Museum geologi jakarta berdasarkan kerangka berpikir masa lampau, masa sekarang, dan masa depan. Permukaan tanah Jakarta lebih rendah dari permukaan air Laut Jawa mempengaruhi gaya hidup salah satu lapisan masyarakat di Jakarta Utara, bukti nyata dari peristiwa tersebut dapat ditemukan pada museum ini dari Kisah Komunitas dan Restorasi Masjid Waladuna.
