A vitória da ONSA

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44

Artigo científico sobre o seqüenciamento genético da Xylella fastidiosa, publicado pela Nature, é destaque na imprensa internacional e revela importantes descobertas científicas

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Equipe da USP ganha prêmio internacional com pesquisa sobre superfícies ópticas capazes de modificar as propriedades de um feixe de luz

Estudo busca compatibilizar as principais teorias da Física para explicar as forças do Universo

34 Pesquisador adiciona moléculas modificadas de ácido linoleico conjugado à ração das vacas e obtém leite com mais proteína e menos gordura

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OPINIÃO

5 6 7

POLITICA CIENTÍFICA E TECNOLOGICA

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EDITORIAL MEMORIAS

FAPESP cria o Programa para Inovação em Ciência e Tecnologia Aeroespaciais, influindo na decisão da Embraer de escolher São Paulo como local de sua nova fábrica

LANÇAMENTOS

30 44 54 60 61

ARTE FINAL

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CIÊNCIA TECNOLOGIA HUMANIDADES LIVRO

Capa: Hélio de Almeida, sobre foto de Fabio Colombini/Kino Fotoarquivo

54 Pesquisa analisa as transformações ocorridas na Zona Leste de São Paulo nas últimas décadas e traça o novo perfil econômico e urbano da região PESQUISA FAPESP · JUlHO DE 2000 • 3

Pesqüisa PESQUISA FAPESP É UMA PUBLICAÇÃO MENSAL DA FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO PROF. DR. CARLOS HENRIQUE DE BRITO CRUZ PRESIDENTE PROF. DR. PAULO EDUARDO DE ABREU MACHADO VICE-PRESIDENTE CONSELHO SUPERIOR ADILSON AVANSI DE ABREU ALAIN FLORENT STEMPFER CARLOS HENRIQUE DE BRITO CRUZ FERNANDO VASCO LEÇA DO NASCIMENTO FLÀVIO FAVA DE MORAES JOSÉ JOBSON DE ANDRADE ARRUDA MAURÍCIO PRATES DE CAMPOS FILHO MOHAMED KHEDER ZEYN NILSON DIAS VIEIRA JUNIOR PAULO EDUARDO DE ABREU MACHADO RICARDO RENZO BRENTANI VAHAN AGOPYAN CONSELHO TÉCNICO-ADMINISTRATIVO PROF. DR FRANCISCO ROMEU LANDI DIRETOR PRESIDENTE PROF. DR. JOAQUIM J. DE CAMARGO ENGLER DIRETOR ADMINISTRATIVO PROF. DR. JOSÉ FERNANDO PEREZ DIRETOR CIENTÍFICO EQUIPE RESPONSÁVEL CONSELHO EDITORIAL PROF. DR. FRANCISCO ROMEU LANDI PROF. DR. JOAQUIM J. DE CAMARGO ENGLER PROF. DR. JOSÉ FERNANDO PEREZ

SOO anos de C&T no Brasil Causou-me espanto que o suplemento especial da revista Pesquisa FAPESP, comemorativo dos SOO anos de ciência e tecnologia no Brasil, não tenha dado a devida referência ao livro de Márcia Helena Mendes Ferraz, As

ciências em Portugal e no Brasil (17721822): o texto conflituoso da química (São Paulo; Educ/FAPESP, 1997). Em um suplemento dedicado à história da ciência no Brasil, não deveria haver referência a uma obra seminal sobre a implantação dos cursos de química em Minas Gerais e no Rio de Janeiro?

PROF. DION DAVID MACEDO

Universidade Metodista de São Paulo São Paulo, SP

brasileiras mais representativas, chegando, ao final, àqueles 27 artigos, assinados por 104 pesquisadores brasileiros.

Revista Parabenizo a revista Pesquisa FAPESP pelos temas abordados. Tive a oportunidade de ler pela primeira vez o exemplar do mês de abril, de número 52, cujos temas vieram contribuir na resolução das questões do Provão/ 2000, realizado no dia 11 de junho.

Sou pesquisadora da Universidade Regional do Cariri- URCA, pelo programa Funcap, e aluna do curso de Ciências Biológicas.

DANIELLE lNACIO MAGALHÃES

EDITORA CHEFE MARILUCE MOURA EDITORA ADJUNTA MARIA DA GRAÇA MASCARENHAS EDITOR DE ARTE HÉLIO DE ALMEIDA EDITORES CARLOS FIORAVANTI (CI~NCIA) MARCOS DE OLIVEIRA (TECNOLOGIA) MÀRIO LEITE FERNANDES (ENCARTES) DIAGRAMAÇÃO E PRODUÇÃO GRÁFICA TÃNIA MARIA DOS SANTOS COLABORADORES ADILSON AUGUSTO ANA MARIA FlORI CLAUDIA IZIQUE CRISTINA DURÁN EDUARDO STOPATO LUCAS ECHIMENCO MARIA LIGIA SANCHES MAURÍCIO TUFFANI OITO FILGUEIRAS ROBERTO MEDEIROS WILSON MAR/N/

Crato, Ceará

De acordo com o professor Shozo Motoyama, coordenador do Suplemento, os livros relacionados na publicação são apenas indicações bibliográficas. O critério para a indicação foi o de serem livros clássicos que tratam da história da ciência e da tecnologia no país. Dos títulos relativos a temas ou áreas específicas, foram apenas assinalados os citados no corpo do texto sobre os 500 anos de C&T no Brasil ou os que foram utilizados como material de consúlta.

Gostaria de parabenizar toda a equipe da revista Pesquisa FAPESP pelo excelente trabalho que vem desenvolvendo.

HWO P EDRINI Araçatuba, SP

Parabenizo-os pela revista Pesquisa FAPESP. Sou professor universitário e me interesso pelos assuntos tratados.

CARLOS NABIL GHOBRIL

ENCARTE ESPECIAL MAPA GENÉTICO DA XYLELLA FASTIDIOSA FOTOLITOS E IMPRESSÃO GRAPHBOX-CARAN

São Paulo, SP

Pesquisadores mais citados

TIRAGEM: 22.000 EXEMPLARES FAPESP RUA PIO XI, N" I SOO, CEP 05468-90 I ALTO DA LAPA- SÃO PAULO - SP TEL (O- 11) 3838-4000- FAX: (O- 11) 3838-4117 ESTE INFORMATIVO ESTÃ DISPONÍVEL NA HOME-PAGE DA FAPESP: http://www.fapesp.br e·mail: mariluce@fapesp.br

SECRETARIA DA CI~NCIA TECNOLOGIA E DESENVOLVIMENTO ECONÓMICO

GOVERNO DO ESTADO DE SÃO PAULO

4 · JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPESP

Li com interesse recente reportagem da revista Pesquisa FAPESP em que se fala dos "mais citados autores brasileiros de 1990 até hoje", seguido de lista de trabalhos. Gostaria de saber qual foi exatamente o critério usado para a feitura desta lista.

SIORGIO P. TOLEDO

São Paulo, SP

Tenho acomparihado os artigos publicados na revista Pesquisa FAPESP e gostaria de demonstrar minha admiração. São artigos de grande importância científica, os quais nos proporcionam um maior conhecimento nas diferentes áreas de pesquisa em nosso país. Como trabalho com pesquisa, a revista tornou-se indispensável aos meus estudos.

VALESCA PANDOLFI

A lista foi elaborada pelo Information Scientific Institute (ISI). O critério foi especifico para a premiação e elaborado exclusivamente pelo ISI. O Instituto escolheu os trabalhos com mais de 50 citações, levando ainda em consideração as áreas do conhecimento e as regiões

CNPT/Embrapa- Passo Fundo, RS

Correção A capa da edição n° 54 da Pesquisa FAPESP saiu, incorretamente, como sendo do mês de maio. É de junho.

EDITORIAL

Boa ciência, boa tecnologia e boa divulgação O programa da FAPESP, dirigido a quaisquer empublicação na Nature do artigo sobre o genoma da Xylella fastidiosa representa um presas do setor aeroespacial, foi fator importante marco na história da ciência no Brasil. A para a Embraer decidir instalar sua nova planta em equipe de quase 200 pesquisadores realizou um Gavião Peixoto, São Paulo, estado que é o locus natural desse tipo de atividade no Brasil. Além do Instrabalho de primeira qualidade e colocou a ciência no Brasil nas manchetes internacionais. O NY tituto Tecnológico de Aeronáutica (ITA) e do Times destacou a entrada de "um surpreendente CTA, que deram origem à Embraer, há no estado novo ator num campo dominado pelas nações o INPE, e as universidades paulistas têm atividades desenvolvidas" e a Nature elogiou a "determinadestacadas nesse campo. Em comum com o exemplo da Xylella, a Embraer é resultado de décadas de ção do Brasil de entrar na era pósgenoma de igual para igual com os esforços cumulativos de formação cientistas dos países mais ricos". O de pessoal, sempre com referenciais The Economist afirma que agora o de excelência internacionais e apoio do Estado. Parece que Francis BaBrasil passa a ser conhecido por "Poucas vezes "Samba, football and ... genomics". con tinha alguma razão ao destacar boas notícias que "nenhuma ação do bom goverPoucas vezes boas notícias sobre o sobre o Brasil Brasil foram motivo de tanto desno é mais valiosa do que o enriqueforam motivo taque internacional. Ao lado de concimento do mundo com conhecide tanto destaque tribuir para a recuperação da automento confiável e fértil': internacional, estima dos cientistas brasileiros, a Quando se discutia a criação da FAPESP, em 1955, José Reis destarealização demonstra o acerto da política de pós-graduação no país, cou em artigo na Revista Anhembi voltada à formação de quadros cien(V. XVIII, n. 50, p. 278- citado em tíficos com qualidade determinada S. Motoyama, FAPESP- Uma Histópor referenciais internacionais. ria de Política Científica e Tecnológica) Sem isso, como seria possível junque seria "preciso que a Fundação faça ponto de honra da necessidade tar um time de mais de 200 para de apresentar relatórios sinceros ao esse empreendimento? O papel da ·público ... E esses relatórios não deFAPESP foi decisivo ao vislumbrar o momento cerveriam ser amontoados de cifras ou nomes, mas to para criar uma nova maneira de se organizar a atividade científica no país. Igual importância tiveexposições vivas dos planos e projetos desenvolvidos, para que se percebesse a existência de um verram as agências federais, apoiando a formação desses pesquisadores, ex-bolsistas da Capes e do dadeiro espírito de amparo à ciência .. . ". Pois o CNPq, e as universidades públicas que abrigam a grande José Reis estava descrevendo quase que exaquase totalidade dos pesquisadores. O resultado tamente a revista Pesquisa FAPESP, que faz exatadestaca a importância do investimento estatal conmente aquilo que o mestre recomendou: divulgar as ações da Fundação para o público, de maneira clara tinuado em ciência e tecnologia, do apoio à ciência fundamental e à formação de pessoal. Coisas e acessível. Por isso foi maior ainda a nossa alegria ao que requerem décadas de esforço, no qual o papel vermos a Pesquisa FAPESPser premiada exatamendo Estado é insubstituível. te com o Prêmio José Reis de Divulgação Científica, Aliar ciência fundamental à sua aplicação tem outorgado pelo CNPq. Está de parabéns a equipe sido um desafio constante para a FAPESP. A Funresponsável pela Pesquisa FAPESP mais do que tudação acaba de criar o programa Parceria para do por ter construído nestes cinco anos uma revista Inovação em Ciência e Tecnologia Aeroespaciais. ágil e de alta visibilidade, que destaca de maneira "viAproveitando a oportunidade da iminência da va os planos e projetos apoiados pela Fundação". decisão da Embraer de instalar uma nova planta para produção e desenvolvimento de tecnologia e, Oaa:l L~'yv &(gÔYl..tt~ . ainda, o desejo da empresa de intensificar suas parCA RLOS H EN RI QUE DE BRITO CRUZ cerias com universidades e institutos de pesquisa.

PRESIDENTE DA FA PESP

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PESQUISA FAPESP · JULHO DE 2000 • 5

Pela ciência amazon1ca A

e

O INPA firmou-se como centro gerador do nosso conhecimento da Amazônia A importância de um centro como o Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA) ressalta numa época em que volta a discussão sobre a posse da biodiversidade acirrada pelo recente acordo entre outro orgão Torre de pesquisa e observação do INPA em reserva florestal do Ministério da Ciência (Bio-Amazônia) e uma multinacional de medicamentos (Novartis) para a bioprospecção na região. Surgido como reação brasileira à proposta da Unesco de criar um centro internacional de estudos da floresta amazônica, o INPA foi fundado em 1952 por decreto Filhote de peixe-boi da Amazônia e laborató~io flutuante de pesquisa do presidente Getúlio Vargas e instalado precariamente da população regional". Assim, existentes na região (contra em 1954. Com o tempo, além do estudo da fauna, apenas 650 em toda a América consolidou-se como centro da flora e do ambiente, seus do Norte). O instituto tem de excelência em pesquisas mais de 200 pesquisadores cadastradas ainda 40o/o amazônicas. Com a implantação dedicam-se a um amplo trabalho das cerca de 3.000 espécies do planejamento estratégico de desenvolvimento de peixes da região. em 1993, sua finalidade inicial de produtos e de tecnologia.

Além de atrações existentes de promover "o estudo Os conhecimentos acumulados na área que ocupa, como científico do meio ambiente pela instituição compõem os tanques do peixe-boi, e das condições da vida as trilhas educativas o maior e mais importante da região" foi mais especificada: banco de informações científicas e as coleções botânicas o INPA tem hoje a missão sobre a Amazônia. Ocupando e zoológicas, o INPA mantém de "gerar, promover três quintos do Brasil reservas biológicas, estações e abrigando cerca de SOo/o e divulgar conhecimentos experimentais e barcos científicos e tecnológicos da biodiversidade mundial, equipados com laboratórios. da Amazônia, para a conservação a Amazônia tem a maior floresta Dirige ainda a Fundação do meio ambiente e um quinto da água doce Djalma Batista, que surgiu e o desenvolvimento sustentável do mundo. Só a xiloteca no início da década de 90 dos recursos naturais, do INPA tem 3.500 espécies para dar mais agilidade em benefício principalmente de árvores, das cerca de 5.000 ao trabalho dos cientistas.

6 · JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPESP

OPINIÃO ]OSÉ CARLOS CAVALCANTI

Projeção internacional, expansão nacional Novo modo de produção de conhecimento se estabeleceu no país çado. E o artigo publicado internacionalmente na a semana entre os dias 9 a 15 de julho de 2000 a Revista Nature, uma das mais conNature é apenas o primeiro dos produtos gerados por este novo modo de produzir conhecimentos. ceituadas publicações científicas do munA conclusão do primeiro genoma de fitopatódo, publicou (com capa e tudo) um artigo sobre geno no mundo pelos cientistas paulistas não as descobertas do grupo de cientistas paulistas que apenas coloca o Brasil na fronteira da Genômica seqüenciou completamente o genoma da bactéria internacional (os outros genomas que estão sendo Xylella fastidiosa. Trata-se de um grande acontecifeitos com financiamento da FAPESP garantirão mento para a comunidade científica do Estado de São Paulo, e, por extensão, para o próprio país. esta posição), mas traz consigo a constatação de que um novo paradigma de produMuito já se escreveu recentemente sobre este feito, o que é basção de conhecimento foi estabeletante compreensível. Num país que cido no país.

E foi exatamente isto que atraiu se acostumou a observar o sucesso a atenção da comunidade científica da ciência e tecnologia (C&T) dos país está de Pernambuco. Quando a Fundação países desenvolvidos, observar que percebendo de Amparo à Ciência e Tecnologia também é possível ter sucesso com que tem potencial, de Pernambuco (Facepe) formalia C&T nacional é motivo para ortem recursos zou, pioneiramente, seu convênio gulho e muitas celebrações. humanos, tem com a O que gostaríamos de dar desFAPESP para a participar da tecnologia taque não é o feito em si, mas sim Rede Onsa no Genoma da Cana-dee muita riqueza Açúcar, havia tanto o interesse em o que acreditamos tenham sido os a ser explorada, dominar a tecnologia de seqüenciaseus determinantes e seus impactos.

Em primeiro lugar, salientar as "conmento genético automático, quan. to em dominar este novo modo de dições gerais da produção" deste produção de conhecimento novo feito, o que aqui denominaremos (fundamentalmente pelo fato de a de "um novo modo de produção de Genômica ser uma ciência nova, inconhecimento novo': Neste sentido, o fator que consideramos mais marterdisciplinar e portadora de futucante foi a existência de um estoque de capital huro) . Outros estados da federação também já perceberam este novo dado da realidade da pesquisa mano altamente qualificado na área das ciências biológica nacional e estão expandindo esta rede, biológicas no território do Estado de São Paulo. como é o caso de Alagoas e do Rio de Janeiro.

A partir da introdução de uma inovação geA grande lição que se pode tirar de um feito corencial proposta pela FAPESP, como foi a da estrutura de trabalho em rede de laboratórios (a Rede mo este é a de que o país está se encontrando conOnsa), esse estoque de capital humano foi estimusigo mesmo. Está percebendo que tem chances, tem potencial, tem recursos humanos, tem tecnolado a viabilizar - numa escala e escopo sem precedentes na história da pesquisa nacional - um logia, e tem muita riqueza a ser explorada. Com o fluxo massivo de novas informações acerca do madevido equilíbrio, com o foco adequado, com ciênterial que estava sendo pesquisado. Esse fluxo procia de excelência internacional e tecnologia de relevância nacional, o Brasil pode ainda ir mais longe. porcionou, por meio da bioinformática, a acumulação de uma nova forma de capital (bancos de dados) que, tendo sido transformado em conhecimento novo (o mapa genético do organismo es]OSÉ C ARLOS C AVALCANTI é professor do Departamento de tudado), possibilitou que seu genoma fosse alcanEconomia da UFPE e presidente da Facepe

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9 770028 083057

s achados científicos originais da equipe de pesquisadores do Brasil responsáveis pelo seqüenciamento genético da bactéria Xylella fastidiosa tanto quanto o significado cultural e político, para o país, do sucesso desse projeto mundialmente pioneiro de genoma de um microrganismo causador de doença em plantas - um fitopatógeno - ganharam uma nova e maior visibilidade internacional com a edição da Nature que começou a circular em 13 de julho último. O artigo científico de sete páginas sobre a Xylella- o paper, como se diz no jargão dos pesquisadores - com contribuições novas para a pesquisa genômica, elaborado e assinado por 116 dos 192 cientistas que concluíram em janeiro passado a decodificação genética da bactéria, forneceu nada menos que a capa da edição número 6.792, volume 406 da revista, uma das mais prestigiosas e respeitadas publicações científicas do mundo.

Em 131 anos de existência da Nature, jamais um artigo produzido por um grupo de pesquisa brasileiro chegara à capa da revista. Mas não bastasse isso, a decifração do genoma da bactéria causadora da Clorose Variegada de Citros (CVC) ou praga do amarelinho, pelos pesquisadores ligados à Organização para Seqüenciamento e Análise de Nucleotídeos-Onsa (a rede virtual de labo-

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Depois de uma capa na Nature, a pesquisa genômica feita no país atrai a atenção do mundo M ARILU C E MOURA

ratórios criada pela FAPESP em 1997 e que tem uma onça em sua logomarca), foi festejada em editorial da publicação inglesa e detalhádamente explicada em linguagem jornalística em sua seção News and Views.

No editorial (ver íntegra no box), destacou-se que o seqüenciamento bem-sucedido do patógeno de planta "é uma realização política tanto quanto científica': E, ainda, que a concepção corrente de que somente os países mais industrializados têm o potencial e o pessoal qualificado necessários para realizar pesquisa de ponta foi desmentida pelo projeto brasileiro. Para finalizar, o editorial afirma que o sucesso do projeto da X. fastidiosa somado ao fato incomum de uma agência do mundo avançado e industrializado- o Departamento de Agricultura dos Estados Unidos - ter contratado a pesquisa genômica de uma variante da Xylella de um país em desenvolvimento "endossam a determinação do Brasil de entrar na idade pós-genômica de mãos dadas com os cientistas dos países mais ricos': Em termos de divulgação, os efeitos desse destaque concedido ao projeto brasileiro por um dos maiores ícones da comunidade científica internacional não se fizeram esperar. Ainda na noite da quarta-feira, 12 de julho, findo o embargo de publicação de notícias sobre o material semanal da Nature veiculado pela Internet, a versão on line do New York Times noticiava "Genes of plant disease mappeâ', e a BBC News Online relatava "Brazil hails scientific firsi: Mais tarde, em 18 de julho, o caderno de ciência do jornal NYTpublicaria a matéria "Agriculture takes its turn in the genome spotlighi'.

PESQUISA FAPESP · JULHO DE 1000 • 9

A matéria da BBC informava que a pesquisa do genoma da Xylella está sendo saudada como "um triunfo da ciência brasileira" e, com base em entrevista do coordenador de DNA do projeto, Andrew Simpson, apresentava alguns resultados da pesquisa que representam contribuições novas à ciência e estavam sob sigilo até a publicação do paper pela Nature. Um deles é que muitos dos 2.900 genes da X. fastidiosa (cerca de um terço) são totalmente novos para a ciência, ou seja, são genes jamais descritos antes, enquanto outros são análogos a genes encontrados em outros organismos.

Outro resultado fundamental da pesquisa, destacado pela BBC, foi a identificação de genes na X. fastidiosa que codificam moléculas cuja existência só estava descrita em patógenos de seres humanos e animais, caso em que servem para sua adesão às células do hospedeiro. Ora, o que aí se apresenta é uma clara e importante indicação de identidade dos mecanismos de patogenicidade das bactérias, afetem elas plantas, seres humanos ou outros animais. or sua vez, a matéria publicadada no New York Times on line, produzida pela agência internacional de notícias Associated Press, destacava o caráter pioneiro do mapeamento genético de um fitopatógeno e o situava como um avanço capaz de levar a novas abordagens na luta contra "um flagelo bacteriológico que devasta laranjais e outras plantações". Na seqüência também informava que o trabalho lança luzes sobre o modo pelo qual bactérias infectam igualmente plantas e seres humanos e neutralizam suas defesas, e abria espaço para comentários entusiasmados de Charles J. Arntzen, presidente do Instituto Boyce Thompson, da Universidade de Cornell, sobre essa e outras contribuições científicas importantes apresentadas no artigo de capa da Nature.

Na quinta-feira, 13, uma nova amostra da repercussão internacional da capa da revista científica britânica aconteceria nas páginas de Le Figaro. Sob o título "Les mécanismes de la virulence dévoilés", o jornal francês publicou uma matéria entusiasmada, escrita uma oitava acima, digamos, do tom que boa parte da imprensa brasileira acha recomendável para noticiar conquistas nacionais fora da

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I O • JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPESP

arena esportiva. Nela resumiam-se os resultados científicos do projeto da X. fastidiosa, explicava-se como foi montada a estrutura da Onsa que permitiu seu desenvolvimento e apresentava-se um quadro da praga do amarelinho no Brasil. Le Figaro concedeu espaço, é claro, para observar que foram os pesquisadores franceses Joseph Bové e Monique Garnier que identificaram a Xylella como agente causador da'cvc, no começo dos anos 90. E para lembrar que quando a FAPESP, em 1997, lançou o projeto de seqüenciamento da X. fastidiosa, Bové se dispôs a fornecer os clones da bactéria produzidos pelo Inra (Instituto Nacional de PesquisaAgronômica) em Bordeaux, ao mesmo tempo em que Frédéric Laigret, pesquisador na Universidade Bordeaux 2, dava apoio à constituição de um banco de DNA da bactéria para fornecimento dos fragmentos a serem seqüenciados. Mas, em meio a tudo isso, o que pode soar como música a ouvidos brasileiros é o título do box da reportagem, "Le Brésil parmi les grands", que começa afirmando que o Brasil se alçou ao nível das potências "biológicas" do planeta: Estados Unidos, Grã-Bretanha, França, Japão, Alemanha" (ver íntegra na página 14).

Na quinta-feira seguinte, 20 de julho, reportagem da conceituada revista inglesa The Economist completava a avaliação positiva de alguns dos mais importantes órgãos da grande imprensa internacional sobre a ciência praticada no Brasil. "Samba, futebol e... genômica. A lista de coisas pelas quais o Brasil é reconhecido subitamente ampliou-se", dizia na abertura a matéria sob o título "Fruits of co-opera-

A Xylella fastidiosa e a laranjeira A bactéria tem 2.904 genes e os pesquisadores da ONSA conseguiram identificar as funções de 47% deles.

I

Um grupo de genes produz e libera a goma xantana, que permite à bactéria aderir à parede celular dos vasos que transportam a seiva e a outras bacterias

2 Outros genes produzem substâncias que atacam a parede celular da planta

3

A planta reage liberando substâncias tóxicas (oxidantes) , mas a X. fastidiosa tem um mecanismo de defesa s116 • que as neutraliza ~t.incias ox·d

4 Outro grupo de genes também colabora

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na defesa, desarmando drogas potencialmente nocivas, como o antibiótico penicilina

5 Além da externa, a bactéria tem uma membrana interna, em que se concentram os transportadores de substâncias, que cu idam de expelir ou "importar" certos compostos

6 A Xylella fastidiosa também tem genes para produzir toxinas, "armas químicas" contra outras bactérias, por exemplo

7

Um grupo de pêlos, as fímbrias, também servem para a adesão da bactéria, provavelmente ao aparelho bucal da cigarrinha, o inseto transmissor da praga do amarelinho

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Entre outros genes ligados à adesão, alguns são similares com os de micróbios que causam infecções em seres humanos

Metais

9

Um grupo de genes absorve certos metais, como o cobre

lO Um conjunto de 67 genes é especializado na absorção de ferro, um nutriente importante para a Xylella

Roteiro elaborado pelo jornalista Ricardo Bonalume I Versão original publicada pela Folha de São Paulo em 1310712000

PESQUISA FAPESP • JULHO DE 2000 • li

tion". Explicava em seguida que, apenas poucos dias depois de publicar o primeiro genoma de um fitopatógeno, cientistas ligados à FAPESP preparavam-se para anunciar, no dia 21 de julho, "um outro sucesso": a identificação de 279 mil seqüências genéticas humanas, número, segundo a revista, só inferior ao de seqüências identificadas pelos Estados Unidos e pela Grã-Bretanha. A referência nesse ponto é aos resultados do projeto Genoma Humano do Câncer, que de fato seriam divulgados em entrevista coletiva no Palácio dos Bandeirantes no dia 21 (a cobertura do evento estará na próxima edição de Pesquisa FAPESP). texto de The Economist dá a partir daí uma série de detalhes sobre o Programa Genoma da FAPESP e sobre a própria Fundação, para concluir dizendo que "a lição a retirar de tudo isso é que não há razão pela qual países como o Brasil não possam competir em ciência de ponta se se empenharem nesse sentido". Para finalizar, considerando "os benefícios da cooperação demonstrados por São Paulo, a fonte segura de financiamento à pesquisa existente neste Estado e os mais de 200 cientistas treinados como resultado apenas do projeto da X. fastidiosa", a matéria faz um prognóstico luminoso de crescimento da participação brasileira na produção científica mundial, que, em número de papers publicados, saltou de 0,4% para 1,2% do total mundial, de 1985 a 1999.

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Contribuições significativas No front interno, onde a atenção da mídia para os projetas de pesquisa genômica feitos no Brasil intensificou-se muito a partir do anúncio da conclusão do seqüenciamento da X. fastidiosa em fevereiro passado, o significado da conquista da capa da Nature por essa pesquisa foi informado para dezenas de milhões de brasileiros. Ainda na quarta-feira, as emissoras de rádio e de televisão, a começar pela Globo em seu Jornal Nacional, deram ampla repercussão ao assunto e, na quinta-feira, 13, os principais jornais brasileiros noticiaram com detalhes o que a revista britânica publicara. Não raro o noticiário situou o fato nas esferas de um brilhante gol de placa da pesquisa feita no país. Na quarta, também a novíssima mídia eletrônica nacional juntara-se à difusão do "deu na Nature", idéia inevitável de título para traduzir o fato em questão com um laivo de humor genuinamente nacional, e que terminou sendo efetivamente usado pela revista Isto 12 · JULHO DE 1000 • PESQUISA FAPESP

É, na sexta-feira, 14 de julho. No sábado, 15, a Época mostrou os rostos de alguns dos principais responsáveis pelo sucesso do projeto da X. fastidiosa. Foram dias de tamanha exposição da pesquisa brasileira em genômica na mídia que, de repente, parecia aberto o caminho para mostrar a ciência não só como espaço privilegiado de resolução de inumeráveis problemas que afetam o indivíduo e a sociedade, mas t~mbém como um campo capaz de contribuir para a elevação da combalida auto-estima nacional.

Na verdade, uma amostra especial do fascínio exercido pelo êxito reconhecido dos pesquisadores brasileiros, na área científica hoje mais em evidência no mundo, já ocorrera na terça-feira, 11 de julho, durante a 52 3 Reunião da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência (SBPC), que reuniu em Brasília cerca de 15 mil pessoas, entre cientistas seniores, jovens pesquisadores e estudantes que ainda estão definindo seus caminhos profissionais.

Ali, num auditório superlotado sobretudo por jovens, Andrew Simpson recebeu uma ovação impressionante depois de mostrar por que o projeto da X. fastidiosa apenas em cerca de dois anos fez o Brasil dar um salto de 10 anos em sua competência científica.

Durante a palestra o pesquisador expôs por poucos segundos a capa da Nature que ainda estava sob embargo e declarou que ter um artigo publicado naquela revista era o sonho de todo pesquisador- ele e os demais pesquisadores que assinaram o paper, ressaltou, estavam vendo esse sonho materializado. Essa mesma declaração Simpson

repetiria em estado de graça no dia seguinte, já em São Paulo, durante a entrevista coletiva à imprensa organizada pela FAPESP para que, junto com João Setúbal, um dos dois coordenadores de bioinformática do projeto (o outro é João Meidanis) explicassem os novos achados científicos que logo se tornariam públicos no mundo inteiro. Participaram da coletiva também o presidente da FAPESP, Carlos Henrique de Brito Cruz, o diretor científico da Fundação, José Fernando Perez, a secretária adjunta de Ciência, Tecnologia e Desenvolvimento Econômico de São Paulo, Betty Abramowicz, o pró-reitor de pesquisa da USP, Hernan Chaimovich, o vice-reitor da Unicamp, Fernando Galembeck e o pró-reitor de pós-graduação e pesquisa da Unesp, Fernando Mendes Pereira.

Biologia decifrada

A seqüência do genoma da X. fastidiosa é o 24° genoma completo de bactéria agora conhecido para a ciência e o primeiro de um fitopatógeno. A Xylella possui quase 2,7 milhões de pares nitrogenados ou nucleotídeos em seu cromossoma (mais precisamente, 2.679.305), o que mostra que ela é um terço maior do que os pesquisadores imaginavam quando iniciaram seu seqüenciamento no começo de 1998.

Dentro desses pares de base estão 2.904 genes, regiões codificadoras de proteínas, dos quais um terço é novo para a ciência e 47% têm as funções precisamente descritas.

Esse percentual está um tanto abaixo do que outros grupos de pesquisa de genoma de bactéria obtiveram - por exemplo, ele chegou a 54% na Thermotoga marítima, a 52,5% na Deinococcus radiodurans e a 53,7% na Neisseria meningiditis. Os pesquisadores brasileiros atribuem esse resultado um tanto menor à inexistência prévia de qualquer outra seqüência completa de genoma de bactéria fitopatogênica antes da Xylella, que em princípio facilitaria o trabalho de definição funcional dos genes, ou seja, trata-se de um custo do próprio pioneirismo. téria se multiplica na cigarrinha e esse inseto to r a introduz diretamente nos vasos de trans·orte da seiva da planta, o chamado xilema.

Aí instalada, ela se multiplica e, fastidiosa como o nome indica, age lentamente. Os sintomas da Clorose Variegada dos Citros vão demorar a aparecer, mas o resultado final é o entupimento dos vasos, a perda de clorofila, o amarelamento, as manchas das folhas e a produção precoce de frutos pequenos e duros, imprestáveis portanto para consumo. O resultado econômico desse processo, no Brasil, produtor de quase metade do suco de laranja concentrado posto no mercado internacional, são prejuízos estimados em US$ 100 milhões anuais. Lembre-se que a receita nacional com a citricultura é de quase US$ 2 bilhões anuais, e que em São Paulo essa atividade gera 400 mil empregos, entre diretos e indiretos.

A X. fastidiosa tem um metabolismo refinado. Ela é adaptada para o uso de açúcares encontrados livres na seiva do xilema e para a utilização da glicose derivada da quebra da celulose, principal componente das paredes das células vegetais. Os carboidratos fornecem energia para todas as reações biossintéticas dessa bactéria que não apresenta genes codificadores das enzimas necessárias

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PESQUISA FAPESP · JULHO DE 2000 • 13

para produção de açúcares a partir de aminoácidos e outros metabólitos.

Outra descoberta dos pesquisadores: 67 genes da X. fastidiosa são dedicados à retirada de ferro e outros metais da seiva da planta, o que, segundo eles, contribui para alguns sintomas típicos da CVC. Mais um achado científico importante: a X. fastidiosa apresenta dois diferentes sistemas de adesão celular. O primeiro deles compreende uma matriz de polissacarídeos extracelulares sintetizados e liberados pelos chamados genes de goma, que grudam a bactéria na parede celular do xilema e em outras bactérias, e terminam por entupir os vasos, bloquear a seiva e levar a planta ao estresse de água. Justamente para o operon ou conjunto de genes que sintetizam essa goma xantana é que a FAPESP solicitou no ano passado o registro de patente nos Estados Unidos. O outro sistema de adesão, especificado por 26 genes que codificam as chamadas proteínas frmbriais, serve provavelmente para grudar a bactéria no aparelho digestivo da cigarrinha.

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14 • JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPES P

O Brasil entre os grandes

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; ra descoberta de grande alcance, já citada, 1 a identificação dos genes que codificam moléculas envolvidas na adesão da célula anteriormente só identificadas em patógenos de seres humanos e de animais. São moléculas diretamente associadas à superfície celular da bactéria, que respondem pela aderência ao tecido epitelial nos hospedeiros, cujo encontro na X. fastidiosa aumenta a evidência de que os mecanismos de patogenicidade das bactérias, ou seja, seu mecanismos para causar doenças são os mesmos, infectem elas plantas, animais ou seres humanos.

O que os pesquisadores organizados na Onsa fizeram está bem descrito nas conclusões finais do paper da Nature.

Eles determinaram "não só o metabolismo básico e as características de replicação da bactéria, mas também numerosos mecanismos potenciais de patogenicidade. Alguns jamais tiveram sua ocorrência antes postulada para fitopatógenos, fornececendo novas percepções para a generalidade desses processos:' Os resultados obtidos permitirão agora, diz o artigo, o começo de uma detalhada comparação entre patógenos animais e vegetais. Para completar, as novas informações deverão fornecer bases para uma investigação experimental, acelerada e racional das inte-

LE FIGARO c

om o seqüenciamento da bactéria Xylella fastidiosa, o Brasil se alça ao nível das potências "biológicas" do planeta: Estados Unidos, Reino Unido, F~ança, Japão, Alemanha. A iniciativa surgiu, há três anos, na Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP). Desejosa de desenvolver a biologia molecular, essa instituição que administra o produto da arrecadação estadual destinado à pesquisa, lançava assim uma espécie de plano keynesiano de crescimento aplicado à ciência. A FAPESP forneceu a cada um dos trinta laboratórios que responderam à sua convocação um seqüenciador cujo preço unitário se avizinha de 700.000 francos. Esses esforços foram recompensados. Melhor, os Estados Unidos acabam de encomendar aos brasileiros o seqüenciamento de uma variante da X. fastidiosa que infesta seus vinhedos.

E que poderá perfeitamente ameaçar a Europa e a França algum dia. Não causa espanto que esse grande país tenha sido convidado, juntamente com a China, a Índia e o México, para participar da reunião dos ministros da Pesquisa do GB, no final de junho, em Bordeaux.

Seqüenciamento de genoma para todos O bem-sucedido seqüenciamento de um patógeno de planta por pesquisadores brasileiros é uma realização tanto política quanto científica

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á um equívoco comum de que somente nações avançadas e industrializadas têm o potencial e o pessoal qualificado necessários para realizar ciência de ponta eficaz. Essa concepção equivocada tem sido adotada pelos pesquisadores de países em desenvolvimento que acham necessário obter seu treinamento de pesquisa no exterior - e decidem não voltar, alegando a falta de oportunidade científica. Mas isso foi desmentido por um artigo publicado nesta edição que descreve o resultado de um projeto realizado por um consórcio de centros de pesquisa do Estado de São Paulo, no Brasil, para seqüenciar a bactéria Xylella fastidiosa. Esta bactéria causa uma doença que afeta frutas cítricas e outras importantes culturas vegetais, resultando num prejuízo de muitos milhões de dólares por ano.

Como primeira seqüência pública de um patógeno de planta de vida livre, o artigo representa um marco científico significativo. Mas também envia um claro sinal político, notadamente o desejo e a capacidade de países como o Brasil de jogar na grande liga.

O projeto de seqüenciamento foi escolhido deliberadamente pela sua principal agência financiadora, a FAPESP, para desempenhar um papel catalisador ajudando grupos de pesquisa a se prepararem eles mesmos para o desafio da era pós-genômica. Também se pretendeu enviar um sinal aos jovens cientistas do Brasil de que eles não precisam deixar o país para tomar parte da ciência de nível mundial. Em ambos os aspectos parece que houve sucesso. É claro que o seqüenciamento do genoma da bactéria é só o primeiro passo no sentido do controle dos

rações entre a X. fastidiosa e seus hospedeiros, que devem conduzir a novos achados nas abordagens para o controle da CVC, a famosa praga do amarelinho.

