Issuu on Google+

HB EWSS HBC C NEW Vol. 16, No. 3

Winter-Spring 2008/2009

DIRECTOR’S NOTE

he new administration in Washington has  made research funding a priority. On Feb.   24 President Obama called for  us  to  seek  a  cure  that  would  conquer  cancer  in  our  time.  With  newly  funded  projects  such  as  the  KU  Specialized  Chemistry  Center,  led  by  Dr.  Jeff  Aube,  the  scientists  of  the  HBC  will  have  the  opportu‐ nity  to  participate  in  such  a  momentous  challenge.  The  specialized  chemistry  project  led by Dr. Aube was funded prior to the pas‐ sage of the American Recovery and Reinvest‐ ment  Act  of  2009  in  which  the  U.S.  govern‐ ment backed statements of support for scien‐ tific research with real dollars that will fund a  new  wave  of  research.  This  new  funding  turns  around  the  trend  of  the  last  decade  in  which more and more researchers were com‐ peting for fewer federal dollars and provides  us  with  an  unprecedented  opportunity  to  explore new scientific frontiers.  

Jeff Aube creates opportunities for interdisciplinary research     Last  year,  Jeff  Aube,  professor  of  medicinal  chemistry,  made  history  when he received the largest federal research grant ever awarded in Kansas;  however, the scope of Dr. Aube’s work goes well beyond this project.     Dr.  Aube  began  his  career  at  the  University  of  Kansas  in  1986  after  spending  four  years  as  a  postdoctoral  fellow  at  Yale  University.  Since  that  time,  he  has  served  as  a  professor  of  medicinal  chemistry  and  a  courtesy  professor of chemistry, interim director of the Center for Teaching Excellence  and  interim  director  for  the Department  of  Medicinal  Chemistry.  Currently,  he  is  director  of  the  KU  Chemical  Methodology  and  Library  Development  Center  of  Excellence  and  the  newly  created  KU  Specialized Chemistry Center.    Last  fall,  Dr.  Aube  was  awarded  two  major  research awards from the National Institutes of Health.  The  largest,  a  grant  providing  more  than  $20  million  over  six  years,  will  allow  Dr.  Aube  to  lead  a  group  of  researchers  in  the  development  of  the  KU  Specialized  Chemistry Center on west campus. KU will be part of a  nine‐institution  network  that  will  work  together  to  understand  human  health  problems.  This  team  approach  will  give  researchers  access  to  additional  resources  and  results  to  help  them  work  together  to  (Continued on page 6)

(Continued on page 2)

In this Issue … 1 1 1 2 2 3 3 4 4 5 6 6 8

···········································Director’s Note ····················· Jeff Aube creates opportunities ······Federal stimulus bill provides new funding ······························ Recently awarded grants ··································HBC research themes ····· Established Investigator profile, Dr. Muma ····················New Investigator profile, Dr. Im ························ New distinguished professors ·················· Brian Blagg wins high ACS honor ······································ HBC Science Talks ······························ HBC brown bag lunches ················ Grant deadlines, Upcoming events ···········································Bishop Scholars HBC News Questions? Contact Debra Simon, HBC News editor, writer and designer, at (785) 864-5209 or dsimon@ku.edu.

Stimulus bill provides additional federal funding for research projects at NIH, NSF Contact HBC for assistance in applying before deadlines   The  passage  of  the  American  Recovery  and  Reinvestment  Act  of  2009  has  provided  increased  opportunities  for  bioscience  researchers  to  gain  funding  from  governmental  sources  such  as  the  National  Institutes  of  Health  and  the National Science Foundation for  facility  improvements  and  research  projects.     Because the funds are designed  to  stimulate  economic  improve‐ ment,  some  of  the  new  funding  competitions  come  with  short  deadlines. For this reason, research‐ ers  should  visit  the  NIH  and  NSF  websites  as  soon  as  possible  to  check  out  the  latest  deadlines  and  opportunities.  

  As  always,  the  Higuchi  Biosciences  Center  is  available  to  assist  any  University  of  Kansas  bioscience  researcher  complete  a  grant  application.  HBC  proposal  preparation  specialists  complete  forms,  prepare  budgets,  gather  university approvals and submit the  application  under  the  direction  of  the  principal  investigator.  For  proposal preparation assistance, call  Donna Burruss at 864‐4244 or e‐mail  ddalsing@ku.edu.    For  more  information,  includ‐ ing  specific  opportunities  for  KU  researchers,  visit  http://www.rgs.  ku.edu/leadership/researchstimulus  /#3. View new NIH opportunities at  http://grants.nih.gov/recovery/. ● 


SPOTLIGHT ON RESEARCH Recent Awards Recent grants and awards to HBC researchers include the following: Jeffrey Aube, Ph.D. NIH/National Institute of General Medical Sciences

Center of Excellence in Chemical Methodologies and Library Development $9,528,802 (five-year project)

Jane Aldrich, Ph.D. NIH/National Institute Allergy on Drug Abuse

Peptidic Kappa Opioid Receptor Ligands as Potential Treatments for Drug Addiction $36,500 (one-year supplement)

Paul Hanson, Ph.D. NIH/National Institute of General Medical Sciences

Probing Diversity Space with Novel Pilot Scale Libraries

(Continued from page 1)

