NUM. 0025 AÑO 03 30 March 2020
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C O N T E T
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The origin of de COVID-19 CITY WUHAN P.6
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The virus genome P.42
•
Scientific contributions P.62
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Development and monitoring of RDM group to Mtra. Celia Dolores Ramirez Rioja the whole team of designers, editors, writers and researchers. that forms RDM group RDM. En relación con todo lo contenido en el sitio, se prohíbe la reproducción, uso, copia, impresión, distribución, publicación, traducción, adaptación, reordenación y cualquier otro uso o modificación total o parcial de los datos y obras contenidos en estas páginas, por cualquier medio y de cualquier forma.
Derechos reservados Investigación por grupo RDM
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Los qué todos leen Ártico
Reader Letter The objective: RDM Group in this publication, wants to make known to all its readers, how the pandemic that haunts us around the world originated, as well as its genomic structure, all the information was collected and provided by the institutions involved, as well as collaboration of researchers in the area, of which RDM group appreciates and acknowledges the efforts of the authorities, of each researcher, doctor, nurse, specialist and all the staff that is supporting the eradication of this pandemic. As well as the collaboration for the preparation and monitoring of the RDM group at Mtra. Celia Dolores Ramírez Rioja, to each of our Editors, designers, writers, who contribute to the development of this document month by month.
RDM Group www.rdmrevista.com.mx Los qué Todos Leen
Los qué todos leen Organización Mundial de la Salud (OMS)
United Nations
Centers For Disease Control
And prevention
The International Natural Product Sciences Taskforce Universidad Johns Hopkins
Derechos reservados, Investigación por grupo RDM Rdm Léenos
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The origin of de COVID-19 CITY WUHAN
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El origen del COVID-19 Ciudada de Wuhan Los qué Todos Leen
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Wuhan city Wuhan city
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Ciudad de Wuhan
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uhan is the capital of the Hubei Province, People's Republic of China. With a population of over 11 million, it is the ninth most populous Chinese city and one of the
nine central national cities in China. Wuhan today is considered the political, economic, financial, commercial, cultural and educational center of Central China.
Wuhan consists of three national development zones, four scientific and technological development parks, more than 350 research institutes, 1,656 high-tech enterprises, numerous business incubators, and 230 business investments is home to multiple notable institutes of higher education, including Wuhan University 10
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uhan
es la capital de la provincia de Hubei , Repú-
blica Popular de China. con una población de más de 11 millones, la novena ciudad china más poblada y una de las
nueve ciudades nacionales centrales de China. Wuhan hoy es considerado el centro político, económico, financiero, comercial, cultural y educativo de China Central.
Wuhan consta de tres zonas de desarrollo nacional, cuatro parques de desarrollo científico y tecnológico, más de 350 institutos de investigación, 1,656 empresas de alta tecnología, numerosas incubadoras de empresas e inversiones de 230 empresas es el hogar de múltiples institutos notables de educación superior, incluida la Universidad de Wuhan Los qué Todos Leen
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Wuhan City before the construction of the hospital
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Ciudad de Wuhan antes de la construcción del hospital
Images by @dailyoverview, Source imagery @Maxar Technologies
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uhan is widely recognized as the source of the world of COVID-19 pandemic, or coronavirus. The city has been closed since January 2020 as a result of the 2019-20 coronavirus pandemic Initially as a Wuhan coronavirus neumonia epidemic, is a pandemic caused by the SARS-CoV-2 virus. The pandemic started as an epidemic on December 1, 2019 in Wuhan City, the capital of central China's Hubei Province, when a group of people with unknown pneumonia, mainly linked to market workers, were reported South China seafood wholesaler from Wuhan, which sells, among other products, various types of live exotic animals. 14
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uhan es ampliamente reconocido como el origen del brote de la pandemia mundial de COVID-19 , o coronavirus. La ciudad ha estado cerrada desde enero de 2020 como resultado de la pandemia de coronavirus 2019-20 Inicialmente como epidemia de neumonía por coronavirus de Wuhan,es una pandemia causada por el virus SARS-CoV-2. La pandemia comenzó como una epidemia el 1 de diciembre de 2019 en la ciudad de Wuhan, capital de la provincia de Hubei, en la China central, cuando se reportó a un grupo de personas con neumonía de causa desconocida, vinculada principalmente a trabajadores del mercado mayorista de mariscos del sur de China de Wuhan, el cual vende, entre otros productos, varios tipos de animales exóticos vivos. Los qué Todos Leen
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Chinese Wuhan City Huoshenshan Hospital
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Ciudad de Wuhan china Hospital Huoshenshan.