São conclusões que, além de um sucesso, marcam também o começo de uma fase nova, "em que o Brasil passa a participar da definição da agenda mundial da ciência", como destacou o presidente da FAPESP, Brito Cruz. "Em que o país já revela uma competência científica na fronteira do conhecimento, em pé de igualdade com os países mais desenvolvidos", como assinalou Perez.

Uma fase em que já pode prever a ampla utilização de conhecimento de ponta pelo setor produtivo no país, ressaltou Betty Abramowicz, para a produção de riqueza.

danos que ela causa. O próximo é aplicar a genômica funcional para entender como operam os genes da bactéria, abrindo caminhos para uma possível intervenção para restringir sua disseminação por insetos.

Com isso, o conhecimento do genoma poderia fornecer a informação necessária para gerar variantes resistentes para as plantações afetadas. Isso levanta um outro conjunto de desafios- convencer o público brasileiro de que plantas transgénicas podem desempenhar um papel econômico importante e, ao mesmo tempo, dar passos firmes para evitar conseqüências sociais e ambientais indesejáveis.

Tecnicamente, muito disso de certa forma é coisa para o futuro. Mas o sucesso do projeto da X. fastidiosa já atraiu manifestações importantes de interesse por projetas semelhantes de outras áreas da comunidade agrícola - uma proposta que está na ordem do dia é a de que os mesmos centros de seqüenciamento voltem sua atenção para as etiquetas de seqüência expressa (ESTs) de frango. O sucesso também foi responsável pelo bem-vindo e relativamente incomum fenômeno de uma agência do mundo industrializado e avançado- neste caso, o Departamento de Agricultura dos EUA, preocupado com o impacto de uma variante da X. fastidiosa nos pomares de citros* da Califórnia - contratar pesquisa de um país em desenvolvimento. Esses dois feitos endossam a determinação do Brasil de entrar na idade pós-genômica de igual para igual com os cientistas de países mais ricos. *Na verdade, a variante da X. fastidiosa afeta as vinhas da Califórnia

* Autores:A.J. Simpson. F. C. Reinach. P.Arruda, F.A.Abreu, M.Acencio, L. M. C. Alves, J. E. Araya. G. S. Baia, C. S. Baptista, M. H. Barros, E. D. Bonaccorsi, S. Bordin,J. M. Bové, M. R. S. Briones. M. R. P. Bueno,A.A. Camargo, L. E. A. Camargo, D. M. Carraro, H. Carrer, N. B. Colauto, C. Colombo, F. F. Costa, C. M. Costa-Neto, L. L. Coutinho, M. Cristofani, E. Dias-Neto, C. Docena, H. EI-Dorry, A. P. Facincani,A.J . S. Ferreira.V. C. A. Ferreira,J.A. Ferro,J. S. Fraga, S. C. França, M. C. Franco, M. Frohme, L. R. Furlan, M. Garnier, G. H. Goldman, S. L. Gomes, A. Gruber, P. L. Ho, J. D. Hoheisel, M. L. Junqueira, E. L. Kemper. J. P. Kitajima, J. E. Krieger, E. E. Kuramae, F. Laigret, M. R. Lambais, L. C. C. Leite, E. G. M. Lemos, S. A. Lopes. C. R. Lopes,J.A. Machado, M.A. Machado, A. M. B. N. Madeira, H. M. Madeira, C. L. Marino, M.V. Marques, E. A. L. Martins, E. M. F. Martins,A.Y Matsukuma, C. F. M. Menck, E. C. Miracca, C.Y. Miyaki, C. B. Monteiro-Vitorello, D. H. Moon , M.A. Nagai ,A. L.T. O. Nascimento, L. E. S. Netto,A. Nhani Jr, F. G. Nobrega, L. R. Nunes, M.A. Oliveira, M. C. de Oliveira, R. C. de Oliveira, O. A. Palmieri, A. Paris, B. R. Peixoto, G. A. G. Pereira, H. A. Pereira Jr, J. B. Pesquero, R. B. Quaggio, P. G. Roberto, V. Rodrigues,A.J . de M. Rosa,V. E. de Rosa Jr, R. G. de Sá, R.V. Santelli, H. E. Sawasaki,A. C. R. da Silva, A. M. da Silva, F. R. da Silva,W.A. Silva,J. F. da Silveira, M. L. Z. Silvestri,WJ. Siqueira,A.A. de Souza, A. P. de Souza, M. F.Terenzi, D.Truffi, S. M.Tsai, M. H.Tsuhako, H.Vallada, M.A.Van Sluys, S. Vejovski-Aimeida,A. L.Vettore, M.A. Zago, M. Zatz, J. Meidanis & J. C. Setubal •

PESQUISA FAPESP · JULHO DE 1000 • IS

POLÍTICA CIENTÍFICA E TECNOLÓGICA

AERONÁUTICA

Programa da FAPESP apoiará projetas de desenvolvimento do setor aeroespacial

CLAUDIA IZIQUE E

LU C AS E C HIMEN C O

as asas a

Conselho Superior da FAPESP aprovou a implantação do programa Parceria para Inovação em Ciência e Tecnologia Aeroespaciais (PICTA) para apoiar projetos desenvolvidos por universidades e instituições de pesquisas em conjunto com empresas do setor aeroespacial. O novo programa contará com recursos da ordem de R$ 18 milhões anuais, de acordo com Carlos Henrique de Brito Cruz, presidente do Conselho Superior da entidade.

O programa vai funcionar nos mesmos moldes do Programa de Inovação Tecnológica em Parceria (PITE): os projetos serão apresenta16 • JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPESP

raer dos por universidades ou instituições, avaliados pela FAPESP, que, se aprovada a proposta, contrata com o pesquisador o financiamento de 50% da pesquisa. Os outros 50% serão apartados pela empresa interessada no desenvolvimento do projeto.

A criação do PICTA pesou, e muito, na decisão da Embraer de instalar no Estado de São Paulo, no município de Gavião Peixoto, uma nova fábrica de aviões e uma pista de ensaio em vôo, com investimento total de R$ 340 milhões e criação de 3 mil empregos.

"Vamos procurar estudar projetos em parceria com o curso de Engenharia Mecânica e Aeronáutica de São Carlos

e com outras instituições de pesquisa que tenham utilidade para a Embraer': afirma Satoshi Yokota, vicepresidente industrial da Embraer.

A fábrica e a pista de ensaio em vôo da Embraer começam a ser construídas em outubro para operar em 2001, e a empresa, provavelmente, será um dos principais clientes do PICTA. Mas a expectativa é que a região venha a se constituir num pólo aeroespacial, reunindo fornecedores nacionais e internacionais de produtos, processos e serviços na área de aeronáutica.

A TAM, por exemplo, já adquiriu a área da extinta Companhia Brasileira de Tratores (CBTA), onde pretende

raíba, Campinas e na capital, como do ponto de vista estritamente tecnológico, o que permitiu fazer esse entendimento com a FAPESP para o financiamento de pesquisadores que apresentem projetos na área aeroespacial", diz o secretário de Ciência, Tecnologia e Desenvolvimento Econômico, José Aníbal. Ele lembra que a região tem uma forte tradição em pesquisa em torno da Universidade de São Paulo (USP) e da Universidade Federal de São Carlos (UFSCar) e garante que as escolas técnicas estaduais da rede Paula Souza, assim como a Faculdade de Tecnologia de Taquaritinga, deverão desenvolver cursos de Engenharia Aeronáutica, com especialização em Engenharia Espacial.

Aeronaves militares -A proximida-

de das universidades e dos institutos

exigiu a construção de nova fábrica para produção de jatos militares e comerciais

instalar um centro de manutenção de aeronaves. De acordo com Yokota, a Embraer faz gestões junto ao Banco Nacional de Desenvolvimento Econômico e Social (BNDES) e Ministério da Indústria e Comércio (Mine), no sentido de atrair alguns de seus fornecedores para o Brasil. "Nos interessa tê-los por perto", diz o vice-presidente da Embraer.

Pólo aeroespacial - O governo do estado aposta na formação desse novo pólo de desenvolvimento. Investe R$ 27 milhões na aquisição de uma área de 14,5 quilômetros quadrados no município, que será cedida à Em-

braer por um período de 35 anos, renováveis por mais 35; na infra-estrutura básica do terreno, como fornecimento de energia, água e tratamento de efluentes; e na pavimentação dos acessos rodoviários. "Antevemos uma nova fronteira para São Paulo, tanto do ponto de vista geográfico, já que se está expandindo para a região de Araraquara uma fronteira tecnológica até então articulada no Vale do Pa-

de pesquisa contou pontos na decisão da Embraer de se instalar na região. Mas também pesou o fato de Gavião Peixoto possibilitar a construção de uma pista de teste distante de áreas urbanas e das rotas aéreas com intenso tráfego de aviões comerciais, além de permitir um requerido sigilo, já que a nova fábrica vai produzir jatos militares como o AL-X, conhecido como SupertucaPESQUISA FAPESP · JULHO DE 1000 • 17

no, e o AM-X, aeronaves de combate de alto desempenho cujos testes exigem ampla disponibilidade de espaço aéreo para manobras. Atualmente, os aviões militares produzidos pela empresa, em São José dos Campos, são testados na base de Moses Lake, no Estado de Washington, nos Estados Unidos.

A topografia plana de Gavião Peixoto permitirá a construção de uma pista de ensaio em vôo de 3 quilômetros de extensão com mais 2 quilômetros de faixa de segurança para manobras. "A região se situa além da Serra da Mantiqueira e as condições meteorológicas são adequadas para testes durante todo o ano': ressalva Yokota.

Em função das demandas do mercado, a Embraer também poderá fabricar em Gavião Peixoto aeronaves comerciais, das famílias de jato ERJ 145/135/140 e ERJ 170/190.

Além de condições meteorológicas e geográficas adequadas, a região em torno de Gavião Peixoto apresenta uma vantagem adicional para a Embraer: a nova fábrica estará instalada em área próxima a cidades com população entre 100 mil e 150 mil habitantes, onde a empresa poderá recrutar funcionários. De acordo com o vice-presidente, é regra da empresa contratar, no máximo, de 3% a 5% da população dos municípios da região onde a empresa está instalada "para que a relação entre empresa e a cidade não seja de dependência vital".

Ampliação de contratos - A fábrica

de Gavião Peixoto será a quarta unidade de produção da empresa no Estado de São Paulo. A Embraer tem duas plantas em São José dos Campos e uma em Botucatu. A decisão de ampliação decorre da expansão dos negócios da empresa no mercado internacional e das limitações dos parques industriais já existentes. A Embraer cresceu uma média de 50% ao ano, nos últimos cinco ano, e já ocupa o 4° lugar no ranking dos maiores fabricantes de aviões comerciais. No 18 • JULHO DE 1000 • PESQUISA FAPESP

ano passado, o faturamento da empresa foi deUS$ 1,8 bilhão ante os US$ 300 milhões registrados em 1995.

Crescem as vendas externas para empresas do porte da British Airways, Alitália e American Eagle. A empresa acaba de fechar um contrato deUS$ 3 bilhões com a Continental Express e conta com a possibilidade de retomar contratos com o governo federal, que autorizou a Força Aérea Brasileira (FAB) a investir US$ 3,35 bilhões nos próximos oito anos para reaparelhar sua frota.

Uma das prioridades do programa de recuperação da FAB é a compra de 76 aviões AL-X, produzidos pela Embraer, no valor de US$ 420 milhões, que substituirão os velhos Xavantes utilizados no Sistema de Vigilância da Amazônia (Sivam). A Embraer deverá ser responsável pela modernização de 53 jatos AM-X, cuja reforma está orçada em mais US$ 285 milhões, e de outros 47 jatos americanos F-5, que integram afrota da FAB. Tudo indica que, a partir de 2001, a fábrica de Gavião Peixoto estará funcionando a plena carga.

Gavião Peixoto reescreve sua história uando os jatos AL-X e AM-X Q cortarem os céus de Gavião Peixoto, talvez dona Neiva se convença de que as coisas mudaram na cidade de 36 ruas e 4.500 habitantes.

Há 30 anos, desde a porta do pequeno bar que herdou do marido, ela observa o vaivém matinal dos ônibus carregados de bóias-frias que partem para o trabalho nas lavouras de cana-de-açúcar e nos laranjais da região. Ela passa o resto do dia atendendo a uma clientela formada basicamente por aposentados, mulheres e crianças ainda sem idade para o trabalho na lavoura, que compra menos que o estritamente necessário. Dona Neiva passa o ano esperando a primavera, quando começa a temporada de pesca do lambari no Rio Jacaré-Açu. Só então ela ganha um pouco de dinheiro vendendo minhocas. "Os pescadores são a sal-

transporte de laranja, andaram pensando em ir embora da cidade. "Mas, quando ele ouviu falar na fábrica, decidiu ficar para ver se consegue um cargo de motorista."

Especulação imobiliária - Por enquanto, o único efeito que a fábrica produziu na vida da cidade foi a especulação imobiliária. Comenta-se que um terreno que custava R$ 10 mil saltou para R$ 90 mil. O aposentado Vavi Sampaio confidencia que o prefeito estava precisando de uma

Está tudo na mão do governo do estado. Quando estiver sacramentado, começaremos a pensar nisso", afirma o prefeito, precavido.

Para Gavião Peixoto, a fábrica de aviões pode ser a grande oportunidade de superar a crônica dependência da atividade agrícola, agravada nos anos em que preços pagos ao produtor ficam deprimidos. Os indicadores do município mostram estar em curso um perigoso cruzamento de cenário.

A laranja, que ocupa 40% da área cultivada, geralmente em pequenas

Gavião Peixoto espera superar dependência crônica do setor agrícola

vação da lavoura: nunca pedem fiado e gastam bem", justifica. Cética, dona Neiva afirma sem muita convicção: "Se a fábrica vier mesmo, acho que vou poder descansar': A fábrica de aviões da Embraer talvez não mude muito a vida de dona Neiva, nem a do paranaense Milton Apoloni ou a da alagoana Quitéria Costa, que integram o contingente de 1.600 trabalhadores rurais responsáveis pelo cultivo de 18 mil hectares ocupados pelas lavouras de cana e laranja, quase 75% da área total do município. Afinal, trata-se de uma mão-de-obra sem qualificação e portanto dispensável num empreendimento de alta tecnologia.

Mas há quem aposte na possibilidade de obter uma vaga entre as 3 mil anunciadas pela empresa. Sandra Fernandes conta que ela e o marido, sócio numa carreta utilizada no

casa boa para hospedar o pessoal da Embraer e ficou assustado. "O dono pediu R$ 15 mil de aluguel."

O prefeito Alexandre Marucci Bastos faz as contas antes de fazer planos para superar as carências de um município cujo orçamento não passa de R$ 3 milhões. A renda mensal per capita oscila entre R$ 300 e R$ 400 nos seis meses da safra de cana e laranja. A cidade tem uma escola estadual, um posto de saúde com seis médicos, não tem ônibus direto para São Paulo, tampouco cinema, hotel ou pousada. Para o viajante, o abrigo mais próximo fica na cidade de Nova Europa, a 12 quilômetros de Gavião Peixoto. "Primeiro vamos esperar.

propriedades, responde por 73,5% da receita municipal, enquanto a cana, que abrange 45% da área, responde por uma fatia bem menor, algo em torno de 18% da receita líquida. Em termos produtivos, o cenário é preocupante, já que o cultivo da cana depende de novos investimentos no solo e até na tecnificação da lavoura. Mas isso requer um capital que não existe e aponta para o risco do desemprego rural. ''A cidade tem absorvido praticamente sozinha a mão-de-obra rural", diz o prefeito Alexandre Bastos.

Vocações regionais - A perspectiva

de instalação da nova fábrica da Embraer na região também mobiliza as PESQUISA FAPESP · JULHO DE 1000 • 19

Inovação em Ciência e Tecnologia Aeroespaciais (PICTA), da FAPESP. Crescimento estratégico - Em Arara-

quara, os projetos da Embraer serviram aos planos de crescimento estratégico, implementado no município desde a década de 90. Uma série de levantamentos realizados ao longo dos últimos 20 anos pela Divisão de Socioeconomia da Secretaria de Planejamento e Meio Ambiente aponta para um crescimento vigoroso do parque industrial, hoje com mais de 600 empresas, e um orçamento municipal de R$ 97 milhões. ' :ii ~ Mas na Divisão de Socioeco§ nomia da Prefeitura prevalece :> ~ a cautela diante da promessa de número de empregos, instalação de empresas fornecedoras da Embraer e da possibilidade de uso da sua rede hoteleira e de serviços. "Talvez não redunde em grande quantidade de empregos", diz Maria Rita, chefe da divisão.

esperam a fábrica de aviões com ceticismo e desesperança

cidades de São Carlos, Araraquara e Matão. Nesses municípios a substituição da base agrária pela atividade comercial e industrial já lavrou tentos irreversíveis, e eles agora se preparam para desempenhar papéis diferenciados nesse rearranjo regional. Acenam com vantagens estratégicas para atrair as empresas fornecedoras que a fábrica de aviões certamente atrairá.

"Houve uma adequação de vocações': avalia José Galizia Tundisi, secretário de Ciência e Tecnologia e Desenvolvimento Econômico de São Carlos, município que tem um orçamento de R$ 110 milhões e uma imagem fortemente ligada às duas universidades locais: a Universidade de São Paulo (USP) e a Universidade Federal de São Carlos (UFSCar).

Na opinião de Tundisi, as universidades darão respaldo técnico às atividades da Embraer na região, seja por meio de cursos de nível superior, seja pela possibilidade real de treinamento e reciclagem de mão-de-obra.

"Mesmo que a cidade não seja a sede da Embraer, creio que teremos um papel importante a desempenhar", avalia Tundisi.

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Estão em São Carlos, por exemplo, o Centro de Caracterização e Desenvolvimento de Materiais, administrado pela UFSCar e Universidade Estadual Paulista (Unesp ), e o Núcleo de Manufatura Avançada (Numa), um pólo que une pesquisa básica e aplicada, mantido pelas universidades Estadual de Campinas (Unicamp), Metodista de Piracicaba (Unimep) e USP. "Haverá ainda um respeitável pacote orçamentário para investimento em pesquisa, fator diferenciador dessa iniciativa", diz, referindo-se ao programa Parceria para

Parque tecnológico- Na cidade de Matão as contas estão sendo feitas com base na expansão da vocação industrial da cidade. "Temos o maior parque tecnológico da região", diz o prefeito Adauto Scardorelli.

Nos seus planos, além de procurar investimentos que possibilitem às indústrias locais a capacitação para atender à nova fábrica, outras medidas estão em estudo. Uma área de 6 alqueires está sendo liberada para a instalação dos novos fornecedores.

As culturas de café, cana e laranja e as indústrias processadoras de suco de laranja contribuem anualmente com cerca de R$ 25 milhões, mais da metade da receita total do município, de R$ 43,4 milhões. Outros setores reforçam o orçamento municipal, como a pecuária de corte, com um plantel de mais de 15 mil cabeças. "A Embraer representará um marco no desenvolvimento tecnológico da região': prevê o prefeito.

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POLÍTICA CIENTÍFICA ETECNOLÓGICA

ENTREVISTA

Um novo perfil para a Fapergs Renato Oliveira fala sobre os planos de reestruturação da fundação Fundação de Amparo à Pesquisa do Rio Grande do Sul (Fapergs), criada em 1964, está se reestruturando para poder melhor atender às demandas e necessidades de desenvolvimento das pesquisas científicas implementadas nas universidades e institutos de pesquisa do Estado. Depois de atravessar um período marcado por grave crise orçamentária e perda de pessoal, a Fapergs está redefinindo sua estrutura organizacional e buscando eficiência para responder às demandas da comunidade científica e da sociedade, assumindo ativo papel no processo de desenvolvimento econômico e social. Renato Oliveira, recém-empossado no cargo de diretor-presidente da fundação, e o diretor-científico da entidade, Dalcídio Moraes Cláudio, visitaram a FAPESP, cujo modelo organizacional deverá pautar a reforma. A meta da nova gestão é apoiar e fortalecer os grupos de pesquisa já consolidados, fomentar a atuação de grupos emergentes e induzir a demanda em algumas áreas e instituições consideradas estratégicas para o desenvolvimento do estado.

Em sua passagem por São Paulo, Renato Oliveira - sociólogo e professor da Universidade Federal do Rio Grande do Sul e ex-presidente da Associação Nacional dos Docentes de Ensino Superior (Andes) - concedeu entrevista a Maria da Graça Mascarenhas.

A

• Qual é a atuação da Fapergs, hoje, no fomento a projetas e programas de pesquisa no Rio Grande do Sul?

-A Fapergs é uma das mais antigas Fundações de Amparo à Pesquisa (FAPs) no País. Foi criada em 1964, por iniciativa de pesquisadores do Rio Grande do Sul, e muito marcada, na sua origem, pelo modelo da FAPESP. Em 1989, conseguimos a inclusão da obrigatoriedade de repasse de 1,5% da arrecadação líquida do Estado para o orçamento da fundação, que tem uma presença muito importante no desenvolvimento da ciência e tecnologia. Nos últimos anos, porém, a Fapergs não conseguiu acompanhar o crescimento da pesquisa no estado, sobretudo por falta de apoio político do governo. O repasse nunca foi garantido. Isso implica um déficit orçamentário muito grande e uma limitação operacional da fundação.

• Esta situação pode mudar a curto prazo?

-A nossa convicção é que está mudando. É comum no país que o apoio à ciência e à tecnologia seja uma espécie de concessão retórica dos governos ao discurso da modernidade, sem ser acompanhado de nenhuma medida prática. O Rio Grande do Sul não foi exceção. Mas essa situação está mudando. Ciência e tecnologia constituem hoje preocupação central nas políticas de governo, que assume essa área como fazendo parte de suas políticas estratégicas. Há uma crescente consciência de que, sem investimento forte em ciência e tecnologia, em inovação tecnológica, certos objetivos de política econômica e de desenvolvimento social são

O estado tem tradição de pesquisa em engenharia e é pioneiro no setor de informática

irrealizáveis, e isso deve refletir-se numa mudança de atitude em relação à Fapergs.

• A Fapergs, então, está se preparando para intensificar sua atuação?

-Assumimos a direção da fundação há dois meses e meio, praticamente, junto com o atual conselho técnico e administrativo. Estamos finalizando o encaminhamento de algumas medidas que já haviam sido tomadas pela gestão anterior para, então, podermos nos ocupar do redesenho estratégico da Fapergs, com o apoio do governo estadual. A nossa idéia é redimensionar a fundação, aumentando o quadro de pessoal, mas, sobretudo, redefinindo a estrutura organizacional, de forma a adequá-la às demandas do estado. No Rio Grande do Sul, é necessário que uma fundação de fomento à pesquisa não só apóie e fortaleça os grupos já consolidados, mas, também, fomente o desenvolvimento de grupos emergentes, atuando como fator de indução

de demanda em algumas áreas e junto a algumas instituições que não têm experiência na área de pesquisa.

• Como o senhor avalia o atual estágio de desenvolvimento da pesquisa no Rio Grande do Sul? -O estado conta com uma infra-estrutura de pesquisa desenvolvida e uma comunidade de pesquisadores de alta qualificação. Ao mesmo tempo, apresenta uma saudável heterogeneidade institucional, com distintas vocações. O Rio Grande do Sul tem peculiaridades pelo fato de contar com quatro universidades federais e algumas universidades privadas importantes, como a Pontifícia Universidade Católica (PUC) e a Universidade Vale dos Sinos (Unisinos), que começam a investir na área da pesquisa. Isso sem falar nas universidades comunitárias, uma experiência típica do nosso estado, que são privadas, leigas e administradas por organizações comunitárias regionais.

• Qual a característica delas?

- Elas têm forte inserção regional e são voltadas para a problemática de sua região. Na área de pesquisa, todas são emergentes, mas muitas já desenvolvem atividades importantes, especialmente na área de agronomia ou de biomédicas. Temos, então, grandes universidades, que poderemos chamar nacionais, convivendo com sólidas e fortes universidades de vocação regional. Ao lado disso, há um conjunto de instituições de pesquisas ligadas à administração estadual. Elas sofreram desgaste grande, nos últimos anos, mas estão em processo de recuperação. A Fapergs, aliás, está com um programa específico de recuperação dessas instituições.

• No estado, há áreas de pesquisa de mais destaque?

- Uma área tradicional de pesquisa no Rio Grande do Sul é o setor agropecuário. Mais recentemente, ga22 • JULHO OE lODO • PESQUISA FAPESP

nharam destaque outras áreas de pesquisa, como a de biomédicas. Na área de cardiologia, atualmente está sendo formado um centro de terapia gênica. O estado também tem tradição de pesquisa na área das engenharias e é pioneiro na pesquisa do setor de informática. Já contamos com um capital de recursos humanos de alta formação e com uma infra-estrutura de pesquisa extremamente importante. Aliás, o desenvolvimento desse setor viabilizou a formação de convênio envolvendo as três principais universidades da região metropolitana de Porto Alegre, os governos do estado e da capital, além de um conjunto de empresas da área de informática e microeletrônica, com apoio da Motorola, para a formação de um centro de excelência em microeletrônica, um projeto que alia pesquisa e desenvolvimento. Temos, ainda, uma área de ciências humanas bastante desenvolvida.

• Quais os programas de apoio à pesquisa implementados pela Fapergs?

ção política e social que caracteriza o modelo político do Rio Grande do Sul e que envolve os vários grupos organizados da sociedade civil. Há um apelo a que esses grupos participem da formulação das políticas públicas.

Isso deve recolocar a pesquisa no contexto da cultura política do estado.

• A fundação mantém programa de bolsas?

- A Fapergs tem programa de bolsas. Concedemos 1.200 bolsas de iniciação científica este ano, quase 50% a mais que no ano passado. Temos também programa de bolsa-estágio para estudantes do nível técnico e um programa de bolsas que visa a atrair pesquisadores seniores de outras regiões do país ou de outros países. E há o programa muito restrito

''A nossa idéia é redimensionar a fundação e redefinir a estrutura organizacional para adequá-la as demandas do estado,,

-Há dois ou três anos, consolidou-se uma prática de lançamento periódico de editais temáticos que acompanham um edital de nível de demanda. São lançadas duas séries de editais por ano, no início e no meio do ano. Essa prática acabou canalizando toda a demanda por financiamento de projeto de pesquisa para os editais. A vantagem óbvia é a canalização de investimento para setores que respondem mais diretamente aos interesses do estado. A desvantagem é que se corre o risco de cercear a liberdade acadêmica, de alguma maneira. Estamos preocupados com isso e vamos buscar um meio-termo, tentando fortalecer temas de livre demanda, possivelmente com fluxos contínuos, e também os editais temáticos. Com relação a esses, o nosso projeto é vincular os temas que serão escolhidos ao processo de delibera-

de bolsa de apoio emergencial ao mestrado e doutorado, implementado pelo estado. Os projetos que já foram credenciados pela Coordenadoria de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes), e que já contam com cota de bolsa, podem receber uma cota emergencial da Fapergs.

O nosso propósito é criar um programa de bolsas para estudantes de mestrado e doutorado. Há, ainda, um programa de apoio a recém-doutores vinculados a instituições públicas ou privadas, que pretendemos ampliar por meio de convênios com organizações do chamado setor produtivo.

O objetivo é a inserção de recémdoutores em empresas onde eles possam tocar projetos de pesquisa.

Também estamos começando a definir um projeto mais ambicioso, que é

o estabelecimento de convênios com organizações ligadas a atividades econômicas específicas, para o estímulo à pesquisa e ao desenvolvimento. Uma possibilidade concreta é um convênio com uma cooperativa de pequenos agricultores do extremo noroeste do estado, com mais de 6 mil associados, 50% dos quais têm propriedade com menos de 30 hectares. Está sendo articulado e detalhado

se um novo perfil para as atividades da Fapergs, com a orientação de recursos para o desenvolvimento tecnológico de setores específicos.

• E como se daria o apoio da Fapergs?

-Nesse convênio com a cooperativa de pequenos agricultores, a Fundação entra com um determinado volume de recursos, ao longo de três anos, com contrapartida dos parceiros. O convênio deixa aberta a possibilidade de apoio de outras instituições, ao longo da sua implementação. Os projetos que forem apresentados no contexto desse programa devem ser aprovados por um comitê técnico montado para esse fim, com representantes da fundação, da instituição conveniada e de pesquisadores da área de abrangência do convênio.

• Na sua opinião, qual a importância das FAPs no sistema de ciência e tecnologia?

o modelo do convênio que visa ao desenvolvimento de tecnologias na área de agricultura orgânica, no contexto da agricultura familiar, com o objetivo de desenvolver metodologias de rastreamento da produção e certificação do produto final. Isso vai agregar valor ao produto agrícola e pode viabilizar econômica e socialmente as atividades de milhares de famílias.

Esse modelo de convênio poderá ser reproduzido em outras áreas, inclusive em setores de atividades econômicas mais tradicionais, que poderiam obter ganhos de escala, de qualidade e agregação de valor, se passassem por processo de incorporação de tecnologia. Pode também ser alternativa para os setores de desenvolvimento tecnológico como, por exemplo, o de informática. Com esse modelo, abre-

- A FAPESP provou que a existência de um sistema de ciência e tecnologia que tenha autonomia de funcionamento, de gestão, e financiamento constante assegurado é vital para o desenvolvimento econômico e social de uma região e para o sucesso de políticas de governo. A Fapergs já deu passos importantes nessa direção.

Acreditamos que a articulação e o fortalecimento do Fórum Nacional de Fundações de Amparo à Pesquisa estaduais poderia assegurar a institucionalização de políticas estáveis de ciência e tecnologia em todo o país, atendendo às peculiaridades das diversas regiões. É compreensível que em algumas regiões do país as fundações sofram ingerências constrangedoras por parte dos governos estaduais.

Muitos estados do Norte e Nordeste, o Paraná e Santa Catarina nem sequer têm fundações organizadas. Se

conseguíssemos articular iniciativas de algumas instituições importantes, como a FAPESP, a Fapergs, a Fundação de Amparo à Pesquisa de Minas Gerais (Fapemig), a Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Rio de Janeiro (Faperj) e a Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia de Pernambuco (Facepe), daríamos uma dimensão nova à discussão sobre ciência e tecnologia no país. E isso seria importante no momento atual, já que a instituição dos fundos setoriais está gerando expectativa forte e pode fazer com que a dinâmica regional seja simplesmente suprimida em algumas regiões, já que o modelo de gestão é muito centralizador. Além disso, os fundos adotam um modelo que prioriza os setores econômicos geradores de recursos. Isso pode se constituir um vício de origem que compromete toda a eficácia do programa.

• Convênios e parcerias entre as FAPs para o desenvolvimento de projetas conjuntos de pesquisa não fortaleceriam o sistema?

- Sim, dividiria a experiência das regiões que estão na frente com as outras áreas do país. Exemplo disso é a experiência da participação de outras FAPs em alguns projetos Genoma da FAPESP. Nós pretendemos desenvolver trabalho de parceria em algumas áreas. Estamos considerando a possibilidade de desenvolver um programa especial nas áreas de informática e de biotecnologia, que são áreas onde temos capacidade instalada, talento, massa crítica e que se constituem numa das fronteiras do desenvolvimento tecnológico e econômico. A partir da definição de um programa, pensamos em iniciar algumas atividades conjuntas com FAPs de regiões que já possuam grupos de trabalho naquelas áreas e que possam aportar recursos para um trabalho comum. A criação de um sistema nacional que garanta estabilidade não pode ser só política, tem de ter um trabalho conjunto de compartilhamento de experiência.

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POLÍTICA CIENTÍFICA ETECNOLÓGICA

Encontro reuniu I 5 mil pessoas e movimentou o câmpus da Universidade de Brasília entre os dias I O e 14 de julho

O lugar da ciência e da tecnologia Pesquisadores debatem o Brasil na sociedade do conhecimento última reunião anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência (SBPC) do século 20, em torno do tema O Brasil na Sociedade do Conhecimento, movimentou o câmpus da Universidade de Brasília durante a semana de 10 a 14 de julho.

"Os países que não entrarem na sociedade do conhecimento vão ficar marginalizados", disse a presidente da SBPC, Glaci Zancan, bioquímica da Universidade Federal do Paraná.

No encontro foram avaliados os rumos da política de ciência e tecnologia no Brasil, os avanços da pesquisa e a sua relação com empresas, entre

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outras questões como mercado de trabalho, meio ambiente e políticas sociais. As grandes estrelas dos debates, no entanto, foram o projeto de seqüenciamento genético da Xylella fastidiosa, realizado por cientistas brasileiros, a implantação dos fundos setoriais para o financiamento de pesquisas e a polêmica em torno da liberação dos alimentos transgênicos no país.

Andrew Simpson, coordenador do Projeto Genoma Xylella, foi aplaudido por uma platéia de 400 pessoas quando anunciou a publicação do artigo sobre o seqüenciamento da bactéria na capa da revista Nature do mês de julho, fato inédito para a ciência brasileira. "Agora vamos concluir o seqüenciamento de outros genomas, tanto na área da saúde (Genoma Câncer), como na área da agricultura ( Genoma da bactéria Xanthomonas citri e Genoma Cana).

Fundos setoriais - A aprovação pelo Congresso de cinco fundos setoriais para o financiamento de pesquisa nas áreas de energia, recursos hídricos, mineral, espacial e de transportes reuniu platéia de centenas de pesquisadores e suscitou polêmicas. Outros quatro fundos, de interação universidade e empresa, informática, telecomunicações e infra-estrutura, estão sendo analisados pela Câmara dos Deputados. Esses fundos terão uma receita estimada de R$ 1 bilhão por ano e serão formados por impostos pagos por empresas de vários setores da produção e destinados a pesquisas nas suas respectivas áreas de atuação.

Parte da comunidade científica teme que a implementação desses fundos resulte em redução de recursos orçamentários da União para pesquisa. "É importante garantir que eles sejam recursos adicionais", afir-

ma a presidente da SBPC. "A maior vantagem dos fundos é que eles criam uma regularidade no repasse de verbas para a ciência", diz Humberto Brandi, professor do Instituto de Física da Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) e presidente da Sociedade Brasileira de Física.

O secretário-executivo do Ministério da Ciência e Tecnologia, Carlos Américo Pacheco, garantiu que "os fundos setoriais não irão substituir outras formas de financiamento da pesquisa" e, para reforçar seu argumento, distribuiu entre os presentes exemplares

ca", diz. Ou seja, poderá haver excesso de oferta de recursos em áreas nas quais a demanda é ainda pequena e, inversamente, escassez de recursos para áreas que exigem mais investimentos. ''A parte da pesquisa fundamental deveria ser mais impulsionada': alertou o físico Roberto Salmeron, um dos fundadores da Universidade de Brasília, que há quase 30 anos trabalha na École Polytechnique, em Paris.

Salmeron lembrou que os novos recursos provenientes dos fundos equivalem ao que a França destina ao Centro Nacional de Pesquisa Cientí-

técnica da transgenia': mas defende a realização de testes locais para avaliar o impacto da produção de alimentos modificados sobre o meio ambiente.

"Por causa das diferenças existentes entre os ecossistemas, os testes feitos em outros países não são válidos para a realidade biológica brasileira:' Ciência, política, economia - Defen-

dendo um dos únicos pontos de consenso entre cientistas, tecnólogos, dirigentes de instituições de pesquisa, professores e estudantes, o de que o Brasil precisa ampliar a capacidade de investir em educação básica para não comprometer os avanços significativos conseguidos no nível da pós-graduação, o ministro da Ciência e Tecnologia, Ronaldo Sardenberg, afirmou que a chamada "década perdida", como tem sido referenciado os anos 90, merece uma reflexão mais profunda. Neste período em que se acentuou a crise do Estado, o Brasil conseguiu melhorar índices a::: A específicos da área de ciênli "' jl IIHl dt J(l{)() cia e tecnologia. Ele lemG;Df Ó; J (( brou que, no período, quadruplicou o número de doutores formados no Brasil e aumentou rapidamenProjeto Genoma, fundos setoriais e alimentos transgênicos foram as estrelas dos debates te o número de artigos científicos indexados. "Isto não ocorreu de uma cartilha sobre a ação dos funfica, o CNRS. "Se este mecanismo dos por acaso': disse Sardenberg. ''Afinal, fundos funcionar será importante, dos e os resultados esperados. ciência e tecnologia é um setor vital, Reinaldo Guimarães, da Universimas tudo deveria ser feito com calma e uma melhor planificação científica, estratégico, central para o Brasil", disdade Estadual do Rio de Janeiro, adse, durante uma mesa-redonda no com prioridades estabelecidas em níverte que o modelo de gestão esboçavel nacional", critica Salmeron. último dia da reunião da SBPC. do para gerenciar os fundos pode Uma prova da melhora do designificar a perda da governabilidade do Ministério da C&T. Estudioso do sempenho brasileiro são os resultados Plantas transgênicas - O cultivo, copreliminares do Diretório de Grupos mercialização e consumo de produtos perfil dos grupos que fazem pesquisa de Pesquisa no Brasil, do CNPq. O e desenvolvimento tecnológico no geneticamente modificados continua pesquisador Reinaldo Guimarães, da a dividir a comunidade científica em Brasil, Guimarães chamou a atenção Universidade Estadual do Rio de Jatorno de questões de saúde, éticas e para o fato de que 70% dos recursos neiro, mostrou que há hoje em ativiambientais. A Academia Brasileira de de cada fundo irão para o desenvolviCiências (ABC) e a SPBC defendem dade regular no Brasill1.613 grupos mento tecnológico e 30% serão para posições distintas, mas a presidente da o desenvolvimento científico. "Quem de pesquisa, baseados em 224 instituições. A versão de 1999 do Diretório SBPC nega qualquer divergência em demandará estes 30% serão os 90% de de Grupos de Pesquisa registrava a relação aos transgênicos.