  The government hopes this spend‐ ing will be a boon to the economy, but  as  researchers  and  academics,  we  know  that  the  additional  studies  we  will  be  able  to  complete  will  lead  to  scientific  advances  with  long‐lasting  health  benefits  for  all  of  society  and  will  improve  our  country’s  ability  to  compete  in  the  global  market.  In‐ creases  in  research  funding  will  not  only  increase  the  number  of  working  scientists  but  also  the  number  of  stu‐ dents  who  will  be  able  to  gain  hands‐ on training at American institutions.    Much  of  this  new  funding  has  been  placed  on  an  expedited  plan  and  will  be  spent  within  the  next  few  months  on  projects  designed  to  get  solid  results  within  two  years.  The 

DIRECTOR’S NOTE National  Institutes  of  Health  alone  now  has  more  $10  billion  in  new  money  available.    This  will  go  toward  funding  previously  submitted  R01,  R21,  R03  and  other  types  of  applica‐ tions that had received highly meritori‐ ous  reviews  but  were  not  funded.  Money  has  also  become  available  to  strengthen  our  infrastructure  and  im‐ prove  our  facilities.  I  know  that  many  HBC  scientists  have  taken    advantage  of these new opportunities, and I hope  we  will  soon  see  the  results  of  these  efforts.  Eli Michaelis, Director 

$1,098,434 (three-year project) Minae Mure, Ph.D. National Science Foundation

CAREER: Mechanistic studies of tyrosine derived cofactors $350,000 (two-year, six-month project)

Kristi Neufeld, Ph.D. Kansas Masonic Cancer Research Institute

Tumor suppressor APC interaction with chemotherapeutic target Topoisomerase II alpha $35,000 (one-year project)

Berl Oakley, Ph.D. NIH/National Institute of General Medical Sciences

Mining the Aspergilus nidulans Secondary Metabolome $4,771,657 (five-year project)

James Orr, Ph.D. NIH/National Institute of General Medical Sciences

KU Post-Baccalaureate Research Education Program

$346,946 (one-year project) Mark Richter, Ph.D. Army Research Office

Fabrication and analysis of hybrid nanodevices for biodefense applications $485,415 (three-year project)

John Stobaugh, Ph.D. Children's Mercy Hospital/Kansas City Area Life Sciences Institute

A Folate Pharmacogenetic Signature in Juvenile Idiopathic Arthritis $25,000 (one-year project)

HBC NEWS WINTER-SPRING 2008/2009— PAGE 2

HBC supports researchers as they delve into mysteries of protein structure, function - By William D. Picking, Associate Director of Academic Research at the HBC

The  Higuchi  Biosciences  Center  recently announced the formal recogni‐ tion of six major research themes repre‐ sented  by  the  Center,  including  neuro‐ sciences;  infectious  diseases  and  vac‐ cine  discovery;  cancer  and  molecular  biology; protein structure and function;  drug  design  and  target  identification;  and  drug  metabolism,  toxicity  and  pharmacogenomics.  In  this  edition  of  our  newsletter,  we  pay  tribute  to  the  protein  structure  and  function  re‐ searchers affiliated with the HBC.  A  centerpiece  of  the  protein  struc‐ ture  and  function  effort  at  the  Univer‐ sity of Kansas is the National Institutes  of  Health  Center  of  Biomedical  Re‐ search  Excellence  in  Protein  Structure  and Function (COBRE‐PSF) directed by  Professor  Robert  Hanzlik,  Department  of  Medicinal  Chemistry.  The  COBRE‐ PSF  recently  was  renewed  with  a  five‐ year,  $10.1  million  grant  from  the  Na‐ tional  Institutes  of  Health  to  conduct  health‐related  research  in  the  area  of  protein  structure,  dynamics  and  func‐ tion. This center provides research and  mentoring  support  to  outstanding  jun‐ ior  faculty  researchers  across  the  state 

of  Kansas.  COBRE‐PSF  participants  have  been  located  across  the  KU‐ Lawrence  campus  in  addition  to  the  University  of  Kansas  Medical  Center,  Wichita  State  University  and  Kansas  State University; however, a home base  for  the  COBRE  and  its  core  facilities  is  the  new  Structural  Biology  Center  lo‐ cated on the KU west campus.  The  COBRE‐PSF  is  but  one  way  that  HBC  investigators  are  providing  basic  research  in  the  area  of  protein  structure  and  the  roles  of  proteins  in  human health. Assistance in this area is  enhanced by state of the art facilities in  the SBC, including the Protein Purifica‐ tion  and  Analysis  Group,  the  NMR  laboratory  and  the  X‐ray  crystallogra‐ phy facility. Additional support is pro‐ vided  by  the  mass  spectrometry  and  new high‐throughput screening labora‐ tories.   The  rich  interactive  research  envi‐ ronment  found  at  the  University  of  Kansas  and  fostered  by  the  HBC  is  clearly evident in the synergistic activi‐ ties  of  the  many  KU  researchers  who  are  working  in  the  area  of  protein  structure and function. ● 


