Page 1

DATA PREPARATION Before  you  Begin 1. On  the  google  drive,  open  the  “Smoking  Pilot  Eyedata  Processing”  document  and  place  your initials  in  the  “processed”  column  of  a  participant’s  data. 2. On  the  lab  server,  in  the  RAW  Subject  Data  folder,  copy  your  participant’s  Eye  tracking  data  and save  it  as  “Subjectnumber_processed”  in  EyedataàProcessed  Subject  Data

Open ASL  Results  Plus  and  Add  Your  Subject’s  Data   1. On  the  lab  server,  in  àEye  DataàSmoking  Study  Eyedata  Analysis  1.23.15,  open  the  “Smoking Study  Analysis”  file. 2. Click  FileàOpen  Participant  File(s),  and  select  your  participant’s  PROCESSED  eye  data  file  from Eye  DataàProcessed  Subject  Data Your  participant’s  data  will  be  added  on  the  left  side  of  the  ASL  project  window,  under “Participant  Files.”

A. Parse Event  into  Fixation  and  Picture  Presentation  Periods 1. Right  click  on  your  subject’s  data  file  name  and  select  “Parse  Events”. 2. You  will  see  a  pop-­‐up  box  (see  image  to  right). • In  the  Event  Start  Condition  Section, Select  “Specific  value(s). • In  The  Event  End  Condition  Section, Select  “Any  change  in  value” • Under  Additional  Options: Check  “Zero  Time  Origin”  and  “Use  as project  default”. 3. In  the  Start/End  values  window,  type  the  numbers 129-­‐168  and  then  250  into  the  boxes. If  they  are  already  there  that’s  okay;  check  that  none  are  missing 4. Click  “okay.”


Now, under  your  participant’s  project  file  name,  the  segment  will  be  divided  into  80  events.         Every  two  events  constitute  one  trial  in  the  task.    The  first  event  in  the  pair  is  the  fixation  cross   period  (odd  numbered  event)  and  the  second  event  in  the  pair  is  the  cue  picture  period  (even   numbered  event).    For  example,  Events  1  and  2  are  both  part  of  the  first  trial.    Event  1  is  when  the   participant  saw  the  fixation  cross  and  Event  2  is  where  the  participant  saw  the  cue  pictures.    Events   3  and  4  are  part  of  the  second  trial…etc.      There  are  40  trials  total.    

B. Find Fixation  Sequences  and  Match  AOIs  with  Picture  Pairs   Now,  you  will  find  all  of  the  fixations  in  each  event.    These  were  periods  where  participant’s  eye   movements  were  stable  on  the  screen  (fixating).    You  will  also  match  Cue  Picture  Pairs  with  Areas  of   Interest.     1. Right  click  on  your  participant’s  file  name  and  select  “Find  Fixation  Sequence”.         2. When  the  “Fixation  Detection  Criteria”  box  appears,  click  the  “Advanced  Configuration”  button.     a. Leave  the  default  settings  as-­‐is.       b. Make  sure  that  under  Eyetracker  Units/Degree,  Horizontal  is  7.399  and  Vertical  is  9.684.           c. Click  “Okay”       3. As  the  program  finds  fixations,  you  may  see  some  error  boxes  like  this:           This  simply  means  that  there  are  no  fixations  in  that  particular  segment  of  data  (could  be  due  to   poor  pupil  recognition  or  to  the  participant’s  simply  not  having  fixated  during  that  period).       Click  “okay”  and  the  program  will  continue  processing  the  data.   At  the  end  of  the  “finding  fixations”  period,  you  may  see  a  popup  like  this:    


This is  a  list  of  all  of  the  Events  in  which  ASL  Results  couldn’t  find  any  fixations.       If  you  do  not  have  one  of  these  popups,  that’s  okay—the  “AOI  Sets  and/or  Background   Correspondences”  box  will  open  immediately  (see  step  6).  

