER III) repose sur les standards et les bonnes pratiques que nous mettons en œuvre dans nos propres ressources (PILIER I)

Notre expertise en matière de développement de bases de données et de logiciels (PILIER I) peut également être appliquée à des besoins spécifiques en R&D et en clinique (PILIER II), par exemple pour rendre des jeux de données propriétaires interopérables avec des données ouvertes.

FINANCES

En 2025, le SIB a obtenu des résultats financiers solides, avec un revenu total de 28,5 millions de francs suisses, provenant de bailleurs de fonds nationaux et internationaux.

 Soutenu par la Confédération suisse

Le Secrétariat d’État à la formation, à la recherche et à l’innovation (SEFRI), dont la contribution de base représente 42% des revenus du SIB, est notre principal et plus stable bailleur de fonds. Le plafond de subvention 2025–2028 reste inchangé par rapport aux deux périodes de financement précédentes.

 Un modèle de financement unique pour des ressources ouvertes

La plus grande part de la contribution de base du SEFRI est consacrée à nos ressources ouvertes (6,9 millions de CHF, 60%). Elle est complétée par d’autres sources de financement, notamment des fonds compétitifs et des contributions de l’industrie.

 Près de la moitié des revenus provient de sources compétitives 11,5 millions de CHF (41%) proviennent par exemple de projets européens public-privé et de services pour l’industrie. Cela représente une augmentation de 1,4 million de CHF par rapport à l’année précédente.

Revenus Subventions du SEFRI

(42%)

Fonds compétitifs

(26%)

(15%)

Reprise de la provision (principalement SPHN) 3,8M (14%)

Perte ( nancé ( par les réserves) 0,7M (2%)

Dépenses

Personnel (intégré)

6,1M (22%)

Pro l des employé·es

Bioinformaticien·nes

 Suivre la hausse des besoins

La perte reflète une utilisation délibérée des réserves pour absorber l’augmentation des coûts liés à la conformité et à la cybersécurité, et renforcer les fonctions support essentielles au maintien de la qualité des services.

Développeur·euses logiciels

Biocurateur·rices

Chercheur·euses

 Un centre d’excellence qui tient ses promesse Notre centre d’excellence propose des formations et des services de bioinformatique aux universités, aux entreprises privées et aux hôpitaux. Il est principalement financé par des collaborations et des fonds compétitifs souvent internationaux.

Personnel (SIB Hub)

18,9M (66%)

Gestionnaires de projet scienti ques

Spécialistes IT

Cadres supérieur·es

Conseil externe 0,7M (2%)

Maintenance et équipements 0,8M (3%)

Autres dépenses 1,6M (6%)

Création de provisions

0,4M (1%)

Fonctions suppor t

 Des fonctions support et de direction efficaces Les dépenses liées à la direction et aux fonctions de support (4,4 millions, 15%) couvrent l’administration, les ressources humaines, les finances, la communication, le support légal et informatique. Ces équipes contribuent également aux projets de nos piliers d’activité (VOIR P. 6).

 Investir dans les personnes au cœur de la recherche 25 millions de CHF (88%) des dépenses sont consacrés au personnel, dont 24 % pour des employé·es intégré·es dans des institutions partenaires. Ceci reflète notre modèle unique et efficace qui ancre les infrastructures de données ouvertes dans la recherche.

 La bioinformatique : un domaine multidisciplinaire

Tous les chiffres sont exprimés en millions de francs suisses. Ils reflètent les états financiers audités.

Sciences de la vie : des enjeux cruciaux

Avec l'explosion du volume des données, les sciences de la vie se transforment rapidement. Les avancées scientifiques dépendent désormais de la capacité à structurer, analyser et exploiter ces données.

Le SIB développe les infrastructures, méthodes et standards qui permettent de transformer ces données en connaissances utiles pour relever les grands défis du siècle.

Biodiversité

Transformer les données en décisions

La perte de biodiversité menace la santé, la sécurité alimentaire et l’économie. Agir nécessite des données fiables, aujourd’hui encore largement fragmentées ou inaccessibles.

En intégrant des données génétiques, environnementales et issues de la littérature scientifique, nous les rendons exploitables à grande échelle pour analyser l’état et l’évolution des écosystèmes. Notre expertise contribue par exemple à multiplier par dix le séquençage des plantes, animaux et d'autres organismes, et à rendre des millions de pages de littérature scientifique exploitables par l’IA. Elle nous permet également de participer à des initiatives internationales ambitieuses, telles que le projet européen Biodiversity Meets Data, pour suivre en continu l'état de la biodiversité.

En savoir plus : www.sib.swiss/fr/protection-de-lenvironnement

Cancer

Des traitements mieux ciblés pour chaque patient

Le cancer pourrait devenir la première cause de mortalité en Europe d’ici 2035. Mieux le traiter nécessite une compréhension fine des tumeurs et une utilisation efficace des données cliniques et moléculaires.

Le SIB soutient cette transformation, de la recherche à la pratique clinique. Nous contribuons par exemple à l’initiative UNCAN pour rendre interopérables les données de cancer à l’échelle européenne ; co-développons avec les Hôpitaux Universitaires de Genève depuis 10 ans la plateforme de diagnostic génétique OncoBench® ; et avons formé plus de 70 spécialistes via le CAS suisse en oncologie moléculaire personnalisée.

En savoir plus : www.sib.swiss/fr/oncologie

Épidémies

Anticiper et répondre plus vite

Le suivi des génomes des agents pathogènes permet de repérer rapidement les épidémies et d’orienter les réponses sanitaires. La Suisse dispose d’atouts majeurs dans ce domaine.