SPOTLIGHT ON RESEARCH Established Investigator

Nancy Muma strengthens neouroscience research at KU Nancy Muma joined the faculty of the  University of Kansas about two years ago  as a professor and chair of the Department  of Pharmacology  and  Toxicology.  Prior  to  her  arri‐ val,  she  had  spent  several  years  as  a  pro‐ fessor  at  Loyola  University  in  Chicago  where  she  developed  a  strong  research  background  in  neurodegenera‐ Nancy Muma, Ph.D. tion  and  nerve  disorders.  Her history of success in maintaining  a  high‐caliber  research  program  and  of  training  postdoctoral  and  graduate  stu‐ dents made her an attractive candidate for  the  chair  position,  said  Higuchi  Biosci‐

ences  Center  Director  Eli  Michaelis  who  helped bring her to KU.  Her  presence  at  KU  adds  strength  to  the  neuroscience  programs,  which  is  one  of  two  key  areas  that  research  is  moving  toward,  the  other  being  cancer.  Neurosci‐ ence is also a main focus of the HBC.  Specifically, Dr. Muma focuses on the  development  of  drugs  for  anxiety  and  other  mood  disorders  by  studying  how  current  drugs  for  anxiety  and  depression  work  at  the  molecular  level.  It  is  known  that such drugs affect serotonin signaling,  but  by  refining  the  research  community’s  understanding  of  these  processes,  she  hopes to be able to develop new drug tar‐ gets that will lead to better treatments.  Her  research  has  lead  to  a  collabora‐ tion with the Target Acceleration Group in  the  Office  of  Therapeutics,  Discovery  and  Development  at  the  University  of  Kansas  Medical  Center  where  she  works  with  Sitta  Sittampalam,  deputy  director  of  the 

OTDD,  on  a  couple  of  projects.  They  are  pursuing new areas of scientific study that  have great potential for the future.  “She has developed a very nice assay  to  screen  for  molecules  of  Huntington’s  Disease,” Dr. Sittampalam said.  This disease kills neurons in the brain  and spinal cord. Dr. Muma has found the  roadway  by  which  the  disease  manifests  itself.  This  knowledge  will  help  research‐ ers  develop  a  drug  to  treat  the  disease.  This,  in  turn,  may  lead  to  expanded  col‐ laborations  with  other  researchers  throughout the country.  Dr.  Muma’s  strong  research  program  is  expected  to  encourage  other  neurosci‐ ence  researchers  to  join  the  university,  which  will  further  enhance  the  research  being doing in Kansas.   “She  is  well  funded,  has  an  active  re‐ search  program  and  is  leading  the  depart‐ ment’s effort to bring new research faculty  to KU and the HBC,” Dr. Michaelis said. ● 

New Investigator

Wonpil Im focuses on collaborative, interdepartmental research  Wonpil  Im,  assistant  professor  in  the  Department  of  Molecular  Biosciences  and  at  the  Center  for  Bioinfor‐ matics,  came  to  the  University  of  Kansas  in  2005  and  has  been  steadily  building a body  of research cen‐ tered  on  the  computational  Wonpil Im, Ph.D. studies  o f  membrane protein structure and function.   Dr.  Im  received  a  bachelor’s  degree  and  master’s  degree  in  chemistry  from  Hanyang  University  in  Korea,  a  doctorate  in biochemistry from Cornell University in 

New  York  City  and  worked  as  a  postdoc‐ toral  fellow  in  molecular  biology  at  Scripps Research Institute in La Jolla, Calif.  “I  was  interested  in  developing  com‐ putational  methods  that  potentially  lead  us  to  better  interpret  experiments,”  he  said.  He  decided  to  join  the  faculty  at  KU  because  “KU  has  an  excellent  research  environment and provides strong supports  for faculty research.”  Currently,  Dr.  Im’s  lab  is  attempting  to  address  important  fundamental  ques‐ tions such as why a single transmembrane  helix  or  beta‐hairpin  has  specific  orienta‐ tions  in  membranes;  what  the  roles  are  of  hydrogen bonds, close packing, and helix‐ lipid  or  beta‐hairpin‐lipid  interactions  in  helix  or  beta‐hairpin  associations  in  mem‐

branes;  how  these  interactions  change  the  membrane structures; and how transmem‐ brane  domains  transmit  signals  across  membranes.  Since  arriving  at  KU,  he  has  been  the  corresponding  author  on  12  published  articles  and  in  2007  received  the  Alfred  P.  Sloan Fellowship. He is the co‐investigator  on a National Institutes of Health grant led  by  Roberto  De  Guzman,  assistant  profes‐ sor  of  molecular  biosciences.  He  has  also  been  involved  in  collaborative  research  with faculty from other departments.   “We  have  been  expanding  our  re‐ search into several different areas with the  help of collaboration with KU faculty,” he  said.  Partners  include  Dr.  De  Guzman;  (Continued on page 7)