Ela argumenpesquisadores que representam a caexistência de 8.544 grupos de pesquita que "ninguém pode ser contra a pacidade instalada de pesquisa bási~

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PESQUISA FAPESP · JULHO DE 1000 • 25

sa atuando no Brasil. Mais da metade dos grupos brasileiros de pesquisa - 56% - realiza suas atividades na região Sudeste, dos quais 6.581 estão localizados no Estado de São Paulo. As três universidades públicas estaduais abrigam exatos 2.014 grupos de pesquisa (1.118 na USP, 537 na Unicamp, 359 na Unesp ). Os dados, obtidos em pesquisa direta junto aos grupos de pesquisa, revelam que a região Sul abriga 20% dos grupos, que totalizam 2.317. A região Nordeste registra a presença de 1.719 grupos, ou seja, 15% FAPESP esteve presente na s• Expociência, uma mostra paralela à reunião da SBPC do total de grupos em atidentro das empresas. Nos Estados vidade regular. Na região Centromas ainda não produz muita tecnoUnidos, há 1 milhão, mas 80% estão Oeste estão 669 grupos, representanlogia. O ambiente econômico é hostil pesquisando na iniciativa privada", aos investimentos empresariais relado 6% do total. Na região Norte comparou. "E lugar de produzir inoatuam 327 grupos de pesquisa, 3% cionados com pesquisa e desenvolvido total. "Mas é evidente que a convação é na empresa", concluiu. mento, que demoram para apresentar resultados." E também é precária centração de grupos nas regiões mais a cultura de inovação tecnológica enRecursos e distribuição regional - O fortes economicamente é uma realitre o empresariado. "O Brasil tem 77 dade que se perpetua em nosso país", papel das Fundações Estaduais de Amafirmou Reinaldo Guimarães. paro à Pesquisa (FAPs) esteve dentre mil pesquisadores e só 11% estão capacidade de desenvolver pesquisa tecnológica das universidades brasileiras fica, no entanto, comprometida pela falta de recursos para transformar projetas em produtos. "Isso só acontecerá quando houver uma forte ligação entre universidades e empresas, reforçada pelo interesse dos governos estaduais e municipais em trabalhar em parceria com as instituições", avaliou Eduardo Krieger, presidente da Academia Brasileira de Ciências no debate sobre os desafios da inovação no país. Do lado das empresas, há uma certa inibição para o investimento em novas tecnologias, constata o presidente do Conselho Superior da FAPESP, Carlos Henrique de Brito Cruz, que coordenou a sessão na SBPC onde se discutiram os retornos de investimentos de empresas. "O Brasil desenvolveu uma excelente capacidade de fazer ciência, Investimento em tecnologia - A

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FAPESP recebe Prêmio José Reis na SBPC A Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo foi a vencedora do 20° Prêmio José Reis de Divulgação Científica, do CNPq, concorrendo com outras 33 instituições. O prêmio reconhece o trabalho de disseminação de informações sobre ciência e tecnologia realizado pela Fundação, ao produzir material informativo para distribuir à imprensa em geral e editar a revista Pesquisa FAPESP. O Museu de Astronomia e Ciências Afins (MAST), do Rio de Janeiro, recebeu menção honrosa.

O prêmio foi entregue em solenidade realizada no dia 10 de julho, presidida pelo ministro da Ciência e Tecnologia, Ronaldo Sar-

denberg, na 52a Reunião Anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência (SBPC). Foi a primeira vez que a entrega do prêmio contou com a presença do ministro de C&T. "Por intermédio do jornalismo científico, o governo e a comunidade acadêmica podem prestar contas à sociedade do uso dos recursos públicos aplicados em ciência e tecnologia, dos progressos alcançados e o que isso implica na vida cotidiana de cada um, de cada família, de cada grupo social", destacou Ronaldo Sardenberg.

Ao receber o diploma e a medalha do Prêmio José Reis, o presidente da FAPESP, Carlos Henrique de

os desafios relacionados ao desenvolvimento de pesquisa e tecnologia.

Dentre as moções votadas e aprovadas pela assembléia da SBPC, uma delas pede que seja criada a FAP de Goiás e recriada a FAP do Maranhão, extinta em 1998. Para Ennio Candotti, ex-presidente da SBPC e professor da Universidade Federal do Espírito Santo, "nos Estados, em geral, prevalece a visão de que ciência e tecnologia é coisa do governo federal': Candotti lembrou que já se passaram 12 anos desde o início do funcionamento dos sistemas estaduais de C&T e, mesmo com o esforço do Ministério da Ciência e Tecnologia

em implementar ações conjuntas, estes organismos "patinam à espera dos partidos políticos e das associações efetivamente empenhadas em sua implementação local': São Paulo continua sendo a solitária exceção na questão das Fundações de Amparo à Pesquisa. "No Estado, para cada real investido pelo governo federal há um aporte de um real estadual", lembrou o diretorcientífico da FAPESP, José Fernando Perez, numa mesa-redonda da SBPC destinada a debater o financiamento da pós-graduação no Brasil. Nos últimos anos, disse Perez, 8 mil bolsistas têm sido atendidos pela FAPESP. Este

Brito Cruz: a divulgação do conhecimento científico necessita do apoio do Estado

Brito Cruz, lembrou que este pesquisador e divulgador científico, que continua em atividade aos 91 anos, escrevendo todas as semanas na Folha de S. Paulo, foi um dos que defenderam a existência de uma Fundação dotada de autonomia e orçamento estável, em artigos publicados nos anos 50 e 60.

"A preocupação da FAPESP em divulgar o conhecimento reconhece que a ciência necessita do apoio do Estado, ou seja, utiliza recursos do contribuinte. Uma agência pública

deve ser, portanto, capaz de constantemente divulgar e demonstrar à sociedade e aos Poderes Executivo e Legislativo as realizações propiciadas por este apoio."

O Prêmio José Reis de Divulgação Científica é o mais importante do Brasil na área de divulgação e jornalismo científico. Mantido pelo CNPq desde 1978, o prêmio é concedido anualmente, de maneira intercalada, a uma das seguintes categorias: instituição, jornalistas e divulgadores científicos.

quantitativo está no limite das diretrizes estabelecidas pela Fundação, "que não pode se transformar numa agência de bolsas, o que comprometeria o apoio à pesquisa". Este número recorde de bolsas no Estado de São Paulo é conseqüência, em parte, da impossibilidade de agências federais, como o CNPq e a Capes, atenderem a esta demanda específica.

Nove moções foram aprovadas na assembléia-geral dos sócios da SBPC, realizada dia 12. A SBPC quer a continuidade do Programa Especial de Treinamento (PET), que permite a participação de universitários em 314 grupos de pesquisa. Mantido pelo Ministério da Educação, o PET foi modificado, após a ameaça de extinção, e a decisão governamental desagradou à comunidade científica.

A assembléia da SBPC quer também a anulação do contrato assinado pela Bioamazônia, uma organização social mantida com recursos do governo federal, e a empresa Novartis, para exploração da biodiversidade na Amazônia. "O Congresso Nacional precisa exami~ nar os projetos de lei sobre o acesso à biodiversidade", afirmou Glaci Zancan. Três projetos sobre o tema estão no Congresso, um de autoria da senadora Marina Silva (PT/Acre), outro do deputado Jacques Wagner (PT/Bahia) e o terceiro de iniciativa do Poder Executivo.

Durante os quatro dias de encontro, os anfiteatros da UnB ficaram lotados com cerca de 15 mil pessoas, de acordo com a direção da SBPC. Quatro mil trabalhos científicos foram apresentados e a SBPC-Jovem, voltada especificamente para acolher o trabalho de estudantes de primeiro e segundo graus, atraiu a atenção de 3 mil participantes. A 53 3 Reunião Anual da SBPC, em 2001, será no câmpus da Universidade Federal da Bahia, em Salvador.

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POLÍTICA CIENTÍFICA ETECNOLÓGICA

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Uma briga pela Internet No começo de julho, 120 líderes de publicações e de biomedicina reuniram-se em Nova York para discutir o efeito da Internet sobre as revistas científicas. Não demorou muito para se desentenderem, porque os dois grupos têm visões muito diferentes sobre o futuro: o primeiro prevê que as empresas privadas vão continuar fazendo as publicações mais legíveis e confiáveis, e o outro, que os cientistas logo abandonarão as publicações tradicionais para partilhar seus resultados diretamente com outros pesquisadores, via Internet.

Segundo a Science de 14 de julho último, as sementes desse debate foram lançadas há 16 meses, quando Harold Varmus, então diretor dos Institutos Nacionais de Saúde (NIH), e o geneticista Patrick Brown, da Universidade de Stanford, lançaram um plano radical para um arquivo biomédico e uma publicação correspondente, antecipando-se aos que 28 • JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPESP

seriam bancados pelos NIH. A partir daí, o alcance da venture de publicação eletrônica dos NIH - agora chamada PubMed Centralvem sendo reduzido e o arquivo público tem demorado para deslanchar.

David Lipman, diretor do Centro para Informação de Biotecnologia dos NIH, que está dirigindo o PubMed Central, relatou no encontro que seu pessoal está fazendo francos progressos na colocação de artigos on-line a partir das 20 publicações que aceitaram, até agora, fornecer papers para o arquivo. Mas sua equipe "se chocou com problemas técnicos", disse ele, em especial com um dos mais ilustres contribuintes, o Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).

Segundo a Science, essas dificuldades não desencorajaram Vitek Tracz, diretor da editora londrina Current Science Group. Em maio, Tracz- cuja empresa patrocinou o encontro de Nova York- iniciou sua própria publicação na Internet, a Central BioMed, que dará acesso gratuito

a autores e leitores.

Apesar de Tracz 3 dizer que não tem nenhum plano comercial para o Central BioMed, ele pretende usá-lo para ganhar credibilidade junto aos cientistas e, dessa forma, desenvolver outras publicações e serviços noticiosos lucrativos.

Reação pesada no encontro de Nova York teve Pieter Bolman, presidente da Academic Press de San Diego, Califórnia, que classificou os esquemas de publicação gratuita de utópicos, a ponto de lembrar trabalho de "acadêmicos sem ter o que fazer" ou "armação comunista': Colocar todos os dados da pesquisa biomédica num único arquivo aberto é "procurar problemas", disse, porque é pedir que os editores existentes abram mão de seus arquivos e "cometam suicídio econômico': As publicações não o farão, previu Bolman, a menos que sejam forçadas pelo governo.

Bolman elogiou uma alternativa, uma venture chamada CrossRef, iniciada por uma editora e lançada em junho. Ainda este ano, ela vai abrigar um índice eletrônico com links para 3 milhões de arquivos em 4 mil publicações.

Diferentemente dos usuários do PubMed Central, os do CrossRef, na maioria dos casos, terão de pagar uma tarifa para

obter um texto completo.

Enfurecido, Brown disparou contra os "parasitas" que recebem o trabalho de cientistas de graça, levam uma eternidade para publicá-lo e cobram dos leitores um alto preço por um produto que freqüentemente pioram ao editar. Terminou exortando os cientistas a darem seu apoio a iniciativas gratuitas como o PubMed Central.

Apesar de os participantes do encontro terem divergido fortemente sobre o modo como a Internet vai afetar a atividade editorial, todos pareceram concordar com o comentário de Varmus de que a experiência da publicação eletrônica mal começou e de que "estamos navegando para um porto distante" com ventos que às vezes favorecem e outras dificultam o avanço.

Transgênicos para o terceiro mundo Um painel independente de lideranças científicas tanto de países industrializados quanto em desenvolvimento, aprovou, na primeira quinzena de julho, o uso de plantas geneticamente modificadas para atender às necessidades de alimentação dos pobres do mundo, informou a Nature, de 13 de julho último. Entretanto, o painel, formado por sete academias nacionais de ciência, também pediu que a indústria privada compartilhe a tecnologia dos transgênicos com "cientistas responsáveis" para aliviar o problema

da fome nos países em desenvolvimento.

O painel foi instalado no ano passado pela Sociedade Real Britânica, academias nacionais de ciência dos Estados Unidos, Brasil, China, Índia e México, e mais a Academia de Ciências do Terceiro Mundo, com o objetivo de oferecer "perspectivas científicas" sobre o papel da tecnologia de transgênicos na agricultura mundial.

Segundo a nota da Nature, José Fernando Perez, um dos membros do painel e diretor científico da FAPESP, disse que os cientistas sentiram que "essa era uma boa oportunidade para oferecer uma reflexão técnica ao debate dos trângenicos". No Brasil, acrescentou, o tema tem sido discutido quase que exclusivamente em termos políticos. "Jamais tivemos um debate técnico:' O relatório defende que, entre outras metas,

a tecnologia transgênica deveria ser usada para reduzir o impacto ambiental da agricultura.

Propõe, também, que os países implantem sistemas para monitorar os potenciais efeitos das plantas transgênicas sobre a saúde humana.

Na questão das patentes, o relatório diz que se certas tecnologias de alteração de plantas não forem extensivamente licenciadas ou fornecidas sem custo ao mundo em desenvolvimento, "dificilmente elas beneficiarão as nações menos desenvolvidas do mundo, por longo tempo."

Críticos, diz a Nature, reclamam que o relatório dá legitimidade a soluções de alta tecnologia, como os transgênicos, sem dar a devida importância a soluções locais mais apropriadas. "Mesmo que a ciência tenha peso, não se pode considerá-lo isoladamente sem questionar o poder da mentira por trás da abordagem de mercado em relação à fome global", diz Mark Curtis, da agência internacional de desenvolvimento ActionAid. Mas os integrantes do painel

dizem que o relatório tem a preocupação de estabelecer a dimensão técnica de culturas transgênicas num contexto mais amplo. Isso requer, por exemplo, "isenções especiais" para agricultores pobres, a fim de protegê-los de "restrições inadequadas à propagação de suas culturas."

Frutos do Projeto Resgate O Departamento de História da Universidade de São Paulo (USP) e o Instituto de Documentação Histórica da Universidade do Porto, com o apoio da FAPESP e do Instituto de Cooperação Científica e Tecnológica Internacional de Lisboa, vão realizar de 25 a 27 de setembro, um colóquio de história luso-brasileira, cujo título é Perspectivas da Historiografia Luso-Brasileiras: Agenda do Milênio. O encontro pretende fazer um balanço da historiografia dos dois países e reforçar a colaboração futura.

Há mesmo uma forte expectativa de que, a partir dele, surjam grandes projetas liderados por pesquisadores de ambos os países.

Presidente assina lei dos fundos setoriais O presidente Fernando Henrique Cardoso sancionou no dia 25 de julho os projetas que criam quatro dos lO fundos setoriais destinados a financiar pesquisa científica e tecnológica com recursos privados.

A proposta de criação dos fundos para os setores de Energia Elétrica, Espacial, Recursos Hídricos e Minerais e Transportes Terrestres havia sido aprovada pelo Congresso Nacional no começo do mês.

Os fundos, formados por percentuais de faturamento de empresas, deverão somar cerca de R$ l bilhão para o investimento em Ciência e Tecnologia.

Uma única saída Pressionada pela Lei de Genéricos, desenvolver a capacidade de inovação tecnológica parece ser a única saída para a indústria brasileira de medicamentos.

"Ou a indústria nacional acaba de uma vez ou se posiciona de modo mais firme no mercado, desenvolvendo sua capacidade de inovação", disse Gonzalo Vecina Neto, presidente da Agência Nacional de Vigilância Sanitária do Ministério da Saúde, durante a 52a reunião da SBPC. Ele aposta que as empresas que se apoiam nas universidades conseguirão assegurar avanços científicos e tecnológicos nos próximos quatro anos.

PESQUISA FAPESP · JUlHO DE 1000 • 29

CIÊNCIA

FÍSICA

Em busca de uma teoria final MAURI C IO TUFFANI

Pesquisa pretende unificar as forças básicas da natureza m dos maiores desafios da FíU sica moderna é desenvolver uma teoria que descreva de forma unificada todos os fenômenos do Universo. O grande obstáculo é a incompatibilidade entre duas das principais teorias físicas deste século, a relatividade geral e a mecânica quântica.

Esse desafio é o tema da pesquisa de Victor de Oliveira Rivelles, profes-

sor do Instituto de Física da Universidade de São Paulo (Ifusp) e dedicado ao problema desde os anos 80.

Cada uma dessas teorias desempenha perfeitamente seu papel quando é aplicada no contexto em que foi criada. Mas cada uma fracassa ao ser aplicada aos fenômenos descritos pela outra. Por que, então, modificálas em vez de deixá-las como estão?

A idéia de unificação é a mola propulsora dos principais avanços da Física desde seus primórdios. Até o século 17, o movimento dos corpos terrestres e celestes era considerado distintamente. Os corpos terrestres tenderiam a parar depois de se movimentar por algum tempo, devido à sua natureza terrena. Já os corpos celestes, como o sol, a lua e os planetas, se moveriam eternamente- o que seria uma demonstração de seu caráter divino.

A mecânica clássica, formulada pelo físico inglês Isaac Newton (1642-1727), mostrou que os corpos terrestres e celestes obedecem às mesmas leis de movimento, ao dar uma descrição unificada para ambos. Suas idéias causaram uma mudança filosófica e religiosa profunda, pois mostraram, matematicamente, que o movimento dos corpos nos céus era puramente material.

Isaac Newton: unificador das leis do movimento

Ao sintetizar teorias que pareciam antagônicas, os cientistas conseguem descrever um número maior de fenômenos com menos hipóteses e também prever fenômenos futuros.

Newton, por exemplo, baseado em sua teoria, previu a data exata do retorno do cometa Halley.

O físico alemão Albert Einstein (1879-1955), segundo seu biógrafo Abraham Pais (em Einstein Viveu Aqui, Nova Fronteira, 1997, Rio de Janeiro), disse que a teoria física tem dois anseios: "Englobar o máximo possível de fenômenos e suas conexões" e "alcançar isso com base no

Duas teorias incompatíveis A mecânica quântica nasceu em 1900, com a teoria de Max Planck (1858-1947), segundo a qual a energia não se propaga num fluxo contínuo, mas por meio de pequenos pacotes de energia, os quanta. Isso permitiu dois avanços: a proposição de Albert Einstein, em 1905, de que a luz também se propagaria por meio de pacotes de energia e o modelo atômico do dinamarquês Niels Bohr (1892-1987).

Ainda em 1905, Einstein formulou a teoria da relatividade restrita, baseada na proposição de que nenhum corpo pode alcançar velocidade superior à da luz no vácuo (300 mil km/s). Depois, mostrou a equação E=md (energia é igual à massa multiplicada pelo quadrado da velocidade da luz). E, em 1915, lançou a teoria da relatividade geral, mostrando que a gravidade de um corpo deforma o espaço e o tempo a seu redor. Essa

menor número possível de conceitos independentes e relações arbitrariamente pressupostas': O objetivo fundamental da unificação de teorias físicas é, portanto, obter modelos mais eficazes para explicar e controlar a natureza. Foi o que Einstein obteve em 1915 ao formular a relatividade geral: uma teoria da gravitação mais abrangente que a de Newton.

No Departamento de Física Matemática do Instituto de Física da USP, 'Rivelles e mais oito físicos (pós-doutores e pós-graduandos) trabalham há três anos e meio no projeto Gravitação Quântica, com financiamento de R$ 3,4 mil da FAPESP. Além da USP, há estudos nessa área nas universidades estaduais Paulista (Unesp) e do Rio de Janeiro (UERJ), nas federais do Rio de Janeiro (UFRJ) e do Rio

tese foi comprovada alguns anos depois num eclipse solar em Sobral, no Ceará: comparando-se posições de estrelas ao redor do sol antes e durante o eclipse, constatou-se que, vistas daqui, elas pareciam estar mais próximas devido à passagem dos raios de luz delas perto do campo gravitacional do sol.

A relatividade geral inspirou outras teorias, como a da expansão do Universo, pelo norte-americano Edwin Hubble (1889-1953), em 1929, e a da formação dos buracos negros pelo indiano-norte-americano Subrahmanyan Chandrasekhar (19101995), em 1931. Em 1997, Wei Cui, do Instituto de Tecnologia de Massachusetts, e colaboradores da Nasa, a agência espacial dos Estados Unidos, anunciaram a descoberta de buracos negros arrastando o espaço-tempo ao seu redor, o que comprovava previsões feitas a partir da relatividade geral 80 anos antes, quando ainda não havia incompatibilidade com a teoria quântica. Em 1924, o francês Louis-Victor de Broglie (1892-1987) propôs a dualidade onda-partícula, o que lhe va-

Grande do Sul (UFRGS) e no Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas (CBPF).

Eles não têm dúvidas: o resultado a ser obtido pode revolucionar a Física. Mas não é fácil chegar lá. Afinal, os dois extremos dessa conciliação são justamente os principais pilares da Física moderna.

Micro versus macro - A mecânica quântica pode parecer para o leigo um amontoado de conceitos que ferem o bom senso: aquilo que ora parece ser uma partícula, comporta -se como uma onda e vice-versa. Além desse aparente contra senso, há uma perda definitiva do que restava da Física clássica. Após séculos de tranqüilidade com as equações deterministas do movimento, os cientistas tiveram de encarar o terrível princípio da incerteza, formulado pelo físico alemão

leu o Prêmio Nobel de Física cinco anos depois: mostrou que o elétron pode apresentar comportamento de onda e também de partícula.

Três anos depois foi a vez de Werner Heisenberg, com o princípio da incerteza.

Contrariando toda a tradição da mecânica clássica, em que a posição e a velocidade de um corpo sempre poderiam ser determinadas precisamente, Heisenberg mostrou que no domínio quântico é impossível determinar ambas com precisão simultaneamente. Einstein jamais aceitou essa formulação.

Einstein: rejeição permanente ao princípio da incerteza

Werner Heisenberg (1901-1976), para o qual é impossível determinar simultaneamente a posição e a velocidade de uma partícula. "Quando tentamos aplicar os conceitos da mecânica quântica à relatividade geral, somos conduzidos a resultados absurdos, que contradizem os próprios fundamentos dessas teorias", diz Rivelles.

Deus joga dados?- Apesar de ter contribuído para o nascimento da mecânica quântica, Einstein jamais aceitou sua interpretação probabilística. Na Física clássica, toda quantidade física tem um valor determinado. No mundo quântico, passou a vigorar a probabilidade. "Deus não joga dados com o Universo': disse Einstein. O físico britânico Stephen Hawking (1942- ), que ocupa o mesmo posto de Newton na Universidade de Cambridge, rebate Einstein: "Deus joga dados, sim!".

Instaurou-se assim o conflito entre mecânica quântica e relatividade

Os vários conceitos para explicar a natureza

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Foi um avanço essencial para a formu lação da mecânica quântica.

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o propõe seu princípio da incerteza, mostrando ser impossível medir com precisão, simultaneamente, a posição e a velocidade de uma partícula.

A mecânica quântica Um grupo de físicos entre eles o austríaco Erwin Schrodinger ( 18871961 ), ao lado, e o alemão Max Born (1882-1970, Nobel de Física de 19 54) - finaliza os métodos matemáticos de

da teoria de cordas Os físicos chegam ao consenso de que a relatividade geral não é compatível com a mecânica quântica.

O físico japonês Yoichiro Nambu , hoje no Enrico Fermi lnstitute, da Universidade de Chicago, propõe a teoria de cordas dentro do contexto das partículas elementares.Ainda não se suspeitava que as cordas descrevessem a gravitação.

32 · JULHO DE 1000 • PESQUISA FAPESP

geral. Muitos físicos seguiram os passos de Einstein e propuseram mudanças na mecamca quântica. O próprio Hawking deu os primeiros passos nessa direção. O holandês Gerard't Hooft ( 1946-) prêmio Nobel de Física de 1999 por seu trabalho sobre a unificação das forças fraca e eletromagnética e o norte-americano Leonard Susskind (1940-) cujo aniversário foi comemorado no final de maio na Universidade de Stanford, nos Estados Unidos, onde leciona, com um seminário sobre gravitação quântica - propõem a manutenção da mecânica quântica e modificações na relatividade geral. As primeiras evidências de que a relatividade geral deveria mesmo ser modificada vieram com a proposta das supercordas, em meados de 80.

A motivação para as supercordas baseia-se na constatação de que o conceito de uma partícula idealizada como um ponto material é inadequado para formular a quantização da relatividade geral. "As teorias tle cordas são radicalmente diferentes das teorias usuais. Os objetos fundamentais não são mais partículas pontuais, mas sim objetos estendidos, unidimensionais, que são as chamadas cordas", diz Rivelles. "Por terem tamanho muito pequeno, elas parecem comportar-se como partículas." A teoria de cordas é objeto de estudo, em São Paulo, dos pesquisadores Nathan Berkovits, do Instituto de Física Teórica da Unesp, e Élcio Abdalla, do Instituto de Física da USP. As teorias de cordas, no entanto, precisam ser formuladas de modo a descrever todos os tipos de partículas elementares conhecidos. Uma das teorias de cordas considera a existência de uma partícula com todas as propriedades do gráviton e que, embora

ainda não comprovada experimentalmente, seria capaz de conduzir a força da gravidade. É um resultado que Rivelles considera surpreendente. Outra partícula prevista pela teoria de cordas tem a propriedade de mover-se com velocidade superior à da luz. A existência dessa partícula, o táquion, é proibida pela relatividade especial de Einstein. É aí que entra o conceito de supersimetria, que resolve o problema ao eliminar essa partícula indesejada.

A supersimetria - tema que Rivelles abordou em sua tese de doutoramento de 1982 no King's College de Londres, Reino Unido - é um artifício teórico que unifica todas as partículas e forças da natureza simplesmente por considerar em pé de igualdade dois tipos de partícula bastante distintos, os bósons e os férmions.

Com a aplicação da supersimetria, as teorias de cordas se transformam em teorias de supercordas, unificando de forma adequada todos os tipos de partículas fundamentais.

Rivelles: persistente na busca da teo ria geral das forç as do Universo

Uma das surpresas da teoria das supercordas, segundo Rivelles, é que ela pressupõe um espaço de dez dimensões, sendo nove de espaço e uma de tempo. A explicação para o fato de nosso espaço-tempo só revelar quatro dimensões é que no início da formação do Universo, logo após o Big Bang, seis dessas dimensões se tornaram extremamente pequenas.

Nessa área, a comprovação prática é considerada praticamente impossível, por lidar com distâncias ínfimas, bilhões de bilhões de vezes menores que as distâncias investigadas nos mais modernos aceleradores de partículas em uso (nos quais se chega à distância de um bilionésimo de um bilionésimo de centímetro). É uma situação análoga à do Big Bang, a explosão que teria originado o Universo e igualmente não é passível de comprovação.

A teoria de supercordas, segundo Rivelles, poderá prever relações desconhecidas entre as partículas ou mesmo a existência de novas partícu-

las e, portanto, de forças ainda não detectadas. À medida que a teoria de supercordas se for consolidando, poderá até resolver questões que intrigam físicos e filósofos, tais como: por que o Universo existe em quatro dimensões (as três dimensões espaciais de comprimento, largura e altura, mais a dimensão temporal) e não em mais ou em menos dimensões? Por que a matéria só aparece na fo rma de quarks e léptons?

Rivelles não desanima ao lembrar que só se conhecem alguns pedaços da teoria de supercordas.

As dúvidas se acumulam, mas essa teoria, que deve descrever todas as forças do Universo, ainda está na infância e sua formulação completa levará muito tempo, lembra o pesquisador. O próprio Einstein levou dez anos para formular a teoria da relatividade geral, que descreve apenas a gravitação. O físico norte-americano Edward Witten comentou há anos - e seus colegas do mundo todo concordam- que a teoria de supercordas é uma teoria do século 21 que, por acidente, foi desco• berta no final do século 20.

PERFIL:

48 anos, graduado em 1974 pelo Instituto de Física da Universidade de São Paulo (USP), com mestrado em 1977 na Universidade Federal da Paraíba (UFPB), doutorado em 1982 no King's College de Londres, é professor do Instituto de Física desde 1987.

Projeto: Gravitação Quântica Investimento: R$ 3.452,00 • V ICTOR DE ÜLIVEIRA R!VELLES,

1973 Supersimetria O alemão Julius Wess, da Universidade de Munique (na foto), e o italiano Bruno Zumino, da Universidade da Califórnia, aplicam o conceito de supersimetria à teoria das partículas elementares.

Embora a supersimetria tenha sido introduzida na teoria de cordas em 1971, era pouco conhecida pelos físicos .

1974 Cordas e gravitação O inglês John Schwarz (na foto) , atualmente no California lnstitute ofTechnology (Caltech) , e o norte-americano Joel Scherk {falecido no início dos anos 80) descobrem que a teoria de cordas inclui a relatividade geral. As teorias de cordas, ainda nos seus primórdios, mostram-se inconsistentes e são deixadas de lado.

Poucos fís icos continuam a estudá-las.

1984 A primeira revolução: supercordas As inconsistências da teoria de supercordas são superadas pelos ingleses Michael Green, da Universidade de Cambridge, e J. Schwarz.

São encontradas cinco teorias de supercordas.

Essa é a chamada primeira revolução das supercordas.

O físico norte-americano Edward Witten, do Caltech, propõe que as teorias de supercordas formam uma pequena parte de uma teoria mais geral , a teoria M, que inclui cordas, membranas e teorias de gravitação supersimétricas.

As membranas são uma das extensões mais simples do conceito de cordas, o equivalente à superfície de uma bolha de sabão.

PESQUISA FAPESP · JULHO DE 1000 • 33

CIÊNCIA

NUTRIÇÃO ANIMAL

Diretamente daumvaca,

leite

dietético Molécula adicionada à ração reduz o teor de gordura, aumenta o de proteínas e acentua efeito anticancerígeno om a infinita calma dos bovinos, um grupo de vacas alimentase de capim e de ração no estábulo da fazenda experimental da Embrapa em Vassouras, RJ. Elas são especiais: seu leite tem 30% a menos de gordura e 10% a mais de proteína, além de propriedades anticancerígenas. Provavelmente dentro de três anos os pecuaristas brasileiros poderão distribuir esse leite, obtido a partir de estudos da Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq) da Universidade de São Paulo (USP), em Piracicaba.

Esse leite, equivalente a um semidesnatado, é o mais recente experimento do engenheiro agrônomo Dante Pazzanese Lanna, da Esalq, que trabalhou em parceria com pesquisadores dos Estados Unidos (EUA) e da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa). Este mês, o engenheiro agrônomo Sérgio Raposo de Medeiros, doutorando orientado

C

Dante Pazzanese Lanna, formulador da nova ração: leite já sai da vaca semidesnatado 34 • JULHO DE 1000 • PESQUISA FAPESP

)

por Lanna, apresenta a novidade na reunião da Sociedade Americana de Ciência Animal, nos EUA. Em agosto, é a vez de Lanna mostrá-la no Congresso da Associação Européia de Produção Animal em Haia, Holanda.

Para obter o leite sonhado pelos nutricionistas, Lanna formulou uma ração com moléculas modificadas de ácido linoléico conjugado (CLA), um ácido graxo que forma os lipídios (gorduras). Adicionado à alimentação animal, o ácido modificado funciona como um composto farmacêutico, alterando a síntese de gordura na glândula mamária.

Lanna começou a estudar há quatro anos as propriedades do CLA, que é produzido naturalmente no estômago dos ruminantes (bovinos, ovinos e caprinos) e encontrado em alimentos de origem animal, sobretudo o leite. Seus efeitos biológicos e anticancerígenos têm sido reiterados em pesquisas internacionais. Em 1996, o Conselho Nacional de Ciências dos Estados Unidos confirmou que o CLA é capaz de inibir a formação de tumores. Além de prevenir o câncer, ataca células tumorais presentes no organismo e reduz tumores já formados. Em experimentos com ratos no Roswell Park Institute de Nova York, Estados Unidos, o CLA, mesmo em concentrações muito baixas, propiciou uma redução significativa no número de tumores mamários. Com doses da ordem de 0,25% da dieta, reduziu à metade o número de tumores em relação a animais que não o receberam.

Variações - A molécula de CLA tem

18 átomos de carbono e existe sob várias formas - os isômeros - em que esses átomos se agrupam diferentemente, o que altera seus efeitos no organismo. Um dos isômeros é o CLA 18:2 eis 9, trans 11 (c9,tll)- as abreviações indicam que o CLA contém uma dupla ligação no carbono 9 na forma eis, isto é, no mesmo plano da molécula, e outra dupla ligação no carbono 11 na forma trans, ou seja, em outro plano, como se a molécula

virasse sobre seu eixo. Pesquisadores norte-americanos confirmaram recentemente em ratos que o CLA c9, tll impede a formação de células tumorais. A formação de placas de gordura (aterosclerose) nas paredes dos vasos sanguíneos é aparentemente reduzida por outro isômero, o CLA 18:2 tlO,cl2. "Procura-se agora saber a quantidade necessária para otimizar a proteção contra o câncer e adicionar essa molécula aos alimentos consumidos pela população em geral", diz o pesquisador da Esalq. Sabese que o isômero CLA 18:2 trans 10, eis 12 é o que inibe a síntese de gordura no leite e tem, portanto, um efeito antiobesidade.

Lanna imaginou um desafio: seria possível elevar o teor de proteína no leite? Para isso, a maior dificuldade foi obter uma combinação do ácido linoléico conjugado, contendo principalmente o isômero t10,cl2, somado a um suplemento de aminoácidos. A hipótese de que seria preciso pôr mais aminoácidos na dieta para a vaca produzir mais caseína (a proteína do leite) provou-se correta e ocorreu um notável aumento no teor protéico. A equipe de Lanna patenteou o efeito do CLA na redução da gordura do leite. Agora, os pesquisadores ·da Esalq, da Embrapa, da Universidade de· Idaho e a FAPESP estão requerendo o registro da descoberta de que o CLA aumenta o teor e a produção de proteína do leite em até 10% e 20%, respectivamente. Não é o único feito que se mostra inédito. "Também demonstramos, pela primeira vez, um aumento na produção de leite a pasto e o aumento da persistência da lactação, fazendo com que a vaca mantenha altas produções de leite ao longo do seu período de lactação, de cerca de dez meses", diz ele.

Já em contato com o setor privado, os pesquisadores querem oferecer a suplementação a baixo custo, o que parece viável porque o ácido linoléico, matéria-prima do CLA, pode ser facilmente obtido de alimentos como

os óleos de oliva e de soja. Pode ser um caminho para ampliar tanto a produção, hoje de 20 bilhões de litros, quanto o consumo de leite no Brasil, estimado em 137litros por habitante/ano, o equivalente a um copo por dia ou um terço do recomendável para evitar problemas como osteoporose (ver Pesquisa FAPESP no 52).

Influência do avô - Com seu trabalho, Lanna prossegue na linha do avô materno, o médico mineiro Dante Pazzanese, que dedicou a vida ao tratamento e à cura de doenças cardíacas. Filho de imigrantes italianos, ele

Uma das produtoras do novo leite light, na fazenda de Vassouras (RJ)

trouxe ao Brasil o primeiro aparelho de eletrocardiograma e em 1954 criou em São Paulo o Instituto de Cardiologia, uma das primeiras instituições do gênero no país, que hoje leva seu nome. Ao se aposentar, em 1974, dedicou-se à fazenda do norte do Paraná onde plantava café e soja e criava gado. A convivência com o neto, que passava lá as férias, foi curta - o médico morreu no ano seguinte, aos 75 anos - , mas intensa, e despertou no garoto o interesse por agronomia.

Outro empurrão para a universidade veio do pai, Amadeu Duarte Lanna, professor de antropologia da Universidade de São Paulo (USP) e autor de um dos primeiros projetos de ciências humanas financiados pela FAPESP, com índios do Parque Nacional do Xingu, no Mato Grosso.

PESQUISA FAPESP · JULHO DE 2000 • 35

Recém-concluída, a pesquisa de Dante Lanna Ácido Linoléico Conjugado: Efeito da Suplementação por Longo Período sobre Vacas Lactantes teve financiamento de R$ 48,8 mil da FAPESP e a colaboração de pesquisadores das universidades de Cornell e Idaho, nos Estados Unidos, e de Helsinque, na Finlândia. Logo no início, um resultado animador veio de Cornell: quatro vacas leiteiras que receberam suplemento alimentar de 50 gramas de CLA por quatro dias tiveram redução de mais de 50% no teor de gordura do leite. "Após três dias de tratamento, os animais passaram a produzir leite com menos de 1,5% de gordura, portanto, mais magro do que o leite semidesnatado (com 2% de gordura) vendido nos supermercados", comenta Lanna, que verificou aqui os mesmos resultados num grupo de 32 animais.

Com base nessa descoberta, Lanna e seu ex-colega de Cornell, Mark McGuirre (hoje em Idaho), iniciaram experimentos com suplementação de CLA por período mais longo (dois meses), em condições de produção comercial. "Não sabíamos nem se os animais poderiam ter problemas metabólicos ao produzir leite tão magro por tanto tempo': diz o pesquisador da Esalq. Nos Estados Unidos, McGuirre trabalhou com vacas holandesas puras e de alto potencial produtivo (mais de 50 kg de leite por dia) em sistemas intensivos confinados. Por aqui, Lanna e Luiz Aroeira, da Embrapa, usaram vacas cruzadas holandesas de menor potencial produtivo (18 kg/dia) e mantidas em pasto. Comiam em média 4 kg/dia de concentrado com CLA e uma suplementação de proteínas que fornecem aminoácidos.

