Contiguo a la playa arenosa se encuentran una serie de charcas salinas que conectan con el mar. Las mismas se formaron durante la década de los 50 a causa de la extracción de alrededor de un 70% de arena de una franja de dunas. Hoy día, existe una gran extensión de dunas de arena restantes, de unos 10 a 50 metros de ancho, que están cubiertas de vegetación incluyendo varios tipos de gramíneas (Estado Libre Asociado de Puerto Rico, 2001). El área noreste de la reserva natural tiene pequeñas dunas, las que se encontraron esparcidas, de forma irregular, debido a la topografía llana del lugar. La Reserva Natural Punta Cucharas contiene depósitos de pantano, compuesto de arena, de arcilla y, mayormente, de desechos carbonosos de mangle. Estos depósitos comprenden un 50% del terreno de la reserva. También, contiene depósitos de playa, y los aluviales se componen básicamente de arena, de guijarros y de arcilla. El grosor varía y puede alcanzar unos 50 metros. Otro depósito, el cual sobrepasa los 200 metros de grosor territorial, es la Caliza Ponce (un tipo de suelo) que consiste de calcarenita cristalina con abundantes moldes de corales, moluscos, conchas del equinoide, ostras y foraminíferas. El área natural contiene siete tipos de suelos. Uno de ellos es el suelo de arena Serrano (Se) localizado en el centro noroeste y en el extremo suroeste con cabidas de aproximadamente 20 a 50 acres. Este suelo llano es salino con escorrentías lentas cuya pendiente varía de 0% a 2%. Estos suelos se encuentran cerca de llanos costeros de región semiárida (Dávila Casanova y Sustache Sustache 2004).
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