HBC NEWS WINTER-SPRING 2008/2009— PAGE 3


SPOTLIGHT ON RESEARCH New distinguished professors increase depth of KU bioscience research Two  new  distinguished  professors  recently joined the University of Kansas as  participants  of  the  Higuchi  Biosciences  Center. In January 2008 Blake Peterson, the  Regents  Distinguished  Professor  of  Me‐ dicinal  Chemistry,  arrived  at  KU  from  Pennsylvania  State  University  where  he  was  a  tenured  associate  professor.  In  Sep‐ tember  Berl  Oakley,  the  Irving  S.  Johnson  Distinguished Professor of Molecular Biol‐ ogy,  transferred  from  Ohio  State  Univer‐ sity. These researchers bring a great deal of  experience and bioscience expertise.      Blake  Peterson,  Regents  Distinguished  Professor of Medicinal Chemistry  Dr.  Peterson  came  to  KU  because  he  was  “attracted  to  the  stellar  reputation  of  the  Department  of  Medicinal  Chemistry.”  Now that he is here, he enjoys the “sunny  skies  and  friendly  people  of  Lawrence  as  well as the excellent resources provided by  the  University  of  Kansas  and  its  partners  such  as  the  Kansas  Bioscience  Authority  and the cancer center.”  Early  in  his  career  Dr.  Peterson  spent  time  as  a  research  assistant  at  the  Univer‐ sity  of  Nevada  in  Reno,  the  University  of  California  in  Los  Angeles  and  the  Swiss  Federal  Insti‐ tute of Technol‐ ogy  (ETH)  in  Zurich.  His  interest  in  me‐ dicinal  chemis‐ Blake Peterson, Ph.D. try  developed 

when  he  saw  first‐hand  how  this  type  of  research could benefit human health.   “I  became  particularly  interested  in  medicinal chemistry as a graduate student  in chemistry at UCLA/ETH‐Zurich when I  worked  on  a  project  involving  making  molecules  with  the  potential  to  combat  atherosclerosis,”  he  said.  “One  of  my  suc‐ cesses in graduate school involved synthe‐ sizing  a  compound  that  is  the  shape  of  a  donut and causes cholesterol to dissolve in  water.  We  were  interested  in  studying  whether this approach might be useful for  dissolving atherosclerotic plaque.”  While  a  postdoctoral  fellow  at  Har‐ vard,  his  research  focus  turned  to  bio‐ chemistry  and  molecular  biology,  a  step  that  broadened  his  understanding  of  the  benefits  of  collaborative  research  and  shaped his future research goals.  “This  deep  exposure  to  a  new  field  was  very  valuable  for  future  research  in  the  fields  of  medicinal  chemistry  and  chemical  biology,  where  my  research  ef‐ forts are focused today,” he said. “While at  Harvard,  I  was  funded  by  a  fellowship  from the Damon Runyon ‐ Walter Winchell  Cancer  Research  foundation.  My  associa‐ tion  with  this  organization  sparked  my  interest in cancer research.”  Since arriving at KU, Dr. Peterson has  been  able  to  collaborate  with  cancer  re‐ searchers from across the region as part of  the  Drug  Discovery  and  Experimental  Therapeutics  program  at  the  KU  Cancer  Center,  a  research  center  that  unites  ex‐ perts  from  KU,  the  KU  Medical  Center  campuses in Kansas City and Wichita, the  KU  Hospital,  the  Stowers  Institute  for  Medical  Research,  and  the  Midwest  Can‐ cer Alliance network of hospitals. 

“As  someone  focused  on  basic  re‐ search,  this  group  gives  me  opportunities  to  meet  with  both  basic  biomedical  re‐ searchers  interested  in  therapeutics  and  more  clinically‐oriented  faculty  that  can  help us focus our efforts on the most medi‐ cally relevant problems,” he said.  The  group  is  currently  attempting  to  create new methods of delivering antican‐ cer  drugs  into  cancer  cells  without  harm‐ ing normal cells.  “We  are  using  synthetic  chemistry  to  create drug‐carrying molecules that resem‐ ble  cholesterol.  These  cholesterol  mimics  are taken up by cells and become inserted  into  the  membranes  that  define  the  cell  surface,” he said. “Once on the cell surface,  these molecules can enable cells to take up  drugs.  We  are  studying  whether  our  cho‐ lesterol mimics might be designed to react  with  enzymes  that  are  only  produced  by  metastatic  cancer  cells,  resulting  in  selec‐ tive drug release.”  Dr.  Peterson  also  works  with  the  re‐ cently  funded  KU  Specialized  Chemistry  Center,  which  is  led  by  Jeff  Aube,  profes‐ sor of medicinal chemistry and director of  the center. They are attempting to develop  new  chemical  and  biological  methods  to  identify protein targets of drugs and other  small molecules.  In  general,  Dr.  Peterson  hopes  to  cre‐ ate  new  technology  platforms  that  could  be  broadly  useful  for  treating  cancer  and  other diseases.   “I  am  particularly  interested  in  de‐ signing  and  discovering  new  antiviral  drugs  that  might  be  useful  for  treating  dengue  virus,  a  mosquito‐borne  pathogen  that  can  cause fatal  disease  that  cannot  be  (Continued on page 5)

Brian Blagg wins high honor from American Chemical Society - Courtesy of University Relations