Images by @dailyoverview, Source imagery @Maxar Technologies
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uoshenshan Hospital in Wuhan, China was built over a 10 day period between January 23 and February 2. With more than 7,000 people working around the clock, the facility was a major step in the Chinese government’s response to slow the spread of COVID-19. The facility has 1,000 beds with 30 intensive care units, medical equipment rooms, and quarantine wards. Field hospitals like this one are one of the ways China has slowed the spread of the virus. As of today, China has reported a second consecutive day of no new confirmed cases in Hubei province, the epicenter of the pandemic. We’ve also updated our “Perspective on the Coronavirus” 18
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Hospital Huoshenshan en Wuhan, China, se construyó durante un período de 10 días entre el 23 de enero al 2 de febrero. Con más de 7,000 personas trabajando durante todo el día, la instalación fue un paso importante en la respuesta del gobierno chino para frenar la propagación de COVID-19. La instalación cuenta con 1,000 camas con 30 unidades de cuidados intensivos, salas de equipos médicos y salas de cuarentena. Los hospitales de campaña como este son una de las formas en que China ha frenado la propagación del virus. A partir de hoy, China ha informado por segundo día consecutivo de que no hay nuevos casos confirmados en la provincia de Hubei, el epicentro de la pandemia. Se ha actualizado la historia "Perspectiva sobre el coronavirus" Los qué Todos Leen
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Chinese Wuhan City Huoshenshan Hospital
he Chinese authorities isolated the pathogen causing the outbreak soon after: a new type of coronavirus (dubbed SARS-CoV-2) that has a 70% genetic similarity to at least SARS-CoV, another type of coronavirus that caused the epidemic. of the 2002-2003 severe acute respiratory syndrome (SARS), and an 89% genetic similarity to Bat-CoV-ZC45, a virus found in bats. It is unclear whether the virus had previously been circulating, or whether Wuhan is the source of the pandemic or just the place where it was first identified. 20
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as autoridades chinas aislaron poco después el patógeno causante del brote: un nuevo tipo de coronavirus (bautizado SARS-CoV-2) que tiene una similitud genética de un 70% al menos con el SARSCoV, otro tipo de coronavirus que causó la epidemia del síndrome respiratorio agudo grave de 2002-2003 (SARS), y una similitud genética del 89% con el BatCoV-ZC45, un virus encontrado en murciélagos. No está claro si el virus había estado en circulación anteriormente. Wuhan es el lugar de origen de la pandemia o solo el lugar donde se identificó por primera vez. Los qué Todos Leen
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Confirmed cases in Wuhan City, People's Republic of China, 20192020.
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Los qué todos leen Casos confirmados en la ciudad de Wuhan, República Popular China, 20192020.
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he first suspected case of the coronavirus disease pandemic in China was reported on December 31, 2019 after the first symptoms appeared three weeks earlier, on December 8, 2019. The market where the Outbreak was closed on January 1, 2020 and people with symptoms were isolated. More than 700 people, including more than 400 health workers who had contact with the suspected cases, were placed under observation at the time. 24
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l primer caso sospechoso de la pandemia de enfermedad por coronavirus en China fue reportado el 31 de diciembre de 2019 luego de que los primeros síntomas aparecieran tres semanas antes, el 8 de diciembre de 2019. El mercado donde se sospecha que se originó el brote fue cerrado el 1 de enero de 2020 y las personas con síntomas fueron aisladas.
Más de 700 personas, incluyendo más de 400 trabajadores de la salud que tuvieron contacto con los casos sospechosos, fueron puestos bajo observación en el momento Los qué Todos Leen
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Confirmed cases in the People's Republic of China, 2019-2020.
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Los qué todos leen Casos confirmados en la República Popular China, 2019-2020.
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s the group of cases with "unknown pneumonia" focused on a wholesale market that markets fish, chi-
ckens, cats, pheasants, bats, marmots, venomous snakes, deer, rabbit organs, and other wildlife, the suspicion was directed at a new type of coronavirus from an animal source.