Os estudos levaram a resultados semelhantes nos dois países. Na fase 36 • JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPESP

inicial, quando se procurou verificar se o CLA prejudicaria os animais, comprovou-se que, mesmo por períodos prolongados, ele não causa nenhum problema digestivo, metabólico, reprodutivo ou sanitário. Mais tarde, os dois estudos atestaram que o CLA aumentou a produção de leite e manteve a produtividade após o início da lactação. No experimento brasileiro, o efeito de melhora na persistência da lactação continuou mesmo após a suspensão do fornecimento de CLA na décima segunda semana.

Tanto nos Estados Unidos como

CLA modificado: composto adicionado à ração especial é responsável pelo "milagre"

no Brasil, confirmaram-se os resultádos iniciais de laboratório, com reduções no teor de gordura de cerca de 26%. Por reduzir a gordura do leite, o CLA também reduz as exigências de energia da vaca. Isso faz com que seu organismo direcione mais nutrientes à reposição da gordura perdida no início da lactação, melhorando sua condição corporal e as taxas reprodutivas. As vacas pesquisadas passaram a produzir diariamente 20 litros de leite, mesmo em regime de pasto, que fornece menos energia que a obtida com dietas de milho, por exemplo.

As pesquisas indicaram outro efeito benéfico: a adição controlada de CLA à alimentação animal inibe a síntese de ácidos graxas saturados de cadeia curta, entre Ganho extra -

Alternativas para engordar o gado Outro trabalho coordenado por Dante Pazzanese Lanna no Laboratório de Nutrição e Crescimento Animal da Esalq e pronto há quase um ano é o programa de nutrição de bovinos Ração de Lucro Máximo. Feito por quatro pesquisadores da Esalq - Lanna, Luis Gustavo Barioni, Luis Orlindo Tedeschi e Celso Boin -,teve a colaboração de especialistas de Cornell e financiamento de R$ 6 mil da FAPESP. O coordenador calcula que o programa já seja usado por cerca de 200 fábricas de ração, consulto-

eles o mirístico e o láurico - os mais perigosos à saúde, por aumentarem os níveis de colesterol. E, ao mesmo tempo, aumenta a proporção de ácidos de cadeia longa, como o palmítico, que tem menos efeito no teor de colesterol e provavelmente reduz a probabilidade de doença cardiovascular.

Houve diferenças nos experimentos. Nas vacas tratadas nos Estados Unidos, o teor de proteína do leite aumentou 4%, enquanto nas brasileiras o aumento foi de 11%. Motivo: os animais daqui receberam quantidades maiores de proteína e de minerais que o considerado necessário para as vacas cruzadas holandesas em lactação. A dieta que o pesquisador formulou incluiu farinha de peixe e farelo de soja com tratamento térmico, o que evita a degradação excessiva das proteínas durante a digestão pelas bactérias do rúmen (primeiro compartimento do estômago bovino) . Assim, sobra proteína, que a glândula mamária pode usar para secretar no leite. Além de o leite das vacas alimentadas com essa dieta, na proporção de 5 gramas de CLA por quilo de alimento, ter o aumento de 11% no teor de proteína, o aumento da produção de leite fez a produção

res e pecuaristas sul-americanos e envolva ao menos 250 mil do 1,3 milhão de cabeças de gado confinado do país. Até há pouco tempo, não havia um modelo semelhante para a realidade brasileira.

O trabalho integra o conhecimento de nutrição de gado num programa de computador, que inclui uma biblioteca de alimentos disponíveis no Brasil. Simula meta-

holismo de nutrientes, quantidade de alimento, conteúdos de proteína e gordura da ração e ganho de peso.

Adaptado à criação tropical brasileira e ao gado de raças zebuínas (85% do rebanho nacional de 160 milhões de cabeças, o maior do mundo), o programa permite um gerenciamento compatível com cada propriedade. Para análises econômicas, conta com um sistema de

RLM 2.0

total de proteína crescer 19% (ver gráficos).

Segundo Lanna, a molécula de ácido linoléico conjugado que inibe a síntese de gorduras pelas vacas é a CLA tlO,cl2, que atua como um modificador metabólico ou repartidor de nutrientes: ela redireciona os nutrientes, reduzindo a proporção dos usados na síntese de gordura e aumentando a dos direcionados à síntese de proteína. Os dois processos ocorrem simultaneamente nas células. Como se verificou, o CLA inibe a síntese de gordura no leite e permite que mais nutrientes sejam redirecionados para a síntese de proteínas na mama.

Havia um risco, entretanto: as bactérias no rúmen podem transformar o CLA em ácido linoléico, que não tem efeitos metabólicos. Para

evitar isso, os animais receberam ~a ração um CLA protegido por sais de cálcio. Deu certo: o composto das moléculas do CLA t10,cl2 e tl1,c9 e o suplemento com proteínas metabalizáveis não degradaram no rúmen, foram absorvidos pela vaca e alteraram o metabolismo da glândula mamária, como se esperava.

Em resumo - A execução do projeto conduzido pelo engenheiro agrônomo e bioquímico Dante Pazzanese Lanna pode ser resumida em quatro fases: 1. O ácido linoléico conjugado (CLA) é protegido da degradação ruminai (no primeiro compartimento do estômago da vaca) por meio da adição de sais de cálcio.

2. O CLA com cálcio é adicionado à

otimização não-linear proposto por Lanna e Barioni, publicado recentemente no International Congress of Modelling and Simulation, da Nova Zelândia. Quando se dispõe de milho, sorgo e polpa de citrus, por exemplo, basta fornecer os preços de cada produto para que o programa aponte a alternativa mais vantajosa.

Depois, ele faz todas as formulações possíveis desses alimentos e identifi"' ca a mais econômica, estimando êo o consumo e o ganho de peso. fi1 Custa R$ 180 e é distribuído pela ~ Fundação de Estudos Agrários Luiz de Queiroz (Fealq).

Novo software: balanceamento ideal da ração para cada caso, em condições tropicais

ração destinada às vacas, juntamente com um suplemento de aminoácidos.

3. O isômero CLA t10,c12 absorvido pelo organismo da vaca chega às células de suas glândulas mamárias, onde reduz a influênciê dos genes das enzimas FAZ e ACC, que são responsáveis pela síntese da gordura do leite.

4. A vaca passa a produzir leite em maior quantidade, com menos gordura, mais proteína e contendo ainda o isômero CLA c9,tl1, que exerce uma forte ação anticancerígena e anti-aterosclerose (formação de placas de gordura que podem obstruir as artérias).

O impacto da descoberta deve ser grande. Afinal, esse leite semidesnatado e com importantes efeitos terapêuticos é um produto inteiramente natural, cuja obtenção não requer a passagem por nenhum processo industrial. E, como o leite é a matéria-prima de muitos alimentos, toda a cadeia de produção dos laticínios deve ser atingida.

Entre produtores e beneficiadores de leite, a pesquisa merece ser comemorada, por reavivar o interesse por um produto cujo consumo se tem liPESQUISA FAPESP · JULHO DE 1000 • 37

g

Mais proteína no leite ...

... e maior volume de produção

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Efeito do CLA na composição do leite de vaca em pasto no Brasil

kg/cab. dia

% 3,00

• CONTROLE •

Efeito do CLA na quantidade total de proteína e gordura do leite

CLA

0,600

CLA

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2,75 2,50

0,500

0,436

2,25 2,00

0,400

1,75 1,50

0,300

1,25 1,00

0,200

0,75 0,50 0,25

o

0, 100

J GORDURA

0,000

PROTEÍNA

GORDURA

PROTEÍNA

Fonte: Dante Pazzanese Lanna

mitado a crianças e adolescentes. "Na última década", diz o pesquisador, "houve uma considerável redução no consumo de manteiga e, simultaneamente, um aumento no consumo de leite desnatado, porque a gordura tem sido apontada como uma das principais vilãs em doenças do coração': Ele acrescenta que "a pesquisa permitirá o controle da produção dos componentes do leite de acordo com as necessidades do mercado".

Lanna desenvolve outro projeto apoiado pela FAPESP - Efeito do Hormônio do Crescimento na Expressão Gênica de Enzimas Reguladoras da Lipogênese e Lipólise - com financiamento de R$ 171,6 mil e término previsto para 2001. Desta vez, a meta é entender os mecanismos celulares e moleculares da ação do CLA e de hormônios nos tecidos mamário e adiposo das vacas.

Esses mecanismos podem explicar mais profundamente a inibição da produção de gordura no leite.

A redução no teor de gordura ocorre devido à menor atividade de certos genes. Esses genes codificam as enzimas sintetase dos ácidos graxas FASe acetil CoA carboxilase (ACC), responsáveis pela síntese da gordura.

As duas enzimas são os motores da transformação em gordura dos nutrientes que chegam pelo sangue. A Estábulo e laboratório -

38 • JULHO DE 1000 • PESQUISA FAPESP

partir de uma amostra do tecido da mama da vaca que recebeu o CLA, os pesquisadores extraem moléculas de ácido ribonucléico (RNA)- que levam para o restante das células as informações dos genes contidos no DNA. Alterações na expressão desses genes são determinadas por meio de uma técnica que permite saber quantas cópias desse RNA mensageiro são feitas.

Inicialmente, a equipe de Lanna, em conjunto com o grupo do projeto Genoma Xylella na Esalq, fez a clonagem e o seqüenciamento de alguns desses genes, desconhecidos para os bovinos. O objetivo é conhecer ós mecanismos envolvidos na regulação da secreção do leite para, por exemplo, desenvolver animais transgênicos que produzam mais leite - na composição considerada ideal para o consumidor- e sejam mais eficientes na conversão de alimentos.

O pesquisador Sérgio Medeiros, por sua vez, está avaliando a presença das diferentes formas de CLA nos alimentos consumidos pelos freqüentadores do restaurante da Esalq. Quer saber quanto do composto é preciso acrescentar para enriquecer os alimentos e proteger contra o câncer. E o zootecnista Dimas Estrásulas de Oliveira, em outro projeto de doutorado, avalia se as vacas comem mais ou menos capim quando suplementadas com o CLA. Seu trabalho poderá de-

tinir quantos quilos de ração a menos a vaca alimentada com CLA requer para produzir um litro de leite.

A equipe tem o mesmo objetivo: produzir leite com menos gordura e mais eficiência. Chegando cada vez mais perto da composição ideal e de uma compreensão clara do modo de atuação do CLA, Dante Pazzanese Lanna procura reduzir a incidência de problemas de coração - o sonho do avô com quem aprendeu a gostar de pesquisa e de agronomia.

• P ERFIL:

• DA NTEPAZZANESELANNA, 36 anos, formou-se engenheiro agrônomo em 1985 na Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq) da Universidade de São Paulo (USP), onde fez mestrado e leciona desde 1996. Doutorou-se em Bioquímica Nutricional em 1993 na Universidade de Cornell, EUA. Projetos: Ácido Linoléico Conjugado: Efeito da Suplementação por Longo Período sobre Vacas Lactantes; Efeito do Hormônio do Crescimento na Expressão Gênica de Enzimas Reguladoras da Lipogênese e Lipólise; e Desenvolvimento de Modelos do Uso de Nutrientes em Ruminantes e de Determinação da Exigências Nutricionais Investimentos: R$ 48.872,80, R$ 171.661,60 e R$ 6.000,00

CIÊNCIA

gelo e cristais de silicatos, entre outras.

•

Arqueologia no interior de Alagoas

Maravilha: fósseis de mastodonte, preguiça e tatu gigantes

Sinal orgânico no espaço interestelar O telescópio espacial infravermelho (ISO) da Agência Espacial Européia (ESA) detectou a presença do radical meti! CH 3 , formado por um átomo de carbono e três de hidrogénio- nas nuvens de gás e poeira entre as estrelas. Já registrado em 1998 pelo ISO em Saturno e, um ano depois, em Netuno, o CH 3 é produto intermediário nas reações que formam hidrocarbonetos - o grupo de compostos orgânicos do petróleo e seus derivados. É um radical chamado livre por ser muito reativo combina-se facilmente para formar substâncias orgânicas - e isoladamente, não existe por mais que milionésimos de segundo. Agora foi detectado no centro de nossa galáxia, numa nuvem de temperatura estimada em -256°C e densidade de cerca de 1 milhão de moléculas por centímetro cúbico. Anunciada em The Astrophysical Journal de 1o de junho, a descoberta fora prevista pelo alemão Gerhard Herzberg (1904-1999, Nobel de Química de 1971),masnão

de forma tão abundante- 13 CH3 para cada milhão de moléculas de hidrogénio - indicando que os atuais modelos teóricos terão de ser revistos.

Segundo Helmut Feuchtgruber - do Instituto MaxPlanck de Física Extraterrestre e um dos autores da descoberta, junto com holandeses, espanhóis e australianos - o ISO está mostrando a singularidade dos processos químicos que ocorrem no espaço.

Operando desde 1995 e já com cerca de 30 mil observações feitas, o ISO também detectou no espaço moléculas de água,

Nunca antes escavado, o município de Maravilha, no interior de Alagoas, se revela muito promissor para a paleontologia e a arqueologia.

Ali, o biólogo Jorge Luís Lopes, do Centro de Tecnologia e Geociências da Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) encontrou fósseis de mastodonte, de preguiça-gigante e de um tatu-gigante, de aproximadamente 1Omil anos.

Estavam em depressões naturais das rochas chamadas caldeirões ou tanques, para onde devem ter sido trazidos pelas chuvas. Outros municípios de riqueza arqueológica comprovada são Ouro Branco, Poço das Trincheiras e Santana do Ipanema, em Alagoas, e Águas Belas, em Pernambuco.

•

Para entender os ecossistemas É difícil explicar a multipli-

cação desenfreada de algas

Imagem do espaço: muito mais CH 3 do que era previsto

planctônicas em águas poluídas, com excesso de fosfatos e nitratos. Insatisfeitos com os modelos atuais- que supõem o ecossistema como uma cadeia linear de três níveis tróficos homogéneos (produtores primários, herbívoros e carnívoros)- franceses do Centro Nacional de Pesquisas Científicas (CNRS) e da Universidade de Paris VI criaram uma alternativa: em vez de uma sucessão, nos ecossistemas haveria uma rede de eventos.

Para eles, em cada nível trófico há de um a três grupos funcionais, conforme o regime alimentar e a vulnerabilidade das espécies. O modelo de rede rompe com a idéia de que a abundância de nutrientes beneficiaria os níveis tróficos mais elevados, normalmente os carnívoros, em detrimento dos herbívoros.

Ele identifica, no primeiro nível, três grupos de produtores primários: algas planctônicas mais comestíveis, algas planctônicas pouco comestíveis e perífiton (não consumidas e auto-reguladas). O segundo nível seria formado por pequenos e grandes herbívoros consumidores de algas. O terceiro, por carnívoros invertebrados que consomem pequenos herbívoros e, eventualmente, por peixes que se alimentam de todos os herbívoros e também de carnívoros invertebrados. Os resultados que o novo modelo prevê ficaram bem próximos dos verificados empiricamente - em experimentos com manipulação de nutrientes no lago de Créteil mas distantes do modelo clássico.

• PESQUISA FAPESP · JUlHO DE 1000 • 39

CIÊNCIA

IMUNOLOGIA

Antiofídico de cascavel fica mais leve Nova imunoterapia permitirá tratamento menos agressivo contra veneno da serpente cascavel é a serpente cuja picaA da causa mais mortes no Brasil. Duas pesquisas do Instituto Butantan (São Paulo) mostram que é possível usar fr-agmentos de anticorpos anti-veneno de cascavel que agiriam especificamente sobre o veneno, diminuindo os sérios efeitos adversos da soroterapia. Essa possibilidade de tratamento, menos agressivo que o convencional - adotado há mais de 100 anos e cuja aplicação é muitas vezes comprometida pelas reações adversas - tem mostrado bons resultados em laboratório, em testes com camundongos.

O veneno da cascavel ( Crotalus durissus terrificus) tem 65% de crotoxina, proteína que é seu principal componente ativo. Ela inibe os movimentos musculares: por isso, a vítima pode até parar de respirar se não tiver socorro adequado em tempo hábil, algo em torno de 2 a 6 horas. As conseqüências do envenenamento são bem conhecidas, mas pouco se sabe do efeito do veneno sobre as células e do desenvolvimento da resposta imune do organismo. Foi justamente a isso que se dirigiu o projeto Efeito do Veneno da Crotalus durissus terrificus (cascavel) sobre o Sistema Imune, do professor Ivan da Mota e Alburquerque, Liderança Científica do Laboratório de Imunopatologia do Instituto Butantan.

40 • JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPESP

Extração do veneno é tradição secular, mas tratamento mudará

A crotoxina age na região de contato entre o nervo e o músculo, inibindo a liberação de acetil-colina ao nível das junções neuromusculares.

Com isso, impede a transmissão do estímulo nervoso para o músculo se contrair: "Um dos primeiros sinais de que o veneno está agindo é a ptose palpebral- a pessoa não consegue abrir a pálpebra': diz o professor Ivan.

Quando o organismo percebe a entrada de proteínas estranhas, reage contra elas produzindo anticorpos, formados por células sangüíneas chamadas linfócitos. Os linfócitos B produzem anticorpos que neutralizariam o efeito tóxico do veneno. Resultados anteriores obtidos no Laboratório de Imunopatologia mostraram que a crotoxina do veneno da cascavel diminui consideravelmente a resposta imune, de modo que o sistema imunológico da vítima produz menos anticorpos, sobretudo anticrotoxina, que neutraliza os efeitos da crotoxina.

Como a resposta dos linfócitos B é muito influenciada pelas citocinas (substâncias também produzidas por eles), a pesquisadora Diva Ferreira Cardoso, Ivan da Mota e sua equipe decidiram injetar em camundongos (Mus musculus) tanto o veneno de cascavel quanto a crotoxina isolada. Então, acompanharam a produção de citocinas e anticorpos pelo animal, para estudar a ação do

veneno sobre o sistema imunológico. Verificaram que tanto o veneno como a crotoxina isolada inibem a produção de citocinas e de anticorpos, mas que esse efeito supressor no sistema imunológico ocorre apenas sobre os linfócitos B (produtores de anticorpos), e não sobre os linfócitos T (responsáveis pela imunidade celular).

O projeto, iniciado em fevereiro de 1997 e terminado em 1999, recebeu financiamento da FAPESP e resultou na tese de doutorado de Diva Cardoso, além de um artigo na mais importante revista científica sobre venenos animais, Toxicon (Vol. 35: 607, 1997), assinado por Mota e Diva.

Um legado importante Formada em Ciências ( 1982) pela Universidade Mackenzie, de São Paulo, Diva Ferreira Cardoso fez mestrado em Microbiologia e Imunologia (1992) na antiga Escola Paulista de Medicina (atual Universidade Federal de São Paulo) e doutorado em Imunologia (1999) no Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo. Desde 1987 era pesquisadora científica

A partir de então, ambos decidiram continuar os estudos sobre o veneno, em busca de uma alternativa para o soro anticrotálico produzido em cavalos ou ovelhas. Eficiente na neutralização dos componentes tóxicos do veneno, esse soro retirado de animais imunizados com o veneno total causa, em 30% a 84% dos casos, as reações indesejáveis, que vão desde a chamada doença do soro até o choque anafi-

Em relação ao mecanismo de ação do veneno, os pesquisadores também queriam responder a novas indagações. Uma delas era descobrir qual a dosagem de citocinas produzidas pelos linfócitos B e qual o efeito da crotoxina sobre a produção de citocinas por esses linfócitos.

No relatório de seu projeto, Mota já apontava, como objetivo futuro, a obtenção de "anticorpos monoclo-

fragmento de anticorpo humano, exatamente a parte que se liga ao antígeno (o veneno). Esse pedaço do anticorpo com especificidade para o veneno (reconhece o veneno) é chamado anticorpo humano recombinante ou scFv. "Diva mostrou que as moléculas scFvs anti-crotoxina são capazes de neutralizar, potencialmente, a atividade enzimática e letal da crotoxina in vitro e in vivo, com animais de experiência': revela Ivan da Mota.

O novo projeto - Caracterização do Potencial de Neutralização de Anticorpos Humanos Recombinantes (scFv) Anti-Crotoxina do Veneno do C. d. terrificus frente à Crotoxina dos Venenos de C. d. collineatus e C. d.

Professor Ivan, do Instituto Butantan: orientador previu uso de anticorpos humanos

lático. A doença do soro produz reações cutâneas que, em casos graves, causam insuficiência renal. Além disso, ocorre a diminuição de imunidade provocada pelo próprio veneno, o que resulta num quadro de resolução complicada.

no Laboratório de Imunopatologia do Instituto Butantan. Assinou dez trabalhos em publicações internacionais, sobretudo sobre veneno de cascavéis.

Foi a grande responsável pela obtenção do fragmento de anticorpo que poderá ser a diferença entre tratamento mais ou menos agressivo para as vítimas de picadas de cascavel. O importante trabalho da dra.

Diva, interrompido por sua morte trágica, em dezembro de 1999, foi retomado por sua orientanda de mestrado Edna Cristina dos Santos sob a orientação do prof. Ivan Mo-

nais de origem humana para fins terapêuticos': que inibissem os efeitos colaterais. Então, sua equipe iniciou novo projeto, no decorrer do qual a pesquisadora Diva Cardoso conseguiu um grande avanço: sintetizou um

ta. Segundo a apresentação do projeto, a "alternativa proposta para o melhoramento da soroterapia é a possível utilização de anticorpos homólogos (de origem humana), específicos para as principais toxinas do veneno, que possam evitar essas reações adversas. Anticorpos humanos recombinantes já vêm sendo usados com sucesso no tratamento de tumores, rejeição de transplantes, artrites reumatóides e alergias, sugerindo que sua utilização também é possível no tratamento dos acidentes crotálicos."

cascavella - foi tema da tese de Diva e continua a ser desenvolvido pela biomédica Edna Cristina dos Santos, que tem bolsa da FAPESP para tese de mestrado, sob orientação de Ivan da Mota e com a colaboração do Hybridolab, do Instituto Pasteur, da França. Os pesquisadores têm pela frente um longo trabalho, que inclui mais testes com animais e humanos, até que o scFv possa ser usado na rotina de atendimento.

• PERFIL:

79 anos, formou-se em 1947 pela Faculdade de Medicina da Universidade Federal de Pernambuco. Foi professor de Histologia na Faculdade de Medicina da USP e de Imunologia no Instituto de Ciências Biomédicas da USP. Trabalha desde 1970 no Laboratório de Imunopatologia do Instituto Butantan.

Projetas: 1. Efeito do Veneno da Crotalus durissus terrificus (casca• IVAN DA MOTA E ALBUQUERQU E,

vel) sobre o Sistema Imune.

Investimento: R$ 12.091,76 e US$ 36.200,37 2. Caracterização da Reatividade Cruzada e do Potencial de Neutralização de Anticorpos Humanos Recombinantes (scFv) Anti-Crotoxina do Veneno da Crotalus durissus terrificus frente à Crotoxina de outros Venenos Crotálicos PESQUISA FAPESP • JULHO DE 2000 • 41

CIÊNCIA

ZOOLOGIA

Peixes do século passado Pesquisadora resgata desenhos inéditos do inglês Alfred Wallace uase cem anos depois, uma carta chega ao devido destino.

Em 1904, o naturalista inglês Alfred Russel Wallace (1823-1913) escreveu a George Albert Boulenger, curador de répteis e peixes do Museu de História Natural de Londres. Perguntava se a instituição teria interesse em abrigar a coleção de 212 gravuras de peixes que havia feito ao longo de sua expedição pela Bacia do Rio Negro, na Amazônia, entre 1850 e 1852. Ao despedir-se, perguntava se "não haveria um estudante disponível, disposto a organizar um catálogo sobre as ilustrações': O material foi aceito pelo Museu de História Natural e um ano depois outro curador, Charles Tate Regan, publicou uma lista onde identificou cerca de metade das espécies ilustradas. Mas o desejo de publicar as ilustrações não pôde ser atendido. Em fevereiro do ano passado, a carta chegou às mãos da bióloga paulista Mônica de Toledo-Piza Ragazzo, pesquisadora de 35 anos do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo (MZUSP) . Ela agora providencia a identificação dos peixes e prepara um catálogo completo com as 212 gravuras, das quais pelo menos 180 são inéditas, que constituem uma pequena amostra da diversidade de peixes da Amazônia. O livro com os desenhos e a carta deve ser publicado no início do próximo ano pela Editora da Universidade de São Paulo (Edusp ), com apoio da Imprensa Oficial do Estado de São Paulo (Imesp ).

Autodidata, Wallace foi um dos primeiros naturalistas a percorrer a

Q

42 • JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPESP

Bagre-sapo (Asterophysus batrachus), uma das 212 gravuras reunidas ISO anos depois

região do Rio Uaupés, um afluente do Rio Negro só explorado novamente muitos anos depois. As observações que fez durante a viagem pela Amazônia contribuíram para a formulação das idéias sobre evolução, depois apresentadas em co-autoria com o inglês Charles Darwin ( 180~1882). Wallace chegou a Belém em 1848 acompanhado pelo seu amigo e também naturalista Henry Walter Bates (1825-1892). Percorreram juntos o Rio Amazonas até 1850, quando Wallace preferiu seguir sozinho pelo Rio Negro.

As plantas e os animais coletados na Amazônia que Wallace levava à Inglaterra perderam-se quando o navio Helen se incendiou e naufragou, três semanas após deixar a costa brasileira.

As gravuras de peixes e de palmeiras e anotações da viagem foram o que ele pôde salvar. Em 1853, um ano depois de retornar a Londres, publicou A Narra tive of Traveis on the Amazon and Rio Negro, traduzido em 1979 pela Edusp. Em 1854, seguiu para a Malásia, onde ficou durante oito anos.

Riq ueza de detalhes - Em 1994, Mônica fazia o doutoramento na City University e no Museu de História Natural, em Nova York, quando, ao selecionar a bibliografia que sustentaria seu trabalho, tomou conhecimento da publicação de Regan que citava duas espécies do grupo de peixes que estava estudando, a subfamília Cynodontinae, chamados peixes-cachorro, com três gêneros e oito espécies, da ordem Characiformes, que inclui também piranhas e lambaris.

Em julho de 1995, Mônica viajou a Londres para examinar o material da coleção de peixes do Museu de História Natural. Aproveitou para ver as gravuras de Wallace. Ficou impressionada com a riqueza de detalhes dos desenhos, feitos a lápis, em três tipos diferentes de papel, com cerca de 15 centímetros de largura por 5 de altura. Entre as gravuras de Cynodontinae havia uma espécie nova que ela estava descrevendo e chamou de Hydrolycus wallacei, em homenagem ao naturalista.

Atribulada para concluir o doutoramento, Mônica não pôde, na época,

Acará-bandeira (Pterophylum a/tum), no desenho preciso a lápis do autodidata Wallace

ater-se às gravuras. Mas não as esquecera. Em 1998, enviou um projeto ao Museu de Londres prontificando-se a organizar o acervo e resgatar o trabalho de Wallace. Proposta aceita, voltou a Londres, com um apoio da FAPESP para passagens e estadia, no valor de US$ 3.841,00, e pôs-se a pesquisar a história das gravuras e cuidar da identificação das espécies retratadas nos desenhos, para a posterior publicação de um catálogo. Foi nessa viagem que descobriu o texto em que o pesquisador inglês expressava seu desejo de ver as gravuras publicadas. "Lendo a carta, fiquei emocionada por saber que Wallace não só aprovaria o catálogo, como na verdade estava à espera de alguém que realizasse sua vontade", diz ela.

Para montar o catálogo, a pesquisadora examinou os relatos da viagem e as anotações do naturalista inglês, com as características morfológicas e as localidades de coleta da maioria das espécies dos peixes ilustrados. "Wallace era muito minucioso e os desenhos muito fiéis, mesmo ele não sendo um especialista", diz a pesquisadora.

e Paraná, além de museus da Suécia, Estados Unidos e França. Desse modo, a pesquisadora está atualizando o trabalho de Regan, que havia trabalhado com a coleção no início do século. "Ainda hoje nosso conhecimento é insuficiente para identificar todas as espécies ilustradas", diz a pesquisadora. Outra dificuldade é que as gravuras nem sempre contêm os elementos necessários para chegar a uma conclusão satisfatória.

Agora, com quase todas as espécies identificadas, pelo menos até gênero, ela comprova que há cerca de 190 espécies diferentes. Cerca de 40 das espécies foram formalmente descritas somente depois do retorno de Wallace a Londres, das quais metade somente nas últimas décadas. Algumas das ilustrações representam espécies novas, ainda não estudadas.

Há um detalhe: as gravuras estão todas numeradas, de 1 a 215, mas não numa ordem cronológica completa.

Mônica procura descobrir o critério que as organiza. "Wallace aparentemente não deixou qualquer indício do motivo da numeração", diz ela.

Faltam as gravuras de número 10 a 14,53 e 210. Outras estão numeradas duas vezes. Mesmo com as dúvidas, a coleção e as anotações reiteram ovalor das observações de Wallace sobre a diversidade e a distribuição das espécies, que certamente influenciaram no desenvolvimento das idéias sobre a evolução das espécies. Darwin, ao publicar A Origem das Espécies, em 1859, recebeu a maior parte dos créditos sobre a formulação dessa teoria.

Não deixou, porém, de reconhecer as descobertas de Wallace.

• PERFIL:

Mônica: descobriu e vai publicar • MONI CA DE TOLEDO-PI ZA RAGAZZO

Contou também com a vasta coleção de espécies amazônicas depositadas no Museu de Zoologia da USP. Após identificar as espécies, Mônica enviou cópia das gravuras, para confirmação, aos especialistas dos diferentes grupos de peixes de água doce da América do Sul, que trabalham em instituições de São Paulo, Rio de Janeiro

é graduada em Biologia pela USP, com doutoramento pela City University/Museu de História Natural, em Nova York. É pós-doutoranda do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo.

Projeto: Peixes do Rio Negro - Alfred Russel Wallace Investimento: US$ 3.841 PESQUISA FAPESP • JULHO DE 2000 • 43

TECNOLOGIA

ÓPTICA

Controle fino das ondas luminosas Equipe da USP ganha prêmio internacional com pesquisa inédita Brasil começa a desempenhar um papel relevante na pesquisa em óptica difrativa. Esse segmento da Física usa técnicas que modificam um feixe de luz para criar uma nova fonte luminosa. Com z isso é possível desenvolver ~ iil tecnologias para fabricar no- ::>'" vos microcircuitos optoele- ~ trônicos, como fotodetectores de câmaras fotográficas digitais, além de confeccionar hologramas impressos em cartões de crédito, por exemplo, ou ainda criar imagens artísticas e publicitárias.

O reconhecimento internacional nessa área foi para um trabalho em conjunto de dois grupos de pesquisadores, um da Escola de Engenharia Elétrica de São Carlos (EESC) e outro da Escola Politécnica, ambos da Universidade de São Paulo (USP). Eles ganharam, em junho, o primeiro lugar na categoria Divisão Artística da versão 2000 do

O

Diffractive Beauty Contest

com a utilização de um feixe de luz laser. Elas chamaram a atenção do público especializado presente na mostra, provocando até a formação de uma fila para a observação das imagens. Depois desse sucesso no Canadá, Gonçalves começou a preparar um pedido de patente para os novos EODs e a publicação dos resultados nas revistas Optics Photonics News e Applied Optics, editadas pela Optical Society of America.

A qualidade dessa imagem apresentada no Canadá foi inédita e valeu um primeiro lugar

(Concurso de Beleza Difrativa), realizado em Quebec, no Canadá, e promovido pela Optical Society of America (OSA). O trabalho intitulado

Elemento Óptico Difrativo com Modulação de Amplitude Complexa foi coordenado pelo professor Luiz Gonçalves Neto, docente das duas escolas.

Os dois grupos estudam os Elementos Opticos Difrativos (EODs), que são superfícies ópticas com microrrelevos capazes de modificar as propriedades de um feixe de luz por 44 • JULHO DE 1000 • PESQUISA FAPESP

meio do atraso de sua propagação no espaço. O controle da luz, nesse caso, é realizado pelos microrrelevos gravados na superfície do EOD que funcionam como obstáculos para o feixe luminoso. Essa é a principal diferença entre elas e as lentes comuns que têm superfícies lisas produzidas por abrasão ou polimento.

O dispositivo mostrado no Canadá proporcionou as melhores imagens geradas até aquele evento com

essa tecnologia, além de a equipe ter demonstrado capacidade intelectual e tecnológica para elaborar os EODs. No evento, o grupo também apresentou novas propostas de cálculos para a confecção desses dispositivos.

Entre filas e patentes · A inovadora

técnica desenvolvida e reconhecida no concurso da OSA foi materializada na projeção de duas imagens, uma borboleta e uma cabeça de águia,

O desenvolvimento de todo esse processo conta com recursos da FAPESP para o projeto Implementação de Miroelementos Ópticos Difrativos, que se desenvolve no âmbito do Programa Jovens Pesquisadores, com o aporte financeiro de R$ 32 mil e US$ 33 mil. &se programa oferece financiamento para auxílio de infra-estrutura e bolsas para pesquisadores recém-saídos do doutorado que demonstrem competência para conduzir projetos de pesquisa.

Outra função do Programa é abrir novas áreas de pesquisa e ajudar a inserir o novo pesquisador nas tradicionais instituições acadêmicas. Com isso o programa possibilita a criação de novos núcleos de estudo, como os dois grupos que estudam óptica difrativa em São Carlos e na Poli, em São Paulo.

Gonçalves chefia há três anos o Grupo de Microóptica, da EESC. Ali, sob sua orientação, um grupo de pesquisadores iniciou, há dois anos, projetas de pós-graduação nessa área.

Entre eles, Patrícia Cardona e Giuseppe Cirino. Participam também como coordenadores os professores Ronaldo Domingues Manzzano e

A luz laser (à esquerda) atravessa os Elementos Ópticos Difrativos (à direita) onde ela é modificada para formar imagens desejadas

Patrick Verdonck, do Laboratório de Sistemas Integráveis da Poli-USP. Alumínio nas placas - Foi trabalhan-

do com técnicas e ferramentas que possibilitam o controle dessas ondas que Gonçalves chegou à formulação de algo novo. "Elementos Opticos Difrativos são conhecidos há pelo menos 25 anos. A novidade que descobrimos foi a formulação de um jeito novo de aplicar alumínio nas placas dos EODs. Essa inovação provocou uma grande diferença com as tecnologias existentes até aqui. Consegui-

mos uma forma de controlar não apenas a modulação da fase de uma frente de luz, mas também, de forma simultânea, a modulação de sua amplitude (modulação da intensidade luminosa)", informa Gonçalves.

Frente de luz ou frente de onda é um conceito em óptica que descreve as superfícies formadas pela junção de pontos no espaço com uma mesma fase (atraso da luz em relação a uma referência no espaço). Já a difração é a interação (desvio) das frentes de onda com obstáculos, que são os microrrelevos existentes na superfície dos EODs, de dimensões próximas a um comprimento de onda.

Uma aplicação potencial desses con-

balho nesse campo foi publicado, em 1965, pelo norte-americano Alfred Lohman, que utilizou esses princípios na realização de hologramas por computador. Mais tarde, o governo americano decidiu investir recursos nessa área por razões estratégicas, sobretudo bélicas, na adoção de visão artificial mais precisa para a interceptação de alvos por meio de mísseis.

"Hoje, a indústria óptica e a eletrônica de uma maneira geral começam a utilizar essa tecnologia", diz Patrícia.

Detectores de distância a laser e até

ceitas que se materializam nas pesquisas dos dois grupos da USP é a possibilidade de melhorar a qualidade dos telescópios ópticos.

A ampliação do estudo e da aplicação da óptica difrativa no desenvolvimento tecnológico industrial tem causado uma procura crescente por pesquisadores e por projetas saí. dos de núcleos avançados de pesquisa.

Uma grande empresa multinacional, por exemplo, procurou o Laboratório do Grupo de Optica da EESCUSP para estudar possíveis aplicações dos novos métodos de difração das ondas de luz. Uma boa idéia nessa área é capaz de economizar alguns milhares de dólares. ''A óptica difrativa contém tecnologias novas que eliminam etapas no processo de cons-

"visão de robôs" estão sendo implementados com essa tecnologia.

Há centenas de usos para as técnicas de difração, explica Gonçalves. Todas dependem de um Elemento Optico Difrativo. Na forma bruta, esse dispositivo parece uma bolacha redonda de vidro. Mas são muito mais do que aparentam conter. São lâminas redondas de dióxido de silício, com espessura de 1 milímetro, sobre as quais são gravadas informações em medidas extremamente reduzidas, que obedecem a especificações determinadas em mícrons, proporcionais ao comprimento de onda utilizado.

"Por ser necessário introduzir apenas um atraso de fase em cada região da frente de luz incidente, os Elementos Opticos Difrativos são mais finos e

trução de elementos ópticos", afirma o professor.

Razão estratégica - O primeiro tra-

PESQUISA FAPESP • JULHO DE 1000 • 45

leves do que todo material com característica refrativa, como as lentes comuns que utilizamos nos óculos e nos aparelhos fotográficos", explica Essas características tornam o processo de produção de uma bolacha dessas em algo muito parecido com o que ocorre na fabricação de circuitos eletrônicos digitais, que são sempre processados em minúsculas estruturas, como os diversos tipos de chips fartamente utilizados, por exemplo, nos computadores. As técnicas de gravação das microinformações sobre os revelos existentes num EOD são basicamente as mesmas usadas na montagem daqueles circuitos, ou seja, li-

evento em Quebec saímos do zero.