  For  his  pioneering  work  on  potential  treatments for cancer and other diseases, a  University of Kansas professor has earned  one  of  the  top  accolades  bestowed  upon  medicinal chemists.    The  Division  of  Medicinal  Chemistry  of  the  American  Chemical  Society  has  awarded  the  2009  David  W.  Robertson  Memorial  Award  to  Brian  S.  J.  Blagg,  KU  HBC NEWS WINTER-SPRING 2008/2009— PAGE 4

associate professor of medicinal chemistry.  The prize, sponsored by the Pfizer Endow‐ ment Fund, is given annually to “scientists  under the age of 40 who have made semi‐ nal contributions to the discovery of novel  therapeutic  agents,  or  who  have  made  substantial  contributions  and  discoveries  in medicinal chemistry.”    The  society  acknowledged  Blagg  for 

his  work  to  create  inhibitors  of  a  protein  called  Hsp90  that  have  promise  as  cancer  fighters.  Because  Hsp90  folds  other  pro‐ teins  and  helps  them  to  achieve  their  cor‐ rect  three‐dimensional  shape,  hindering  the  process  can  obstruct  the  constant  pro‐ liferation of cancer cells.    “Cancer cells continually grow and as  (Continued on page 7)


SPOTLIGHT ON RESEARCH HBC encourages collaboration through annual Science Talks Speakers discussed latest work, participants presented posters   Each  year,  the  Higuchi  Biosciences  Center  hosts  the  HBC  Science  Talks.  The  half‐day  event  features  presentations  by  three  leading,  University  of  Kansas  researchers  with  whom  the  HBC  partners  to  assist  in  handling  the  administrative 

burden  of  their  research.  This  year  presentations  began  at  1:30  p.m.  Friday,  Dec.  5, in  Simons  Auditorium.  They  were  followed  by  a  poster  session  on  level  two  of  Lied  Center,  which  lasted  until  approximately 5 p.m.  

  This  year  Jeff  Aube,  professor  of  medicinal chemistry,  spoke on “The Role  of  Synthetic  Organic  Chemistry  in  Drug  Discovery.”  Brian  Blagg,  associate  professor  of  medicinal  chemistry  (Continued on page 7)

New distinguished professors increase depth of KU bioscience research (Continued from page 4)

treated or prevented by any current drugs  or vaccines,” he said.     Berl  Oakley,  Irving  S.  Johnson  Distin‐ guished Professor of Molecular Biology  This  fall,  the  Molecular  Biosciences  Department  also  added  a  new  distin‐ guished professor to its ranks.  “Berl  Oakley  is  a  gem,”  Molecular  Biosciences Chair Kathy Suprenant said of  her  depart‐ ment’s  new  re‐ searcher.  “He  has  an  interna‐ tional  reputation  as  a  generous  and  thoughtful  colleague as well  as  an  out‐ standing  re‐ searcher  and  Berl Oakley, Ph.D. teacher.  We  are  all  thrilled  that  KU  was  able  to  tempt  him  away  from  Ohio State.”  Dr.  Oakley’s  schedule  has  kept  him  very  busy  since  his  arrival  at  KU  with  a  couple  of  overseas  conferences  and  the  setup of his new laboratory on the seventh  floor  of  Haworth  Hall.  He  is  pleased  that  his position at KU will allow him to devote  more time to research than was possible in  his previous position at Ohio State.   Much of Dr. Oakley’s work focuses on  mitosis.  Initially,  his  group  discovered  a  protein called gamma tubulin that is a key  protein  in  the  mitotic  apparatus  without  which  mitosis  wouldn’t  work.  They  have 

since  learned  that  this  protein  affects  cell  cycle regulation as well.  “His 1990 landmark paper on gamma  tubulin started a new scientific movement  that  resulted  in  a  better  understanding  of  the  essential  process  of  mitosis,”  Su‐ prenant  says.  “If  the  mitotic  apparatus  does  not  function  properly,  chromosomes  can  land  in  the  wrong  cell  resulting  in  birth  defects  and  even  cancer.  It  is  appro‐ priate  that  his  latest  research  involves  identifying some of the secondary metabo‐ lites  that  Aspergillus  (bread  mold)  pro‐ duces to kill bacteria. Many of these mole‐ cules also have anti‐tumor activity.”  Sequencing of the Aspergillus genome  has  revealed  that  it  has  the  potential  to  make more than 40 secondary metabolites,  but only about a dozen have been identiti‐ fied.  Secondary  metabolites  are  not  neces‐ sary for a cell to be viable, but they do help  cells  compete  in  nature.  Many  have  prop‐ erties  that  make  them  useful  in  medicine.  Dr. Oakley wants to identify the remaining  secondary  metabolites  in  Aspergillus  and  determine  what  their  biological  activity  might be.  “That’s  already  turning  up  some  in‐ teresting things,” he said. Specifically, As‐ pergillus has shown promise in the area of  antibiotic activity.  Dr.  Oakley  brought  a  new  program  project  to  KU  that  involves  collaborations  with the labs of researchers at the Univer‐ sity  of  California  in  Los  Angeles  and  the  University of Wisconsin. He expects future  projects  to  bring  the  opportunity  to  col‐ laborate with HBC‐affiliated researchers.  “There  are  some  strong  programs  at  KU,  clearly,  and  a  lot  of  potential  to  de‐

Berl Oakley . . . has an international reputation as a generous and thoughtful colleague as well as an outstanding researcher and teacher. Kathy Suprenant, Ph.D.