Coronaviruses circulate mainly between animals, but have evolved and infected humans (thus making it a zoonotic virus), as seen in SARS, MERS, and four other types of coronaviruses found in humans that cause respiratory symptoms similar to those of common cold. The six types of coronavirus known so far can be spread from human to human. 28
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omo el grupo de casos con «neumonía de causa desconocida» se centraba sobre un mercado mayorista que comercializa pescado, pollos, gatos, faisanes, murciélagos, marmotas, culebras venenosas, ciervos, órganos de conejos y otros animales salvajes, la sospecha se dirigió a un nuevo tipo de coronavirus de una fuente animal. Los coronavirus circulan principalmente entre animales, pero han evolucionado e infectado a los humanos (convirtiéndolo así en un virus zoonótico), como se ha visto en el SARS, MERS y otros cuatro tipos de coronavirus encontrados en humanos que causan síntomas respiratorios similares a los del resfriado común. Los seis tipos de coronavirus conocidos hasta ahora se pueden contagiar de humano a humano Los qué Todos Leen
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Confirmed cases in the world, 2019-2020
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Los quĂŠ todos leen Casos confirmados en el mundo, 2019-2020
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ollowing the development of a specific diagnosis to detect the infection, the presence of SARS-CoV-2 was confirmed in 41 people from the group of suspected cases in Wuhan. The first deaths were recorded on January 9 and 16, 2020, both men aged over 60. The third death was reported on January 19, and three more were added on January 21, 2020. The Chinese National Health Commission confirmed on January 20, 2020 that this new coronavirus is transmitted between humans. At the same time, the number of infected health workers increased. The World Health Organization warned that an international epidemic could start, and there was an increase in fear due to the proximity of the Chinese New Year celebrations. 32
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ras el desarrollo de un diagnóstico concreto para detectar la infección, la presencia de SARS-CoV-2 fue confirmada en 41 personas del grupo de casos sospechosos en Wuhan. Las primeras muertes se registraron el 9 y 16 de enero de 2020, ambos hombres con edades superiores a los 60. La tercera muerte se reportó el 19 de enero de y tres más se agregaron el 21 de enero de 2020. La Comisión Nacional de Salud de China confirmó el 20 de enero de 2020 que este nuevo coronavirus se transmite entre humanos. Al mismo tiempo, el número de trabajadores de la salud infectados se incrementó. La Organización Mundial de la Salud advirtió que podría originarse una epidemia internacional, y hubo un incremento en el temor debido a la cercanía de las celebraciones del Año Nuevo Chino Los qué Todos Leen
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china
Map of regions with confirmed cases (red) of COVID-19 (as of December 31, 2019) 34
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a
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Mapa de regiones con casos confirmados (rojo) de COVID-19 (a partir del 31 de diciembre de 2019)
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s of December 31, 2019, some regions and countries close to China hardened infrared scans to travelers. In China, infrared thermometers were installed in airports, railway stations, and bus stations. People with fever were taken to medical centers. In late January and early February, people in the worst affected areas such as Wuhan and Huanggang were ordered to shut themselves up in their homes. Only one departure per family was authorized every two days to buy food and medicine, which entered the city only on board certain authorized vehicles, through specific checkpoints.
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partir del 31 de diciembre de 2019, algunas regiones y países cercanos a China endurecieron los escaneos infrarrojos a viajeros. En China se instalaron termómetros infrarrojos en aeropuertos, estaciones de ferrocarril y estaciones de autobuses. Las personas con fiebre fueron llevadas a centros médicos. A finales de enero y principios de febrero, se ordenó a la población de las zonas más afectadas como Wuhan y Huanggang que se encerrase en sus viviendas. Solo se autorizaba una salida por familia cada dos días para comprar alimentos y medicinas, los cuales entraban a la ciudad solo a bordo de ciertos vehículos autorizados, a través de puestos de control específicos. Los qué Todos Leen
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Map of provinces with confirmed cases of COVID-19.
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Los quĂŠ todos leen Mapa de provincias con casos confirmados de COVID-19.
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or the first week of March, after more than 3,000 deaths, the Chinese government considered that the worst of the epidemic had already passed. The number of new infections is continuously decreasing and the alert level has been reduced in most of the provinces. Economic activity picks up despite the fact that some 50 million workers are still missing from their jobs. March 19 is the first day that no case is registered among the Chinese population, the only 34 cases exported from abroad.
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ara la primera semana de marzo, tras más de 3000 muertos, el gobierno chino consideraba que lo peor de la epidemia ya había pasado. El número de nuevas infecciones decrece continuamente y el nivel de alerta ha sido reducido en la mayoría de las provincias. La actividad económica repunta a pesar de que todavía faltan por retornar a sus puestos unos 50 millones de trabajadores. El 19 de marzo es el primer día que no se registra ningún caso entre la población china, siendo los únicos 34 casos exportados desde el extranjero
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The virus genome
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El genoma del virus Los qué Todos Leen
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SARS-CoV-2
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he World Health Organization (WHO) declared on January 30, 2020 the existence of a public health risk of international interest, under the regulations of the International Health Regulations, and later on March 11, 2020 that the disease was already considered a pandemic due to the high number of infected people (118,000) and deaths (4,291) that it had caused around the world (114 countries). 2 41 Since that date, the figures have
continued to increase (as of March 20, 2020, there have been more than 339,000 cases in more than 191 countries and more than 14,628 deaths) 46
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a Organización Mundial de la Salud (OMS) declaró el 30 de enero de 2020 la existencia de un riesgo
de salud pública de interés internacional, bajo las regulaciones del Reglamento Sanitario Internacional, y posteriormente el 11 de marzo de 2020 que la enfermedad se consideraba ya una pandemia por la alta cantidad de personas infectadas (118 000) y muertes (4 291) que había causado alrededor del mundo (114 países). 241 Desde esa fecha las cifras han seguido incrementándo-
se (a partir del 20 de marzo de 2020 ha habido más de 339 000 casos en más de 191 países y más de 14 628 fallecimientos) Los qué Todos Leen
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oronavirus 2 of severe acute respiratory syndrome (SARS-CoV-2) is a type of coronavirus that causes coronavirus disease (COVID-19). It was
initially called 2019-nCoV (in English 2019-novel coronavirus). It was first discovered and isolated in Wuhan, China,
following the 2019-2020 coronavirus disease pandemic. It appears to have a zoonotic origin, that is, it passed from an animal host to a human host. 48
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l coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave
(SARS-CoV-2)
es
un
tipo
de coronavirus causante de la enfermedad por coronavirus
(COVID-19).