Eu tinha o conceito escrito e alunos de doutorado trabalhando no projeto. Montar tudo, testar, remontar no Canadá e fazer tudo de novo foi um belo trabalho de equipe. Fizemos todo o trabalho em duas semanas': Trabalhar com esses dispositivos controladores da onda de luz representa um desafio extra porque a imagem resultante sempre foi irregular, com um padrão baixo em termos de definição, principalmente se comparada ao conceito de imagem gerada pelo cinema ou pela televisão. No concurso ganho pela equipe brasileira, o dado diferenciador, em relação à

Patrícia e Gonçalves: estudo tem amplas perspectivas

tografia óptica, corrosão por plasma e litografia por feixe de elétrons.

Um dos pontos de apoio da Escola de Engenharia da USP é a Fundação Centro Tecnológico para Informática (CTI), localizada em Campinas, que fabrica as máscaras necessárias para a materialização dos microelementos ópticos. A CTI tem três institutos (computação, automação e microeletrônica) nos quais são realizadas etapas cruciais no processo, tais como prototipagem (desenho) de circuitos integrados e microssistemas, microusinagem e máscaras fotolitográficas e o empacotamento eletrônico, entre outros.

Vitória da equipe - O próprio Gon-

çalves reconhece: "Para participar do 46 • JUlHO DE 1000 • PESQUISA FAPESP

imagem, foi justamente o padrão de qualidade que nunca havia sido obtido em tal medida.

Mais do que o uso correto de bons equipamentos, os microelementos difrativos também dependem de inúmeros cálculos. Esse ponto também constitui uma dimensão especial do avanço conseguido. "Na verdade, não revolucionamos os cálculos, pelo contrário, quanto mais conseguirmos tornar o processo funcional e flexível, mais simples eles se tornam. Sempre digo aos meus alunos que se eles não sabem cálculo e o processo de fabricação a fundo para saber onde podemos introduzir uma simplificação, podem esquecer o assunto", relata Gonçalves.

Dominada a técnica de construção dos EODs, o país se capacita a

realizar processos como filtragem óptica, modelagem da luz laser e até mesmo a construir hologramas por computador de melhor qualidade. Entretanto, segundo os estudos da equipe, os custos, hoje, representam um entrave respeitável nesse campo. Os investimentos industriais são altos. ''A montagem de um laboratório de pesquisa de porte, equipado para proceder a caracterização dos materiais utilizados, além da fabricação, dos testes e da mão-de-obra especializada, atinge a cifra de US$ l milhão."

Separar canais - A correção de teles-

cópios ópticos talvez seja a mais comezinha das possibilidades de uso dessas novas técnicas difrativas, afirma o professor. "É um campo de trabalho que está sempre se ampliando", acredita Gonçalves. Uma das áreas beneficiadas é a indústria de telecomunicações. Elas precisam usar dispositivos como demultiplexadores em redes de fibras ópticas, para tornar mais segura e eficiente a separação de informações ao longo desses tipos de rede. Os demultiplexadores são dispositivos que separam vários canais de informação existentes num determinado meio. Servem para separar os vários comprimentos de onda transmitidos por uma fibra, por exemplo.

Após esse primeiro reconhecimento internacional, os dois grupos da USP voltam a se embrenhar nos estudos de óptica difrativa, uma área que está apenas começando a se desenvolver.

• PERFIL: • Lurz GONÇALVES NETO, 38 anos, formou-se em Engenharia Elétrica na Escola de Engenharia de São Carlos da USP. Fez mestrado no Instituto de Física de São Carlos, também da USP. Doutorou-se na Universidade Laval, em Quebec, Canadá.

Projeto: Implementação de Microelementos Ópticos Difrativos

Investimento: R$ 32 mil e US$ 33 mil

TECNOLOGIA

LINHA DE PRODUÇÃO

Audiência garantida: sem rodas e levitando sobre um trilho

Trem que levita é sucesso em Brasília Um miniprotótipo de trem que levita e transita a 400 quilômetros por hora na presença de campo magnético foi um dos sucessos de público na 8• Expociência, feira paralela à 52• Reunião Anual da SBPC, acontecida em julho, em Brasília. O Laboratório de Aplicações de Supercondutores (Lasup) da Coordenação dos Programas de Pós-graduação de Engenharia (Coppe) e da Escola de Engenharia da UFRJ desenvolveu esse trem durante dois anos. Ele corre a cinco centímetros, em média, de distância de um trilho único composto de um ímã comum feito de ferrita. A levitação acontece porque existe um campo magnético que se forma entre o trem e o trilho. Para criar esse campo, as rodas são substituídas por pastilhas supercondutoras compostas de ítrio, bário e cobre que recebem uma carga de nitrogênio líquido, deixando-as resfriadas a uma temperatura de -196°C. Esse tipo de tecnologia é mais avançado que outras experimentadas por países como Japão e Alemanha, que têm

protótipos em tamanho real prontos para entrar em operação comercial. O projeto brasileiro está agora na fase de captação de recursos para a construção de uma pista de 30 metros e um protótipo de laboratório. A concepção do projeto, financiado pela Faperj e Fundação José Bonifácio (UFRJ), foi de três professores da universidade, Richard Stephan, da Coppe, Rubens de Andrade Júnior, da Escola de Engenharia, e Roberto Nicolsky, do Instituto de Física. •

Entulho reciclado é mais econômico Multiplicam-se por todo o pais os experimentos que buscam

materiais alternativos e mais baratos para a construção civil.

O mais recente vem da Bahia e utiliza a reciclagem de entulho resultante de atividades de construção e demolição na fabricação de novos materiais.

Os resultados apontam uma economia de 65% quando o entulho reciclado é utilizado em pavimentação e 30% no uso de argamassa. Na fabricação de tijolos, o ganho é ambiental, pois esse material é prensado, não necessitando a queima de combustível para sua produção. A iniciativa é do Grupo de Estudos em Materiais de Construção (Gemac) da Escola Politécnica da Universidade Federal da Bahia (UFBA), que elaborou um plano de utilização do entulho da região metropolitana de Salvador. "Em testes de laboratório, nós provamos a viabilidade técnica e econômica da reciclagem de entulho, mesmo que esse material apresente grande mistura de elementos como restos de cimento, pedra e cerâmica", explica Alex Carneiro, coordenador do projeto. O Gemac tem a colaboração da Limpurb, empresa de limpeza da capital baiana que está implantando 27 pontos de coleta de entulho.

•

Em Salvado r estão previstos 27 pontos de coleta de ent ulho

Antena simula energia dos raios O desenvolvimento tecnológico ainda não eliminou por completo os perigos milenares das descargas elétricas atmosféricas mais conhecidas como raios. Ao contrário, hoje, há uma grande preocupação em fazer com que esses raios não "queimem" a profusão de equipamentos eletrônicos existentes em qualquer prédio ou residência. Ao contrário de carros e aviões, por exemplo, os edifícios não têm total garantia contra os raios.

"Pela norma brasileira que regulamenta os pára-raios, eles protegem as pessoas e evitam incêndios, mas não eliminam a possibilidade de descargas elétricas atingirem os aparelhos eletrônicos, incluindo os computadores", afirma o professor José Osvaldo Paulino, da Escola de Engenharia Elétrica da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Ele orientou a tese da doutoranda Maria Luiza Grossi, que projetou uma antena capaz de gerar descargas elétricas similares aos raios. "Com essa antena instalada no alto de um prédio, podemos fazer uma descarga elétrica com o auxílio de um gerador que, ao mesmo tempo, testa o pára-raio e cria um campo magnético próximo ao dos raios, proporcionando medições do nível de tensão elétrica suportado pelos equipamentos." A antena está quase pronta e os pesquisadores preparam o processo de patente. Eles esperam, em breve, fazer uma parceria com uma empresa que se interesse em fabricar o equipamento.

• PESQUISA FAPESP · JULHO DE lODO • 47

TECNOLOGIA

QUÍMICA

Equipamentos bem calibrados Pequena empresa busca a excelência na produção de materiais de referência s indústrias químicas brasileiras terão em breve uma nova fonte para obtenção de materiais de referência, usados na calibração e controle de seus equipamentos. A novidade vem de São José dos Campos, da empresa Quimlab, que está finalizando um laboratório de metrologia química adequado às normas internacionais. Instalada na Incubadora de Base Tecnológica Polovale II, dentro da Universidade do Vale do Paraíba (Univap ), a empresa já produz algumas substâncias de uso industrial para medição das chamadas grandezas químicas. Essas grandezas, em geral, estão ligadas à quantidade de matéria em uma determinada substância, líquida ou sólida. Por exemplo, a porcentagem de chumbo ou ferro encontrada em uma liga metálica é uma grandeza química. Da mesma forma, o valor de pH de um alimento ou líquido indica se a substância é ácida, neutra ou básica.

A Quimlab elabora e vende soluções-padrão de pH fundamentais para empresas químicas que produzem matérias-primas utilizadas na indústria de alimentos, no tratamento de água de piscina e até na análise de urina. Se a indústria usa ou fabrica uma substância que deve ter acidez correspondente a pH 4 (a escala é de O a 14), o aparelho no qual rotineiramente são analisadas as amostras desse material é ajustado e calibrado por comparação com a solução-padrão de pH 4 produzida pela Quimlab. Como não há fabricantes de padrões de pH

A

48 • JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPESP

com certificação no Brasil, grande parte desse material é importada.

A fabricação desses produtos beneficia as empresas usuárias que pagam preços menores que os importados.

Para desenvolver o projeto Laboratório de Metrologia Química, a Quimlab recebe finan ciamento da FAPESP, dentro do Programa de Inovação Tecnológica em Pequenas Empresas (PIPE), desde 1997. São R$ 71,7 mil e mais US$ 149,8 mil que a empresa deve receber até março de 2001. Embora com tempo para encerrar o projeto, o laboratório está praticamente pronto e com uma ampla lista de clientes.

O químico e proprietário da empresa, Nilton Pereira Alves, relaciona alguns clientes como Alcan Alumínio, Petrobrás, Henkel, Texaco, Tintas Renner, Crylor e Leiner Davis Gelatin. São 30 empresas da região de São José dos Campos que compram padrões químicos da Quimlab e recebem consultaria no desenvolvimento de materiais específicos para cada uma delas.

O gerente técnico da Crylor, Elson Garcia, compra da Quimlab os padrões mais convencionais, como os de pH e de condutividade, e contratou a empresa para ajudar no desenvolvimento de novos equipamentos.

Outra empresa, a Leiner Davis Gelatin, produtora de gelatina utilizada como ingrediente na indústria alimentícia, compra da Quimlab soluções-padrão para calibração de equipamentos que medem o pH de seus produtos. ''A Leiner possui ISO 9001 e, quando Padrão convencional -

passamos por auditorias para manutenção dessa certificação, um dos itens verificados pode ser o certificado da solução-padrão': explica Eduardo Aparecido Stephano, assistente de pesquisa e desenvolvimento da empresa.

O próximo passo da Quimlab é ter o Laboratório de Metrologia Química reconhecido e credenciado pelo Instituto Nacional de Metrologia, Normalização e Qualidade Industrial (Inmetro). A empresa de certa forma sai na frente. "Estamos pedindo o credenciamento pela Rede Brasileira de Laboratórios de Ensaios do Inmetro - por meio da norma internacional ISO Guia 25- porque a instituição ainda não tem normas específicas para nos certificar como produtores de materiais de referência", diz Alves.

A Quimlab foi criada em 1997, depois que Alves desligou-se da Kodak Brasileira, onde trabalhou durante 11 anos no desenvolvimento de padrões. Mestre em Química Inorgânica, ele viu a oportunidade de não sair de sua área de atuação, ao abrir uma empresa própria com as facilidades de infra-estrutura oferecidas pela incubadora. Como estratégia técnica, a empresa garantiu a qualidade das soluções-padrão ao Conceito mundial -

Fabricar soluções-padrão para o mercado brasileiro evita que as indústrias químicas instaladas aqui importem esses produtos

comparar as substâncias fabricadas por ela com os materiais de referência do National Institute of Standards and Technology (Nist), uma espécie de Inmetro dos Estados Unidos, que atua nessa área desde 1905 e hoje é o laboratório mais conceituado no mundo na área de metrologia química.

A outra área de atuação da Quimlab é a consultaria para desenvolver materiais de referência específicos, utilizados apenas por uma determinada indústria. É o caso, por exemplo, da produção de fibras sintéticas. As indústrias têm uma fórmula para esse produto que confere à fibra propriedades como maciez e capacidade de receber corantes. Para calibrar o equipamento que rotineiramente analisa as amostras e verifica os componentes da fórmula na proporção ideal, a indústria precisa de um material de referência.

Nesse caso, pode ser um disco de fibra, produzido em escala de laboratório de acordo com a patente industrial. É uma fibra perfeita, que ajusta o aparelho na medida certa e serve de comparação para a produção do dia-a-dia.

A Crylor, por exemplo, fabrica 1200 t/mês de uma fibra sintética chamada de poliacrilonitrila, feita com matéria-prima derivada do petróleo.

"Chamamos a Quimlab para calibrar

os aparelhos que medem o teor de acetato de polivinila durante a produção dessa fibra , explica Garcia, da Crylor" Alves esclarece que existem inúmeros materiais de referência utilizados nas mais diversas indústrias químicas.

Para delimitar um pouco o raio de atuação da Quimlab, a empresa dedica-se, basicamente, à fabricação de materiais de referência de íons (por exemplo, pH) e de padrões espectroquímicos. Esses últimos calibram os espectofotômetros, aparelhos que medem quantidades de elementos e compostos químicos nas mais diversas substâncias.

para o desenvolvimento de materiais de referência de pH. O equipamento consiste de um sensor eletroquímico capaz de perceber e quantificar a variação na concentração do íon hidragênio numa solução qualquer. A precisão da análise chega a milésimos de unidade de pH, algo como 0,001 pH. O desenvolvimento dessa célula de hidrogênio segue as normas do Comitê Internacional de Química Pura e Aplicada (lupa c) e, de acordo com Alves, após sua conclusão, os materiais de referência de pH produzidos estarão no mesmo nível de confiabilidade dos materiais do Nist. Um futuro que ajudará a Quimlab a desenvolver novos materiais de referência. • PERFIL: • NILTON PEREIRA ALVES é químico formado pelas Faculdades Oswaldo Cruz, de São Paulo. Fez mestrado em Química Inorgânica no Instituto de Química da USP. Projeto: Laboratório de Metrologia Química Investimento: R$ 71.716,00 e US$ 149.878,00

Conquista de mercado - A Quim-

lab tem sete funcionários, um com doutorado concluído, todos vinculados ao projeto Laboratório de Metrologia Química. Alves acredita que o faturamento atual, de cerca de R$ 18 mil por mês, possa atingir em dois anos cifras de cerca de R$ 300 mil reais mensais. "Estamos na fase de pesquisa e desenvolvimento e, terminado o projeto, teremos a fase de conquista do mercado, com aumento gradativo do faturamento", ele explica.

No momento, a empresa também participa de uma parceria com a Universidade de São Paulo (USP) e a Univap, na construção da primeira célula de hidrogênio da América Latina Alves: de olho na produção de materiais específicos utilizados apenas por uma indústria

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TECNOLOGIA

ENGENHARIA ELÉTRICA

Vigia eletrônico a distância Empresa de São Carlos elabora um sistema inédito de acesso remoto m aparelho capaz de funcionar como um guardião que controla temperatura, pressão, umidade e mau funcionamento de sistemas e equipamentos. Essa é a proposta do Modcon, um controlador eletrônico a distância desenvolvido pela Incon, uma pequena empresa de São Carlos que produz 18 tipos de aparelhos voltados para o controle de processos. São contadores, tacômetros, temporizadores, termostatos microprocessados, codificadores, sensores, transmissores, conversores de sinais, fontes de alimentação e relés.

Da central O novo aparelho usa a linha telefônica comum como via de transmissão de informações discando automaticamente, se preciso, o número do telefone de uma central de supervisão da empresa que o está utilizando, durante as 24 horas do dia. Ele será muito útil para todos os tipos de empresas da área de telefonia, por exemplo, que mantêm estações isoladas de transmissão. O Modcon permite também que se atue a distância nos equipamentos, modificando desde o funcionamento de uma máquina até a temperatura do ar-condicionado por meio de softwares próprios. Mais do que interligar dados, esse aparelho informa o que acontece no ambiente, diminuindo, assim, o drama que ronda a cabeça de quem dirige companhias que operam dia e noite.

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"Imagine uma célula de telefonia fora do ar por incêndio, sabotagem ou um raio. Quantos aparelhos ficarão mudos? E qual o prejuízo disso?", pergunta Paulo Giglio, sócio da Incon junto com Vanberto Nave. "A solução desse problema está cada vez mais no sensoriamento a distância", afirma Durval Makoto Akamatu, professor aposentado na Univer-

mais próximos de Akamatu são os professores Paulo Rogério Politano, chefe do Departamento de Computação da UFSCar, e Orides Morandin Júnior, do mesmo departamento, que resume a importância do trabalho que vem sendo feito: "Pesquisamos no mercado nacional e não encontramos nada parecido com o que é desenvolvido aqui em São Carlos':

Disca de supervisão, controla-se, por telefone e computador, a temperatura de outro ambiente

sidade Federal de São Carlos (UFSCar) e coordenador dos cursos de informática da Fundação Paulista de Tecnologia e Educação de Lins. Ele é o coordenador do projeto Desenvolvimento de um Controlador Microprocessado de Propósito Geral de Baixo Custo com Capacidade de Comunicação de Dados Remota em Rede Multiponto, do Programa Inovação Tecnológica em Pequenas Empresas (PIPE) da FAPESP. Por esse projeto, que deve encerrar-se no início de 2001, a Incon está recebendo R$ 258 mil da Fundação ao longo de três anos.

Ao todo, entre funcionários e proprietários da Incon, além de estudantes da UFSCar que colaboram no projeto, mais de 20 pessoas estão mobilizadas. Dois dos colaboradores

Testes práticos - Até agora foram

realizados diversos testes de campo com bons resultados. "Todos os passos necessários para a efetivação do controlador foram dados", afirma o coordenador. Grandes empresas abriram portas e máquinas para que o engenho saído da Incon fosse testado no dia-a-dia. É o caso da Uniklima, empresa localizada na cidade de Embu, na Grande São Paulo, que fornece equipamentos de ar-condicionado para grandes empresas. "Nós fornecíamos termostato e controladores para a Uniklima e, quando a empresa passou a instalar máquinas de ar-condicionado nas salas dos transmissores das companhias de telecomunicação, surgiu o interesse pelo Modcon", explica Nave.

Hoje, o principal desafio da lncoo é desenvolver protocolos que interliguem os diversos sistemas de acesso que envolvem o funcionamento do Modcon. Um primeiro estudo está sendo iniciado agora em agosto para permitir a conexão do Modcon com a Internet. Tal estudo deverá ser desenvolvido juntamente com alunos de graduação e pós-graduação do Departamento de Computação da UFSCar. Tanto na Incon quanto na universidade a contagem regressiva para interligação do Modcon à ln-

foi "tropicalizar" componentes de máquinas largamente compradas fora do país, tais como temporizadores para tratares compactadores de asfalto.

Para crescer, a Incon foi ampliando seu leque de produtos. Assim, foram lançados controladores de temperatura, contadores digitais, instrumentos para avião e sistemas de controle para incubadoras, além de sensores, dos mais variados modelos, para uso em ambientes diversos, rurais e industriais. Dez anos depois de lançar a Incon no mercado, Nave e Giglio perceberam que

Akamatu, da lncon: diversos testes de campo comprovaram a eficiência do Modcon que deve ganhar, em breve, a interconexão com a Internet

mais de 150 componentes num aparelho que pesa em torno de 350 gramas, fácil de instalar e de monitorar.

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.............................................................. ê ternet está acionada. Para a empresa, essa nova técnica será o incremento que falta para agregar valor a seus produtos, capacitando-a para atender a novos segmentos de mercado, até do exterior. Com isso, Giglio e Nave esperam, com o Modcon, elevar em pelo menos 20% o faturamento da empresa.

Sociedade acadêmica- A Incon ini-

ciou suas atividades em 1987, com o objetivo de substituir alguns produtos eletrônicos importados. Nave e Giglio, então professor e aluno na Escola Técnica de Mococa, juntaram suas economias, cerca de R$ 4 mil, e fundaram a empresa que teve como berço o Centro de Desenvolvimento de Indústrias Nascentes (Cedin) de São Carlos. O empreendimento inicial

sonhar mais alto não era apenas uma necessidade imperiosa trazida pela globalização. Eles perceberam a necessidade de entrar na área de equipamentos para acesso remoto.

Nesse caminho, Nave saiu a campo, associou-se à UFSCar e pediu financiamento à FAPESP. "Tudo o que está sendo feito é fruto do programa PIPE", reforça Nave.

O novo controlador usa uma diminuta placa com um chip-modem, menor mas muito parecida com as que existem nos computadores, responsáveis, por exemplo, pelo acesso à Internet. "Tivemos de desenvolver todo o hardware e o software, além dos protocolos de comunicação", explica Paulo Giglio. O Modcon é um equipamento que potencializa um conjunto de tecnologias já existentes. São

Diferença de custos - O desenvolvimento do produto forçou a Incon a trabalhar sistematicamente em microcomponentes. Por exemplo, utilizando técnicas que permitem uma redução das dimensões desses produtos eletrônicos. Para esse trabalho, foi preciso adquirir uma estação de solda e lentes que ampliam 30 vezes o material a ser gravado nos circuitos integrados.

A Incon tem concorrentes para o novo produto, todos importados, a um custo próximo deUS$ 1,2 mil. E com uma diferença importante.

"Equipamentos de controle existem muitos no mercado, é lógico, mas com as características e para as fina!idades indicadas para o Modcon não existe nada igual no País", comenta Nave. Além disso, os controladores importados precisam de ajustes para funcionar nas condições e sistemas brasileiros. E isso certamente vai torná-los muito mais caros.

Para Nave, além da tecnologia avançada do Modcon, uma outra questão deve garantir o sucesso desse aparelho. Ele deve custar cerca de R$ 300,00. Um preço baixo e atraente para um vigia eletrônico • P ERFIL:

é professor aposentado do Departamento de Computação da UFSCar. Formou-se em Engenharia Civil na Escola de Engenharia de São Carlos da Universidade de São Paulo (USP), onde também fez mestrado.

Doutorou-se em Engenharia de Sistemas e Computação na Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ).

Projeto: Desenvolvimento de um • DURVAL MAKOTO AKAMATU

Controlador Microprocessado de Propósito Geral de Baixo Custo com Capacidade de Comunicação de Dados Remota em Rede Multiponto

Investimento: R$ 258.240,40 PESQUISA FAPESP · JULHO DE 1000 • 51

TECNOLOGIA

MEDICINA

Alternativa para falar melhor Prótese mostra-se eficaz para corrigir malformações labiais reabilitação de pessoas com fissuras e malformações no lábio e no céu da boca já pode ser realizada com próteses especiais. A solução é inédita no país e foi desenvolvida por uma equipe multidisciplinar do Hospital de Reabilitação de Anomalias Craniofaciais (HRAC) da Universidade de São Paulo (USP), mais conhecido como o Centrinho de Bauru.

A nova técnica substitui a cirurgia no tratamento de alguns casos desse que é um dos problemas congênitos mais comuns do mundo. No Brasil, chamada popularmente pelo nome de lábio leporino, essa anomalia atinge uma em cada 750 crianças que nascem, acrescentando 16 novos bebês por dia à população de 240 mil pessoas que têm fissuras labiopalatais.

O lábio leporino seria suficientemente ruim se fosse apenas um problema estético. Mas não é. As fissuras labiopalatais são a principal causa da disfunção velofaríngea, uma situação capaz de prejudicar de tal maneira a fala que a pessoa atingida não consegue comunicar-se normalmente. "Ela pode levar o indivíduo a um desajuste psicológico e até mesmo ao afastamento social': afirma a fonoaudióloga Maria Inês Pego raro-Krook, coordenadora do projeto de pesquisa Tratamento de Pacientes Fissurados de Palato (Congênita ou Adquirida) por Meio de Prótese de Fala, que recebeu financiamento da FAPESP no valor de R$ 12,4 mil.

Normalmente, esse problema é tratado com uma intervenção cirúrgica.

No entanto, os especialistas perceberam, há muito tempo, que um grande número de pacientes fissurados, inclusive

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52 • JULHO DE 2000 • PESQUISA FAPESP

em função de acidentes, não podia ser tratado com cirurgias e, portanto, apresentava indicação para uma prótese de palato. Para identificar essas situações, a equipe do Centrinho realizou o estudo que envolveu 71 pacientes.

A adoção de prótese ajuda as pessoas a superar um sério pro-

Alto nível -

muscular situada entre o nariz e a boca. Sua função é a de controlar a passagem do ar. Nas pessoas com fissuras labiopalatais, a válvula não efetua automaticamente o movimento de abrir ou fechar, por falta de tecido ou por incapacidade de fazer os movimentos adequados. Se a válvula não funciona perfeitamente, a pes-

Maria Inês: na seleção dos pacientes util iza-se o exame dos sons da boca e do nariz

blema de exclusão social. "A angústia de ser incompreendido e de não conseguir se expressar reprime a criatividade e a capacidade de aprender", lembra Maria Inês. Para o sucesso do estudo contou o fato de o Centrinho unir o atendimento de pessoas de todo o país a pesquisas acadêmicas de alto nível, com o objetivo de aprimorar as técnicas de tratamento não só das fissuras labiopalatais, mas de problemas como dismorfias craniofaciais, como são chamadas as malformações da cabeça que também apresentam deficiências auditivas, visuais e de linguagem de modo geral.

Uma das próteses desenvolvidas no Centrinho corrrige a disfunção velofaríngea, que atinge uma válvula

soa, mesmo tendo boa articulação, não consegue emitir os sons da fala de forma natural. Há uma perda de ar pelo nariz durante a fala caracterizando a hipernasalidade, ou voz fanhosa.

Os pesquisadores de Bauru começaram o projeto identificando algumas situações nas quais, pelas indicações existentes, o uso da prótese seria preferível à intervenção cirúrgica tradicional. As situações escolhidas foram: quando as fissuras são tão grandes que não existe tecido suficiente para o reparo cirúrgico, quando não há tecido suficiente para fechar o palato duro, a parte óssea do céu da boca, com tecidos do próprio local ou quando há

Análise acústica -

deficiências neuromusculares no pa59 pacientes, 41, ou 69,49%, apresenlato ou na faringe. taram melhoras significativas quanto à compreensão da fala com o uso da Foram escolhidos 71 pacientes com prótese. Dos restantes, três, ou 5,08%, fissura do palato, congênita ou adquirida depois do nascimento. O princinão apresentaram diferença e 15, ou 25,42%, mostraram uma leve piora. pal instrumento usado na pesquisa foi Quanto à avaliação nasométrica, um equipamento de avaliação acústirealizada com 62 pacientes, houve ca chamado nasômetro. O aparelho melhora em 43 pacientes, ou 69,36%, capta separadamente, por meio de piora em 18, ou 29,03%, e igualdade dois microfones direcionais, separados de condições em um, ou 1,61 o/o. A por uma barra horizontal colocada acima dos lábios, os sons emitidos peavaliação da ressonância da fala, feita lo nariz e pela boca. Os sinais, filtrados em 55 pacientes, mostrou redução da hipernasalidade com o uso da prótee digitalizados por módulos eletrônise em 38, ou 69,09%, nenhuma difecos e processados num computador, indicam o grau de nasalância, ou intensidade da hipernasalidade do paciente.

No final, a pesquisa usou os dados de 59 pacientes. Os outros foram eliminados por estarem resfriados ou porque as gravações apresentaram problemas técnicos. Todos os pacientes leram um texto padronizado, constituído por 73 palavras em oito frases, chamado A História do Urso Preto. Em seguida, o paciente era solicitado a discorrer sobre um fato qualquer, para o registro do que é chamado de sua "fala espontânea".

O uso de prótese obteve a melhora da fala em 69% dos O projeto não ficou aí. rença em seis, ou 10,9%, e um auAlguns dos pacientes com prótese mento ligeiro na hipernasalidade em passaram por programas intensivos 11, ou 20%. de fonoterapia no próprio hospital ou em suas cidades de origem. No final, Acordo com a Flórida - Os resultapassavam por novas gravações e os dos do projeto ampliaram os conheresultados eram confrontados. Isso lecimentos adquiridos pelo Hospital vou a conclusões importantes não só de Reabilitação, que, em 32 anos de com relação à prótese, mas também existência, já atendeu quase 50 mil quanto ao tratamento de fonoterapia pessoas e é considerado centro de exe ao conhecimento das alterações ocorcelência nacional pelo Ministério da ridas no bulbo faríngeo. Ainda como Saúde e centro de referência mundial parte do projeto, alguns pacientes fopela Organização Mundial da Saúde ram filmados com e sem a prótese.

(OMS). Maria Inês, além de professora do Departamento de FonoauMelhora significativa - Os pesquisadiologia da Faculdade de Odontolodores chegaram à conclusão que gia de Bauru da Universidade de São existem realmente situações indiPaulo (USP), é responsável pelo Lacadoras da prótese como o tratamenboratório de Fonética Acústica e pelo to mais indicado para a fissura. Dos

Serviço de Prótese de Palato do Centrinho. Ela dirige também um convênio entre a USP e a Universidade da Flórida, nos Estados Unidos.

Esse projeto de pesquisa foi assinado em 1992 e tem o objetivo de comparar os resultados obtidos na fala e na função da velofaringe em pacientes com fissura unilateral de lábio e palato submetidos à palatoplastia, ou fechamento cirúrgico da fissura palatina por meio de duas técnicas cirúrgicas, a de Von Langenbeck e a de Furlow. O projeto, que começou em fevereiro de 1996, preo vê a participação de 352 o ~ pacientes. o Para fazer a pesquisa, a '"Q, Universidade da Flórida recebeu uma verba de US$ 1 milhão do Instituto Nacional de Saúde dos Estados Unidos. O projeto foi aprovado em 1995, incluindo o repasse de parte do auxílio para o Centrinho, por meio da USP. Não é pouca coisa. "Somos a primeira universidade brasileira a ter um projeto aprovado por esse respeitado e concorrido órgão do governo americano", comen• ta Maria Inês. pacientes

PERFIL: • MARIA INÊS PEGORARO-KROOK tem 38 anos e formou-se em Fonoaudiologia pela Pontifícia Universidade Católica de Campinas, em 1982.

Fez mestrado e doutorado na Universidade Federal de São Paulo (Unifesp) e está concluindo o programa de pós-doutorado no Centro Craniofacial da Universidade da Flórida, nos Estados Unidos. Tem cursos de especialização na Universidade de Copenhague, na Dinamarca, e no Hospital Geral de Malmõ, da Universidade Lund, na Suécia.

Projeto: Tratamento de Pacientes Fissurados de Palato (Congênita ou Adquirida) por Meio de Prótese de Fala Investimento: R$ 12.430,70 PESQUISA FAPESP · JUlllQ DE 2000 • 53

HUMANIDADES

URBANISMO

Zona Leste de São Paulo enfrenta ~. .~ o novo milênio Pesquisa traça origens e destinos da região paulistana arquiteta e urbanista Raquel Rolnik, professora e coordenadora do mestrado de urbanismo da Pontifícia Universidade Católica (PUC) de Campinas, acaba de completar Reestruturação Urbana da Metrópole Paulistana: Análise de Territórios em Transição. Resultado de 10 meses de pesquisa, o trabalho faz uma análise profunda das transformações ocorridas na Zona Leste de São Paulo, neste final de século, e traça o novo perfil econômico e urbano da região. Patrocinado pela FAPESP, o trabalho é fundamental para a consulta de quem se preocupa com o reordenamento territorial urbano de São Paulo.

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Com o auxílio de pesquisa da FAPESP - R$ 40 mil para a ::> aquisição dos equipamentos L - - - - -- " - - - - - - ' " " - - - = - - - - ' - - - - "l' necessários, entre computado- Raquel Rolnik com o mapa res, software e scanners -, uma da cidade: o novo espaçoo urbano verba de R$ 30 mil proveniente do Sesc Belenzinho e do projeto Arte "Nos centramos na Zona Leste para Cidade e em parceria com o Instituto trabalhar em uma escala menor e mais Polis (organização não-governamendetalhada e porque é ali que estão tal que trabalha com políticas urbaacontecendo as principais mudanças." nas e municipais), Raquel coordenou Em mais de 200 páginas, documenuma equipe de cinco pessoas, entre tadas com tabelas, mapas e fotografiestudantes da PUC de Campinas e as aéreas, Raquel radiografou a região pós-graduandos da Faculdade de Arbaseada na observação das indústrias, quitetura e Urbanismo (PAU) da Unicomércio e mercado imobiliário resiversidade de São Paulo (USP), de mardencial. "Cartografamos esse novo esço de 1999 e janeiro deste ano. paço, fizemos cartas temáticas como "Observamos os sinais da transforuma espécie de atlas da Zona Leste." mação econômica e comercial e das Raquel e sua equipe utilizaram os caformas de trabalho, na passagem da dastros do Senai sobre a estrutura inindustrialização de São Paulo para a dustrial de São Paulo, de 1968 e 1993, terceirização e quisemos verificar o e os registras de lançamentos imobiliáimpacto dessas mudanças em lugares rios do município paulista, de 1985 a tomados pela indústria': conta Raquel.

1999, arquivados pela Embraesp.

Igreja Universal baixada do Glicério Estação do Metrô Pedro 11

Praça da Sé Palácio das Indústrias

"Para cada tema que focalizamos, usamos uma base de dados; depois, sobrepusemos as planilhas e cruzamos informações até verificar o que permaneceu e o que já não existe na região." Na etapa final, Raquel também utilizou os resultados da Pesquisa da Atividade Econômica Paulista (Paep ), feita pela Fundação Seade. A urbanista traçou, assim, o novo perfil daquele território formado pelo conjunto de distritos situados a leste do centro histórico e do eixo Tamanduateí.

O resultado final surpreendeu.

"Tomamos um susto porque a conclusão é bem diferente daquela que imaginamos no início: além de a indústria continuar existindo, ela cresceu, embora tenha se modificado", observa ela. "O que mudou foi sua inscrição territorial, antes implantada ao longo das ferrovias, hoje espalhada por toda a cidade."

Outra mudança verificada sobre aquele território é que as grandes indústrias manufatureiras deram lugar às pequenas e médias empresas industriais. "Antes elas empregavam até SOO trabalhadores, hoje não usam a mão-de-obra de mais de 100 pessoas." De acordo com Raquel, isso não se deve às novas máquinas e à tecnologia de ponta, mas sim à terceirização que, hoje, domina a economia da

cidade. "As empresas são prestadoras de serviços para a indústria."

Perfil histórico- Na introdução

de seu trabalho, a urbanista recorre à história para localizar a formação do perfil anterior da Zona Leste. Recorda que no final do século 19, tempos áureos do café, a cidade viveu seu primeiro surto industrial, baseado principalmente na indústria têxtil e alimentícia. "Ocupando as várzeas por onde passavam as ferrovias, constituiu a grande região operária de São Paulo: sua Zona Leste-Sudeste", escreve Raquel. O primeiro dos 114 mapas que a urbanista apresenta mostra a cidade em 1877. Demonstra que, enquanto a colina histórica- ou centro velho - encontrava-se já ocupada e arruada, a várzea inundável do Tamanduateí a leste permanecia despovoada.

"Conforme a cidade cresce e aumenta a concorrência pelo solo urbano, instala-se a segregação no espaço, e nesse ponto inicia-se a história da ocupação das terras de várzea." Em paralelo aos trilhos do bonde e do trem, em um plano horizontal, começaram a surgir os galpões de tijolos, vilas e cortiços, oficinas e vendas, povoados por milhares de trabalhadores que chegavam à cidade, ocupando-a de maneira intensa e rápida.

Por outro lado, as colinas a sul e oeste, secas e ventiladas, eram procuradas pelas elites, para uso residencial.

Surgiram, assim, os Campos Elíseos, primeiro, e Higienópolis, Paulista e Jardins em seguida. "A cidade fortemente dualizada entre as terras altas ricas e qualificadas e as terras baixas pobres e insalubres é uma das dominantes por meio da qual se poderia descrever São Paulo durante todo o século 20", prossegue Raquel.

"A barreira representada pelas ferrovias- a Santos/Jundiaí, ao longo da várzea do Tamanduateí, e a Central do Brasil, ao longo da várzea do Tietê - e pelas indústrias (que até os anos 30 ocuparam todo o território da orla ferroviária em busca de uma situação favorecida do ponto de vista do escoamento da mercadoria), com suas poucas possibilidades de transposição, era a muralha que dividia claramente o território da cidade."

Com base nos mapas que apresenta para comprovar a evolução da ocupação da cidade, Raquel conclui que o poder público atua historicamente no sentido de reforçar a barreira e as diferenças.

A identidade dominante da região Leste foi se constituindo a reboque da industrialização e da habitação operária, consolidando-se em um ponto que a urbanista chama de PESQUISA FAPESP · JUlHO DE 2000 • 55

RHÓDIA divisão química

"Posição Leste": "É a posição das várzeas industriais ferroviárias e proletárias, dos conjuntos habitacionais, das baixadas e sua relação com as áreas de consumo e moradia de alta qualidade do outro lado da cidade." É, também, de acordo com ela, a posição dos investimentos públicos apenas funcionais - e não urbanísticos chegando muito após os lugares terem sido povoados. "É a luta contínua por espaços de vida e cidadania por parte daqueles que fazem da região a sua casa".

