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muestras, lo cual alteró grandemente los resultados iniciales; por tanto, tuvimos que repetir las diluciones, el PCR y la corrida del gel hasta que los controles no indicarán contaminación. Otra limitación fue que los terrenos estuvieron inundados en septiembre y las muestras fueron coleccionadas en áreas más accesibles a los puntos de Jobos 1 y Jobos 2. Conclusiones Los humedales son ecosistemas complejos que poseen diversas funciones ecológicas y un alto valor económico y ecológico. Ante la necesidad de proteger, restaurar y conservar nuestros recursos naturales y manejar riesgos ambientales, nos dimos a la tarea de investigar el perfil bacteriano de los sedimentos de los árboles de mangle en la ciénaga Las Cucharillas y en la Reserva Nacional Estuarina Bahía de Jobos. En este estudio analizamos una variedad de muestras de suelo, mediante la técnica Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP). El proceso de T-RFLP es una buena fuente para recobrar el material genético de organismos noveles obtenidos de estos ecosistemas. El análisis de TRFLP es utilizado para examinar estructuras y comunidades de microorganismos que responden diferentes cambios y parámetros ambientales; también puede utilizarse para estudiar las poblaciones de bacterias presentes en un hábitat (Applied Biosystem, 2005). La ventaja que tiene la técnica del TRFLP es que nos permite tener una visualización rápida de la comunidad bacteriana de la muestra con un solo ensayo. Un problema que podemos encontrar al correr un gel es la interpolación en el programa de un tamaño estándar. Este tamaño de pares de base podría ser impreciso, lo cual puede llevar a que se obtengan bacterias similares al analizar el gel. Por tal motivo, se procede a practicar el T-RFLP al comparar las comunidades bacterianas, pues se crean estándares entre las corridas donde se pueden comparar los fragmentos obtenidos de la muestra (Hewson & Fuhrman, 2006). Mediante el T-RFLP, creamos una lista de las posibles bacterias que se encuentran en las áreas estudiadas. Determinamos que las bacterias encontradas pueden ser propicias para la biorremediación de contaminantes clorinados y volátiles. Entre las bacterias encontradas podemos destacar: Rhodococcus, Burkholderia, Acinetobacter y Sphingomona, Alcaligenes, Pseudomonas y Bacteroides. Además, realizamos un perfil de bacterias presentes en los sedimentos de las estaciones estudiadas dentro de la ciénaga Las Cucharillas y del estuario bahía de Jobos que puede ser útil para futuras investigaciones. Esta investigación ayudó