velop  new  programs,  depending  on  fund‐ ing,” he said.  Like Dr. Peterson, these collaborations  may  relate  to  KU’s  ever‐increasing  focus  on cancer research. Anti‐mitotic agents can  be  useful  in  the  treatment  of  cancer  as  some  existing  chemotherapy  drugs  are  anti‐mitotic  agents.  Abnormal  mitosis  plays  an  important  role  in  tumor  forma‐ tion.  Recently,  a  National  Cancer  Institute  investigator  with  whom  Dr.  Oakley  col‐ laborates  on  research  found  a  compound  in  a  drug  screen  related  to  Dr.  Oakley’s  work that is a potent killer of breast cancer  cells in cultures.  “It kills really effectively at a low con‐ centration,” he said. 
  This  drug  screen  could  lead  to  a  new  class of anti‐mitotic agents.  Together,  these  two  new  distin‐ guished  professors  help  to  strengthen  the  Kansas  research  community.  In  addition,  they  bring  the  opportunity  for  increased  collaboration  between  departments  in  ar‐ eas such as cancer research, which demon‐ strates  the  Higuchi  Bioscience  Center’s  resolve  to  support  research  that  leads  to  improvements in the lives of Kansans and  and the broader community. ●  HBC NEWS WINTER-SPRING 2008/2009— PAGE 5


HBC UPDATES HBC concludes discussion series aimed at uniting life science researchers Topics focused on multidisciplinary bioscience projects The  final  in  a  series  of  brown  bag  lunch  discussions  hosted  by  the  Higuchi  Biosciences  Center  was  held  Thursday,  April  23,  on  the  topic  of  drug  targeting  and  identification. All University  of Kan‐ sas  researchers  were  welcome  to  attend  the series, which focused on encouraging  collaborative  research in  the life  sciences.  A  new  series  is  tentatively  planned  for  the fall.   “It  is  our  hope  that  these  lunches  will open the door for increased cross‐talk  between individuals who associate them‐

selves  with  different  research  themes,”  said  HBC  Associate  Director  Bill  Picking,  who moderated the first discussion in the  series.  This  was  the  final  in  a  series  of  six  lunches  that  dealt  with  subjects  relating  to  the  six  major  research  themes  of  the  HBC.  These  themes  are  neuroscience;  infectious diseases and vaccine discovery;  cancer  and  molecular  cellular  biology;  protein  structure  and  function;  drug  de‐ sign  and  delivery;  and  drug  metabolism,  (Continued on page 8)

Jeff Aube’s research programs create opportunities (Continued from page 1)

understand  basic  human  biology  and  to  use that knowledge to develop new drugs  and treatments.    Last  fall,  Dr.  Aube  also  received  an  NIH  renewal  award  of  more  than  $9.5  million  to  continue  the  Center  of  Excellence in Chemical Methodologies and  Library  Development  for  five  more  years.  The  KU‐CMLD  began  in  2003  with  an  initial  award  of  $9.5  million.  The  basic  function  of  this  library  is  to  catalog  molecules,  which  allows  researchers  to  quickly  and  efficiently  evaluate  their  potential for drug development.    The  KU‐CMLD  is  one  of  five    such  libraries  sponsored  by  the  NIH.  The  information  from  each  chemical  library  is  available for study by the general scientific  community  through  the  NIH  Molecular  Libraries  Probe  Production  Centers  Network.  The  research  associated  with  these  libraries  could  lead  to  treatments  cancer  and  many  other  diseases.  Eventually,  Dr.  Aube  hopes  that  KU’s  facilities  will  become  self‐sustaining  and  will  develop  into  a  standard  resource  for  researchers.    Dr.  Aube’s  projects  put  KU  on  the  cutting‐edge  of  biomedical  research  while  uniting  his  efforts  with  that  of  researchers  throughout  the  country.  For  KU  these  HBC NEWS WINTER-SPRING 2008/2009— PAGE 6

Grant Deadlines May 15 Higuchi Biosciences Center J.R. and Inez Jay Fund May 29 National Institutes of Health Two Recovery Act Limited Competitions: (1) Research and Research Infrastructure “Grand Opportunities” (RC2), (2) Supporting New Faculty Recruitment to Enhance Research Resources through Biomedical Research Core Centers (P30) June 5 National Institutes of Health New R01 and U01 applications June 15 National Institutes of Health Recovery Act 2009 Limited Competition: Enabling National Networking of Scientists and Resource Discovery (U24) June 16 National Institutes of Health New R03, R21, R33, R21/R33, R34 and R36 applications This is a partial listing of available grant opportunities. For information about American Heart Association awards go to www.americanheart.org/presenter.jhtml? identifier=9713. For NSF opportunities visit http://www.nsf.gov/funding/pgm_list.jsp? org=NSF&ord=date. For NIH application deadlines visit http://grants.nih.gov/grants/ funding/submissionschedule.htm. To learn more about Recovery Act opportunities at NIH visit http://grants.nih.gov/recovery/. When possible, please contact the HBC Grants Management Office at 864-4244 at least three weeks prior to a grant deadline for personalized assistance in preparing an application.