As mudanças ocorridas na cidade traçaram o novo perfil da Zona Leste, agora retratado por Raquel. "É de onde se sente com mais contundência a transformação industrial, pelo desaparecimento do emprego, da identidade operária e pela desintegração do próprio espaço urbano anteriormente estruturado pela indústria': escreve. E é, segundo diz, de onde se assiste ao surgimento aleatório de focos de dinamismo econômico e poder de consumo, provocando a concentração do comércio em shopping centers e hipermercados e a verticalização imobiliária da região.

"A verticalização da periferia, com o surgimento de novos edifícios de dois dormitórios e até de quatro dormitórios de alta renda em bairros como Tatuapé, Mooca e Vila Prudente, é um fenômeno residencial intenso", diz.

56 • JULHO OE 2000 • PESQUISA FAPESP

Raquel observa também que o termo "desindustrialização" não se aplica ao atual estágio do parque industrial da capital. "A concentração de empresas de potencial inovador, a exportação de plantas menos dinâmicas e a grande dispersão das pequenas e micro novas indústrias pela cidade indicam que se trata de um amplo processo de reconversão industrial." Em outras palavras, as indústrias de hoje na Zona Leste aboliram as chaminés e o maquinário pesado e foram substituídas por outras mais enxutas. "Houve uma mudança radical da indústria e o emprego industrial sumiu", diz ela. · Ordenamento futuro - A estrutura

urbana que se insinua a partir daí caracteriza-se por dispor de um capital que se comporta de forma menos direcionada do que já foi. "Isso não significa que esteja se produzindo uma cidade melhor ou mais homogênea, já que mesmo megainvestimentos em regiões de urbanização incompleta não repercutem em melhora alguma em seu entorno: sua forma de inserção tem sido de forma a recortar e fragmentar o tecido circundante e, sobretudo, não estabelecer qualquer relação com este': escreve Raquel.

A urbanista conclui que uma intervenção pública no sentido de dirigir o reposicionamento da Zona Leste é fundamental. "Por enquanto,

todo o crescimento urbano da região é pautado pelo mercado. Seu futuro dependerá da política urbana adotada na cidade de São Paulo, onde o mercado lidera e a intervenção do poder público é escassa."

Apesar do trabalho minucioso que a urbanista realizou para analisar a Zona Leste, para ela, sua pesquisa apenas dá uma "pincelada" na nova realidade da região. Assim, ela planeja novo projeto para desenvolver pesquisa detalhada do atual perfil de suas indústrias.

De acordo com as observações que a urbanista fez sobre dados da pesquisa da Paep utilizados em seu trabalho, hoje em São Paulo predominam empresas de alta tecnologia. "É a indústria do software, programas produtivos de qualidade e informatização da gestão, que têm um impacto muito grande e economizam mão-de-obra."

O conteúdo de Reestruturação Urbana da Metrópole Paulistana: Análise de Territórios em Transição, também pode ser encontrado em CD para consulta, posterior distribuição e possível venda.

Raquel utilizou o mesmo método em outra pesquisa patrocinada pela FAPESP, em 1997, sobre o impacto da aplicação de instrumentos urbanísticos em cidades do Estado de São Paulo com mais de 20 mil habitantes.

Em tempo de eleições municipais, o documento pode ser de extrema importância para um projeto de governo sério.

• P ERFIL:

é arquiteta formada pela Faculdade de Arquitetura e Urbanismo (FAU) da USP. Doutorou-se em História Urbana na Universidade de Nova York. Foi diretora de Planejamento do munícipio (1989 a 1992). É coordenadora do mestrado em Urbanismo da PUC de Campinas.

Projeto: Reestruturação Urbana da Metrópole Paulistana: Análise de Territórios em Transição Investimento: R$ 40 mil

• RAQ UEL ROLN IK

HUMANIDADES

ARTES PLÁSTICAS

Corpos femininos vestidos de tintas Estudo analisa como artistas brasileiros pintaram as mulheres

tudo e queria dar a ele um aspecto acadêmico. Então elaborei um projeto que me permitisse pesquisar no Brasil. Propus uma revisão do tema modernista, levando em conta a leitura que vinha sendo dada a certos artistas latino-americanos do período, entre eles alguns brasileiros, como porta-vozes políticos. A minha indagação é sobre o que não aparece. Eu queria verificar no contexto, na inserção social dos artistas, que elabo-

representação da figura da mulher na obra de Candido Portinari sugere a afirmação de um papel feminino preconizado pelos ideais políticos/governamentais. Já em Di Cavalcanti (tomando, por exemplo, o quadro O Mangue, 1926), a mulher surge no papel da prostituta e, portanto, apesar do modernismo, sob o olhar masculino vindo do século anterior. Tarsila do Amaral traz em A Negra ( 1923) a mescla das experiências da vivência na fazenda onde cresceu, a estética cubista e o aspecto de seu compromisso "político". Estas e outras informações pertinentes ao estudo sobre o tratamento dado à representação do corpo feminino pelos artistas modernistas brasileiros instigaram os cinco anos de pesquisas feitas pela professora Giulia Crippa durante o desenvolvimento de sua tese de doutorado Imaginário e Construção da Experiência; as Representações do Corpo Feminino nas Artes Plásticas Brasileiras (1900/1940 ). Mangue, de Di Cavalcanti: mitologia da mulata Desenvolvida com o apoio da FAPESP, sob a orientação do professor ração tinha sido feita sobre a mulher.

Se os dois lados tinham coisas em coNicolau Sevcenko, e concluída em mum e de que forma esses artistas maio de 1999, a tese foi apresentada expressam para o imaginário coletivo em novembro ao Departamento de o masculino e o feminino."

História da Faculdade de Filosofia, Letras e Ciências Humanas da UniImaginário e Construção da Expeversidade de São Paulo (USP). riência ... está dividida em dez capíItaliana, 31 anos, formada em Letulos: Análise do conceito de modertras pela Universidade de Bolonha, nidade através de uma interpretação Giulia, que trabalhava em uma ONG filosófica; Corpos vestidos/Corpos ligada ao movimento feminista de despidos; Oswald e Zola; Pistas para seu país, partiu para esse trabalho em uma leitura de gênero na obra de Tarsila; Espelho, espelho meu, existe 1995. "Eu já tinha interesse nesse es-

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alguém mais bonita do que eu?; Os difíceis percursos de uma expressão; A Natureza da mulher e a mulher na natureza: uma visão européia; Café: o ventre da mulher, origem da vida; O corpo como sucata; e Algumas considerações finais entre epistemologia e metodologia.

A autora valeu-se de farta base de estudos, tanto no que diz respeito à forma como a mulher é apresentada nas artes como na literatura. Para o começar, lembra que a representa·~ ção da mulher no imaginário social o do Ocidente sempre a colocou no âmbito da vida privada, do lar, reforçando as imagens de boa mãe, boa esposa, boa dona de casa e assim por diante. Também não ignora que, a partir do século 20, houve uma mudança no papel social da mulher em várias partes do mundo, que alterou a sua representação nas artes. O que, entretanto, não ocorreu de maneira homogênea, permanecendo a leitura do feminino delimitada pelo discurso médico do final do século anterior.

Como São Paulo é a base irradiadora do modernismo nacional, ganha destaque no texto a cidade que cresce a partir das décadas finais do século 19, graças à expansão da cultura cafeeira, à implantação da estrada de ferro e à chegada de novas levas de imigrantes europeus - que movimenta e dá importância à Hospedaria dos Imigrantes, no bairro do Brás. E também o fato de o Liceu de Artes e Ofícios de São Paulo (fundado em 1883) apontar para uma necessidade de institucionalizar o papel do artista e do artesão num momento de transição técnica (o escultor Victor Brecheret foi "descoberto" por modernistas que visitavam o Palácio das Artes.)

Não passa despercebido o fato de que, em 1914, uma modernista emer-

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gente, Anita Malfatti (1896/1964), expôs suas telas no chique magazine Casa Mappin, construido em frente ao Teatro Municipal. A mostra, instalada ali, aponta muito mais a interesses de consumo que propriamente artísticos. Naquele momento, inspirados mais pelo futurismo italiano que pelo pensamento francês Anita, Oswald de Andrade e Lasar Segall começavam a produzir algo que assinalaria o caminho do modernismo.

Dez anos mais tarde, pinturas de Tarsila do Amaral (1897/1973) como

São Paulo, Estrada de Ferro Central do Brasil (ambas de 1924) e A Gare

(1903/1962). O primeiro, pela constante atenção a "sujeitos femininos" claramente associados à mitologia da mulata. O segundo por ser representativo das temáticas sociais e políticas que, conforme a autora, "especialmente nos anos 30, utilizavam de forma peculiar certa imagem da mulher inextricavelmente ligada à questão público/privado, em relação à construção de uma 'identidade nacional'".

O Mangue, de Di Cavalcanti, com cinco figuras masculinas e cinco femininas, apresenta três planos: no primeiro, uma das três mulheres; no segundo, outras duas (la-

(1925), que trazem em sua elaboração o sistema representativo cu- --:=-.:-- -:--;o- .:=7'1"-::---:::---=-:bista trazido da Europa, indi- ~~ "" ~ cam sintonia com essa nova c: o cidade, epicentro de um movi- gr-W~'-I~Ill~\lf~l~~ menta - a Semana de 22 - que § iria motivar, também em outros ~ g pontos do país, acaloradas dis- c: cussões e propostas estéticas re- ~ o lativas à arte, poesia, arquitetura z~ iii e literatura.

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O pro- ~~ 8 jeto teve como meta a busca dos traços essenciais expressos na construção iconográfica do corpo e da imagem da mulher, visando a identificar nesse percurso as diferenças na linguagem figurativa entre os aspectos da autorepresentação e da representação do desejo masculino. "Em O Café, de Portinari: imagem clássica e politizada da mulher na década de 30 outros termos, tentar individualizar na obra dos artistas os traços deadas por um bêbado, pouco persintomaticamente explorada em de uma diferença sexual como prouma obra localizada no mangue - a ceptível ao primeiro olhar); no terduto do meio social na construção ceiro, outras figuras indistintas nas região úmida, de água parada e acesdas representações", esclarece o texfeições. Conforme análise da pesquiso difícil - e o Mangue, zona de prosto. Para isso, a pesquisadora partiu sadora, o centro real e simbólico do tituição carioca. para um cotejamento com a produEm outra investida - a tela Café quadro está nas três mulheres, cujas ção literária brasileira e estrangeira, (1934), a primeira de Di Cavalcanti linhas de olhares são paralelas, crualém de considerar a produção artísonde surge a mulher sentada -, Giuzando-se do lado externo da tela com tica nas suas relações internacionais. lia lembra que a interpretação do o espectador. O quadro, de claro teor Entre as grandes questões levantadas quadro sempre se deteve sobre a recrítico social, evidencia ao mesmo e observadas estavam a modernizatempo a formação de marco europeu presentação do trabalho humano. O ção e a tecnologização presentes no "esquecimento" para o papel da mudo artista e os ecos revolucinários soBrasil, a construção do "nacional" e a cialistas e influências de peso (Apollher retratada ali lhe pareceu grave, condição feminina da época. uma vez que este é funcional em dois linaire, Picasso, De Chirico, Léger). E Entre os artistas plásticos modertraz à discussão a figura da "mulher níveis: "Primeiro, na construção de nistas estão Emiliano Di Cavalcanti perdida", da "mulher perigosa" (nouma figura solidamente clássica, de (1897/1976) e Candido Portinari vamente a herança do século 19), um pintor capaz de transpor em uma 'Leituras' do feminino -

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linguagem nacional a tradição eurotura que poderia ser definida como péia ( ... ) Portanto, a referência à deu'nacional": conclui a pesquisadora. sa da fertilidade (Ceres) caberia aqui.

Contemporâneo, porém diferente Segundo, o trabalho da mulher seria de todos, é Ismael Nery (1900/1934).

O artista à margem da "turma" moderreconhecido não só como participanista, que se recusa a entrar no debação direta da coleta, mas no que mais sublime era considerado na época, te sobre arte nacional, não apresenta isto é, na própria geração de homens, uma obra que se encaixe no pacote da "oficialidade". Nery traz um outro tiou seja, dos braços e corpos que trapo de discurso pictórico (quando a balham na lavoura': moda sugere um corpo feminino meEntre as mulheres, figuram Tarsinos arredondado), no qual os limites la do Amaral e Anita Malfatti. A primeira tem sua obra comparada com entre o masculino e o feminino são têa de outra pintora, Tamara deLemnues. Em sua obra- até 1927 com forte influência cubista, sendo depois marpicka. Contemporâneas, estudaram cada pelo surrealismo (especialmencom André Lothe, em Paris, e seguite Chagall)- muitas vezes é difícil esram a "formulação estética no sentido da poética derivada do cubismo 'maquinista' de Fernánd Legér", considera Giulia. Finalmente Anita, a artista, conforme artigo de Mário de Andrade, "original e corajosa", cujas obras eram "pesquisas duma exacerbação romântica formidável, em que poucos puderam perceber o enorme temperamento apaixonado, dramático ..." A ela é dirigida a pergunta: "Mas o que realmente aconteceu à pintora após os ataques ferozes de Monteiro Loba- Tropical, de Anita Malfatti: olhar "desviante" da figura to?" Após o que cita a mexicana Frida Kahlo (que, como Anita, tabelecer o gênero. Tomando o quadro tinha um defeito físico), que fez de Duas Figuras (1925), a autora afirma: seu corpo devastado um emblema fí"... impossível definir o gênero, atrasico/metafísico da própria pintura. vés das características narrativas das Anita é estudada por meio do figuras. Se na figura da frente os traços quadro Tropical (1916), no qual foe as roupas são femininas, o cabelo curram feitos alguns "recortes", como o to é o mesmo que aparece nos auto-reolhar desviante da figura feminina tratos. A outra figura ( ... ) tem cabelos (lição do expressionismo alemão) e o longos mas não é dado saber se tratacesto de fruta, sugerindo a natureza se de um homem ou uma mulher': morta como tema privilegiado na O estudo da arte é precedido por produção artística e um sistema souma análise da atuação de escritores. bre o qual é possível refletir levando Machado de Assis, José de Alencar e em conta as questões nacionalistas da Francisco Ferraz de Macedo estão preépoca. "A tela Tropical é um produto sentes em fragmentos de textos que da fase mais rica da artista, quando, apontam uma "leitura" da figura da ainda fresca sua influência alemã, mulher marcada pela moral segundo tenta procurar um caminho que pera qual "o corpo feminino é perigoso mita uma fusão da experiência no exvestido porque esconde suas verdadeiterior e, contemporaneamente, uma ras formas, e despido porque revela o busca mais abrangente de uma pinque realmente é':

Chegando aos modernistas, temos nomes como Menotti Del Picchia, e sua Salomé (livro iniciado em 1926 e só completado em 1939).Aqui é a mulher "alegoria': o fascínio da mulher com "M" maiúsculo, como escreviam literatos de finde siecle. Oswald de Andrade, com sua personagem Alma, a prostituta de luxo comparada à Nana, de Zola. Mário de Andrade com Amar, Verbo Intransitivo (1923/1924) e a ousadia de sua Elza, a friiulein, a prostituta/educadora, limpa, alemã e que remete à teoria da eugenia, antecipando o que viria com o nazismo.

"Nas primeiras décadas do século, dos anos 30 em diante, temos um momento de modernidade, o mundo procura uma nova ordem. Na Europa surgem o fascismo, o nazismo. O Brasil e os artistas brasileiros - estamos no governo Getúlio Vargas -, portanto, estão colocados dentro desse contexto do mundo ocidental. Veja Portinari, por exemplo, ele faz uma pintura oficial para Vargas e em sua obra a mulher tem uma tarefa clara. Os artistas falam a linguagem do seu público para serem reconhecidos mas, ao mesmo tempo, colocam um indício do seu tempo, isso é inevitável", diz Giulia. Assim, Imagi-

nário e Construção da Experiência ... "acrescenta mais um tijolinho em uma grande construção, para que se possa fazer novas associações, verificar se os aspectos tratados são satisfatórios e procurar novos caminhos de pesquisa.

• PERFIL:

• GIULIA CRIPPA é graduada em Letras Modernas pela Universidade de Bolonha e doutora em História Social pela Faculdade de Filosofia, Letras e Ciências Humanas da USP. Projeto: Imáginario e Construção da

Experiência; as Representações do Corpo Feminino nas Artes Plásticas Brasileiras PESQUISA FAPESP · JULHO OE 1000 • 59

OSCAR CESAROTTO

Uma aventura do espírito O tratamento psicanalítico não é apenas um processo terapêutico m Porque a psicanálise?, último livro de Elisabeth Roudinesco, o "homem trágico" descrito por Freud é contraposto ao "homem comportamental" definido pelo discurso da ciência, mesmo que esta última nada queira saber do inconsciente. Doravante, fica previsto que o século 21 será o palco onde ambas concepções irão se confrontar para dirimir o mal-estar da civilização.

Enquanto isso, um tratamento psicanalítico nunca seria apenas um processo terapêutico; antes, talvez, mereceria ser valorizado como uma verdadeira aventura do espírito. Nesta perspectiva, qualquer paciente enfrenta um percurso incerto que só quando concluído a contento oferece a evidência de quanto teria valido a pena. Para poder chegar a ser de um jeito como -até então- nunca foi na vida, precisará passar por provas e provações, frustrações, lutos e elaborações.

Como um herói destemido - apesar das angústias, inibições e sintomas - terá de arcar com seus medos e quereres, suas ansiedades e volúpias; enfim, lidar com seus fantasmas e se sair bem na empreitada.

Nada garante, a priori, um futuro promissor. O passado, entretanto, sobredetermina, e seus efeitos no presente parecem ter a força e o peso de um karma. Com maior precisão, digamos que a trama estrutural da própria história, subordinada ao desejo do Outro, faz do sujeito uma marionete do destino, cobrando um alto preço pela sua liberdade, tanto existencial quanto desiderativa. Exatamente disto uma análise seria capaz de curá-lo, para permitir-lhe a possibilidade - ainda que difícil- de ser feliz.

Neste sentido, todo analisante é um Édipo, um Hamlet, um Romeu, ou algum personagem de Nelson Rodrigues. E se fosse mulher, poderia ser uma Ofélia, uma Antígona, uma Julieta, ou uma "bonitinha mas ordinária". Pois viver é sempre

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um risco, um drama, uma comédia, e também uma tragédia, entanto sina inevitável.

Portanto o trágico, considerado de forma ampla, não se restringe a um mero gênero teatral, na medida em que aponta a uma dimensão essencial da condição humana. E, pelas razões acima expostas, acaba por constituir um parâmetro capital da experiência analítica.

Neste particular, o excelente livro de Mauro Meiches, A Travessia do Trágico em Análise (Casa do Psicólogo Livraria e Editora/FAPESP), oferece uma contribuição relevante, aludindo simultaneamente à psicanálise em intenção e em extensão. Assim como o trágico diz respeito ao âmbito do teatro, lido desde a teoria freudiana, sua presença na prática fica explicitada nos momentos considerados cruciais das análises, ao se atingirem certas questões irredutíveis. São estes os rochedos que devem ser transpostos, contor. nados e superados, num processo constante, ao longo de anos. Daí a idéia de travessia: um périplo não linear, cuja meta previamente inexiste, sendo construída no trajeto, e onde o happy end - para além da catarse - conduz a uma posição subjetiva inédita.

A vivência trágica na clínica concerne, embora de forma diferente, não só ao paciente, como também ao analista. O primeiro, colocando em palavras seus afetos, faz do seu discurso uma verdade inaudita e, dependendo de como é escutado, recupera para si a dimensão antes desconhecida do seu fado. O segundo, ciente de tal responsabilidade, sabe que suas palavras, na interpretação, terão sempre conseqüências. Como Lacan dizia, o horror do próprio ato não lhe é alheio.

OscAR CESAROTTO - Psicanalista. Doutor em Comunicação e Semiótica pela PUC-SP.

LANÇAMENTOS

REVISTAS Novos Estudos

Ciência na Periferia O livro de Marcelo Burgos (um lançamento da Editora UFJF) disseca o longo processo de construção do LNLS. O estudo também traça um painel extenso da evolução das ciências físicas [iência na periferia: a luz sínrrotron brasileira no país, desde a implantação intermitente da matéria nos tempos da República Velha até a implementação do portentoso laboratório síncrotron no Brasil, passando pela delicada questão nuclear e as tentativas de criação do organismo científico durante o regime militar. Burgos deixa claro as dificuldades enfrentadas pelos cientistas para a criação do Projeto Síncrotron em um país que carece de tradição científica.

A revista mensal do CEBRAP chega ao no 56 (referente a abril de 2000), com 208 páginas (R$ 20,00), no momento em que o Centro Brasileiro =-~-~--·--

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de Análise e Planejamento chega

aos seus 30 anos de existência. ~§§::.~~ O dossiê desta edição traz "Leituras de Gilberto Freyre", uma homenagem ao centenário do autor de Casa Grande e Senzala, com textos de Fernand Braudel, Frank Tannenbaum, entre outros. Franco Montoro tem a sua trajetória política relembrada por Eduardo Muylaert e Paulo Sérgio Pinheiro. E José Nun analisa o futuro do trabalho sob a perspectiva da "massa marginal", a população à margem do capitalismo contemporâneo. "':::""'...==:=-'~".::::::-=---

Médicos e Clientela O subtítulo do livro de Marina Cardoso (lançamento da editora da Universidade Federal de São Carlos, UFSCar, com apoio da FAPESP), Da Assistência Psiquiátrica à Comunidade, esclarece a intenção da autora: mostrar como se verificam as mudanças no atendimento clínico a partir da inclusão da assistência psiquiátrica na prática médica local. Não sem razão, a obra inicia-se, inusitadamente, com o relato de um dia de consulta numa pequena cidade do Vale do Jequitinhonha.

O estudo de Marina Cardoso explicita a evolução do sistema, daquele primórdio (um bom recurso estilístico) até hoje, passados 12 anos.

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Editado pelo Centro de Lógica, Epistemologia e História da Ciência da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp), a revista chega ao volume 8 trazendo [5 artigos sobre Naturalismo Epistemológico.

Entre os estudi?sos que tratam da matéria: Paulo Abrantes com "Naturalismo Epistemológico: Apresentação"; Philip Kitcher em "O Retorno dos Naturalistas"; Alvin Goldman discutindo "Epistemologia Naturalista e Confiabilismo"; e L. Bonjour, "Contra a Epistemologia Naturalizada" Naoo.Iismo~

Revista Brasileira de Geociências

Retroviroses Humanas Reunindo uma equipe de profissionais, coordenados pelo dr. Ricardo Veronesi, da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Retroviroses Humanas: Doenças Associadas ao HTVL - Etiologia, Patogenia, Patologia Clínica, Tratamento e Prevenção é um estudo inédito, pelo seu porte, no Brasil. São pesquisas sobre os retrovírus HTVL isolados no país, sua epidemiologia e quadro clínico. O estudo analisa a incidência do retrovírus em bancos de sangue, na população indígena e examina as suas origens na América do Sul.

Cadernos de História e Filosofia da Ciência

IRliE'W~i~ ~!Fil~~o .r~o!Fil~

Este é o volume 29, número 3, de setembro de 1999, do órgão da Sociedade Brasileira de Geologia (com financiamento do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, o CNPq). Neste número: "O Diamante na Bacia do Rio Santa Rosa", de Paulo C. Soares; "Classificação de Recursos Minerais usando a Variância de Interpolação", de Rita Conde; ''América do Sul: Quatro Fusões, Quatro Fissões e O Processo Acrescionário Andino", de Benjamim Bley de Brito Neves; entre outros.

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Table 3. Putative identification of Xyfella fastidiosa genes. Gene numbers correspond to those in Fig. 1. Percentages represent per cent identities relative to the most relevant data base hit. Conserved hypotheticals and per cent identities of genes with frameshift/stop codon in trame are not shown.

INTERMEDIARY METABDLISM/ DEGRADATION/Deg"dation of small molecules

XF0187 sulfite synthesis pathwayprotein (cysO/amtA)

XF2395 acetylxylan esterase (axeAJ XF1250 arginine deaminase{rocf)

34% 45%

INTERMEDIARY METABOLISM/ENERGY METABOLISM. CARBON/Aerobic respiration

37% 71% 41% 35%

54%

XF0347 0-lactate dehydrogenase (dld1) XF1802 glycerol-3-phosphate dehydrogenase(gpsA) XF2266 glycerol-3-phosphate dehydrogenase lglpO) XF0310 NADH-ubi quinone oxidoredu ctase.

N001 subunit (nuoF) XF0314 NADH-ubiquinone oxidoreductase.

N0010 subunit(nuoJ) XF0315 NADH-ubiquinone oxidoreductase.

N0011 subunit(nuoK) XF0316 NADH-ubiquinone oxidoreductase.

N0012 subunit{nuol) XF0317 NAOH-ubiquinone oxidoreductase.

N0013 subunit (nuoM) XF0318 NADH-ubiquinone oxidoreductase.'

N0014 subunit(nuoN) XF0309 NAOH-ubiquinone oxidoreductase.

N002 subuOII(nuoE) XF0311 NAOH-ubiquinone oxidoreductase.

N003 subunit {nuoG) XF0308 NAOH-ubiquinone oxidoreductase.

N004 subunit (nuoD) XF0307 NAOH-ubiquinone oxidoreductase.

N005 subuni t {nuoC) XF0306 NADH-ub iquinone oxidoreductase.

N006 subuni t (nuo8) XF0305 NADH-ubiquinone oxidoreductase.

N007 subunit [nuoA) XF0312 NADH-ubiquinone oxidoreductase.

NOOB subunit (nuoH) XFD313 NAOH-ubiquinone oxidoreductase.

N009 subunit{nuol)

47% 45%

CAABON/Anaerobic respiration and fermentation

XF1472 benzene 1.2-dioxygenase. ferredoxin' protein[bedBl XF0840 beta-galactosidase (bga) XF0439 beta-glucosidase (bgiXI XF0846 beta-mannosidase precursor XF 1234 ca rboxyphosphonoeno lpyruvate phosphonomutase (prpB) XF2210 dioxygenase XF1743 esterase(est) XF1610 fructokinase XF1740 glucose dehydrogenase 8 (ylil) XF1064 glucose kinase{glk) XF1460 glucose kinase{glk) XF1965 haloalkane dehalogenase (dhaA) XF2677 l·ascorbate oxidase {aao) XF1253 hpase (lipP) XF0781 lipase/esterase{estA) XF1825 NAO(P)H steroid dehydrogenase (cdh) XF1201 phosphoglycolate phosphatase (yfbT) XF2470 phosphoglycolate phosphatase (cbbZC) XF2259 polyvinylalcohol dehydrogenase XF0366 ribokinase{rbsK) XF0379 rubredoxin{rubA) XF1819 threonine dehydratase catabolic (tdcB) XF11B1 triacylglycerollipase precursor {lip) XF0610 UDP-glucose 4-epimerase {galE) XF2432 UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase (gta8)

62% 4B% 46% 36% 44% 41% 35% 30% 29% 46% 25% 35% 35% 37% 22% 38% 54% 39% 56% 27% 82%

INTERMEOIARY METABOLISM/CENTRALINTERMEOIARY METABOLISM/Amino sugars XF0141 glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase(glmS) XF1464 glucosamine--fructose-6phosphateaminotransferase XF2355 N-acetyl-beta-glucosaminidase (exo) XF1465 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase (nagA)

39%

INTERMEOIARY METABOLISM/CENTRALINTERMEDIARY METABOLISM/Emner-Oouderoff XFI 061 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase (eda/hga/kdgA) XF1062 6-phosphogluconate dehydratase (edd)

41% 58%

INTERMEOIARY METABOLISM/CENTRALINTERMEDIARY METABOLISM/G iuconeogenesis XF0977 ma late oxidoreductase (mae8) XF1259 phosphoenolpyruvate synthase (ppsA/pps)

57% 64%

INTERMEDIARY METABOLISM/CENTRALINTERMEOIARY METABOLISM/Non-oxidative branch, pentose pathway XF0208 0-ribulose-5-phosphate 3-epimerase(rpe/dod) XF2015 ribose-5-phosphate isomerase A {rpiA) XF1936 transketolase 1 !tktNtkt)

76% 57% 63%

INTERMEDIARY METABOLISM/CENTRALINTERMEOIARY META80USM/Nucleotide interconversions XF1288 CTP synthetase {pyrG) XF1058 uridylate kinase (pyrH)

65% 54%

INTERMEDIARY METABOLISM/CENTRALINTERMEOIARY META80LISM/Phosphorus compounds XF0657 XF0904 XF2590 XF2591

alkat ine phosphatase{phoA) ATP-binding protein (ybeZ) exopolyphosphatase(ppx) polyphosphate kinase (ppk)

32% 55% 42% 33%

INTERMEDIARY METABOLISM/CENTRALINTERMEOIARY METABOLISM/Pool, multipurpose conversions XF2255 XF1037 XF0880 XF2095 XF2249 XF1889 XF2268 XF0181 XF0183 XF1385 XF2160

XF2171 XF1399 XF0392 XF0913

acetyl coenzyme A synthetase {acs) adenosylhomocysteinase (ahcY) carbonic anhydrase {yadf) carbonic anhydrase deoxyxylulose-5-phosphate synthase (dxs) ferredoxin-NAOP reductase {fpr) glycerol kinase{glpK) glycine cleavage H protein (gcvH) glycine cleavage T protein{gcvT) glycine decarboxylase (gcvP) hydroxyacylglutathione hydrolase (gloB) inorganicpyrophosphatase(ppa) lactoylglutathione lyase {gloA) methionineadenosylt ransferase(metK) tropinone reductase

61% 65% 46% 32% 55% 59% 59% 48% 55% 57% 45% 59% 63% 70% 43%

XF1746 XF2389 XF1136 XF1727 XF1734

XF0609 GDP-mannose 4.6 dehydratase (gmd) XF2279 nucleotidesugarepimerase{wbnF) Xf0260 phosphoglucomutase/ phosphomannomutase{xanA) XF1468 phosphomannomutase (mrsA) XF0259 phosphomannose isomerase-GDPmannose pyrophosphorylase{xanB) XF1606 UDP-glucose dehydrogenase [ugd)

50% 51%

alcohol dehydrogenase {yahK) alcohol dehydrogenase {yahK) NADP-alcohol dehydrogenase NADP-alcohol dehydrogenase {adh) NADP-alcohol dehydrogenase

(sucB)

38% 46% 54% 53% 45% 69% 42% 50%

CAABON/ATP-proton motive force interconversion

38%

XF1149 XF1145 XF1147 XF1 143 XF1 148 XF1 146 XF1 142 XF1 144

58% 63% 87% 53%

81% 78% 56% 42% 56%

31% 63% 52% 79% 6B% 60% 56% 50% 48%

INTERMEDIARY METABOLISM/ENERGY METABOLISM. CARBON/Oxidat.ve branch. pentose pathway

84% 63%

XF1063 6-phosphogluconolactonase {pgl) 35% XF1065 glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase (zwf) 46%

XF0122 XF1182 XF1813 XF1830 XF1843 XF0352 XF21 45 XF1275

XF2691 XF1408 XF1 350 XF2239 XF1407 XF0911

XF1497 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate reductase(cysH) XF150 1 ATPsulfurylase.la rge subunit [nodO) XF1500 ATP sulfurylase. small subun it (cysD) XF1499 NADPH-sullite reductase. flavoprotein subunit(cysJ) XF1 498 NADPH-sulfite reductase. iron -sulfur protein (cysl)

XF0869 dihydrol ipoamide acetyltranferase(pdhB) XF0868 dihydrol ipoamidedehydrogenase(lpdA/Ipd) XF0669 pyruvate dehydrogenase (aceE)

57% 55% 67% 40%

IN TERMEDIARY METABOLISM/ENERGY METABOLISM. CARBON/TCA cycle

52%

XF0292 aconitate hydratase 2{acn8)

ATP synthase. A chain (atp8/unc8/pap0) ATPsynthase.alphachain/atpNuncA) ATPsynthase. 8 chain (atpF/uncF) ATP synthase. beta chain {atpD) ATP synthase. C chain (a tpE/uncE) ATP synthase. delta chain (atpH/uncH) ATP symhase . epsilon chain(atpC) ATPsynthase.gammachain (atpG/uncG/papC)

XF2608 XFOB33 XF1132 XF1 730 XF1752 XF1768 XF0216 XF1354 XF1490 XF1996 XF0061 XF2062 XF1920 XF1094 XF1133 XF1733 XF1455 XF0322 XF0389 XF0450 XF1113 XF1626 XF1848

XF2534

52% 57% 56%

XF2545 XF2578 XF2593

72%

aconitate hydratase l(acnA/acn) ATP:GTP 3'-pyrophosphotranferase (reiA) carbon storage regulator{csrA) cold shock protein{scoF) extragenic .supressor {suhB/ssyA) heat-inducible transcriptional repressor {hrcA) le•A repressor{lexA) lipase modulatm{act) methanol dehydrogenase regulatory protein nitrile hydrataseactivator nitrogen regulatory protein P-11 (glnB) pentaphosphate guanosine-3'· pyrophosphohydrolase(spoT) phospha te regulon transcriptional regula tor(phoUI poly(hydroxyalcanoa te) granule associa ted protein (phaF) ANA polymerase sigma-32 factor (rpoH) ANA polymerase sigma -54 factor (rpoN) ANA polymerase sigma -70 factor (rpoD) ANA polymerase sigma -H factor (algU/algT) sigma-54 modulation protein stringent starvation protein A

lsspA/ssp/pogl XF0912 XF2165 XF0962 XF1749 XF1858 XF2038 XF2228 XF2085 XF1254 XF0767 XF1540 XrDB21 XF2344 XF1463 XF0972

XF2336

INTERMEDIARY METABOUSM/ENERGY METABOLISM.

36%

XF0323 XF0390

XFOB53 two-component system. sensor XF0973 two-component system. sensor XF1625 two-component system. sensor XF1849 two-component system. sensor

protein (phs) 37% protein {flhS) 35%

XF2535 XF2546 XF2577 XF2592

protein {caiS) 34% protein [pi IS) 37% protein [actS) 25% protein [phoA)38%

two-component two-component two-component two-component

system. system. system. system.

sensor sensor sensor sensor

protein {algZ) 40% protein (ntrB) 37%

BIOSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/AMINO ACIOS BIOSYNTHESIS/Giutama te familylnitrogen assimilation XF1 001 XF1000 XF1003 XF0999 XF1005 XF1 004 XF2710

acetylglutama te kinase (a rgB) 30% acetylorni thine deacetylase(argE) 28% argin inosuccinate lyase (asl) 35% argininosuccinate synthase(argG) 36% gamma-glutamyl phosphate reductase (proA) 51% 46% glutamate 5-kinase glutamatesymhase. alpha subunit

lgi1B/aspBI 71% 58%

46% 74% 45% 78% 56% 37% 46% 57%

INTERMEOIARY METABOLISM/REGULATORY FUNCTIONS

84% 55%

CAABON/Pyruvate dehydrogenase

38%

XF1241 XF1316 XF0125 XF2352 XF2476 XF2342

CARBON/Giycolysis

METABOLISM/Sulfur metabolism

69%

60%

INTERMEDIARY METABOLISM/ENERGY METABOLISM.

INTERMEDIARY METABOLISM/CENTRALINTERMEDIARY

70%

56%

XF2460 c-type cytoch rome biogenesis membraneprotein(cyc K) 52% XF2459 c·type cytochrome biogenesis protein (cycJ) 39% XF2462 c·typecytochrome biogenesis protein(cycl) 52% XF0620 c-typecytoch rome biogenesis protein(coppertolerance)(dsbD) 32% XF2461 c-type cytochrome biogenesis protein/thioredo•in (dsbE/ccmG) 39% XF1328 cytochrome 8561 (yod8) 34% XF1360 cytochrome C oxidase assembly factO! (cox0)41% XF1389 cytochrome O ubiQuinol oxidase. subunit I {cyoB) 69% XF1390 cytochrome O ubiQuinot oxidase, subunit ll{cyoA) 56% XF1388 cytochrome O ubiquinol oxidase. subunit III {cyoC) 63% XF1387 cytochrome O ubiquinol oxidase. subunit IV(cyoD) 41% XF0253 electron transfer 1\avoprotein alpha subunit(etfA) 51% XF0254 electron transfer flavoprotein beta subun it(etfB/etiS) 54% XF1298 electron trans fer flavoprotein ubiquinone oxidoreductase (etf-00) 46% XF0557 electron trans fer protein azurin I {azl) 49% XF0983 ferredo~in 56% XF1964 ferredoxin (ykgJ) 47% XF2601 ferredoxin 70% XF0547 ferredoxin ll(ydgM) 54% XF0053 flavohemoprotein {fhp) 40% XF2082 oxidoreductase 31% XF1990 thioredoxin{yneN) 30% XF0909 ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome 8 subunit {petB) 56% XF0910 ubiquinol cytochwme C oxidoreductase, cytochrome Cl subunit (petC) 48% XF0908 ubiquinol cytoch10me C oxidoreductase. iron-sulfursubunit{petA) 52%

XFOB23 XF1893 XF0824 XF0303

53% 58% 30% 49% 75% 62% 57% 54%

INTERMEDIARY METABOLISM/ENERGY METABOLISM. 41%

CAA80N/Eiec tron transpor!