Fue
inicialmente
llamado
2019-
nCoV (en inglés 2019-novel coronavirus). Fue
descubierto
y
aislado
por
primera
vez
en Wuhan, China, tras provocar la pandemia de enfer-
medad por coronavirus de 2019-2020. Parece tener un origen zoonótico, es decir, que pasó de un huésped animal a humano. Los qué Todos Leen
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he virus genome is made up of a single strand of RNA, (Ribonucleic acid), which is why it is classified as positive single-stranded RNA. Its gene-
tic sequence has been isolated from a sample obtained from a patient affected by pneumonia in the Chinese city of Wuhan. It was first detected in December 2019. The exact mechanism of transmission is unknown, but it is believed that transmission from one person to another may occur through saliva droplets expelled through coughing and sneezing or by exhaling. It can cause acute respiratory disease and severe pneumonia in humans. 50
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Los qué todos leen l genoma del virus está formado por una sola cadena de ARN, (acido Ribonucleico) por lo que se clasifica como ARN monocatenario positivo. Su secuencia genética se ha aislado a partir de una muestra
obtenida
de
un
paciente
afectado
por neumonía en la ciudad china de Wuhan. Fue detectado por primera vez en diciembre de 2019. No se conoce el mecanismo exacto de transmisión, pero se cree que puede producirse el contagio de una persona a otra mediante las gotas de saliva expulsadas a través de la tos y el estornudo o al espirar. Puede provocar enfermedad respiratoria aguda y neumonía grave en humanos.
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n the taxonomy of viruses, coronaviruses correspond to the Orthocoronavirinae subfamily, which is included within the Coronaviridae family. The Orthocoronavirinae subfamily is made up of four genera, according to their genetic structure: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus, and Deltacoronavirus. Both
alphacoronaviruses
and
betacoronaviruses
cause different diseases in different mammalian species: respiratory infections in humans and gastroenteritis processes in some animals. 52
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Los qué todos leen n la taxonomía de los virus, los coronavirus se corresponden con la subfamilia Orthocoronavirinae, que está incluida dentro de la familia Coronaviridae. La subfamilia Orthocoronavirinae se compone de cuatro géneros, según su estructura genética: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gamma-
coronavirus y Deltacoronavirus. Tanto los alfacoronavirus como los betacoronavirus provocan distintas enfer-
medades en diferentes especies de mamíferos: infecciones respiratorias en humanos y procesos de gastroenteritis en algunos animales.
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oronaviruses form a large family of viruses that can cause disease in humans, from a simple common cold to more serious illnesses such as Middle East respiratory syndrome (MERS) and severe acute respiratory syndrome (SARS). Only six had been discovered that could cause disease in humans.
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os coronavirus forman una gran familia de virus que pueden causar enfermedades en humanos, desde un simple resfriado co-
mún hasta enfermedades más graves como el síndrome respiratorio del Medio Oriente (MERS) y el síndrome respiratorio agudo
grave (SARS). Solo se habían descubierto seis que podían provocar enfermedades en humanos.
