camadas da superfície e do fundo podem chegar até 10 ºC, mas geralmente estão entre 5 ºC e 7 ºC (NOGUEIRA, op. cit.). Em conseqüência da estratificação da coluna d'água, os nutrientes resultantes da decomposição da matéria orgânica são acumulados no hipolímnio, ocorrendo uma estratificação também das substâncias químicas orgânicas e inorgânicas. Portanto, uma estratificação química é conseqüência da estratificação térmica. Paralelamente, há o empobrecimento do epilímnio, o que gera, na maioria dos casos, a redução da produtividade primária do sistema. A eutrofização é um fenômeno que depende do aporte de substâncias nutrientes e de matéria orgânica na represa, os quais podem ser oriundos da decomposição da vegetação submersa ou trazidos pelas chuvas e águas superficiais, que lavam ou erodem a superfície terrestre da bacia de contribuição. Um processo de eutrofização intensa resulta em geral em efeitos extremamente deletérios para a qualidade da água (mediante alterações significativas no pH em um curto período de tempo, concentração de nutrientes e oxigênio dissolvido, aumento da concentração de gases metano e sulfídrico, por exemplo) e sobre a biota (alterações na diversidade e na densidade dos organismos). Em rios, todo o aporte de nutrientes é carreado, tornando as condições do meio quase sempre oligotróficas (pobres em nutrientes). Com o barramento dos rios e sua transformação em represas, ocorre uma diminuição da circulação da água e, consequentemente, um acúmulo da concentração de nutrientes, podendo haver uma transformação de um meio oligotrófico em eutrófico. Outro fator importante envolvido se refere ao tempo de residência da água. Um baixo tempo de residência implica em elevada taxa de reprodução para os organismos planctônicos, como forma de repor as perdas de biomassa potencialmente reprodutiva ocasionadas pela saída da água. Do contrário, um alto tempo de residência pode provocar, a médio ou longo prazo, uma superpopulação, com posterior diminuição no potencial reprodutivo da maioria dos organismos planctônicos, devido a diversos fatores limitantes, como escassez de nutrientes. Entretanto, se o sistema apresentar altos níveis de nutrientes e um alto tempo de residência deixa de existir um fator limitante, podendo haver intensa colonização do meio aquático com grande superpopulação fitoplanctônica e de macrófitas aquáticas, gerando efeitos diretos na qualidade da água e seus aproveitamentos. Isto pode ser incrementado por outros fatores, como a pouca profundidade do reservatório, que aumenta a área da zona eufótica, aumentando a produtividade primária do sistema. Uma das principais conseqüências do aumento da produtividade do sistema é o aumento da demanda bioquímica de oxigênio (DBO), que a médio prazo pode baixar os níveis de oxigênio dissolvido na água, podendo levar o sistema a quadros de hipoxia (baixa concentração de oxigênio) ou até anoxia (ausência de oxigênio). Nessas condições, há incremento no metabolismo dos microoorganismos anaeróbios, gerando como resíduos metabólicos gases como metano e gás sulfídrico, com efeitos tóxicos imediatos sobre a biota aquática. Sabe-se também que áreas agrícolas podem ser fontes de nutrientes oriundos de fertilizantes e outros insumos, bem como fontes de matéria orgânica oriunda de diversos tipos de dejetos, que contribuem para o processo de eutrofização.
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