6-phosphofructokinase {pfkA) enolase (enol fruc tose-bisphosphate aldolase glucose-6-phospha te isomerase (pgi) glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase(gapA) phosphoglycerate kinase {pgk) phosphoglyceromutase (gpmNgpml pyruvate kinase type ll(pykA) triosephosphate isomerase {tpiNtpi)

XF1855 fumarate hydratase [fumBJ XF2596 isocítratedehyd rogenase (icd) XF2700 isocitrate dehydrogenase (icd) XF1211 ma latedehydrogenase(mdh) XF0942 malate:quinone oxidoreductase (yojHI XF1550 oxoglu tarate dehydrogenase (odhA) XF1073 succinate dehydrog enase iron-sul fur protein(sdhB) XF1072 succinate dehydrogenase. flavoproteinsubunit(sdhA) XF1070 succinate dehydrogenase. membrane anchor subunit (sdhC) XF1071 succinatedehydrogenase. membrane anchor subunit{sdhD) XF2548 succinyi-CoA synthetase. alpha subunit{sucO) XF2547 succinyi-CoA synthetase. beta subunit {sucC)

61% 58%

43%

INTERMEOIARY METABOUSM/ENERGY METABOLISM.

XF0274 XF 1291 XF0826 XF0232 XF0457

XF1548 dihydrolipoamide dehydrogenase (lpd) XF1549 dihydrolipoamide S-succinyltransferase XF1554 fumarate hydratase {fumC)

INTERMEOIARY METABOLISM/ENERGY METABOLISM.

INTERMEDIARY METABOLISM/CENTRALINTERMEOIARY METABOUSM/Sugar-nucleotide biosynthesis. conversions

XF1535 citrate synthase(gltA)

45%

---% 42% 84% 69% 44% 40% 76% 53% 53% 46% 87% 47% 43% 20% BD% 64% 63% 56% 44% 46%

stringent starvation protein B (sspB) 42% llanscription-related protein(te•) 59% transcriptional regulator {gcvA) 26% 1/anscriptional regulator{opdE) 77% llanscriptional regul~tor{exsB) 49% transcriptional regulator{paiB) 31% transcríptional regulator(algH) 45% transcríptional regulator (AcrR family) 23% !lanscriptional regulator {AraC family) {ara L) 34% transcriptional regulator (ArsR family)(hlyU) 34% transcriptional regula~or (Crp/Fnr family) {clp) 85% transcriptíonal regulator (Fur fami ly)(zurl 38% transcriptional regulato r (Fur fami ly)(fur) B5% transcríptional regulator {lacl family) 32% transcriptional regulato r (luxA/UhpA family)(agmR/glpA) 38% transcriptional regulator (luxA/UhpA family)(gacA) 44% transcriptional regulator (lysA family) {cysB) 39% transcriptional regulator{lysA family){act) 33% llanscriptional regulator /LysA family) {yafC) 35% llanscriptional regulator{lysR family) 80% llanscriptional regulator (lysR family) {ycjZ) 45% transcriptional regulator {MarR family)(prsX) 22% transcriptional regulator{MarR family)(yybAl28% transcriptional regulator {MarR/EmrR family) 26% transcriptional regulator {PbsX family) 35% transcriptional repressor {korB) 28% transcríptional repressor {korC) 69% Trp operon transcriptional rep ressor (trpA) 36% tryptophan repressor binding protein(wrbA) 39% llyptophan repressor binding protein 33% llyptophan repressor binding protein 31% two-component system. hybrid sensor/regu!atory protein 28% two-component system. regulatory proteinUctD) 45% two-component system. regulatory protein{popP/IeuP/phoP) 54% two-component system. regulatory protein{piiH) 50% two-component system. regulatory protein 30% two-component system. regulatory protein(algR) 47% two-component system. regula!Ory protein{glnG/ntrC/glnT) 51% two-component system. regulatory protein{coiR) 51% two-component system. regulatory protein{coiR) 59% two-component system. regulatory proteinlpi iR) 58% two-componen t system. regulato ry proteinlactR) 40% two-componen t system. regulatory protein(phoB) 56% two-component system. sensor protein {tctEJ 31% two-component system. sensor protein {pho0)36%

53%

XF2709 glutamate synthase. beta subunit(gltD/asp8)55% XF1842 glutamine synthetase{glnA) 64% XF1002 N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase 33% XF0998 ornithine carbamoyltransferase {argF) 36% XF2712 pyrroline-5-carboxylate reductase{proC) 49% XF1427 succinylornithine aminotransferase 48% {argM/astC/cstC)

BIOSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/AMINO ACIOS BIOSYNTHESIS/Aspa rtate family, pyruva te family XF0114 2.3.4.5-tetrahydropyridine-2-carboxyla te N-succinylt ransferase (dapD) XF1818 2-isopropylmalate synthase(leuA) XF2375 3-isopropylmalate dehydratase large subunit (leuA) XF2374 3-isopropylmalatedehydratasesmall subunit (leuD) XF2372 3-isopropylmalate dehydrogenase (leuB) XF1121 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase{metF) XF2272 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate·· homocysteine methyltransferase {metEI XF1821 acetolactate synthase isozyme 11. large subunit{ilvG) XF1473 aminotransferase (nifS) XF2396 aminotransferase (aspC) XF0118 asparagine synthase 8 (asnB) XF1371 aspartate-B-semialdehyde dehydrogenase(asd) XF2100 asparty!/asparaginyl beta-hyd roxylase (aspH) XF2443 beta-alanine synthetase XF2225 bilunctional aspartok inase/homoserine dehydrogenase I (thrA/thrA1/thrA2) XF11 16 bilunctional diaminopimelate decarboxylase/aspartatekinase(tysA) XF1999 branched-chain amino acid aminotransferase{ilvE) XF0864 cystathionine gamma -synthase (metB) XF1481 diaminopimelate epimerase (dapF) XF1105 dihydrodipicolinate reductase{dapB) XF0099 dihydroxy-acid dehydratase {i IvO) XF0963 dihydroxydipicolinate synthase (dapA) XF2211 enolase-phosphatase {masA) XF2224 homoserine kinase{thrB) XF0863 homoserine 0-acetylllansferase {met2) XF2465 homoserine 0-acetyltransferase XF1822 ketol-acid reductoisomerase {ilvC) XF0116 succinyl-diaminopimelate desuccinylase{dapE) XF2223 threonine synthase(thrC)

60% 47% 63% 79% 78% 37% 56% 56% 47% 45% 60% 59% 28%

62% 40% 33% 55% 57% 45% 34% 73% 42% 50% 33% 30% 34% 59% 52% 38%

BIOSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/AMINO ACIDS BIOSYNTHES!S/Giyc ine-serine fam ilylsulfur metabolism XF0603 XF0128 XF0831 XF2206 XF2326 XF0946

cystathionine beta-synthase (cysB) cysteine syn thase cysteine synthase{cysK) 0-3-phosphoglycerate dehydrogenase (ser A) phosphoserine aminotransferase {serC) serine hydroxymethyftransferase (glyA)

31% 27% 51% 62%

49% 71%

BIOSYNTHESIS OF SMALL MOLECULES/AMINO ACIDS BIOSYNTHESIS/Aromatic amino acid family XF1334 3-dehydroquinate synthase {aroS) 47% XF2324 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase(aroE) 46% XF0212 anthranilate phosphoribosyltransferase {trp0)48% XF0210 anthranilatesynthasecomponent I (trpE) 57% XF0674 anthranilate synthasecomponent I (trpE) 36% XF1914 anthranilate synthasecomponent I (trpE) 37% 67% XF0211 anthranilate synthasecomponent 11 (trpG) XF1915 anthranilate synthasecomponent 11 (trpG) 43% XF0036 aromatic-amino-acid aminotranferase {tyrB) 55% XF0047 catabolic dehyd roquinase (aroO) 65% XF1141 chorismatemutase 25% XF2338 chorismatemutase 29% XF1369 chorismate synthase{aroC) 62% XF0213 indole-3-glycerol phosphate synthase (trpCl 63% XF1374 N-{5'-phosphoribosyl) anthranilate isomerase (trpF) 43% XF2325 P-protein{aroO/pheA) 75% XF0026 phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate 61% aldolase{aroGI XF0624 shikimate 5-dehydrogenase {aroEI 43% XF1335 shikimate kinase (aroK) 40% XF1376 tryptophan synthase alpha chain {trpA) 46% XF1375 tryptophan synthase beta chain (trpB) 65%

BIOSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/AMINO ACIDS BIOSYNTHESIS/Histidine XF2216 XF2220 XF2214 XF2219 XF2218 XF2217

amidotransferase lhisH) 43% ATP phosphoribosyl transferase (hisG) 43% 61% cyclase lhisF) histidinol dehydrogenase(hisO) 50% histidinol-phosphate aminotransferase (hisC) 42% imidazoleglycerolphosphate dehydratase/histidinol-phosphate phosphatase bifunctional enzyme(hisB) 50%

XF2213 phosphoribosyi·AMP cyclohydrolase/phosphoribosyi-ATP pyrophosphatasebifunct ional enzyme(hisl/hisiE) XF2215 phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamideribotideisomerase(hisA)

810SYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/Molybdopterin 56% 44%

81DSYNTHESIS DF SMALL MDLECULES/NUCLEDTIDES BIOSYNTHESIS/Purine ribonucleotides

81DSYNTHESIS DF SMALL MDLECULES/NUCLEDTIDES BIOSYNTHESIS/Pyrimidine ribonucleotides 52% 68% 68% 48% 30% 51% 51% 41%

81DSYNTHESIS DF SMAll MDLECULES/NUCLEDTIDES Bl OS YN TH ESI S/2 '- Deoxyr ibonuc Ieoti des XF0762 deoxycytidinetriphosphatedeaminase(dcd) 65% XF1441 phosphohydro lase(orfUll 45% XF1196 ribonucleoside-diphosphate reductase alphachain(nrdA) 44% XF1197 ribonucleoside-diphosphate reductase betachain(nrdB) 34% XF1448 thioredoxin reductase(trxB) 70% XF0580 thymidylate kinase 39%

81DSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/NUCLEOTIOES BIOSYNTHESIS/Salvage of nucleosides and nuc leotides XF2089 XF2150 XF0150 XF1831 XF2354

5'-nucleotidase diadenosine tetraphospha tase (apaH) dUTPase(dut/dnaS/sof) formylte trahydrofolate deformy lase (purU) hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase(hpt) XF2599 phosphodiesterase-nucleotide pyrophosphataseprecursor XF2353 purinenucleosidephosphorylase XF2332 thymidylatesynthase(thyA)

42% 44% 59% 47% 27% 39% 45% 70%

810SYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/SUGARS ANO SUGAR NUCLEOTIOES 810SYNTHESIS XF1297 gluconolactonase precursor XF0608 mannosyltransferase (mtfAI

37% 38%

BIDSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/Biotio XF1357 8-amino-7-oxononanoate synthase (bioF) 42% XF0189 adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase(bioA) 47% XF1356 biotin biosynthesis protein (bioH/bioB) 36% XF0064 biotin synthase(bioB) 60% XF2099 biotin synthesis protein (bioC) 36% XF0356 cytochrome P-450 hydroxylase 37% XF0377 cytochrome P450-like enzyme (biol) 37% Xf2477 dethiobiotin synthetase (bioD) 44%

BIDSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/ COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/Folic acid XF0228 2-amino-4-hydroxy-6hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphok inase(foiK) XF1456 2·amino-4 -hydroxy-6hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase(foiK) XF2431 bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahyOrofolate cyclohydrolase (foi O) XF2331 dihydrofolate reductase type III XF0436 dihydroneopterin aldolase (foiBI XF0091 dihydropteroate synthase(foiP) XF1946 folylpolyglutamate synthase/dihydrololate synthase(loiC/dedC) XF1983 GTPcyclohydrolase I (folE)

50%

35%

58% 43% 50% 52% 44% 52%

BIOSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/lipoa te XF1270 lipoate biosynthes is protein B(lipB) XF1269 lipoic acid synthetase (lipA/Iip)

XF1916 coenzyme F390 synthetase XF0466 molybdopterin biosynthesis protein (moeBI XF1545 molybdopterin biosynthesis protein

53% 42%

BIOSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/CDFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/Pantothenate

XF0587 5'-phosphoribosyl-5-aminoimidazole synthetase(purM/purGI 59% XF0585 5'-phosphoribosylglycinamide transformylase(purN) 43% XF0275 adenylate kinase (adk) 47% XF1553 adenylosucc inate lyase(purB) 57% XF0455 adenylosucc inate.s',lllthetase(purAI 59% XF1949 amidophosphoribosyltransferase(purF) 61% XF1975 bifunctiona l purine biosynthesis protein (purH) 59% XF2429 glutamine amidotransferase (guaA) 68% XF1976 glycinamide ribonucleotide synthetase (purO I 64% XF0560 GMP synthase 37% XF1503 guanylatekinase(gmk/spoR) 52% XF2430 inosine-5'-monophosphate dehydrogenase(guaB) 64% XF0458 nucleosidediphosphatekinase(ndk) 68% XF2644 phosphoribosyl pyrophosphate synthetase(prsA/prs) 60% XF2671 phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit(purK) 50% XF2672 phosphoribosylaminoimidazole carboxylase.catalyticsubunit(purE) 66% XF0205 phosphor ibosylaminoimidazolesuccinocarboxamidesynthase(purC) 53% XF1423 phosphoribosylformylglycinamid ine synthetase(purl/purl) 50%

XF2226 aspartatecarbamoyltransferase(pyrBI XF1107 carbamoyl-phosphate synthase largechain(carB/pyrA) XF1106 carbamoyl-phosphate synthase small chain(carA) XF2439 cytidylatekinase(cmkA) XF0988 dihydrooro tase (pyrC) XF2571 dihydroorotatedehydrogenase(pyrO) XF0153 orotate phosphoribosyl transferase (pyrE) XF0034 orotidine5'-phosphatedecarboxylase(pyrF)

BIOSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/Others

55% 60%

XF0229 3·methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase(panB) XF0231 aspartate l·decarboxylase precursor lpanO) XF0230 pantoate--beta-alanine ligase lpanC)

55% 53% 46%

810SYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/Pyridoxme XF0060 pyridoxal phosphate biosynthetíc proteinlpdxJI XF0839 pyridoxal phosphate biosynthétic protein(pdxA) XF1337 pyridoxamine 5'-phosphate oxidase lfprA)

49% 50% 52%

25%

BIOSYNTHESIS OF SMALL MOLECULES/FATTY ACID ANO PHOSPHATIOIC AGI OBIOSYNTHESIS XF1 044 XF2269 XF0173 XF0671 XF0673 XF1970 XF0319 XF0203 XF1467 XF0672 XF0771 XF0572

49% 34% 42% 66% 60% 24% 65%

62% 72% 40%

XF0071

~~

~%

XF1902

64%

L·aspartateoxidase 40% NH3·dependen t NAO synthetase lnadE/adgA)47% nicotinate phosphoribosyltransferase (pncB) 43% nicotinate-mononucleotide pyrophosphorylase(nadC) 54% XF1923 quinolinatesynthetaseAlnadA) 42%

BIOSYNTHESIS OF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS 810SYNTHESIS/Thiamio

810SYNTHESIS OF SMALL MOLECULES/POLYAMINES 810SYNTHESIS

XF1048 1-deoxy-0-xylulose 5-phosphate reductoisomerase(dxr) XF0621 phosphomethylpyrímidine kinase XF0378 thiamin-phosphatepyrophosphorylaselthiE) XF0594 thiamine biosynthesis lipoproteinApbE precursor(apbE) XF0783 thiamine biosynthesisproteinlthiG) XF1888 thiamine biosynthesis proteín lthiC/thiA) XF0956 thiamine-monophospha tekinase(thil)

XF0144 biosyntheticar9ininedecarboxylase(speAI XF1539 S-adenCisyl methionine decarboxylase proenzyme(speO) XF0143 spermidinesynthase(speE)

XF1924 XF1961 XF1097 XF1925

46% 45% 41% 33% 57% 67% 44%

810SYNTHESIS OF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS, CARRIERS BIOSYNTHESIS/Riboflavin XF1748 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase 21% XF0954 6}-d imethyi·B-ribityllumazine synthase (ribH) 45% XF0953 GTPcyclohydrolase 11/3.4-dihydroxy-2-butanone 4-phospha tesynthase(ribA) 52% XF1992 riboflavin biosynthesis protein (r ibA) 35% XF2419 riboflavin biosynthesis protein (r ibF) 43% XF0952 riboflavinsynthasealphachain(r ibE) 45% XF0950 riboflav in-specific deaminase (ribD/r ibG) 51%

810SYNTHESIS OF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS, CARRIERS BIOSYNTHESIS/Thioredoxin, glutaredoxin,glutathione XF0984 XF1428 XF2595 XF2394 XF1956 XF1199 XF2174 XF2698

gamma-glu tamyltranspeptidase (ggt) glutamate-cysteine ligase precursor(gshll glutaredoxin(grxq glutaredoxin-likeprote in glutathione syn thetase (gshB/gsh-11) thioredoxin( trxA) thioredoxin(ybbN) thioredoxin (trxA/tsnC/fipA)

39% 57% 53% 54% 53% 34% 31% 49%

810SYNTHESIS OF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/Menaquinone. ubiquinone XF0835 2·octaprenyl-6·methoxyphenol hydroxylase (ubiH/visB) 34% XF2471 3-demethylubiquinone-93-methyltransferase (ubiG/pufX) 49% XF0661 geranyl transt ransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(ispA) 54% XF0068 hydroxybénzoate octaprenyltransferase (ubiA/cyr) 52% XF1391 octapreny l·diphosphate synthase (ispB/cel) 49% XF1538 ubiquinone biosynthesis protein (coq7) 29% XF1833 ubiquinone biosyn thesis protein(aarF) 43% XF1487 ubiquinone/menaquinonetransferase(ubiE) 58%

810SYNTHESIS OF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/Heme. porphyr in XF0017 coproporphyrinogen III oxidase. aerobic [hemFI XF2306 delta-aminolevulinic acid dehydratase [hemBI XF0566 lerrochelatase(hemH) XF2302 glutamate-1·semialdehyde 2, 1-aminomutase [hemll XF2648 glutamyl·tRNA reductase (hemA) XF1627 hydroxymethylbilane synthase (hemC) XF1797 porphyrin biosynthesis protein (hemY) XF1512 protoporphyrinogenox idase(hemK) XF0832 sirohemesynthase(cysG) XF1332 uroporphyrinogendecarboxylase(hemEI XF1799 uroporphyrinogen-11 1synthase(hemD)

63% 65% 48% BD% 76% 52% 20% 45% 45% 54% 27%

BIOSYNTHESIS OF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/Cobalamio XF1886 phosphoglycerate mutase (pgmA)

32%

810SYNTHESIS OF SMALL MOLECULES/COFACTORS. PROSTHETIC GROUPS. CARRIERS BIOSYNTHESIS/8iopterm

45% 66% 41%

MACROMOLECULE METABOLISM/DNA METABOLISM/Replication XF2680 XF0882 XF1229 XFOOOl XF2552 XF0005 XF2556 XF1103 XF0136 XF1807 XF0204 XF0002 XF0676 XF2178 XF2157 XF0430 XF2025 XF0920 XF1776 XF0149 XF1935 XF2106 XF1383 XF2689 XF0361 XF1127 XF1353 XF1286

ATP-dependent DNA helicase (rep) ATP·dependenthelicase(yoaA) ATP-dependenthelicase chromosomal replication initiator (dnaA) DNA gyrase subunit A (gyrA) DNA gyrase subunit B (gyrB) DNA ligase (ligA/Iig/dnal/pdeC/Iop) DNA polymerase I (poiA/resA) ONA polymerase III holoenzyme chi subunit [hoiCI ONA polymerase III subunit (dnaX/dnaZ/dnaZXI DNA polymerase III, alpha chain [doaE/poiCI ONA polymerase III. beta chain (dnaN) ONA polymerase III. de lta subunit (hoiB) DNA polymerase III, delta subunit (hoiA) DNA polymerase III, epsilon chain (dnaO) DNA pr imase (dnaG/dnaP/parB) DNA primase ltraC) ONA topoisomerase l(topA) ONA topoisomerase II I (topB) DNA/pantothenate metabolism flavopro tein(dfp) glucose inhibited division protein (gidB) glucose inhibited division protein A (gidA) helicase. ATPdependen t (hrpA) primosomal protein N' (priA) rep licative DNA helicase (dnaB/groP/grpA) TidO protein (tidO) topoisomerase IV subunit(parC) topoisomerase IV subunrtB(parE)

43% 43% 43% 53% 57% 60% 46% 52%

chromosome segregation protein (smc) ONA-binding protein (bbh3) DNA-binding protein (fis) histone-like protein(hbs/hbsU) histone-likeprotein single-stranded ONA binding protein (ssb) single-stranded DNA binding protein (ssb) single·s tranded DNA binding protein (ssb) single-stranded DNA binding protein (ssbl single-stranded DNA bind ing protein (ssb)

XF1892 XF0425 XF0423 XF0422 XF1425 XF0743 XF2437 XF1809 XF2343 XF0123 XF1110 XF1483 XF2028

ATP-dependent DNA helicase (recG) ONA helicase ONA repa ir prote in RecO (recO) DNA rephcation and repa ir RecF protein (recF/uvrF) endonuclease V (deoxyinosine 3'endonuclease)(nfi) exodeoxyribonuclease V alpha cha in (recO) exodeoxyribonuclease V beta chain (recB/rorA) exodeoxyribonuclease V gamma cha in (recC) integrase/recombinase (xerD/xprBI integration host factor, alpha subunit (himAI integration host factor, beta subunit (himD) recomb ination protein (recR) recombinat ion protein N (recN) recombination protein RecA (recAI single-stranded ONA exonuclease (recJ) site-specific recombinase (sss/xerC) site-specific recombinase(rin)

63% 37% 34%

XF2598 6-0-methylguanine-ONA methyltransferase (dal/dat1) XF1262 7,8-d ihydro-8-oxoguanine-triphosphatase (mutX) XF1909 A!G-specific adenine glycosylase (mutY /mutB) XFOOSO ONA helicase ll(uvrD/mutU/pdeB/rad/recl)

XF1905 XF1716 XF0045 XF2692

XF1368 XF2297 XF0641 XF1774 XF0924 XF0935 XF1968 XF1804 XF2313 XF2724 XF0297 XF2723 XF2728 XF2742 XF0295

XF2725 XF2739

48% 51% 35% 29% 49% 46% 56% 41% 48% 51% 45% 65% 50% 44% 53% 61% 61% 64%

27% 33% 58% 64% 54% 49% 56% 36% 54% 25%

55% 54% 35% 32% 53% 38% 30% 29% 53% 73% 72% 54% 38% 91% 45% 53% 81%

46% 38% 46% 56%

DNA mismatch repa ir protein Mutl (mutU ONA repair protein (radC) DN/\ repair protein (radA/sms) ONA repa ir system specific for alkylated ONA [alk81 DNA-3-methyladenine glycosidase (mag1) DNA-dama~e-inducible protein (dinD/pcsA) DNA-damage-inducible protein (dinJ) endonuclease III (nthl excinuclease ABC subunit A (uvrA) excinuclease ABC subunit B (uvrB) excinuclease ABC subunit C (uvrC) exodeoxyribonuclease exodeoxyribonuclease I (sbcB/xonA/cpeA) exodeoxyribonuclease III (xthA) exodeoxyribonuclease small subunit (xseBI exodeoxyribonuclease Vlllarge subunit (xseA) formamidopyrimidine DNA glycosylase (mutM/fpg) formamidopyrimidine DNA glycosylase (mutM/fpg) holliday junction bind ing protein, ONA helicase (ruvB) holliday junction bind ing protein, DNA helicase (ruvA) holliday junction reso lvase. endodeoxyribonuclease(ruvC) misma tch repair protein (mutSI transcription-repair coupling factor (mfd) uracii-DNA glycosylase (ung)

42% 41% 61%

28% 35% ---% 57% 67% 70% 83% 50% 43% 43% 46% 39% 41% 51% 51% 69% 42% 52% 54% 49% 55%

MACROMOLECULE METABOLISM/DNA METABOLISM/Restriction, modilication

40%

MACROMOLECULE METABOLISM/DNA METABOLISM/Repair XF0193 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase [ygcMI XF1457 pteridine reductase 1 (ptrl/ltdH) XF2604 pterin-4-alpha-carbinolamine dehydrataselphhB)

XF1904

XF2721

MACROMOLECULE METABOLISM/ONA METABOLISM/Recombination XF0354 XF1381 XF2248 XF0003

XF0170

34%

MACROMOLECULE META80LISM/DNA METABOLISM/Structural ONA binding proteins XF2558 XF0446 XF1998 XF1190 XF1943 XF0482 XF1392 XF1558 XF1644 XF1778

XF1326 XF1806 XF2081 XF0647 XF2426 XF0967 XF2311 XF0164 Xf2022 XF1933 XF0660 XF0755

(3r)-hydroxymyristoyl ACP dehydrase (labZ) 3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase 3-oxoacyi-[ACP] reductase 3-oxoacyi-[ACP] reductase (labG) 3-oxoacyi-[ACP] synthase ll(fabF) 3-oxoacyi-!ACP] synthase III acetoacetyi·CoA redu cta se (phbB) acetyl-coenzyme Acarboxylase carboxyl transferasesubunitalpha(accA) acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferasesubunitbeta(accD/dedB/usg) acyl carrier protein (acpPI acyl carrier protein (acpC) beta-hydroxydecanoyi-ACPdehydratase

XF1639 beta-ketoacyi-[ACP) syn thasell (fabF/fabJ) 34% XF1817 beta-ke toacyi-[ACP] synthase III (fabHI 62% XF0048 biotin carboxyl carrier protein ol ace tyi-CoA carboxilase (accB/fabE) 53% XF0049 biotin carboxylase subunitof acetyl CoA carboxylase (accC/fabG) 76% XF1087 cardiolipinsynthase 33% XF1209 cardiolipinsynthase(cls/nov) 34% XF2716 ketoreducta~e 29% XF0670 malonyl CoA· ACP transacylase (fabO) 51% XF1049 phospha ti date cytidylyltransferase (cdsA/cds)36% XF1365 phosphat idylserinedecarboxylase(psd) 44%

BIOSYNTHESIS DF SMALL MOLECULES/COFACTORS PROSTHETIC GROUPS. CARR IERS BIOSYNTHESIS/Pyridme nucleotides

XF0760 XF0148 XF1378 XF1299

XF0296 XF2722 XF2726 XF2741

adenine-specilicmethylase DNA methylase DNA methyltransferase (sliiM) DNA methyltransferase DNA processing chain A (smf/dprA) methyltransferase methyltransferase(kpniM) site-specific DNA-methyltransferase (sphiM) site-specific DNA-methyltransferase type I restriction-modification system (hsdM) type I restriction-modificationsystem DNA methylase type I restriction-modification system DNA methylase (hsdM) type I restriction-modification system DNA methylase type I restriction·modificationsystem DNA methylase (hsdM) type I restriction-modification system endonuclease type I restriction-modification system endonuclease(hsdR1) type I restriction-modification system endonuclease type I restriction-modificationsystem endonuclease(hsdR) type I restriction-modilicationsystem specificitydeterminant type I restriction -modificationsystem specificityde terminant type I restriction-modificationsystem specificityde terminant(hsdS) type I restriction-modilicationsystem specificityde terminant(hsdS)

46% 40% 31% --·% 37% 37% 33% 39% 41% 25% ·--% 44% 61% 53% ··-% 20% 53% 42% 27% 21% 24% 24%

MACROMOLECULE META80LISM/RNA METABOLISM/Ribosomal proteins XF2438 XF1151 XF1174 XF2631 XF1173 XF1165 XF0238 XF0107 XF1161 XF2560 XF1156 XF2580 XF2421 XF0434 XF1158 XF1175 XF1169 XF2561 XF2630 XF1166 XF1536 XF2636 XF2635 XF2637 XF1537 XF1162 XF1171 XF1159 XF1177 XF1168 XF0110 XF1155 XF0740 XF2424 XF1157 XF1154 XF1163 XF2643 XF2423 XF1206 XF1160 XF1152 XF1170 XF1534 XF1816 XF1207 XF2782 XF0739 XF2440 XF1153 XF1164 XF1167 XF2634 XF2559

30S ribosomal protein Sl (rpsA/ssyF) 30S ribosomal protein S10 (rpsJ) 30S ribosomal protein Sll(rpsK) 30S ribosoma l protein S12(rpsl) 30S ribosomal protein S13(rpsM) 30S ribosoma l protein S14 (rpsN) 30S ribosoma l protein S15 (rpsO/secC) 30S ribosoma l protein S16 (rpsP) 30S ribosomal protein S17 (rpsO) 30S ribosomal protein S18 (rpsRI 30S ribosoma l protein S19 (rpsSI 30S ribosomal protein S2 (rpsB) 30S ribosomal protein S20(rpsT) 30S ribosomal protein S21(rpsU) 30S ribosomal protein S3 (rpsCI 30S ribosomal protein S4 (rpsD) 30S ribosoma l protein S5(rpsE/spc) 30S ribosoma l protein S6 (rpsF) 30S ribosomal protein S7 (rpsG/rps7) 30S ribosomal protein SB (rpsH/rps8) 30S ribosoma l protein S9(rpsl/rps9) 50S ribosomal protein l1 (rp iA/rpl1) 50Sribosoma l protein L10(rpiJ) 50S ribosomal protein L11 (rpiK/reiC) 50S ribosomal protein L13 (rpiM) SOS ribosoma l protein L14 (rpiN) 50S ribosoma l protein L15(rpl0) 50S ribosoma l protein L16(tp1PI 50S ribosoma l protein L17(rpl0) 50S ribosomal protein L18(rp1Rl 50S ribosoma l protein L19(rpiSI 50S ribosoma l protein L2 (rp!B) 50S ribosoma l protein L20 (rpiT) 50S ribosoma l protein L21 (rpiU) 50S ribosoma l protein L22(rpiV) 50S ribosoma l protein L23 (rpiW) SOS ribosomal protern L24 (rpiX) 50S ribosomal protelO L25 (rpiYI 50S ribosoma l protein L27 (rpmA) SOS ribosoma l protein L28 (rpmB) 50S ribosoma l protein L29 (rpmC) 50S ribosoma l protein L3(rpiC/rpl3) 50S ribosomal protein L30 (rpmO) 50S ribosomal prote inl31 (rpmE) 50S ribosomal proteinl32(rpmF) 50S ribosomal protein L33 (rpmG) 50S ribosomal protein L34 (rpmH) 50S ribosomal protein L35 (rpml) 50S ribosomal proteinl36(rpmJ) SOS ribosomal protein L4 (rpiDI 50S ribosomal protein L5 (rp1E/rpl5) 50S ribosomal proteinl6(rpiF) 50S ribosomal proteinl7/L121rpll) 50Sribosomal proteinl9(rpll)

67% 72% 86% 81% 85% 62% 62% 65% 51% 70% 60% 60% 54% 67% 67% 84% 71% 67% 60% 56% 68% 64% 43% 69% 71% 80% 48% 69% 80% 53% 65% 69% 72% 53% 63% 52% 48% 48% 64% 71% 50% 61% 47% 57% 75% 73% 76% 60% 65% 54% 63% 52% 67% 52%

MACROMOLECULE METABOLISM/RNA METABOLISM/Ribosomes- maturation and modification XF0108 XF2607 XF1125 XF0939

XF2201 XF2532 Xf1200 XF0236 XF0441 XF2358 XF1972 XF1985

16S rRNA processing protein (rimM) ribonuclease E (rne/ams/hmpl) ribonuclease G!cafA/rng) ribosomallarge subunit pseudouridine synthase O (rluO/sfhB) ribosomal protein lll methyltransferase (prmA) ribosomal protein S6 modification protein (rimK) ribosomal small subunit pseudouridine synthase(rsuA) ribosomal-binding factor A (rbfA) ribosomal-protein-alanine acetyltrans ferase(riml) ANA methyltransferase (ygcA) tRNA/rRNA methylase (yibK) tRNA/rRNA methyltransferase !yjfH)

36% 43% 53% 54% 46% ---% 42% 35% 38% 38% 57% 50%

XF1959 XF2222 XF2418 XF2176 XF1112 XF2555 XF0927 XF0549 XF0742 XF0741 XF0445 XFD751 XF2781 XF1314 XF2286 XF0736 XF0109 XF1362 XF0090 XF1440 XF1373 XF0237 XF2475 XF0428 XF0169 XF0134

alanyl-tRNA synthetase !alaS/IovB) 56% 40% arginyl-tRNA synthetase {argS) asparaginyl-tRNA synthetase (asnS/tss) 66% aspartyl-tRNA synthetase (aspS) 53% 46% cysteinyl-tANA synthetase {cysS) 54% glutaminyl-tRNA synthetase {ginS) glutamyl-tRNA symhetase (gltX) 54% glycyl-tANA synthetase alpha chain 74% (glyO/glySIAII glycyl-tANA synthetase beta chain 39% (glyS/glySIBII histidyl-tRNA syn thetase (hisS) 36% 54% isoleucyl-tRNA synthetase (ileS/i lvSJ leucyl- tRNA synthetase (teuS) 58% lysyl-tRNA synthetase (lysU) 56% lysyl-tRNA synthetase {yjeA/genX) 47% methmnyl-tRNA formyltransferase (lmt) 56% 54% methionyHRNA synthetase (metG) phenylalanyl-tRNA sinthetase beta chain 42% (pheTI phenylalanyl-tRNA synthetase alpha chain (pheS) 59% prolyl-tRNA synthetase {proS/drpA) 55% 31% ribonuclease O (rnd) ribonuclease P(rnpA) 37% S-adenosylmethionine: tRNA ribosyltransferase-isomerase (queA) 52% seryHANA synthetase (serS) 59% threonyHANA synthetase (thrS} 59% tRNA (guanine-Nl-)-methyltransferase (trm0)51% tANAadenylyltransferase (cca) 52% tANAde lta(2)-isopentenylpyrophosphate 49% transferase (miaA/trpX) tRNA methyltransferase (trmU/asuE) 55% tANA pseudourid ine synthase A (truA/hisT/asuC/IeuK) 52% tRNA pseudouridine synthase B (truB) 42% tRNA/rANA methyltransferase 41% tryptophanyl-tANA synthetase 34% tyrosyl-tRNA synthetase {tyrS) 53% valyl-tRNA synthetase (vaiS) 51%

MACROMOLECULE META80LISM/RNA META80LISM/RNA synthesis. modification, DNA transcription XF0192 XF0252 XF2696 XF0234 XF0227 XF2606 XF1176 XF2633 XF2632 XF1502 XF2638 XF0955 XF2699 XF1108

ATP-dependent ANA helicase (rhiE) ATP4-dependent ANA helicaSe (deaO) ATP-dependent ANA helicase {rhiB/mmrA) N utilization substance protein A {nusA) polynucleotide adenyltransferase (pcnB) pseudouridy!ate synthase (riu C) ANA polymerase alpha subunit (rpoA) ANA polymerase beta subunit (rpoB/groN/nitB/rif/ron) ANA polymerase beta' subunit (rpoC/tabB) ANA polymerase omega subunit (rpoZ) lfanscr iption antitermination factor (nusG) transcription termination factor (nusB/ssyB) !fanscription termination factor Aho {rho/nitA/psuA/rnsC/tsu) transcriptional elongation factor{greA)

52% 55% 52% 56% 48% 48% 87% 67% 71% 43% 60% 49% 72% 62%

MACROMOLECULE METABOLISM/RNA META80LISM/RNA degradatmn XF1257 XF0239 Xf2615 XF2158 XF104\ XF2246 XF1505 XF2146

otigoribonuclease !orn) polynucleotide phosphorylase {pnp) ribonuclease ribonuclease H (rnhA/rnh) ribonuclease Hll (rnhB) ribonuclease III (rnc) ribonuclease PH (rph) ribonuclease T (rnt)

58% 64% 44% 60% 55% 50% 63% 47%

MACROMOLECULE META80LISM/PROTEIN METABOUSM/TranSiation and modification XF1018 XF1436 Xf1834 Xf2629 XF2203 XF2473 XF2579 XF2628 XF2640 XF2553 XF1445 XF0235 XF0737 XF0857 XF2417 XF2298 XF0576 XFOlll XF2649

XF1111 XF0174

arginine-tRNA-protein transferase (atei) disulfide oxidoreductaseldsbA) disulphide isomerase elongation factor GlfusA) elongation factor P{yeiP! elongation factor P{efp) elongation factor Ts {tsf) elongation factor Tu (tufA) elongation factor Tu (tufB) initiation factoreiF-28. atpha subunit-related initiation factor IF-1 (infA) initiation factor IF-2 {iniBI initiation factor IF-J(infC) l·isoaspartate 0-methyltransferase {pcm) lipoprotein signal peptidase{lspA) low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase{stpl) metallopeptidase methionineaminopeptidase(map) peptidechain release factor 1 (prfA/sueB/uar) peptide chain release factor 2(prf8) peptide chain release factor 3(prfC)

59% 49% 38% 43% 32% 25% 60% 36% 37% 55% 35% 51% 34% 58% 40% 39% 54%

25% 38% 30% 70% 39% 63% 50% 82% 82% 50% 73% 49% 60% 47% 45% 40% 37% 60% 61% 66% 62%

XF0616 XF0615 XF1452 XF2233 XF2339 Xf2340 Xf0991 XF0978 XF2341 XF1186

10k0a chaperonin (groES/htpA) 60k0a chaperonin !mopA/groEL) chaperone!loiA) OnaJ protein{dnaJ) OnaJ protein{dnaJ) OnaK protein (dnaK/grpF/groP/seg) DnaK supressor heat shock protein G{htpG) heat shock protein GrpE(grpE) peptidyl-prolyl cis-trans isomerase(tig)