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he Wuhan coronavirus (SARS-CoV-2) would be the seventh: I. HCoV-229E. It was discovered in the 60s of the 20th century. It causes a flu-like respiratory illness in humans. II. HCoV-0C43. It was discovered in the 60s of the 20th century. It also causes a flu-like respiratory illness in humans. III. HCoV-NL63. It was identified in the Netherlands in 2003 in a child with bronchiolitis. IV. HCoV-HKU1. It was discovered in 2005 in two patients from the Chinese city of Hong Kong. V. SARS-CoV. It originated the epidemic of severe acute respiratory syndrome. It was discovered in November 2002 in the province of Guangzhou, China. VI. MERS-CoV. It causes Middle East respiratory syndrome, an infectious disease that was first identified in 2012 in Saudi Arabia. 56
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l coronavirus de Wuhan (SARS-CoV-2) sería el séptimo: I. HCoV-229E. Se descubrió en la década de los 60 del siglo xx. Provoca en humanos una enfermedad respiratoria similar a una gripe. II. HCoV-0C43. Se descubrió en la década de los 60 del siglo xx. También provoca en humanos una enfermedad respiratoria similar a una gripe. III. HCoV-NL63. Se identificó en Países Bajos en 2003 en un niño con bronquiolitis. IV. HCoV-HKU1. Se descubrió en 2005 en dos pacientes de la ciudad china de Hong-Kong. V. SARS-CoV. Originó la epidemia del síndrome respiratorio agudo grave. Se descubrió en noviembre de 2002 en la provincia de Cantón, China. VI. MERS-CoV. Provoca el síndrome respiratorio de Oriente Medio, enfermedad infecciosa que fue identificado por primera vez en 2012 en Arabia Saudita.
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ARS-CoV-2 is classified within the genus Betacoronavirus. On rare occasions, coronaviruses from other mammals can mutate and infect humans and then spread from one person to another, as has happened with the Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) that first appeared in November 2002 in the province of Canton (China) and the Middle East Coronavirus Respiratory Syndro-
me (MERS) that was first identified in 2012 in Saudi Arabia. Wuhan's betacoronavirus sequence shows simila-
rities to betacoronaviruses found in bats, but they are genetically distinct from other coronaviruses such as SARS-CoV and MERS-CoV 58
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l SARS-CoV-2 se clasifica dentro del género Betacoronavirus. En raras ocasiones, los coronavirus procedentes de otros mamíferos pueden mutar e infectar al hombre para después propagarse de una persona a otra, como ha ocurrido con el Síndrome respiratorio agudo grave (SARS) que apareció por primera vez en noviembre
de
2002
en
la
provincia
de Cantón (China) y el síndrome respiratorio por coronavirus de Oriente Medio (MERS) que
fue identificado por primera vez en el año 2012 en Arabia Saudita. La secuencia del betacoronavirus de Wuhan
muestra semejanzas con los betacoronavirus encontrados en murciélagos, pero son genéticamente distintos de otros coronavirus como
el SARS-CoV y el MERS-CoV
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ive genomes of the new coronavirus have been isolated and reported, including: BetaCoV / Wuhan / IVDC-HB-01/2019, BetaCoV / Wuhan / IVDC-HB-04/2020, BetaCoV / Wuhan / IVDC-HB-05/2019, BetaCoV / Wuhan / WIV04 / 2019, and BetaCoV / Wuhan / IPBCAMS-WH-01/2019. Its RNA sequence is approximately thirty thousand nucleotides in length. It consists of four structural proteins that are designated by the letters S, M, E, and N and a hemagglutinin esterase (HE). 60
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e ha aislado e informado de cinco genomas del nuevo coronavirus, incluyendo: BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019, BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019, y BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019. Su secuencia de ARN es de aproximadamente treinta mil nucleótidos de longitud. Consta de cuatro proteínas estructurales que se designan con las letras S, M, E y N y una hemaglutinina-esterasa (HE). Los qué Todos Leen
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scientific contributions
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contribución científica
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COVID-19 low-cost and laboratory-safe detection protocol
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Protocolo de detección COVID-19 de bajo costo y seguro para laboratorio Los qué Todos Leen
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Dr. Atanas G Atanasov
New study reports cost-effective, rapid and easy to perform RT-PCR-based method for the detection of SARS-CoV-2 / COVID-19. 66
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Los qué todos leen Author : Dr. Atanas G. Atanasov Is a leading scientist interested in molecular medicine and digital health, PI of LBIDHPS, Editorin Chief of CRBIOTECH and Executive Director of INPST. Social media contacts: Twitter, LinkedIn, Facebook . holds a MSc degree in Biotechnology, PhD degree in Biochemistry and Habilitation (Privatdozent (PD) degree) in Pharmaceutical Biology (issued from the University of Vienna, Austria). He is currently Principle Investigator of Ludwig Boltzmann Institute for Digital Health and Patient Safety at Medical University of Vienna (Austria), Adjunct Professor at IGAB PAS (Poland), Guest-Professor at Bulgarian Academy of Sciences (Bulgaria), Guest-Lecturer at the University of
