2018 metais Nacionalinė LGBT* teisių organizacija parengė dokumentinę ataskaitą, siekdama įvertinti, kokių veiksmų ėmėsi Lietuvos valdžios institucijos, siekdamos įgyvendinti Rekomendaciją nacionaliniu lygmeniu. Ataskaitoje identifikuotos šios prioritetinės LGBT asmenų žmogaus teisių apsaugos problemos:
• „homoseksualumo propagandą“ draudžiantys įstatymai, kuriais remiantis ribojama LGBT bendruomenės saviraiškos laisvė;
• neegzistuojantis teisinis tos pačios lyties šeimų pripažinimas;
• neegzistuojanti administracinė procedūra teisei į lytinės tapatybės pripažinimą realizuoti;
• sisteminis neveikimas, tiriant prieš LGBT asmenis nukreiptus neapykantos nusikaltimus.