Upcoming Events

Dr. Jeff Aube and Chancellor Robert Hemenway notify the community of Dr. Aube’s $20 million NIH award that allows for the creation of the University of Kansas Specialized Chemistry Center. programs  mean  the  university  can  offer  valuable  training  opportunities  for  students.  In  addition,  Dr.  Aube’s  projects  increase  the  number  of  research  positions  at KU and improve the resources available  for research at the university by providing  additional specialized equipment. ● 

May 29 HBC Annual Picnic 6 p.m. at the West Shelter House at Clinton Lake Outlet Park (east of dam, south of spillway). Barbecue, beverages and children’s prizes will be provided. All researchers and staff affiliated with the HBC and their families are invited. All dates The HBC offers travel grants to assist research ers meet with n on -KU collaborators regarding grant applications, to speak with agency representatives prior to grant submission and to fund travel for proposal review for program projects or center proposals. Any KU researcher in a bioscience-related field is eligible. Go to http://www.hbc.ku.edu/internalservices/ programs/TravAward.html for more information and an application.


HBC OPPORTUNITIES New Investigator—Wonpil Im focuses on collaborative research (Continued from page 3)

Researchers discuss a poster presentation at the HBC Science Talks held in December.

HBC sponsors annual Science Talks (Continued from page 5)

discussed  “Designing  old  drugs  for  new  targets;  A  case  study  with  novobiocin.”  In addition, Jeff Krise, associate professor  of  pharmaceutical  chemistry”  presented  his research on “Exploiting lysosomes to  enhance the chemoselectivity of drugs.” 

  The  HBC  Science  Talks  provide    an  opportunity  for  HBC‐affiliated  scientists  and  their  staff  to  share  research  and  to  encourage  and  expand  future  collaborations.  It also acts as a forum for  high‐level  scientific  exchanges  between  colleagues. ● 

Wendy  Picking,  associate  research  professor;  Bill Picking,  professor  of  molecular biosciences; David Weis,  assistant  professor  of  chemistry;  and Philip Gao, director of the Pro‐ tein  Production  Core  Laboratory.  Together  they  research  protein  translocation  through  the  type  III  secretion system.  “In  particular,  we  have  been  developing several methods to bet‐ ter interpret NMR observables,” he  said.  Recently, they also began work  with  Robert  Dunn,  professor  of  chemistry,  to  study  the  orientation  of  a  lipid‐like  dye  molecule  in  membrane  environments  at  the  atomic level.  Dr.  Im  hopes  to  expand  his  role  in  these  types  of  projects,  which  deal  with  computation  and  experiment  combination,  in  the  future. ● 

KU researcher wins high honor from American Chemical Society (Continued from page 4)

a  result  depend  on  Hsp90  more  so  than  normal cells to allow continuous growth,”  said  Blagg.  “When  one  inhibits  Hsp90,  it  prevents  the  folding  of  multiple  proteins  that  are  essential  to  cell  growth.  The  net  effect  is  similar  to  the  administration  of  multiple  drugs  to  fight  cancer,  but  in  our  case  only  one  drug  is  needed  and  affects  multiple targets simultaneously.”    Blagg  and  his  colleagues  also  are  ad‐ vancing preclinical development of related  compounds  shown  to  be  successful  in  the  treatment  of  neurodegenerative  diseases  like Alzheimer’s and Parkinson’s.    “In  contrast  to  cancer,  in  which  we  want  to  halt  the  folding  of  proteins  that  allow  for  cell  growth,  in  neurodegenera‐ tive  diseases  we  want  to  refold  proteins  that  have  accumulated  into  plaques,”  Blagg said. 

  The KU researcher stressed the impor‐ tance  of  a  team  effort  that  advanced  un‐ derstanding  of  Hsp90,  citing  the  15  or  so  scientists active in his group.    “It  is  an  honor  to  receive  the  Robert‐ son  Award,”  Blagg  said.  “Professionally,  the award acknowledges the contributions  made by my group members and collabo‐ rators who aim to understand a new target  for cancer and neurodegenerative diseases.  Without  their  assistance  and,  in  many  cases,  their  guidance,  we  would  not  have  been  able  to  make  these  contributions  to  science.”    Blagg’s  acclaimed  research,  along  with  the  work  of  other  medicinal  chemis‐ try faculty, are key assets to the KU Cancer  Center  in  its  goal  of  winning  designation  as  a  Comprehensive  Cancer  Center  from  the National Cancer Institute. The work on  Hsp90  is  another  example  of  “bench  to 

bedside”  drug  development,  where  dis‐ ease‐fighting  chemical  elements  can  be  discovered, improved and taken to clinical  trial — all within the KU pipeline.    “A  number  of  collaborators  both  at  the  Lawrence  campus  and  at  the  medical  center are involved in the development of  these  compounds  so  that  one  day  they  may  become  clinically  used  anti‐cancer  drugs,” Blagg said.    “Currently  we’re  working  toward  the  preclinical  development  of  these  com‐ pounds  in  an  effort  to  support  the  cancer  center’s mission of developing drugs from  bench to bedside.”    Blagg will accept his award in August  in Washington, D.C. — along with a $1,000  honorarium  and  a  plaque  —  at  the  na‐ tional  meeting  of  the  American  Chemical  Society. ● 