Vienna (Austria) and Editor-in-Chief of Current Research in Biotechnology (Elsevier). Dr Atanasov has published over 200 papers with a focus on Molecular Medicine, Biotechnology and Natural Products. Moreover, he is a pioneer in digital science communication approaches (e.g., using diverse social media networks, including a Twitter channel with over 100,000 followers) and was named #11 in the world on the “Top 25 biotech influencers to watch on Twitter” and #44 in the world on the “Twitter top 100 – scientist” rankings by Disruptor Daily and Finster Data, respectively. Moreover, he is the Founder and Executive Director of the International Natural Product Sciences Taskforce (INPST), an open innovation platform bringing together scientists and key opinion leaders of the natural product scientific research field, as well as members of multiple scientific excellence centers and pharmaceutical-, bio-
tech-, healthtech- and natural product-related industries, united with the aim to promote collaborative natural product-linked research, technology development, health literacy and biomedical science communication
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he new coronavirus disease 2019 (COVID-19) was first reported in Wuhan, China, in December 2019 and it rapidly spread to over 100 countries, prompting the World Health Organization to declare this disease to be a pandemic on 11 March 2020. COVID-19 is caused by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), a virus belonging to the large coronavirus family of RNA viruses that also includes viruses causing more mild respiratory tract infections (such as the common cold), as well as more se-
vere diseases such as Middle East Respiratory Syndrome (MERS) and Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). 68
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a nueva enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) se informó por primera vez en Wuhan, China, en diciembre de 2019 y se extendió rápidamente a más de 100 países, lo que llevó a la Organización Mundial de la Salud a declarar esta enfermedad como una pandemia el 11 de marzo de 2020. COVID- 19 es causada por el Coronavirus 2 del Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARSCoV-2), un virus que pertenece a la gran familia de virus de ARN del coronavirus que también incluye virus que causan infecciones más leves del tracto respiratorio (como el resfriado común), así como enfermedades más severas como el Síndrome Respiratorio del Medio Oriente (MERS) y el Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARS). Los qué Todos Leen
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Los quĂŠ todos leen ARS-CoV-2/COVID-19 spreads from person-to-
person through small droplets transmitted by the infected person through coughing, sneezing or breathing. These droplets can be directly inhaled by
other people to cause new infections, or first land on different surfaces that can then be a source for infection for the individuals touching it (followed by touching their eyes, nose or mouth, which all can serve as entry points for the virus). In line with these infection routes, to prevent transmission current guidelines recommend keeping a distance of at least 1m away from other people (to prevent infection through inhalation) and often washing hands with soap and hot water (to prevent infection through touching sur-
faces).
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l SARS-CoV-2 / COVID-19 se propaga de persona a persona a través de pequeñas gotas transmitidas por la persona infectada al toser, estornudar o respirar. Estas gotas pueden ser inhaladas directamente por otras personas para causar nuevas infecciones, o primero aterrizar en diferentes superficies que luego pueden ser una fuente de infección para las personas que lo tocan (seguido de tocar sus ojos, nariz o boca, que pue-
den servir como entrada). puntos por el virus). En línea con estas rutas de infección, para evitar la transmisión, las pautas actuales recomiendan mantener una distancia de al menos 1 m de distancia de otras personas (para evitar la infección por inhalación) y, a menudo, lavarse las manos con agua caliente y jabón (para evitar la infección al tocar superficies).
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ommon symptoms observed among 138 hospitalized patients with SARS-CoV-2/COVID-19 in Wuhan, China, included fever (in 98.6% of all cases), fatigue (69.6%) and dry cough (59.4%). Some patients may also experience aches and pains in different parts of the body, runny nose, nausea, vomiting or diarrhea.
In around 80% of the detected infections the overall symptoms are mild and there is no need for a special treatment. Serious illness more often occurs in older
people or people with other medical conditions such as high blood pressure, heart disease, diabetes, lung disease or cancer. 72
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os síntomas comunes observados entre 138 pacientes hospitalizados con SARS-CoV-2 / COVID-19 en Wuhan, China, incluyeron fiebre (en el 98.6% de todos los casos), fatiga (69.6%) y tos seca (59.4%). Algunos pacientes también pueden experimentar dolores y molestias en diferentes partes del cuerpo, secreción nasal, náuseas, vómitos o diarrea . En alrededor del 80% de las infecciones detectadas, los síntomas generales son leves y no hay necesidad de un tratamiento especial. Las enfermedades graves ocurren con mayor frecuencia en personas mayores o personas con otras afecciones médicas como presión arterial alta, enfermedad cardíaca, diabetes, enfermedad pulmonar o cáncer. Los qué Todos Leen
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mportantly, in the first days after infection there are no symptoms and some SARS-CoV-2/ COVID-19 carriers do not develop any symptoms
at all, while there are indications that the transmission of the disease is also possible in the absence of symptoms. The latter indicates that screening for SARS-CoV-2/COVID-19 infections just based on symptoms might not be the most optimal strategy to combat the spread of the disease, which makes the development of fast, widely-applicable and cheap tests to be of a very high interest.