59% 77% 32% 41% 59% 72% 48% 58% 38% 32%

MACROMOLECULE METABOLISM/PROTEIN METABOLISM/Protein degradation XF2260 XF0138 XF1488 XF2009 XF1188 XF1187 XF0381 XF1443 XF1189 XF2704 XF1282 XF0156 XF0015 XF1484 XF1485 XF0452 XF0453 XF0280 XF0435 XF0127 XF1479 XF1944 XF2241 XF0220 XF1510 XF2330 XF0267 XF1026 XF1851 XF1823 XF0816

alanyl dipept idyl peptidase aminopeptidase A/1 (pepA/xerB/carP) aminopeptidase N aminopeptidase P(pepP) ATP-dependent Clp protease ATP binding subunit Clpx (clpX/IopC) ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit(clpP/IopP) ATP-dependent Clp protease subunit (clp8/htpMI ATP-dependent Clp protease subunit (clpA/IopOI ATP-dependent serine proteinase la (lon/capA/deg/muc/lopA) carboxyl-terminal protease {ctpA) carboxypeptidase related protein cysteine protease(cpr6) dipeptidyl-peptidase heat shock protein (hsiV/htpO) heat shock protein (hsiU/htpl) in tegral membrane protease (hf iK/hfiA) integral membrane proteinase(hfiC) leuc ine aminopeptidase (pepA) 0-sialoglycoprotein endopeptidase (gcp) oligopeptidase A (priC/opdA/optAI peptidase(ptrB/tlp) peptidyl-dipeptidase{dcp) periplasmic protease {mucO) prolinedipeptidase(pepO) proline imino-peptidase{pip/xap) proteinase{slpO) serine pmtease (pspB) serine protease !pspB) serine protease tail-specific protease(prc/tsp) zinc p10tease

30% 47% 36% 46% 73% 73%

64% 41% 33% 28% 28% 65% 66% 33% 36% 34% 63% 50% 44% 53% 47% 33% 81% 22% 28% 27% 25% 39% 40%

36% 24% 31%

49% 37%

40% 26% 47% 40% 54% 54% 33% 37% 78% 36% 25% 36% 22% 47% 45% 52% 48% 37% 48% 28% 49%

CELL STRUCTURE/MEM8RANE COMPONENTS/Outer membraneconstituents XF2392 autolytic lysozyme llyc) XFOB47 beta-hexosaminidase precursor (nahAl XF2184 membrane-bound lytic transglycosylase (mltB)

XF0759 XF2646 XF1896 XF1614 XF0368 XF0884 XF1312 XF0792 XF0795 XF2185 XF1309 XF1311 XF0907 XF0797

CELL STRUCTURE/MEM8RANE COMPONENTS/Inn" membrane XF2780 60k0a inner-membrane protein XF1640 ankyrin-like protein(ank2) XF2235 bifunctionat penicillin-binding protein IC precursor (pbpC) XF0082 chaperone protein precursor (ecpO) Xf0851 D-aminoacid dehydrogenase subunit ldadA/dadRI XF2334 diacylglycerol kinase (dgkA) XF0340 disulf ide bond formati on protein B(dsbBI XF2433 epim'erase/dehydratase protein (capO) XF0256 glucose-1-phospha te thymidylyltransferase (rfbAI XF0375 inner membrane protein (yjdB) XF0103 membraneprotein XF0764 membrane protein XF0777 membrane protein {actll-3) XF2230 penicillin-binding protein 6 precursor (dacC) XF0151 phosphomannomutase (algC) XF1183 polysaccharide biosynthetic protein 1vipA/tvi8) XF2333 prolipoproteindiacylglyceryl transferase (lgt/umpAI XF1310 rod shape-determining protein (mreC) XF1313 rod shape-determining protein (mrdB/rodA) XF1979 transmembrane protein lampE) XF1140 UDP·N-acetylglucosamine pyrophosphorylase(glmU)

XF0852 XF0799 XF0855 XF0416 XF1715

61%

MACROMOLECULE METABOLISM/OTHER MACROMOLECULES METABOLISM/Phospholipids XF2310 CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3phosphatidyltransferase{pgsA) XF1031 glycerol-3-phosphate acyltransferase {plsB)

XFOOJJ XF0975 XF0321 XF0028 XF1363

69%

MACROMOLECULE META80LISM/OTHER MACROMOLECULES METABOLISM/Polysaccharides XF2714 alpha-l-fucosidase (fucAl) XF2278 dolichol-phospha te mannosyltransferase (dpml) XF0887 mannosyltransferase (mtfA)

XF1046 XF0384 XF0343 XF0872 XF0873 XF1053 XF1123 XF1739 XF2345 XF1024 XF1811 XF1547

outer membrane antigen (orna) outer membrane hemin receptor (phuR) outer membrane protein (mopB) outer membrane protein {ompW) outer membrane protein outer membrane protein (ompPl) outer membrane protein ou ter membrane protein (ramAl ou ter membrane protein (smpA) outer membrane protein H.B precursor outer membrane protein Slp precursor (slp) peptidoglycan-associated outer membrane lipoproteinprecursor(pcp/lpp) PilE protein (pilEI polyphosphate-selective porin O(oprO) porin O precursor (oprO) pre-pilin like leader sequence (fimT) so luble lytic murein transglycosylase precursor (s!t/sltYl

37% 11% 31% 30% 43% 28% 34% 43% 38% 42% 31% 29% 37% 23% 23% 37% 25%

CELL STRUCTURE/MUREIN SACCULUS. PEPTIDOGLYCAN

MACROMOLECULE METABOLISM/PROTEIN METASOLISM/Chaperones

MACROMOLECULE METABOLISM/RNA METABOUSM/Aminoacyl tRNA synthetases. tRNA modification XF0124 XF0147 Xf2563 XF1856 XF0995 XF1338 XF0822 XF1960

XF1940 peptide methionine sulfoxide reductase {msrA/pms) XF2642 peptidyl tRNA hydrolase {pth) XF0644 peptidyl-prolyl cis.trans isomerase (mip) Xf0652 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (slyD\ XF0838 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (surA) XF1191 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (ppiO) XF1212 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (ppiB/ppi) XF1605 peptidyl-protyl cis-trans isomerase XF0442 phosphatidyltransferase (ptr) XF0926 polypeptide deformylase (def/fms) XF2156 protein phosphatase(yloO) XF1446 protein transferase (aat) XF2585 protein-l-isoaspartate 0-methyltrans ferase (pc m) XF1051 ribosome recycli ng factor(frr) XF2244 signal peptidase I !lepB) XF1437 thiol:disulfide interchange protein(dsbA) XF0353 translation initiation inhibitor

30% 37% 36%

XF0798 XF0276 XF1118 XF0793 XF0794

XF2572 XF1050

45% alanine racemase !a Ir) 0-alanine--0-alanine ligase B (ddiB/ddl) 51% lipoprotein {nlpD/IppB) 39% lipoprotein precursor(vacJ) 36% monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase(mtgA) 50% N-acetylmuramoyl -l-alanine amidase 45% precursor(amiC) outer membrane lipoprotein precursor (loiB/hemMI 29% outer membrane protein P6 precursor 37% (pal/ompP61 penicillin binding protein(pbp4) 39% penicillin-binding protein 1A (mrcA/ponA) 39% penicillin-binding protein 18(ponB) 41% penicillin-binding protein 2(mrdA/pbp2) 38% penicillin-binding protein 3 (hsl/pbp8) 43% phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide· uansferase{mraY/murX) 59% rare lipoprotein A(rlpA) 30% rod shape-determining protein 77% (mreB/envB/rodY) rod shape-determining protein (mreO) 32% soluble lytic murein uansglycosylase 42% precursor(yjbJ) UDP-N-acetylgtucosamine--N-acetylmuramyt{pentapeptide)pyrophosphoryt-undecaprenol 47% (murG) UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase (murC) 53% UOP-N-acetylmuramate-l-alanine ligase 50% (mpll UOP-N-acetylmuramoylalanine--0-glutamate 29% ligase(murO) UOP-N-acetylmuramoylalanyl-0-g lutamate·2.6-diam inopimelateligase(murE) 43% UOP-N-acetylmuramoyla lanyi-O-glutamyl·2,6 diam inopimelate--0-alanyl-0-alanyl 41% ligase(murF/mra) UOP-N-acetylpyruvoylglucosamine 43% reductase{murB) undecaprenyl pyrophosphate synthetase 51% (uppS/<thl

CELL STRUCTURE/SURFACE POLYSACCHARIOES. LIPOPOLYSACCHARIOES, ANO ANT1GENS XF1289 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate 44% aldolase{kdsA) XF0105 3-deoxy-0-manno-octulosonic acid 44% transferase (kdtA/waaA) XF2299 3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase(kdsB) 50% XF1419 acetyltransferase (tpxD/firA/omsA) 26% XF0918 acyi·[ACP)-UDP-N-acetylglucosamine (lpxA) 32% 29% XF1994 beta 1,4 glucosyltransJerase XF0612 dolrchol-phosphate mannosyltransferase (dmt) 24% XF1638 dolichyl-phosphate mannose synthase 34% related protein XF0257 dTOP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase 75% ldbOI XF0258 dTDP-4-keto-l-rhamnose reductase {rfbC) 54% XF0255 dTOP-glucose 4.6-dehydratase {rfbB) 76% XF0611 dTDP-glucose 4-6-dehydratase (rfbB) 63% XF1637 glycosyl transferase{spsO) 29% XF1082 lipid A4'-kinase(lpxK) 38% XF0104 lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase 40% {htrB/waaM) XF1348 lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (htrB/waaM) 26% 45% XF1042 lipid A disaccharide synthase (lpxB/pgsB) XF0879 lipopolysaccharide biosynthesis protein (rfbU)26% XF2434 lipopolysaccharide core biosynthesis protein 37% XF0980 lipopolysaccharide synthesis enzyme (kdtB) 56% XF0778 0-antigen acetylase (oafA) 26% XF1413 polysialic acid capsuleexpression protein 45% (kpsFI XF2154 saccharide biosynthesis regutatory protein 73% (opsXI 43% XF0176 sugar transferase XF1045 UDP-3-0-!R-3-hydroxymyristoy!)-glucosamine 41% N-acyltranslerase (lpxD/fir A/ssc) XF1646 UOP-3-0-(R-3-hydroxymyristoyl)-glucosamine N-acyltransferase(lpxO/firA) 28% XF0486 UOP-3-0-13-hydroxymyristoyl] glucosamine N31% acyltransferase{lpxD) XF0803 UOP-3-0-13-hydroxymyristoyl] Nacetylglucosamine deacetylase {lpxC) 59% XF1415 UOP-N-acetylglucosamine 1carboxyvinyltransferase (murA/murZ) 62% XF1043 UOP-N-acetylglucosamine acyltransferase 44% (lp•AI

CELL STRUCTURE/SURFACE STRUCTURES XF0077 XF0078 XFOOSO XF0369 XF0370 XF0371 XF0372 XF0373 XF0478

fímbria! adhesin precursor (mrkO) fimbrial adhesin precursor (mrkD) fímbria i adhesin precursor (limA/pilA) fimbrial assembly membrane protein (pi iM) fimbrial assembly membrane protein(pi iN) fimbfial assembly membrane prote in (pi lO) fimbrial assembly protein (pi lP) fimbrial assembly protein(piiQ) fimbrial assembly protein {piiYI)

30% 32% 29% 61% 44% 43% 38% 34% 33%

XF2538 XF2539 XF2542 XF0083 XF0487 XF0538 XF0539 XF1791 XF0081

fimbrial assembly protein (piiCl fimbrial protein fimbrial protein fimbrial subunit precursor fimbrillin fimbrillin fimbrillin(fimA) frmbrillin outer membrane usher protein precursor

56% 48% 53% 42% 37% 37% 38% 48%

XF1953 XF1954 XF2544 XF1955 XF0031 Xf0032 XF1224 XF2537 XF0029 XF1632 XF1633 XF0677 XF0479

lf1mDI pilus biogenesis protein (piiJ) pilus biogen"esis protein (pill) pilus biogenesis protein (piiB) pilus protein (piiG) PiiX protein(piiX) PiiYl gene product (piiYl) PiiYl gene product (piiYl) pre-pilin leader peptidase(xpsO) pre-pilin leader sequence (pi IV) twitching motility protein (piiU) twitching motility protein (piiT) type 4 fimbriae assembly protein (piiZ) type IV pilin (pilE)

36% 46% 33% 55% 82% 28% 32% 30% 76% 33% 60% 74% 62% 35%

CEllULAR PROCESSES!TRANSPORT/Amino acids, amines XF0408 XF2730 XF2207 XF2208 XF1891

amino acid transporter {yhdG) amino acid transporter{rhtC) cationic amino acid transporter catronic amino acid transporter di-tripeptide ABC transpor ter membrane protein(yciF) XF0656 glutamate symport protein {gltT) XF1937 proton glutamate symport protein {gltP)

43% 28% 43% 41% 35% 28% 35%

CELLULAR PROCESSES/TRANSPORT/Amons XF0411 ABC transporter nitrate permease (nrtB) XF2141 ABC transporter phosphate binding protein (phoXI XF2142 ABC transporter phosphate permease (pstC/phoWI XF2143 ABC transporter phosphate permease lpstA/phoTI XF1344 ABC transponer sulfate binding protein (sbpl XF1345 ABC transponer sulfate permease {cysU/cysT) XF1346 ABC transpor ter sulfate permease {cysW) XF0412 nitrate ABC transponer ATP-binding protein{nrtO) XF2144 phosphate ABC transpor ter ATP-binding protein (pstB/phOT) XF1347 sulfate ABC transporter ATP-binding protein(cysA)

26% 67% 50% 53% 64% 50% 49% 46% 65% 61%

CELLULAR PROCESSES/TAANSPORT/Carbohydrates, organic acids.alcohols XF2446 XF2447 XF2448 XF0087 XF0976 XF1462 XF1609 XF2267 XF1406 XF0320 XF1402 XF1403 XF1067

ABC transporte r sugar permease ABC transporter sugar permease (lacF) ABC transporter sugar-binding protein (mal E) alpha-ketoglutarate permease symporter (kgtP/wiiAI C4-dicarboxylate transpor! protein (dctA) glucose/galactose transporter (gluP) glucose/galactose transporter (gluP) glycerot uptake facilitator protein(glpf) HPr kinase/phosphatase {ptsK) Mg++/citrate complex transporter {citN/citH) phosphotransferase system enzyme I (phbl) phosphotransferase system HPr enzyme lphbHI sugar ABC transporter ATP-binding protein

40% 37% 24% 64% 66% 31% 48% 39% 36% 60% 40% 52% 53%

CELLULAA PROCESSES/TRANSPORT/Cations XF2328 XF1844 XF0395 XF2140 XF2134 XF2137 XF0932 XF0933 XF1426 XF0900 XF1015 Xf1401 XF1398 Xf2019 XF0324 XF0901 XF1903 Xf2329 XF0599 XF1496 XF0367

ABC transporter sodium permease (natB) ammonium transporter (amtB) bac terioferritin (b!r) cation:proton antiporter(ybal) ferric enterobactin receptor {bfeA) ferric enterobactin receptor (bfeA) ferrous iron transpor! protein ferrous iron transpor! protein B (feoB) ion transporter magnesium and cobalt transpor! protein(corA) manganese transpor! protein (mntH2) Mg++ transporter (mgtE) Na-+/H+ exchange protein Na+:H+ antiporter (yjcE) periplasmiciron-bindingprotein{afuA) polaramino acid transporter (ybeX) potassium uptake protein (kup/trkO) sodium ABC transporter ATP-binding protein (natA) TonB-dependent receptor for iron transport(ybil) TonB-dependent receptor for iron transpor t (yncD) voltage-gated potassium channel beta subunit

27% 57% 61% 57% 22% 22% 47% 52% 48% 33% 64% 26% 24% 42% 24% 46% 48% 47% 47% 23% 50%

CELLULAR PROCESSES/TRANSPORT!Protein. peptide secretion XF2455 heme ABC transporter ATP-binding protein(ccmA) XF2456 heme ABC transporter membrane protein !ccmB) XF2457 heme ABC transporter mE!mbrane protein !ccmC) XF2261 oligopeplide transporter XFOB06 preprotein translocase SecA subunrt {secA/priD/azi/pea) XF1172 preprotein translocase SecY subunrt lsecY/priAI XF2639 preprotein translocase subunit{secE) XF0224 preprotein translocase YajC subunit (yajC) XF2685 protease IV(sppA) XF0225 protein-export membrane protein (secO) XF0226 protein-export membrane protein (secf) XF0304 protein-export membrane protein (secG) Xf1801 protein-export protein (secB) XF0562 sec-independent protein translocase (tatC/mttBl XF0073 signal recognition particle protein(ffh)

41% 50% 48% 40% 60% 55% 33% 36% 40% 44% 38% 43% 43% 47% 63%

XF1913 type V secretory pathway proteín (mttC)

46%

CELLULAR PROCESSES/TRANSPOR! /Othe< XF0875 XF0944 XF1077 XF1081 XF1223 XF1302 XF1409 XF1475 XF1602 XF2133 XF2568 XF2582 XF2617 XF2695 XF1474 XF1476 XF0874 XF2567 XF1604 XF0406 XF0039 XF0589 XF2301 XF12SB XF2251 XF0281 XF0651 XF1728

ABC transpor ter ATP-binding protein (yusC) ABC transporter ATP-binding protein (yjjK) ABC transporter ATP-binding proteín (ycfV) ABC transpor ter ATP-binding protein (msbAl ABC transporter ATP-binding protein {yadG) ABC transporter ATP-binding protein ABC 11anspor1er ATP-binding protein ABC 11anspor1er ATP-binding protein (ynhD) ABC transporter ATP-binding protein ABC transporter ATP-binding protein {yheS) ABC transporter ATP-binding protein (rfbE) ABC transporte r ATP-binding protein ABC transporte r ATP-binding protein {uup) ABC transporter ATP-binding protein (ltsE) ABC transporter membrane protein (ynhC) ABC uansporter membrane protein ABC transporter permease protein ABC transporter permease protein (rfbO) ABC transporter vitamin 812 uptake permease{btuEJ export protein(ygjT) large-conductance mechanosensitive channel(mscl) permease polysaccharide export protein (mrp) small conductance mechanosensitive ion channel {yggB) solute:Na+ symporter{ppa) transportprotein(yuef) transpor! protein{yxaH) transpor! protein

48% 69% 55% 41% 54% 41% 60% 63% 31% 45% 45% 41% 49% 47% 33% 69% 48% 35% 44% 54% 51% 18% 63% 35% 58% 14% 33% 17%

CELLULAR PROCESSES/CELL OIVISION XF0659 XF0286 XF1322 XF0093 XF0094 XF0791 XF0796 XFOBOO XF0801 XFOB02 XF1450 XF1910 XF2557 XF2694 XF1320 XF1657 XF2281 XF2282 XF1785 XF2247 XF1084 XF1321

celt cycle protein{mesJ) cell division inhibitor{suiA) cell division inhibitor {minC) cell division protein {hiiB/ItsH/mrsC/toiZ) cell division protein {ftsJ/mrsF) cell division protein{ltsl) cell divisionproteinUtsW) cell division protein{ltsO) cell division protein{ltsA/divA) cell division protein {ftsZ) cell division protein {ltsK) cell division protein (ltsY) cell division protein (zipA) cell division protein (ltsX/ftsS) cell division topological specificity factor (minEI cell filamentation protein(fic) chromosome partitioning protein chromosome partitioning protein {parA) chromosome partitioning related protein{soj) GTP binding protein (era) partition protein{parA) septum site-determining protein (minO)

48% 38% 43% 49% 17% 51% 31% 68%

41%

MOBILE GENETIC ELEMENTS/PHAGE-RELATEO FUNCTIONS ANO PROPHAGES XFOOB9 host factor·l protein(hfq) XF0719 phage-related baseplate assembly protein 19PVI XF0723 phage-related baseplate aSsembly proteín lgpWI XF0724 phage-related baseplate assembly protein lgpJI XF24BB phage-related baseplate assembly protein igpJI XF2489 phage-related baseplate assembly protein igpWI XF2492 phage-related baseplate assembly protein igpVI XF0727 phage-related contractile ta ii sheath protein{fiR2) XF2485 phage-related contractile ta ii sheath protein{fiR2) XF0728 phage-related contractile ta ii tube protein lfiiR11 XF0683 phage-related DNA polymerase {dpol) XF2525 phage-related DNA polymerase {dpol) XF0513 phage-rela ted endolysin (lycV) XF0631 phage-related integra se (int) XF0678 phage-related integra se (int) XF1642 phage-related integrase{int) XF1718 phage-related integra se (int) XF2288 phage-related integrase(int) XF2530 phage-related integra se (int) XF1564 phage-related lysozyme (lycV) XF1669 phage-related lysozyme (lycV) XF2314 phage-related lysozyme (lycV) XF0713 phage-related portal protein {gp4) XF2498 phage-related portal protein{gp4) XF0485 phage-related protein XF0680 phage-related protein XF0682 phage-related protein XF0684 phage-related protein XF0685 phage-related protein XF0686 phage-related protein XF0704 phage-related protein XF0705 phage-related protein XF0707 phage-related protein XF0710 phage-related protein XF1555 phage-related protein XF1570 phage-related protein XF1573 phage-related protein XF1645 phage-related protein XF1663 phage-related protein XF1675 phage-related pmtein XF1678 phage-related protein XF1763 phage-related protein XF1786 phage-related protein XF1864 phage-related protein XF1869 phage-related protein XFl870 phage-related protein XF1875 phage-related proteín XF1876 phage-related protein

phage-related phage-related phage-related phage-rela ted phage-rela ted phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related phage-related

protein protein protein protein protein proteín protein protein protein protein protein pmtein protein protein protein protein protein protein proteín protein repressor protein (racR) repressor protein (rpcl) repressor protein (CI) ta ii fiber proteín {gp37) ta ii protein (gpl) tail protein (gpT) ta ii protein (gpU) ta ii protein (gpX) ta ii protein (gpO) ta ii pmtein (gpX) ta ii protein (gpU) tail protein (gpl) terminase large subunit (gp2) terminase targe subunit{gp2) termina se large subunit {gp2)

24% 34% 57% 47% 50% 32% 53% 32% 21% 41% 27% 44% 34% 18% 41% 52% 43% 50% 11% 56% 50% 19% 14% 25% 35% 11% 40% 41% 31% 41% 40% 35% 15% 18% 28%

MOBILE GENETIC ELEMENTS/PLASMIO-RELATEO FUNCTIONS 41% 39% 35% 64% 51% 30% 44% 31% 45% 59% 50% 45% 17% 31%

CELLULAR PROCESSES/CHEMOTAXIS ANO MOBILITY XF1952 chemotaxis-related protein kinase (chpA)

XF2127 XF2132 XF2290 XF2291 XF2292 XF2294 XF2295 XF2479 XF2482 XF2484 XF2501 XF2504 XF2505 XF2511 XF2522 XF2523 XF2524 XF2526 XF2527 XF2528 XF0500 XF0696 XF1658 XF1706 XF0725 XF0730 XF0731 XF0732 XF0733 XF2480 XF2481 XF2487 XF0508 XF0711 XF2500

91% 31% 40% 46% 46%

XF2045 XF2046 XF2048 XF2049 XF2050 XF2051 XF2052 XF2053 XF2054 XF2055 XF2056 XF2058.

XF2059 XF2060 XF1759 XF2066 XF2161 XF1061 XF2444 XF1589 XF1590 XF2031 XF2032 XF1574 XF1679 XF1945

conjugal transfer protein{trbN) conjugal transfer protein{trbl) conjugal transfer protein{trbJ) conjugal transfer protein{trbl) conjugal transfer protein {trbH) conjugaltransfer protein!trbG) conjugal transfer protein{trbF) conjugaltransfer protein{trbE) conjugal transfer protein {trbO) conjugal transfe r protein {trbC) conjugal transfer protein{trb8) conjugaltransfer protein(traF) conjugal transfer protein {traE) conjugal transfer protein {traO) conserved plasmid protein conserved plasmid protein (yacB) conserved plasmid protein DNA primase {traC) pheromoneshutdownprotein(traB) plasmid stabilization protein plasmid stabilization protein plasmid stabilization protein (parO) plasmidstabilízationprotein{parE) plasmid-related protein {traN) plasmid-related protein (traN) VirK protein (virK)

76% 45% ---% 53% 45% 65% 49% ---% 68% 51% 69% 59% 73% 43% 35% 35% 30% 44% 31% 50% 61% 81% 75% 34% 34% 35%

MOBILE GENETIC ELEMENTS/TRANSPOSON- ANO INTRONRELATEO FUNCTIONS XF2063 XF1930 XF1775 XF1931 XF2303 XF032S XF0535 XF0326 XF0536

ONA-invertase (rin) resolvase{tnpR) reverse transcriptase transposase(tnpA) transposase (tnpA) transposase OrlA transposase OrlA transposase Or!B transposase OrfB

---% ---% ---% ---% 71% 64% 64% ---% 35%

PATHOGENICITY. VIRULENCE, ANO AOAPTATION/TOXIN PROOUCTION ANO OETOXIFICATION

40% 31% 46% 46% 41% 50% 49% 46% 18% 17% 18% 91% 16% 18% 43% 43% 42% 25% 15% 34% 56% 50% 49% 53% 41% 31% 31% 44% 17% 34% 19% 17% 31% 47% 19% 17% 30% 41% 48% 37% 35% 36% 36%

XF1726 2,5-dichloro-2,S-cyclohexadiene-1,4·diol dehydrogenase{linC) XF0243 acriflavin resistance protein (yerP) XF2386 acriflavin resistance protein (yegN) XF2385 acriflavin resistance protein O{yegN) XF2407 bacteriocin XF0165 beta-lactamase induction signal transducer protein{ampG) XF1611 beta-lactamase-likeprotein(pbp) XF0010 biopolymer transpor! ExbB protein (exbB) XF0011 biopolymer transpor! Exb01 protein{exb01) XF0012 biopolymer transpor! Exb02 protein {exb02) XF2232 catalase/peroxidase (cpeB) XF2083 cation efflux system protein (czcA) XF0262 colicin V precursor (cvaC) XF0263 colicinV precursor (cvaC) XF1948 colicin V production protein (cvpA) XF1220 colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein (cvaB) XF1216 colicinV secretion protein{cvaA) XF2084 component of multidrug efflux system (mexEI XF1341 copper homeostasis protein {cutC) XF0132 copper resistance protein A precursor {copA) XF0133 copper resistance protein B precursor (copBJ XF17"4] d11unorubicin C-13 ketoreductase (dnrU) XF2148 dimethyladenosine transferase (ksgA/rsmA) XF2416 drug tolerance protein (lytB) XF0993 ctrug:proton antiporter (tetVl XF1765 drug:proton antiporter (mmr) XF1029 glutaryi-7-ACA acylase precursor {gaa) XF1890 glutathione perox idase-like protein{gpo) XF1210 glutathione S-transferase (gst) XF0175 hemolysin III protein XF2398 hemolysin secretion protein D {hlyO) XF0668 hemotysin-type calei um binding protein {frpC) XF1011 hemolysin-type calcium binding protein (frpC) XF2759 hemolysin-type calcium binding protein (frpCJ XF1934 Hetl protein (hetl) XF0244 membrane fusion protein (mexC) XF2384 membrane fusion proteín precursor (mtrC) XF2686 multidrug efflux protein{ydhE) XF2094 multídrug-efflux transporter{acrF/envO) XF1732 NAD{P)H·dependent 2-cyclohexen-1-one reductase{ncr) XF1137 NonF-related protein{nonF)

39% 13% 41% 50% 17% 38% 14% 81% 78% 81% 66% 14% 36% 31% 31% 40% 15% 28% 47% 61% 38% 31% 48% 64% 14% 33% 60% 50% 38% 48% 39% 32% 30% 35% 35% 15% 37% 34% 50% 40% 34%

XF1827 organic hydroperoxide resistance protein{ohr) XF2586 ou ter membrane export factor {toiC/mtcB/mukA/refl) XF2550 ou ter membrane hemolysin actívator protein(hecB) XF1532 oxidative stress transcriptional regulator (oxyR) XF1038 peptide synthase XF2276 peptide synthase XF0619 periplasmic divalent cation tolerante protein lcutNcycY/cutA 1) XF1729 phenylacetaldehyde dehydrogenase Xf1131 PmbA protein (pmbA/tldEJ XF2135 polyketide synthase (PKS)(frnE) XF2093 precursor of drug resistance protein (acrA/mtcA/Iir) XF0769 pteridine-dependent deoxygenase {rapK) XF1530 subunit C of alkyl hydroperoxide reductase lahpCI XF1531 subunit F of alkyl hydroperoxide reductase lahpfl XF2614 superoxide dismutase IMN] {sodNsod) XF1921 superoxide dismutase IMN] precursor lsodA/sodMI XF2778 thiophene and furan oxida tion protein ithdF/,.mEI XF189B TolA protein {tolA) XF1897 ToiB protein precursor (toiB) XF1900 TolO protein {tolO/Iii) XF1899 TolA protein {tolA) XF0009 TonS protein (tonB) XF1957 TonS protein (tonS) XF2287 TonS protein (tonS) XF2327 TonB protein (tonS) XF2605 TonB protein (tonS) XF2397 toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein (hlyB) XF1841 undecaprenol kinase (bacA)

70% 33% 26%

1.4-beta-cellobiosidase (cbhA) endo-1.4-beta-glucanase {engXCA) endo-1.4-beta-glucanase{egl) extracellularendoglucanase precursor lengXCAI XFDB45 family 3 glycoside hydrolase {xyiA) XF2466 polygalacturonase precursor (pgiA)

ORFS WlTH UNOEFlNEO CATEGORY

37% 61% 45% 35%

XF2149 XF1828 XF0961 XF1120

41% 34%

XF1796

70% 77% 78% 57% 47% 21% 40% 48% 34% 71% 16% 19% 18% 36% 61% 38%

46% 64% 47% 33% 45% ---%

PATHOGENICITY, VIRULENCE. ANO AOAPT ATI ON/EXOPOLYSACCHAR IOES XF2370 XF2369 XF2367 XF2366 XF2365 XF2364 XF2362 XF1361 XF2360

GumB protein (gumB) GumC protein (gumC) GumO protein (gumO) GumE protein (gumE) GumF protein{gumF) GumH protein (gumH) GumJ protein{gumJ) GumKprotein(gumK) GumM protein {gumM)

hemagglutinin-like secreted protein (pspA) hemagglut inin-like secreted protein (pspA) hemagglutinin-like secreted protein (pspA) surface protein{hsf) surface protein{hsf) surface-exposed outer membrane pr01ein (uspA1)

XF1624 XF0063 XF1179 XF1078 XF2243 XF1213 XF0088 XF0465 XF1430 XF2422 XF1641 XF1668 XF1192 XF1927 XF2645 XF0145 XF1744 XF1723 XF1724

67% 62% 73% 61% 44% 64% 65% 69% 69%

15% 35% 35% 11% 14% 18%

PATHOGENICITY. VIRULENCE. ANO AOAPTATION/AOAPTATION. ATYPICAL CONOITIONS XF0432 BrkB protein (brk) 33% XF0866 cobalt-zinc-cadmium resistance protein (czcO) 53% XF0285 heat shock protein (htrA/degP/ptd) 43% XF2625 heat shock protein (htpX) 53% XF2234 low molecular weight heat shock protein lhspAI 38% XF1379 luciferase 31% XF0837 organic solvem tolerante precursor (imp/ostA) 29% XF1623 periplasmic glucan biosyn thesis protein lmdoHI 37% XF2682 periplasmic glucan biosyn thesis protein lmdoGI 36% XF0785 sulfur deprivation response regulator (sac1) 21% XF085B survival protein{surE) 60% XF2622 tem per ature acclimation protein 8(tap8) 85% XF0418 toluene tolerante protein (ng20) 14% XF0419 toluene tolerance protein (ttg2C) 41% XF0420 toluene tolerance protein (ttg28) 41% XF0421 toluene tolerante protein{ttg2A) 50%

PATHOGENICITY, VIRULENCE. ANO AOAPTATION/OTHER XF0290 aconitase(rpfA) 79% XF1424 chitinase{chi) 43% XF1527 general secretory pathway protein O precursor(xpsO/pefO) 68% XF1517 general secretory pathway protein E {xpsE/pefE) 81% XF1518 general secretory pathway protein F {xpsFJ 66% XF15l9 general secretory pathway protein G precursor{xpsG/pefG) 78% XF1520 general secretory pathway protein H precursorlxpsH) 67% XF1521 general secretorypathwayprotein I precursor{xpsl/pefl) 55% XF1522 general secretorypathwayproteinJ precursor !xpsJ/pefJ) 56% XF1523 general secretory pathway protein K {pefK) 60% XF1524 general secretory pathway protein L (pefl) 60% XF1020 pathogeniclty-related protein 48% XF0720 prateie ki11er active proteín (higB) 33% XF0711 prateie kil!er suppression protein {higA) 40% XF0223 queuine tRNA-ribosyl transferase (tgt/vacC) 61% XF0287 regulator of pathogenicityfactors (rpfB) 71% XF1114 regulator of pathogenicitylactors{rpfC) 59% XF1115 regulator of pathogenicityfactors(rpfFJ 67% XF1987 VacB protein (vacB) 46%

48% 39% 39% 28% 47% 46% 31% 32%

ApaG protein {apaG/corO) 45% ATPase 28% bacterioferritin comigratory protein (bcp) 51% bifunctional OGTPpyrophosphohydrolase/thiamine phosphate 43% synthase(mutT/thiEll bifunctional transcriptional repressor of the biotin operon/bimin acetyi-CoA·carboxylase synthetase {birA/bioR/dhbB) 40% carboxylesterase {estB) 37% competente protein F (comF) 37% competente related protein {comMJ 52% ONA uptake protein {comA) 35% GTP binding protein{lepA) 69% GTP-binding elongation factor protein (typA) 69% GTP-binding protein{hfiX) 54% GTP-binding protein(yfgK) 46% GTP-binding protein(yihA) 51% GTP-binding protein(yhbZ) 55% GTP-binding protein 68% HicB-related protein 38% integral membrane protein 49% integral membrane protein ---% isopentenyl monophosphate kinase (ipk) 50% oxidoreductase {ydfG) 50% oxidoreductase 71% sugar-phosphate dehydrogenase (yrpG) 55% sugar-phosphate dehydrogenase (yrpGJ 55%

pXF51 genes

INTERMEOIARY METABOLISM/REGULATORY FUNCTIONS XFaOOOI transcriptional regulator XFa0057 transcriptional regulator {korA)

31% 40%

MACROMOLECULE METABOLISM/ONA METABOLISM/Replication XFa0061 single-strandbindingprotein(ssb) XFaOOOJ topoisomerase I (topA/supX)

PATHOGENICITY. VIRULENCE. ANO AOAPTATION/SURFACE PROTEINS XF0889 XF2196 XF2775 XF1529 XF1981 XF1516

virulence factor virulence factor (mviN) virulence protein (acvB) virulence protein (acvB) virulence regulator (xrvA) virulence regulator (xrvA) virulence-assocíated protein E(vapE) virulence-associated protein E(vapE)

81% 13% 26%

PATHOGENICITY. VIRULENCE. ANO AOAPTATION/HOST CELL WALL OEGRAOATION XF1267 XF0818 XF2708 XF0810

XF0591 XF2420 XF0754 XF2679 XF0749 XF1493 XF0506 XF2121

54% 35%

MACROMOLECULE METABOLISM/ONA METABOLISM/Recombination XFa0019 si te·specific recombinase{rin)

91%

MOBILE GENETIC ELEMENTS/PLASMIO-RELATEO FUNCTIONS XFa0001 XFa0005 XFa0006 XFa0007 XFa0008 XFa0011 XFa0011 XFa0013 XFa0014 XFa0015 XFa0016 XFa0036 XFa0037 XFa0039 XFa0040 XFa0041 XFa0042 XFa0043 XFa0044 XFa0047 XFa0027 XFa0060 XFa0059 XFa0029

conjugal transfer protein{tral/vir81) conjugal transfer protein(trbC/vu82) conjugaltransferprotein{traA/virB3) conjugal transfer protein (traB/vir84) conjugaltransfer protein (traC/virB5) conjugal transfer protein {traD/virB6) conjugal transfer protein (traE/VirBS) conjuga l transfer protein (tra0/vir89) conjugal transfer protein (traF/vir810) conjugaltransferprotein (traG/vir811) conjugal transfer protein {traG/vlr04) conjugaltransferprotein{trbN) contugaltransferprotein(trbl) con1ugal transfer protein (trbJ) conjugal uansferprotein (trbl) conjugal transferprotein (trbH) conjugal transfer protein (trbG) conjugal transfer protein(trbF) conjugal transfer protein{trbE) nickase (taxC) plasmid maintenance protein {pemK) plasmid replication protein {incC) plasmid replication/partition protein plasmid stabilization protein{parE)

46% 31% 39% 43% 18% 13% 33% 34% 40% 41% 35% 76% 45% 54% 51% 44% 65% 47% ---% 30% 48% 34% 31% 76%

PATHOGENICITY. VIRULENCE. ANO AOAPTATION/OTHER XFa0052 virulence-associated protein O(vapO)

64%

pXF1.3 genes

MOBILE GENETIC ELEMENTS/PtASMIO-RELATEO FUNCTIONS XFbOOOl

replicationprotein

41%