4. If there  is  an  Error  Messages  Box,  click  “Export”  and  save  this  information  as              “subject_number_Error  Messages”  on  the  lab  server  in  “Processed  Data  Excel  Sheets.”     5. If  there  is  an  Error  Messages  Box,  write  “Exclude  Event  #,  NO  Fixations”  in  the  google  drive processing  tracking  document  for  any  Events  that  DO  NOT  have  fixations. 6. If  applicable,  close  the  Error  Messages  Box. The  “AOI  Sets  and/or  Background  Correspondences”  box  will  appear  (see  below).  

7. Select your  participant’s  Data  File  Name  in  Row  1. If  another  participant’s  data  file  is  in  the  first  row,  replace  it  with  your  participant’s  data  file. Leave  the  Data  File  Name  in  the  rest  of  the  rows  blank.


8. In the  XDAT  column,  type  the  Numbers  129-­‐168  and  250. If  the  numbers  are  already  there  that’s  okay,  check  to  be  sure  they’re  correct. 9. Match  XDAT  numbers  with  the  numbers  in  the  AOI  Set  and  Background  drop  down  menus. XDAT,  AOI  Set,  and  Background  should  be  the  same  number  in  each  row. e.g.  XDAT:  129,  AOI  Set:  129,  Background:  129 10. Click  Okay.

C. Find Percentage  of  Data  Tracked  for  Each  Event   This  number  might  be  less  than  100%  because  the  eye  tracker  failed  to  recognize  the   participant’s  pupil,  OR  because  the  eye  tracker  could  not  find  the  participant’s  corneal  reflection.     Both  pupil  recognition  and  corneal  reflection  are  crucial  to  gaze  tracking  with  D6  optics.     1. Right  click  on  your  participant’s  data  file  name. 2. Select  “Calculate/Display  Percent  of  Data  Tracked”. 3. Export  this  data  and  save  it  as  “[subject  number]  percent  tracked”  in  the  “Processed  Data  Excel Sheets”  folder  on  the  lab  server. 4. Click  “Close”. 5. Open  the  saved  “Percent  Tracked”  text  file  and  keep  it  open  on  your  desktop.


DATA PROCESSING   Before  you  Begin   1. On  the  google  drive,  open  the  “Smoking  Pilot  Eye  data  Processing”  document  and  place  your initials  in  the  “processed”  column  of  a  participant’s  data. 2. On  the  lab  server,  open  the  “Eye  Data  Processing  Template”  from  Smoking  Pilot StudyàParticipant  DataàEye  data 3. Save  the  template  as  your  subject  number  (e.g.  “301”)  in  EyedataàProcessed  Data  Excel  Sheets

Exporting and  Processing  AOI  Summary  Tables  (DO  THIS  STEP  FIRST)   A. Export  AOI  Summaries  Text  File   1. In  ASL,  Go  to  Fileà Export  to  Text  Fileà FixSeq  AOI  Summaries. 2. First,  unselect  all  subjects.  Then  select  your  participant’s  file  in  the  pop-­‐up  box,  and  click  “Okay.” 3. Save  your  file  as  “subject  number_TextAOIs”  in  the  “Exported  and  Processed  AOI  tables”  folder on  the  lab  server.    E.g.  “323_TextAOIs”

B. Open the  Text  File  in  Excel   1. Open  a  new  instance  of  Excel. 2. In  Excel,  go  to  FileàOpen 3. Navigate  to  the  “Exported  and  Processed  AOI  Tables”  folder  on  the  server.    Search  for  “All  Files.” 4. Select  your  subject’s  “TextAOIs”  file  and  click  “Okay.” 5. Move  through  the  text  import  wizard. a. On  the  first  screen,  choose  “Fixed  Width”  as  the  Data  Type  and  press  “Next”.


b. On the  second  screen,  scroll  through  the  data  preview  and  make  sure  all  of  the  column  breaks are  in  the  correct  place.    Double-­‐click  to  delete  extra  column  breaks.   c. On  the  third  screen,  leave  the  column  data  format  as  “General”  and  click  “Finish.”