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s importante destacar que en los primeros días después de la infección no hay síntomas y algunos portadores de SARS-CoV-2 / COVID-19 no desarrollan ningún síntoma, mientras que hay indicios de que la transmisión de la enfermedad también es posible en ausencia de síntomas. Esto último indica que la detección de infecciones por SARS-CoV-2 / COVID-19 basadas solo en los síntomas podría no ser la estrategia más óptima para combatir la propagación de la enfermedad, lo que hace que el desarrollo de pruebas rápidas, ampliamente aplicables y baratas sea de muy alto interés.
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Los quĂŠ todos leen In a new study, published in the journal Experimental
Neurobiology, the team developed a protocol optimized for cheap and easy wide-scale detection of SARS-CoV2/COVID-19 based on sample self-collection from the tested individual via pharyngeal swab, Trizol-based RNA purification and SYBR Green-based RT-PCR. This protocol
was
specifically
designed
with
conditions-
optimized for testing of asymptomatic individuals. The self-collection of tissue samples from the tonsils via pharyngeal swab in this protocol was performed to prevent contact between the volunteers participating in the
study, as well as between volunteers and the health care professionals conducting the test. The collected tissue on swab was extracted with commercially available Trizol kit, whereby the application of the Trizol reagent led to denaturation and inactivation of the virus particles and all following steps of the procedure could be performed in a conventional biosafety level 2 labora-
tory.
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En un nuevo estudio, publicado en la revista Experimental Neurobiology, el equipo desarrolló un protocolo optimizado para la detección a gran escala barata y fácil de SARS-CoV-2 / COVID-19 basado en la auto-recolección de muestras del individuo probado a través de un hisopo faríngeo, purificación de ARN basada en Trizol y RT basada en SYBR Green -PCR. Este protocolo fue diseñado específicamente con condiciones optimizadas para la prueba de individuos asintomáticos. La recogida de muestras de tejido de las amígdalas a través de un hisopo faríngeo en este protocolo se realizó para evitar el contacto entre los voluntarios que participan en el estudio, así como entre los voluntarios y los profesionales de la salud que realizan la prueba. El tejido recogido en el hisopo se extrajo con el kit Trizol disponible en el mercado, por lo que la aplicación del reactivo Trizol condujo a la desnaturalización e inactivación de las partículas virales y todos los pasos siguientes del procedimiento podrían realizarse en un laboratorio convencional de nivel 2 de bioseguridad.
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he next step of the protocol also involved the application of a commercial kit to convert the virus RNA to cDNA. For the following quantitative RT-PCR step, primer pairs were designed based on the published full sequence of SARS-CoV-2/COVID-19 and the reaction was performed with the use of SYBR Green PCR Master Mix. SARS-CoV-2/COVID-19 total RNA
was used as a positive control and determination of detection efficiency and limit were done using lentivirus (a well-known, RNA-containing research-purpose
recombinant virus). The lentivirus tests revealed an accuracy and sensitivity limit of 1–10 virus particles for the newly established protocol 78
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l siguiente paso del protocolo también implicó la aplicación de un kit comercial para convertir el ARN del virus en ADNc. Para el siguiente paso cuantitativo de RT-PCR, los pares de cebadores se diseñaron en base a lo publicado secuencia completa de SARS-CoV-2 / COVID-19 y la reacción se realizó con el uso de SYBR Green PCR Master Mix. El ARN total de SARS-CoV-2 / COVID-19 se usó como un control positivo y la determinación de la eficiencia de detección y el límite se realizó usando lentivirus (un virus recombinante conocido con fines de investigación que contiene ARN). Las pruebas de lentivirus revelaron un límite de precisión y sensibilidad de 1 a 10 partículas de virus para el protocolo recientemente establecido. Los qué Todos Leen
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o optimize the detection test, the authors tested multiple primer pairs and demonstrated that the primer vali-
dation step was critical for developing a well-performing detection protocol. Importantly, in the hands of the authors many previously reported primer sets gave strong false positive signals (including primer pairs originating from CDC). Unsurprisingly, the SARS-CoV-2/COVID-19 rapid spread around the world has meant that some of the rapidlydeveloped (and thus not sufficiently validated) diagnostic
tests would be sub-optimal and indeed problems with the accuracy of some early CDC testing kits for SARS-CoV-2/ COVID-19 are reported also from other sources. 80
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ara optimizar la prueba de detección, los autores probaron múltiples pares de cebadores y demostraron que el paso de validación del cebador fue crítico para desarrollar un protocolo de detección con buen rendimiento. Es importante destacar que, en manos de los autores, muchos conjuntos de cebadores informados anteriormente daban fuertes señales de falsos positivos (incluidos los pares de cebadores que se originan de los CDC). Como era de esperar, otras fuentes . Los qué Todos Leen
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he total cost of the newly developed test was estimated to be around $15 (without taking an account of labor cost) per testing, while the total duration of the protocol was found to be approximately 4 hours. The self-collection of the samples by the tested patients, followed by virusinactivation upon the addition of the Trizol reagent
allows the test to be performed in a biosafety level 2 laboratory. These characteristics make the newly developed
protocol
laboratory-safe,
high-
sensitivity, low-cost and especially suitable for large-scale screening of SARS-CoV-2/COVID-19 in asymptomatic individuals.
