CAPITULO 14
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Mutaciones simples como causa de enfermedad
2.
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aminoácidos, según los casos. Siempre la Adenina del codón de iniciación ATG se toma como posición +1, de forma que el nucleótido anterior es la posición –1. Describir las substituciones de nucleótidos según el esquema general: 2.
Intervalo + secuencia antigua + tipo de cambio + secuencia nueva.
2.
Utilizar una flecha o el signo «>» para las sustituciones, «del» para deleciones, «ins» para inserciones. Los rangos se indican con guión bajo (de subrayado) para evitar confusiones con el signo negativo. Las combinaciones de dos o más alteraciones se separan con el signo + y se incluyen en corchetes. Algunos ejemplos:
2.
g.12T>A (Cambio de timina por adenina en el nucleótido 12 de la secuencia genómica) [6T>C + 13_14del] (Dos cambios en el mismo alelo) [6T>C] + [13_14del] (Dos mutaciones, una en cada alelo) 14–15insT (Inserción de timina entre dos nucleótidos) 112_117delAGGTCAinsTG (Inserción de TG en vez de AGGTCA, también se podría indicar como 112_117>TG)
2. 2. 2. 2. 3.
4.
5.
2. 2.
6.
En repeticiones en tándem, se asigna por convenio el cambio a la última repetición (la que ocupa una posición más 3’): por ejemplo, la deleción de un dinucleótido TG en la secuencia ACTGTGTGCC (siendo A el nucleótido 1991) se describiría como 1997-1998del (o 1997-1998delTG). La variabilidad en microsatélites se designa contando la posición de la primera repetición. Si la secuencia del ejemplo anterior fuese polimórfica, se designaría 1993(TG)3-22, para indicar que en posición 1993 comienza un dinucleótido TG que se encuentra en la población repetido entre 3 y 22 veces. En intrones (cuando no se conoce la secuencia genómica), se señala la posición dentro del intrón con referencia al exón más cercano (utilizando números positivos comenzando con la G de la secuencia de ayuste GT donante, y números negativos contando desde la G de la secuencia AG aceptora). Se puede usar tanto la sigla IVS como sinónimo de «intrón», como la numeración correspondiente a la secuencia del ADNc. Ejemplos: IVS3+1G>T o c.621+1G>T (621 es el último nucleótido del exón 3, luego +1 es la G de la secuencia donante GT del intrón 3). IVS6-5C>A o c.1781–5C>A (1781 es el primer nucleótido del exón 7, luego –1 es la G de la secuencia aceptora AG del intrón 6, –2 es la A, y así sucesivamente hasta llegar a –5). Para describir substituciones de aminoácidos, se indica el número del aminoácido y el cambio operado, considerando la metionina iniciadora como
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