C. Delete Extra  Columns   1. Delete  Columns  A-­‐F. (File,  Segmno,  Segmname,  Eventno,  EventName,  AOI#) 2. Delete  Columns  C,  E,  F,  G,  H,  and  J. (%  FixCount,  %TotalFixDur,  AvgFixDur,  AvgInterFixFDur,  AvgInterFixDeg,  FirstFixTime) At  the  end,  you  should  have  AOIName,  FixCount,  TotalFixDur,  AvgPupilDiam,  and  XDAT.  If  you  don’t,   please  undo  and  try  again.  

D. Reorganize the  Data   1. Click  and  drag  to  select  all  of  the  data. 2. Go  to  Sort  and  FilteràCustom  Sort 3. In  the  first  row,  Sort  By:  XDAT,  on  Value,  Order:  Smallest  to  Largest 4. Click  Add  Level 5. In  the  second  level,  Sort  By:  AOINAME,  on  Value,  Order:  A-­‐Z

E. Check for  Missing  XDATS   1. Scroll  down  the  xdat  column  and  check  that  all  of  the  xdat  numbers  (129-­‐168)  are  present.    If any  are  missing,  it’s  because  there  is  no  data  (ASL  couldn’t  calculate  any  fixations  for  that  trial). If  XDATS  are  missing,  scroll  to  the  first  blank  row  in  the  excel  sheet  and  enter  the  XDAT  number   from  your  first  missing  trial  in  Row  E.    It  is  okay  to  leave  all  of  the  other  cells  in  the  row  blank.   Continue  adding  XDATS  in  subsequent  rows  until  you  have  added  one  XDAT  for  each  AOI.   For  quick  reference:                    Enter  8  rows  for  XDATS:  131,  132,  137,  138          Enter  7  rows  for  all  other  XDATs   When  you  have  finished,  repeat  step  D.  


F. Delete Extra  Data  Rows  from  Fixation  Cross  Period   1. Delete  all  the  rows  with  XDAT  250  (in  the  F  column).  These  will  all  be  at  the  bottom.

G. Copy and  Paste  Data  into  Excel  Template   1. Scan  the  XDAT  column.    XDATS  should  be  in  order  from  smallest  to  largest  (129-­‐168). 2. Scan  the  AOIName  column.  Cue/Neutral  picture  AOI’s  should  be  in  order  from  1-­‐20.    E.g.  XDAT 129  should  be  with  cue  1  and  neutral  1;  XDAT  131  should  be  with  Cue  2  and  Neutral  2;  etc.. If  cue  pairs  are  not  in  order  from  1-­‐20,  Stop  Processing  and  let  Laura  know  immediately. 3. Go  to  FileàSave  As  and  save  the  reorganized  data  file  as  an  Excel  Document  in  the  “Exported and  Processed  AOI  Tables”  folder.    Name  your  file  “subjectnumber_Excel  AOIs” 4. Click  and  drag  in  cell  B2  to  copy  the  all  of  the  data  from  columns  B,  C,  and  D.    Paste  this  data  into your  subject’s  Processed  Data  Excel  template  in  the  AOI  Summary  Tables  tab. DO  NOT  enter  any  data  into  the  “Percent  of  time  fixated”  boxes. 5. Check  to  be  sure  that  you  copied  and  pasted  the  data  correctly. 6. Enter  “-­‐9999”  in  any  blank  cells  (blank  rows  from  when  you  manually  entered  missing  XDATS). 7. Save  your  subject’s  Processed  Data  Excel  Sheet.

Renaming Trials,  Finding  End  Times,  &  Calculating  Direction  of  Initial  Fixation   REMEMBER:  For  Events  that  DO  NOT  have  fixations,  write:  “Exclude  [Segment  #,  Event  #],  NO  Fixations”   in  the  processing  tracking  document.  