HBC NEWS WINTER-SPRING 2008/2009— PAGE 7


OF NOTE AT HBC HBC Endowed Activities

Bishop Scholars share progress with donors   The  Higuchi  Biosciences  Center  held  a meeting in late January in which Bishop  Scholars  shared  their  research  with  donors Dr. Fred and Barbara Bishop.      “It is so enjoyable to hear and observe  the  scholars  share  their  research  progress  with  Dr.  and  Mrs.  Bishop,  who  are  so  truly interested in each and every scholars  success,”  HBC  Associate  Director  Susan  Sloop said.    Through the generosity of University  of Kansas alumna Barbara Johnson Bishop  (class  of  ‘46),  the  HBC  has  been  able  to  award  scholarships  to  highly  qualified  graduate students of participating faculty.  These scholarships are paid directly to the  graduate student in addition to any other  support  such  as  a  stipend,  tuition  or  fellowships,  which  the  student  may  receive.     “Through  her  gift  to  establish  the  Johnson  Bishop  Scholarship  fund,  Mrs.  Bishop  is  taking  an  active  role  in  the  pursuit  of  scientific  discovery  in  the  future,”  Sloop  said.  “She  is  touching  the  lives  of  the  scholar  and  those  who  they  may teach or that may be touched by their 

future research — a gift that will continue  to give to the future of science discovery.”    Bishop  Scholars  are  selected  from  among  those  candidates  nominated  by  faculty  mentors  of  the  HBC.  Faculty  are  invited to nominate outstanding potential  graduate  students  during  the  graduate  recruiting  process  beginning  in  late  fall  and running through February. Decisions  are usually made by the end of February.     “This Bishop scholarship is a valuable  recruitment  tool  to  assist  graduate  programs in recruiting top‐notch graduate  students  who  are  interested  in  either  neurodegenerative  diseases  or  cancer  research,” Sloop said.      Barbara Johnson Bishop    Barbara  Bishop  was  born  into  a  KU  family. Both her father, C.B. Johnson, and  her  mother,  Blanche  Lorimer  Johnson,  graduated  from  KU  in  1916.  Barbara  Bishop  was  born  Jan.  29,  1925,  in  Kansas  City. She grew up in Eudora and received  her  first  KU  degree  in  zoology  in  1946.  Two years later, she graduated from KUʹs 

HBC concludes discussion series aimed at uniting researchers (Continued from page 6)

toxicity  and  pharmacogenomics.  All  re‐ search  conducted  by  HBC  participants  falls broadly within these themes.  The  discussions  covered  ongoing  research  efforts  and  future  trends.  A  dif‐ ferent KU scientist who conducts research  in  the  designated  topic  facilitated  each  meeting.  It is hoped  that  sharing  research  will  generate  new  dialogues  and  help  in‐ dividuals  interested  in  leading  team  ef‐ forts  to  find  support  and  direction  for  their projects.  “Even  though  the  majority  of  the  folks who attend are affiliated in one way  or  another  with  the  HBC,  we  welcome  anyone  who  is  interested  in  building  or  participating  in  research  teams  that  are  competitive  for  major  funding  initiatives  from  the  NIH  and  other  agencies.  Such  HBC NEWS WINTER-SPRING 2008/2009— PAGE 8

initiatives  can  include  multi‐investigator  research  projects,  program  projects  or  center grants,” Picking said.  The HBC strives to work with investi‐ gators  to  maximize  research  productivity  in  the  biomedical  sciences  at  KU  and  to  help  the  KU  biomedical  research  commu‐ nity meet research and funding challenges  of the future.  “In  many  cases,  seemingly  unrelated  research interests can be combined to cre‐ ate  innovative  collaborative  teams  having  a  synergy  that  is  well‐suited to  obtain  ex‐ tramural funding,” Picking said.  Turnout  at  the  brown  bag  lunch  se‐ ries was good and included broad partici‐ pation by regular faculty, research faculty,  postdoctoral  researchers,  students  and  core lab scientists. ● 

physical  therapy  program.  While  at  KU,  Bishop  was  a  member  of  Alpha  Chi  Omega social sorority.    Bishop  began  her  physical  therapy  career at Wadsworth Veterans Hospital in  Leavenworth,  then  transferred  to  a  veterans  hospital  in  Portland,  Ore.  There  she  met  her  husband,  Fred.  H.  Bishop,  a  physician.  Barbara  Bishop  retired  from  physical  therapy  work  when  she  and  her  husband moved to Washington.    Barbara  Bishop  is  a  life  member  of  the KU Alumni Association and is a major  donor  to  the  Simons  Laboratory,  the  administrative home of the HBC.     Bishop Scholars    The  2008  Bishop  Scholars  received  awards  of  $7,500  annually.  Earlier  scholars  who  received  awards  of  $5,000  are  eligible  for  an  additional  year  if  their  degrees  are  not  yet  completed.  Current  scholars  are  Shaheen  Latiff,  Carrie  McAllister,  James  McGuire,  Heather  Menchen and Natasha DeVore. ● 

Grant Services Contacts Susan Sloop, Associate Director (785) 864-5142, sloop@ku.edu Linda Carlyle, Manager, Accounting Services (785) 864-5127, carlyle@ku.edu Rhonda McGuire, Manager, Transaction Services (785) 864-3752, rmings@ku.edu Peggy Williams, Personnel Searches (785) 864-5340, pwilliam@ku.edu The Higuchi Biosciences Center — we simplify administration to help our scientists focus on research.

For more information about the Higuchi Biosciences Center visit

www.hbc.ku.edu


HBC News