Le Centre de Bioinformatique des Pathogènes du SIB coordonne expertise nationale, outils et projets autour des données issues de la santé humaine, animale et environnementale, pour fournir des informations utiles pour analyser et surveiller en continu la circulation des agents pathogènes dans le pays et, en temps de crise, permettre des prises de décision éclairées aux autorités sanitaires. SPSP (Swiss Pathogen Surveillance Platform) intègre par exemple des données multi-pathogènes permettant aux autorités fédérales de suivre leur évolution. Le projet Pathogen Data Network, financé par le NIH aux Etats-Unis et coordonné par le SIB, relie quant à lui données et outils pour accélérer la détection des foyers pathogènes à l’échelle globale et mieux comprendre les pathogènes émergents grâce à l’IA.

En savoir plus : www.sib.swiss/fr/renforcement-de-lapreparation-aux-epidemies

Intelligence Artificielle

Les fondations d’une IA fiable

La pertinence de l'IA pour la société et la recherche dépend en grande partie de la qualité des données sur lesquelles elle est entraînée, et de leur gouvernance. Dans un contexte de rivalités technologiques, leur maîtrise est un enjeu de souveraineté et de compétitivité.

Nos équipes transforment des données complexes en connaissances de haute qualité, exploitables par l’IA et conformes aux exigences de protection des données, et développent des outils d’évaluation des modèles (benchmarking). Le SIB contribue ainsi à garantir la fiabilité de l’IA.

Ces compétences, associées à un écosystème scientifique unique, positionnent la Suisse comme un acteur clé. Cela se traduit par exemple par l’organisation en 2026 de la conférence européenne sur les données du vivant (ECCB) à Genève, dans un contexte marqué par le futur Sommet mondial sur l’IA; ou encore par la mise en place d'un noeud suisse EOSC (European Open Science Cloud) qui connecte les infrastructures suisses au cloud scientifique européen, dans un ecosystème prêt pour l’IA et respectueux de la souveraineté des données.

En savoir plus : www.sib.swiss/fr/ia-fiable

Compétitivité nationale

Transformer les données en avantage stratégique

La maîtrise des données du vivant est devenue un levier de compétitivité et d’innovation.

Le SIB agit comme acteur neutre et de confiance au service de la recherche et de l’industrie. UniProt (VOIR P. 6), co-développé à Genève, génère par exemple des bénéfices jusqu’à 39 fois supérieurs à ses coûts et est cité dans plus de 180 000 brevets, dont de nombreux déposés par des entreprises suisses. Par ailleurs, via SPHN (VOIR P. 6), une collaboration pilote avec Novartis a permis d’analyser des données hospitalières anonymisées pour mieux comprendre les facteurs de risque cardiovasculaire.

En savoir plus : www.sib.swiss/fr/competitivite-suisse

#GenevaLovesData
Quand les données du vivant

deviennent visibles, utiles et stratégiques

En 2026, Genève accueille un programme inédit autour des données du vivant, porté par la principale conférence européenne en sciences des données biologiques (European Conference on Computational Biology, ECCB), organisée par le SIB. L’objectif ? Permettre la rencontre entre scientifiques, décideur·ses, citoyen·nes et artistes autour d’un constat : santé, souveraineté, innovation et IA dépendent de données fiables – un domaine où la Suisse occupe une position de premier plan.

CÉRÉMONIE D'OUVERTURE avec notamment la présidence de la Confédération et du Canton

PERFORMANCE ARTISTIQUE

SESSION PUBLIQUE sur les enjeux sociétaux

EXPOSITION en plein air : Datarium

DÉCOUVRIR LE PROGRAMME COMPLET

Ce document présente un aperçu simplifié. Pour des informations détaillées ou officielles, veuillez vous référer au rapport complet « SIB Profile 2026 ». CRÉDITS PHOTOGRAPHIQUES COUVERTURE : Melissa Ensmenger, Adriano Martinelli and Marianna Rapsomaniki, Lausanne University Hospital; Marianna Kruithof-De Julio and team, University of Bern 2E ET 3E DE COUVERTURE : Keystone / Gaetan Bally – Adobe Stock P. 1 : Valentin Luggen P. 3 : Gilles Laurent | CC BY-SA 4.0 – Unsplash / Catherine Heath – Adobe Stock / Dragana Gordic P. 4 : Jens Maus – iStock / JuSun – Gerhard Wagner, Harvard Medical School P. 7 : SIB – Myo Han | CC BY 3.0 – Adobe Stock – Kalnytska et al. iScience 2024 | CC-BY-NC-ND – Unsplash / NIAID P. 10 : Alamy / Dorling Kindersley – Bio-Techne Spatial P. 11 : NIAID | CC BY 2.0 – Unsplash / NCI

Notre institut rassemble des partenaires publics et privés pour conduire des projets d’envergure. Grâce à la coordination interdisciplinaire et interinstitutionnelle que nous exerçons, le SIB permet de structurer, harmoniser et partager les données des sciences de la vie, tout en alignant les pratiques suisses avec les standards internationaux.

Saviez-vous que la diversité des cellules dans et autour des tumeurs peut être corrélée à l'évolution de la maladie chez les patients·es ? C’est l’une des facettes du cancer que nos spécialistes décryptent pour ouvrir la voie à une nouvelle génération de soins.

SIB Swiss Institute of Bioinformatics

Site web www.sib.swiss LinkedIn sib-swiss-institute-of-bioinformatics

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