A. Rename and  Enter  Percent  of  Data  Tracked   1. Click  on  Event  2  and  scroll  to  the  right  until  you  see  the  XDAT  number. 2. Right click  on  the  event  and  choose  “Edit  Event  Name”. The  new  name  should  be  the  XDAT  number (e.g. "146"). 3. In  Excel,  find  the  Tab  associated  with  that  XDAT  number.  There  are  two  XDAT  numbers  for  each  tab. odd  xdats  (e.g.  129)  go  in  the  blue  “T1”  box even  xdats  (e.g.  130)  go  in  the  orange  “T2”  box 4. Open  the  “Percent  Data  Tracked”  file  for  this  subject  (EyeDataà  Processed  Data  Excel  Sheets). 5.

In Excel,  enter  the  percent  of  data  tracked  from  the  Fixation  Period  (Event  1)  and  the  Picture Period  (Event  2). Do NOT enter the percent sign. Minimize  the  Percent  Tracked  file.  


B. Find the  Times  that  the  Last  Samples  were  taken  

1. In ASL  Results,  click  on  Event  1. In  the  middle  of  the  project  window,  you  will  see  rows  representing  the  data  samples  collected 2. Scroll  down  to  the  last  row.    The  time  in  the  “Time_secs”  column  is  the  time  that  the  last  sample was  taken  (the  time  at  which  the  fixation  period  ended).    This  should  be  approximately  2 seconds.

3. Record this  time  on  your  subject’s  Excel  Sheet  in  “End  time  of  fixation  Period”. Note:  For  the  very  first  segment  for  each  subject,  the  end  time  of  Event  1  may  be  less  than  2 seconds.  That  is  okay. 4. In  ASL  Results,  click  on  Event  2. 5. Scroll  down  to  the  last  row.    The  time  in  the  “Time_secs”  column  is  the  time  that  the  last  sample was  taken  (the  time  at  which  the  cue  period  ended).    This  should  be  approximately  2  seconds. 6. Record  this  time  on  your  subject’s  Excel  Sheet  in  “End  time  of  Cue  Picture  Period”.

C. Calculate Direction  of  Initial  Fixation   1. Click  on  Event  1àFixationsàFixation  Sequence.

If any  of  the  AOINames  are  “Central  Region”,  place  a  “1”  in  “Fixation  on  Cross  at  ALL  during cross  Period”  in  the  Excel  box

Look at  the  last  fixation  in  the  list  (in  red  box  above). If  the  AOIName  =  “Central  Region”  and  the  “Stop  Time”  =  “End  time  of  Fixation  Period”, place  a  “1”  in  “Fixation  on  Fixation  Cross  Directly  Before  Pic  Onset”


2. Click on  Event  2à  FixationsàFixation  Sequence.     • Find  the  first  Fixation  with  an  AOIName  that  contains  “Cue”  or  “Neutral.”  (see  below)  

• •

Record the  “Direction  of  Initial  Fixation”  in  Excel.    Cue  Region  (1);  Neutral  Region  (2).       Enter  the  Start  Time  and  Duration  of  this  fixation  into  Excel.  

IMPORTANT: Mark  Missing  Data  with  “-­‐9999”.    For  example,  if  the  participant  did  not  look  at  either  of   the  pictures  during  this  period,  then  mark  this  as  -­‐9999.    

D. Repeat for  remaining  39  trials.   • •

Remember that  Odd  events  (e.g.  Event  3)  are  fixation  cross  periods  and  Even  Events  (e.g.   Event  4)  are  picture  periods.     Also  remember  that  each  trial  consists  of  two  sequential  events.    For  example  Events  3  and   4  are  part  of  the  same  trial.    

           

Eyedata Instructions  
Read more
Read more
Similar to
Popular now
Just for you