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l costo total de la prueba recientemente desarrollada se estimó en alrededor de $ 15 (sin
tener en cuenta el costo laboral) por prueba, mientras que la duración total del protocolo fue de aproximadamente 4 horas. La autocolección de las muestras por parte de los pacientes probados, seguida de la inactivación del virus tras la adición del reactivo Trizol permite que la prueba se realice en un laboratorio de nivel 2 de bioseguridad. Estas características hacen que el protocolo desarrollado recientemente sea seguro para el laboratorio, de alta sensibilidad, bajo costo y especialmente adecuado para la detección a gran escala de SARS-CoV-2 / COVID-19 en individuos asintomáticos Los qué Todos Leen
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evertheless, since this new detection protocol is so far tested in a limited number of asymptomatic volunteers, the authors conclude their study with the following words of caution: “We are cautious about the potential for use of this protocol in clinics because there should be much more thorough examinations of our protocol for clinical use. Those who already show obvious symptoms of SARS-CoV-2/COVID-19 should not rely on our detection protocol, but resort to certi-
fied hospital and health agencies. Our protocol should be useful when the purpose of the testing is to identify the negative people, who need to
work, study and sport normally.”
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in embargo, dado que este nuevo protocolo de detección se ha probado hasta ahora en un número limitado de voluntarios asintomáticos, los autores concluyen su estudio con las siguientes palabras de precaución: “Somos cautelosos sobre el potencial de uso de este protocolo en clínicas porque
debería haber exámenes mucho más exhaustivos de nuestro protocolo para uso clínico. Aquellos que ya muestran síntomas obvios de SARS-CoV-2 / COVID19 no deben confiar en nuestro protocolo de detección, sino recurrir a agencias de salud y hospitales certificadas. Nuestro protocolo debería ser útil cuando el propósito de la prueba es identificar a las per-
sonas negativas, que necesitan trabajar, estudiar y hacer deporte normalmente ".
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Los quĂŠ todos leen Finally, I would like to conclude with featuring some ot-
her resources for further reading on SARS-CoV-2/ COVID-19, which might be of interest for fellowscientists and the general public:
Latest updates on COVID-19 by the WHO Jin Y-H, Cai L, Cheng Z-S et al. A rapid advice guideline for the diagnosis and treatment of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV). Military Medical Research. doi:10.1186/ s40779-020-0233-6 (2020). McCarty MF, DiNicolantonio. Nutraceuticals to enhance interferon signaling and counteract RNA viruses, including influenza and coronavirus. Cardiovasc. Dis. doi: 10.1016/j.pcad.2020.02.007 (2020). Zheng Y-Y, Ma Y-T, Zhang J-Y, Xie X. COVID-19 and the cardiovascular system. Nat. Rev. Cardiol. doi: 10.1038/s41569-020-0360-5 (2020).
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Los qué todos leen Finalmente, me gustaría concluir con la presentación de algunos otros recursos para lecturas adicionales sobre SARS-CoV-2 / COVID-19, que podrían ser de interés para los colegas científicos y el público en general:
Últimas actualizaciones sobre COVID-19 por la OMS Jin YH, Cai L, Cheng ZS y col. Una guía de asesoramiento rápido para el diagnóstico y el tratamiento del nuevo coronavirus 2019 (2019-nCoV) . Investigación médica militar. doi: 10.1186 / s40779-020-0233-6 (2020). McCarty MF, DiNicolantonio. Nutracéuticos para mejorar la señalización de interferón y contrarrestar los virus de ARN, incluidos la gripe y el coronavirus. Cardiovasc. Dis. doi: 10.1016 / j.pcad.2020.02.007 (2020). Zheng YY, Ma YT, Zhang JY, Xie X. COVID-19 y el sistema cardiovascular. Nat. Rev. Cardiol. doi: 10.1038 / s41569-020-0360-5 (2020).
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SARS-CoV-2 Global map of infections 88
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SARS-CoV-2 Mapa global de contagios Los qué Todos Leen
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