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Análisis Filogenéticos
from PRODUCCION DE TRICHODERMA
by juan guerra
Análisis Filogenéticos
Los análisis filogenéticos utilizando el gen Rpb2 fueron realizadas con base en la identificación
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inicial del GenBank. Todas las secuencias recuperadas fueron alineadas con las secuencias de los
aislados fúngicos utilizando el software Muscle®, implementado en el programa MEGA 10.0
(Molecular Evolutionary Genetics Analysis) (Kumar et al., 2016). Los análisis filogenéticos fueron basados en Maximum likelihood (ML) y fueron realizados con RAxML v. 8.2.12 (Stamatakis,
2014). Los parámetros utilizados fueron: análisis bootstrap rápido (con 1000 replicatas) y la
búsqueda para el mejor puntaje del ML tree. Todas las filogenias fueron realizados a través de
la interfaz online del CIPRES Science Gateway (Miller et al., 2010). Los árboles resultantes fueron
visualizados en el software FigTree y editados en el programa gráfico Inkscape 0.92.
