Al concluir las operaciones militares, el Presidente Constitucional de la República del Ecuador Dr. Jaime Roldós Aguilera, mediante decreto ejecutivo, confirió al estandarte del GFE 1 la condecoración Cruz al Mérito de Guerra, en el grado de Gran Cruz, el 24 de mayo de 1981 en el estadio Olímpico Atahualpa. El 19 de marzo de 1982, la unidad se traslada a las instalaciones de la hacienda Rumipamba, cercana a la ciudad de Latacunga, siendo su comandante el teniente coronel Gonzalo Bueno. En consonancia con la ampliación de las actividades de los contingentes de fuerzas especiales, en el mes de abril de 1984, llega un contingente de instructores del Ejército de los Estados Unidos, para capacitar al personal en actividades de contra insurgencia. Un contingente del GFE 27 viaja posteriormente a Panamá con la finalidad de participar en maniobras conjuntas con el Ejército norteamericano. Un año más tarde, oficiales y tropa de fuerzas especiales reciben el primer curso antiterrorismo con instructores norteamericanos. En 1986 se produce la reorganización numérica del Ejército, debido a la cual cambia la numeración de Brigada de Fuerzas Especiales Nº 1 al de Nº 9; mientras el Grupo de Fuerzas Especiales Nº 1 pasó a denominarse Grupo de Fuerzas Especiales Nº 27, denominación que aún conserva. El 8 de marzo de 1986, en la ciudad de Manta, el general Frank Vargas Pazzos se rebeló contra el gobierno y la cúpula militar denunciando un supuesto negociado en la adquisición de un avión Fokker y su malestar por considerar que la Fuerza Aérea Ecuatoriana, estaba siendo marginada dentro de las Fuerzas Armadas. Al llegar a Quito, fue detenido en la Base Militar del Aeropuerto Mariscal Sucre. Casi un año después, el 16 de enero de 1987, durante una visita que realizó con su comitiva a la base de Taura, el presidente León Febres Cordero fue secuestrado por comandos de la FAE que le exigieron la liberación de Vargas, quien había recibido una amnistía del Congreso no acatada por el gobierno. Tras un intercambio de disparos que produjo un muerto en la comitiva presidencial, los insurrectos tomaron de rehén al primer mandatario, al jefe del Comando Conjunto de las FF. AA., al ministro de Defensa, comandante general del Ejército y otros miembros de la delegación. Los comandos obtuvieron del presidente cautivo la amnistía para el general Vargas, para ellos y la promesa de no tomar retaliaciones. Finalmente, efectivos del Grupo de Fuerzas Especiales Nº 27, tomaron la base por asalto y sometieron a los insubordinados. En el mes de agosto de 1992, efectivos del grupo viajaron a Fort Bragg, base militar del Ejército de los Estados Unidos en Carolina del
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Sistema de Fuerzas Especiales.